Detecção de pontos de mudança para a identificação de ilhas de homozigose (2022)
- Authors:
- USP affiliated authors: LEONARDI, FLORENCIA GRACIELA - IME ; PRATES, LUCAS DE OLIVEIRA - IME
- Unidade: IME
- Assunto: BIOESTATÍSTICA
- Language: Português
- Abstract: Neste trabalho propomos estimadores regularizados para pontos de mudança nos parâmetros de uma distribuição multidimensional quando temos várias amostras independentes alinhadas, de tamanho limitado. O estimador pode ser calculado eficientemente por um algoritmo de programação dinâmica ou aproximado por segmentação binária. Mostramos que ambos estimadores convergem quase certamente para o conjunto de pontos de mudança, sem a necessidade de especificar a priori o número de pontos de mudança. Além disso, apresentamos uma nova metodologia para a seleção da constante de regularização que tem a vantagem de ser automática, consistente e menos propensa à análise subjetiva. O trabalho está motivado pelo problema de identificar ilhas de homozigose no genoma dos indivíduos de uma população. Nosso método aborda diretamente a questão da identificação das ilhas de homozigose ao nível populacional, sem a necessidade de analisar indivíduos isolados e depois combinar os resultados, como é feito hoje em dia em abordagens estado-da-arte. Este é um trabalho em colaboração com os pesquisadores Renan B. Lemes, Tábita Hünemeier do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo.
- Imprenta:
- Source:
- Título: Livro de Resumos
- Conference titles: Simpósio Nacional de Probabilidade e Estatística - SINAPE
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ABNT
PRATES, Lucas de Oliveira e LEONARDI, Florencia Graciela. Detecção de pontos de mudança para a identificação de ilhas de homozigose. 2022, Anais.. São Paulo: ABE, 2022. Disponível em: https://app.eventize.com.br/upload/004449/files/Sinape2022_FINAL.pdf. Acesso em: 13 fev. 2026. -
APA
Prates, L. de O., & Leonardi, F. G. (2022). Detecção de pontos de mudança para a identificação de ilhas de homozigose. In Livro de Resumos. São Paulo: ABE. Recuperado de https://app.eventize.com.br/upload/004449/files/Sinape2022_FINAL.pdf -
NLM
Prates L de O, Leonardi FG. Detecção de pontos de mudança para a identificação de ilhas de homozigose [Internet]. Livro de Resumos. 2022 ;[citado 2026 fev. 13 ] Available from: https://app.eventize.com.br/upload/004449/files/Sinape2022_FINAL.pdf -
Vancouver
Prates L de O, Leonardi FG. Detecção de pontos de mudança para a identificação de ilhas de homozigose [Internet]. Livro de Resumos. 2022 ;[citado 2026 fev. 13 ] Available from: https://app.eventize.com.br/upload/004449/files/Sinape2022_FINAL.pdf - Detecção offline de pontos de mudança para dados binários via métodos de regularização
- Offline change point detection for binary data via regularization methods
- Population-based change-point detection for the identification of homozygosity islands
- Consistent model selection for the degree corrected stochastic blockmodel
- Change point detection for high-dimensional regression data with l1-regularization
- Context tree selection: a unifying view
- Some upper bounds for the rate of convergence of penalized likelihood context tree estimators
- Cadeias estocásticas parcimoniosas com aplicações à classificação e filogenia das seqüências de proteínas
- Computationally efficient change point detection for high-dimensional regression
- Nonparametric statistical inference for the context tree of a stationary ergodic process
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