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Tese (Doutorado)
Caracterizando regiões promotoras: protocolo de análise de arquiteturas de promotores utilizando dados de expressão e sua aplicação em cana-de-açúcar (2024)
Melo, Alícia Lie de ; Souza, Gláucia Mendes (Orientador) ; Durham, Alan Mitchell (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Assuntos: BIOTECNOLOGIA, BIOCOMBUSTÍVEIS, CANA-DE-AÇÚCAR, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
MELO, Alícia Lie de. Caracterizando regiões promotoras: protocolo de análise de arquiteturas de promotores utilizando dados de expressão e sua aplicação em cana-de-açúcar. 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-13112024-184644/. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Melo, A. L. de. (2024). Caracterizando regiões promotoras: protocolo de análise de arquiteturas de promotores utilizando dados de expressão e sua aplicação em cana-de-açúcar (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-13112024-184644/
NLM
Melo AL de. Caracterizando regiões promotoras: protocolo de análise de arquiteturas de promotores utilizando dados de expressão e sua aplicação em cana-de-açúcar [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-13112024-184644/
Vancouver
Melo AL de. Caracterizando regiões promotoras: protocolo de análise de arquiteturas de promotores utilizando dados de expressão e sua aplicação em cana-de-açúcar [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-13112024-184644/
Parte de monografia/livro
Computational analysis of transposable elements and circRNAs in plants (2021)
Oliveira, Liliane Santana; Patera, Andressa Caroline; Domingues, Douglas Silva ; Sanches, Danilo Sipoli; Lopes, Fabricio Martins ; Bugatti, Pedro Henrique ; Saito, Priscila Tiemi Maeda; Maracaja-Coutinho, Vinicius ; Durham, Alan Mitchell ; Paschoal, Alexandre Rossi
Fonte: Plant circular RNAs : methods and protocols. Unidade: IME
Assunto: BIOINFORMÁTICA
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ABNT
OLIVEIRA, Liliane Santana et al. Computational analysis of transposable elements and circRNAs in plants. Plant circular RNAs : methods and protocols. Tradução . New York: Humana, 2021. . Disponível em: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1645-1_9. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Oliveira, L. S., Patera, A. C., Domingues, D. S., Sanches, D. S., Lopes, F. M., Bugatti, P. H., et al. (2021). Computational analysis of transposable elements and circRNAs in plants. In Plant circular RNAs : methods and protocols. New York: Humana. doi:10.1007/978-1-0716-1645-1_9
NLM
Oliveira LS, Patera AC, Domingues DS, Sanches DS, Lopes FM, Bugatti PH, Saito PTM, Maracaja-Coutinho V, Durham AM, Paschoal AR. Computational analysis of transposable elements and circRNAs in plants [Internet]. In: Plant circular RNAs : methods and protocols. New York: Humana; 2021. [citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1645-1_9
Vancouver
Oliveira LS, Patera AC, Domingues DS, Sanches DS, Lopes FM, Bugatti PH, Saito PTM, Maracaja-Coutinho V, Durham AM, Paschoal AR. Computational analysis of transposable elements and circRNAs in plants [Internet]. In: Plant circular RNAs : methods and protocols. New York: Humana; 2021. [citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1645-1_9
Artigo de periodico
CodAn: predictive models for precise identification of coding regions in eukaryotic transcripts (2021)
Nachtigall, Pedro Gabriel ; Kashiwabara, André Yoshiaki ; Durham, Alan Mitchell
Fonte: Briefings in Bioinformatics. Unidade: IME
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
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ABNT
NACHTIGALL, Pedro Gabriel e KASHIWABARA, André Yoshiaki e DURHAM, Alan Mitchell. CodAn: predictive models for precise identification of coding regions in eukaryotic transcripts. Briefings in Bioinformatics, v. 22, n. 3, p. 1-11, 2021Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1093/bib/bbaa045. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Nachtigall, P. G., Kashiwabara, A. Y., & Durham, A. M. (2021). CodAn: predictive models for precise identification of coding regions in eukaryotic transcripts. Briefings in Bioinformatics, 22( 3), 1-11. doi:10.1093/bib/bbaa045
NLM
Nachtigall PG, Kashiwabara AY, Durham AM. CodAn: predictive models for precise identification of coding regions in eukaryotic transcripts [Internet]. Briefings in Bioinformatics. 2021 ; 22( 3): 1-11.[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bib/bbaa045
Vancouver
Nachtigall PG, Kashiwabara AY, Durham AM. CodAn: predictive models for precise identification of coding regions in eukaryotic transcripts [Internet]. Briefings in Bioinformatics. 2021 ; 22( 3): 1-11.[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bib/bbaa045
Artigo de periodico
TSSFinder—fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes (2021)
Oliveira, Mauro de Medeiros ; Bonadio, Ígor ; Melo, Alícia Lie de ; Souza, Gláucia Mendes ; Durham, Alan Mitchell
Fonte: Briefings in Bioinformatics. Unidades: IQ, IME, Interunidades em Bioinformática
Assuntos: TRANSCRIÇÃO GÊNICA, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
OLIVEIRA, Mauro de Medeiros et al. TSSFinder—fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes. Briefings in Bioinformatics, v. 22, n. 6, p. 1-12, 2021Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1093/bib/bbab198. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Oliveira, M. de M., Bonadio, Í., Melo, A. L. de, Souza, G. M., & Durham, A. M. (2021). TSSFinder—fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes. Briefings in Bioinformatics, 22( 6), 1-12. doi:10.1093/bib/bbab198
NLM
Oliveira M de M, Bonadio Í, Melo AL de, Souza GM, Durham AM. TSSFinder—fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes [Internet]. Briefings in Bioinformatics. 2021 ; 22( 6): 1-12.[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bib/bbab198
Vancouver
Oliveira M de M, Bonadio Í, Melo AL de, Souza GM, Durham AM. TSSFinder—fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes [Internet]. Briefings in Bioinformatics. 2021 ; 22( 6): 1-12.[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bib/bbab198
Parte de monografia/livro
Noncoding RNAs databases: current status and trends (2019)
Maracaja-Coutinho, Vinicius ; Paschoal, Alexandre Rossi ; Caris-Maldonado, José Carlos; Borges, Pedro Vinícius; Ferreira, Almir José; Durham, Alan Mitchell
Fonte: Computational biology of non-coding RNA : methods and protocols. Unidade: IME
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, BANCO DE DADOS, RNA
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ABNT
MARACAJA-COUTINHO, Vinicius et al. Noncoding RNAs databases: current status and trends. Computational biology of non-coding RNA : methods and protocols. Tradução . New York: Springer, 2019. . Disponível em: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-8982-9_10. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Maracaja-Coutinho, V., Paschoal, A. R., Caris-Maldonado, J. C., Borges, P. V., Ferreira, A. J., & Durham, A. M. (2019). Noncoding RNAs databases: current status and trends. In Computational biology of non-coding RNA : methods and protocols. New York: Springer. doi:10.1007/978-1-4939-8982-9_10
NLM
Maracaja-Coutinho V, Paschoal AR, Caris-Maldonado JC, Borges PV, Ferreira AJ, Durham AM. Noncoding RNAs databases: current status and trends [Internet]. In: Computational biology of non-coding RNA : methods and protocols. New York: Springer; 2019. [citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-8982-9_10
Vancouver
Maracaja-Coutinho V, Paschoal AR, Caris-Maldonado JC, Borges PV, Ferreira AJ, Durham AM. Noncoding RNAs databases: current status and trends [Internet]. In: Computational biology of non-coding RNA : methods and protocols. New York: Springer; 2019. [citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-8982-9_10
Dissertação (Mestrado)
Predição de genes ab initio combinada com informações de alinhamento (2019)
Lopes, Bruno Tenório da Silveira; Durham, Alan Mitchell (Orientador)
Unidade: IME
Assuntos: APRENDIZADO COMPUTACIONAL, BIOINFORMÁTICA, MODELOS PARA PROCESSOS ESTOCÁSTICOS, CADEIAS DE MARKOV
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ABNT
LOPES, Bruno Tenório da Silveira. Predição de genes ab initio combinada com informações de alinhamento. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-28092019-175959/. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Lopes, B. T. da S. (2019). Predição de genes ab initio combinada com informações de alinhamento (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-28092019-175959/
NLM
Lopes BT da S. Predição de genes ab initio combinada com informações de alinhamento [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-28092019-175959/
Vancouver
Lopes BT da S. Predição de genes ab initio combinada com informações de alinhamento [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-28092019-175959/
Tese (Doutorado)
Uma abordagem integrada para a construção e utilização de HMMs de perfil para análises genômicas e metagenômicas (2019)
Kashiwabara, Liliane Santana Oliveira; Durham, Alan Mitchell (Orientador) ; Gruber, Arthur (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, MODELOS PARA PROCESSOS ESTOCÁSTICOS, DESENVOLVIMENTO DE SOFTWARE, MARCADOR MOLECULAR
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ABNT
KASHIWABARA, Liliane Santana Oliveira. Uma abordagem integrada para a construção e utilização de HMMs de perfil para análises genômicas e metagenômicas. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29082019-160757/. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Kashiwabara, L. S. O. (2019). Uma abordagem integrada para a construção e utilização de HMMs de perfil para análises genômicas e metagenômicas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29082019-160757/
NLM
Kashiwabara LSO. Uma abordagem integrada para a construção e utilização de HMMs de perfil para análises genômicas e metagenômicas [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29082019-160757/
Vancouver
Kashiwabara LSO. Uma abordagem integrada para a construção e utilização de HMMs de perfil para análises genômicas e metagenômicas [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29082019-160757/
Tese (Doutorado)
Transcriptoma, sítios de ligação para fatores de transcrição e região promotora de cana-de-açúcar (2018)
Oliveira, Mauro de Medeiros ; Souza, Gláucia Mendes (Orientador) ; Durham, Alan Mitchell (coorient)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, CANA-DE-AÇÚCAR
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
OLIVEIRA, Mauro de Medeiros. Transcriptoma, sítios de ligação para fatores de transcrição e região promotora de cana-de-açúcar. 2018. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2018. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10122018-101543. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Oliveira, M. de M. (2018). Transcriptoma, sítios de ligação para fatores de transcrição e região promotora de cana-de-açúcar (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10122018-101543
NLM
Oliveira M de M. Transcriptoma, sítios de ligação para fatores de transcrição e região promotora de cana-de-açúcar [Internet]. 2018 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10122018-101543
Vancouver
Oliveira M de M. Transcriptoma, sítios de ligação para fatores de transcrição e região promotora de cana-de-açúcar [Internet]. 2018 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10122018-101543
Artigo de periodico
GenSeed-HMM: a tool for progressive assembly using profile HMMs as seeds and its application in Alpavirinae viral discovery from metagenomic data (2016)
Alves, João Marcelo Pereira ; Oliveira, Andre L. de; Sandberg, Tatiana Orli Milkewitz ; Moreno-Gallego, Jaime L; Toledo, Marcelo A. F. de; Moura, Elisabeth M. M. de; Oliveira, Liliane S; Durham, Alan Mitchell ; Mehnert, Dolores Ursula; Zanotto, Paolo Marinho de Andrade ; Reyes, Alejandro; Gruber, Arthur
Fonte: Frontiers in Microbiology. Unidades: ICB, IME, IB
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, PROCESSOS DE MARKOV
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ALVES, João Marcelo Pereira et al. GenSeed-HMM: a tool for progressive assembly using profile HMMs as seeds and its application in Alpavirinae viral discovery from metagenomic data. Frontiers in Microbiology, v. 7, n. article º 269, p. 15 , 2016Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.00269. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Alves, J. M. P., Oliveira, A. L. de, Sandberg, T. O. M., Moreno-Gallego, J. L., Toledo, M. A. F. de, Moura, E. M. M. de, et al. (2016). GenSeed-HMM: a tool for progressive assembly using profile HMMs as seeds and its application in Alpavirinae viral discovery from metagenomic data. Frontiers in Microbiology, 7( article º 269), 15 . doi:10.3389/fmicb.2016.00269
NLM
Alves JMP, Oliveira AL de, Sandberg TOM, Moreno-Gallego JL, Toledo MAF de, Moura EMM de, Oliveira LS, Durham AM, Mehnert DU, Zanotto PM de A, Reyes A, Gruber A. GenSeed-HMM: a tool for progressive assembly using profile HMMs as seeds and its application in Alpavirinae viral discovery from metagenomic data [Internet]. Frontiers in Microbiology. 2016 ; 7( article º 269): 15 .[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.00269
Vancouver
Alves JMP, Oliveira AL de, Sandberg TOM, Moreno-Gallego JL, Toledo MAF de, Moura EMM de, Oliveira LS, Durham AM, Mehnert DU, Zanotto PM de A, Reyes A, Gruber A. GenSeed-HMM: a tool for progressive assembly using profile HMMs as seeds and its application in Alpavirinae viral discovery from metagenomic data [Internet]. Frontiers in Microbiology. 2016 ; 7( article º 269): 15 .[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.00269
Dissertação (Mestrado)
Alinhamento múltiplo de genomas e sequências de proteínas com repetições e rearranjos (2016)
Chaves, Laécio Freitas; Durham, Alan Mitchell (Orientador)
Unidade: IME
Assuntos: ALGORITMOS, GENOMAS, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
CHAVES, Laécio Freitas. Alinhamento múltiplo de genomas e sequências de proteínas com repetições e rearranjos. 2016. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2016. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-113328/. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Chaves, L. F. (2016). Alinhamento múltiplo de genomas e sequências de proteínas com repetições e rearranjos (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-113328/
NLM
Chaves LF. Alinhamento múltiplo de genomas e sequências de proteínas com repetições e rearranjos [Internet]. 2016 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-113328/
Vancouver
Chaves LF. Alinhamento múltiplo de genomas e sequências de proteínas com repetições e rearranjos [Internet]. 2016 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-113328/
Parte de monografia/livro
Small RNA sequencing for squamous cell carcinoma research (2015)
Severino, Patricia; Oliveira, Liliane Santana; Durham, Alan Mitchell
Fonte: Next generation sequencing in cancer research, volume 2. Unidade: IME
Assuntos: COMPUTAÇÃO APLICADA, BIOINFORMÁTICA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, NEOPLASIAS CUTÂNEAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SEVERINO, Patricia e OLIVEIRA, Liliane Santana e DURHAM, Alan Mitchell. Small RNA sequencing for squamous cell carcinoma research. Next generation sequencing in cancer research, volume 2. Tradução . Cham: Springer, 2015. . Disponível em: https://doi.org/10.1007/978-3-319-15811-2_16. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Severino, P., Oliveira, L. S., & Durham, A. M. (2015). Small RNA sequencing for squamous cell carcinoma research. In Next generation sequencing in cancer research, volume 2. Cham: Springer. doi:10.1007/978-3-319-15811-2_16
NLM
Severino P, Oliveira LS, Durham AM. Small RNA sequencing for squamous cell carcinoma research [Internet]. In: Next generation sequencing in cancer research, volume 2. Cham: Springer; 2015. [citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-3-319-15811-2_16
Vancouver
Severino P, Oliveira LS, Durham AM. Small RNA sequencing for squamous cell carcinoma research [Internet]. In: Next generation sequencing in cancer research, volume 2. Cham: Springer; 2015. [citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-3-319-15811-2_16
Artigo de periodico
Small RNAs in metastatic and non-metastatic oral squamous cell carcinoma (2015)
Severino, Patrícia; Oliveira, Liliane Santana; Andreghetto, Flávia Maziero; Torres, Natalia; Curioni, Otavio; Cury, Patricia Maluf; Toporcov, Tatiana Natasha ; Paschoal, Alexandre Rossi; Durham, Alan Mitchell
Fonte: BMC Medical Genomics. Unidades: IME, FSP
Assuntos: COMPUTAÇÃO APLICADA, BIOINFORMÁTICA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, NEOPLASIAS CUTÂNEAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SEVERINO, Patrícia et al. Small RNAs in metastatic and non-metastatic oral squamous cell carcinoma. BMC Medical Genomics, v. 8, 2015Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12920-015-0102-4. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Severino, P., Oliveira, L. S., Andreghetto, F. M., Torres, N., Curioni, O., Cury, P. M., et al. (2015). Small RNAs in metastatic and non-metastatic oral squamous cell carcinoma. BMC Medical Genomics, 8. doi:10.1186/s12920-015-0102-4
NLM
Severino P, Oliveira LS, Andreghetto FM, Torres N, Curioni O, Cury PM, Toporcov TN, Paschoal AR, Durham AM. Small RNAs in metastatic and non-metastatic oral squamous cell carcinoma [Internet]. BMC Medical Genomics. 2015 ; 8[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12920-015-0102-4
Vancouver
Severino P, Oliveira LS, Andreghetto FM, Torres N, Curioni O, Cury PM, Toporcov TN, Paschoal AR, Durham AM. Small RNAs in metastatic and non-metastatic oral squamous cell carcinoma [Internet]. BMC Medical Genomics. 2015 ; 8[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12920-015-0102-4
Dissertação (Mestrado)
Implementação de abordagens computacionais para identificação de RNAs longos não codificadores envolvidos na diferenciação neural (2015)
Zaniboni, Gabriel Francisco; Reis, Eduardo Moraes (Orientador) ; Durham, Alan Mitchell (coorient)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Assunto: BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ZANIBONI, Gabriel Francisco. Implementação de abordagens computacionais para identificação de RNAs longos não codificadores envolvidos na diferenciação neural. 2015. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2015. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02022016-150323. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Zaniboni, G. F. (2015). Implementação de abordagens computacionais para identificação de RNAs longos não codificadores envolvidos na diferenciação neural (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02022016-150323
NLM
Zaniboni GF. Implementação de abordagens computacionais para identificação de RNAs longos não codificadores envolvidos na diferenciação neural [Internet]. 2015 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02022016-150323
Vancouver
Zaniboni GF. Implementação de abordagens computacionais para identificação de RNAs longos não codificadores envolvidos na diferenciação neural [Internet]. 2015 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02022016-150323
Parte de monografia/livro
Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em Bioinformática (2015)
Durham, Alan Mitchell ; Setubal, João Carlos ; Barrera, Júnior
Fonte: Práticas da interdisciplinaridade no ensino e pesquisa. Unidades: IME, IQ
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, INTERDISCIPLINARIDADE
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
DURHAM, Alan Mitchell e SETUBAL, João Carlos e BARRERA, Júnior. Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em Bioinformática. Práticas da interdisciplinaridade no ensino e pesquisa. Tradução . Barueri: Manole, 2015. . . Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Durham, A. M., Setubal, J. C., & Barrera, J. (2015). Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em Bioinformática. In Práticas da interdisciplinaridade no ensino e pesquisa. Barueri: Manole.
NLM
Durham AM, Setubal JC, Barrera J. Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em Bioinformática. In: Práticas da interdisciplinaridade no ensino e pesquisa. Barueri: Manole; 2015. [citado 2025 nov. 16 ]
Vancouver
Durham AM, Setubal JC, Barrera J. Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em Bioinformática. In: Práticas da interdisciplinaridade no ensino e pesquisa. Barueri: Manole; 2015. [citado 2025 nov. 16 ]
Parte de monografia/livro
Using bioinformatics tools to study the role of microRNA in cancer (2014)
Passetti, Fabio; Jorge, Natasha Andressa Nogueira; Durham, Alan Mitchell
Fonte: Clinical bioinformatics. Unidade: IME
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, NEOPLASIAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PASSETTI, Fabio e JORGE, Natasha Andressa Nogueira e DURHAM, Alan Mitchell. Using bioinformatics tools to study the role of microRNA in cancer. Clinical bioinformatics. Tradução . New York: Humana Press, 2014. . Disponível em: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-0847-9_7. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Passetti, F., Jorge, N. A. N., & Durham, A. M. (2014). Using bioinformatics tools to study the role of microRNA in cancer. In Clinical bioinformatics. New York: Humana Press. doi:10.1007/978-1-4939-0847-9_7
NLM
Passetti F, Jorge NAN, Durham AM. Using bioinformatics tools to study the role of microRNA in cancer [Internet]. In: Clinical bioinformatics. New York: Humana Press; 2014. [citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-0847-9_7
Vancouver
Passetti F, Jorge NAN, Durham AM. Using bioinformatics tools to study the role of microRNA in cancer [Internet]. In: Clinical bioinformatics. New York: Humana Press; 2014. [citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-0847-9_7
Dissertação (Mestrado)
Desenvolvimento de um arcabouço probabilístico para implementação de campos aleatórios condicionais (2013)
Bonadio, Ígor; Durham, Alan Mitchell (Orientador)
Unidade: IME
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, SIMULAÇÃO, INFERÊNCIA ESTATÍSTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
BONADIO, Ígor. Desenvolvimento de um arcabouço probabilístico para implementação de campos aleatórios condicionais. 2013. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2013. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-112855/. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Bonadio, Í. (2013). Desenvolvimento de um arcabouço probabilístico para implementação de campos aleatórios condicionais (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-112855/
NLM
Bonadio Í. Desenvolvimento de um arcabouço probabilístico para implementação de campos aleatórios condicionais [Internet]. 2013 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-112855/
Vancouver
Bonadio Í. Desenvolvimento de um arcabouço probabilístico para implementação de campos aleatórios condicionais [Internet]. 2013 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-112855/
Tese (Doutorado)
Bioinformática aplicada em RNomics: estratégias computacionais para caracterização de RNAs não-codificadores (2012)
Paschoal, Alexandre Rossi; Durham, Alan Mitchell (Orientador) ; Simoes, Zila Luz Paulino (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Assunto: BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PASCHOAL, Alexandre Rossi. Bioinformática aplicada em RNomics: estratégias computacionais para caracterização de RNAs não-codificadores. 2012. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2012. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-24092013-211625/. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Paschoal, A. R. (2012). Bioinformática aplicada em RNomics: estratégias computacionais para caracterização de RNAs não-codificadores (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-24092013-211625/
NLM
Paschoal AR. Bioinformática aplicada em RNomics: estratégias computacionais para caracterização de RNAs não-codificadores [Internet]. 2012 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-24092013-211625/
Vancouver
Paschoal AR. Bioinformática aplicada em RNomics: estratégias computacionais para caracterização de RNAs não-codificadores [Internet]. 2012 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-24092013-211625/
Artigo de periodico
Non-coding transcription characterization and annotation (2012)
Paschoal, Alexandre Rossi; Maracajá-Coutinho, Vinicius Ramos Henriques; Setubal, João Carlos ; Simões, Zila Luz Paulino; Verjovski-Almeida, Sergio ; Durham, Alan Mitchell
Fonte: RNA Biology. Unidades: IQ, FFCLRP, IME
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PASCHOAL, Alexandre Rossi et al. Non-coding transcription characterization and annotation. RNA Biology, v. 9, n. 3, p. 274-282 : + Supplementary materials ( S1-S92), 2012Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.4161/rna.19352. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Paschoal, A. R., Maracajá-Coutinho, V. R. H., Setubal, J. C., Simões, Z. L. P., Verjovski-Almeida, S., & Durham, A. M. (2012). Non-coding transcription characterization and annotation. RNA Biology, 9( 3), 274-282 : + Supplementary materials ( S1-S92). doi:10.4161/rna.19352
NLM
Paschoal AR, Maracajá-Coutinho VRH, Setubal JC, Simões ZLP, Verjovski-Almeida S, Durham AM. Non-coding transcription characterization and annotation [Internet]. RNA Biology. 2012 ; 9( 3): 274-282 : + Supplementary materials ( S1-S92).[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.4161/rna.19352
Vancouver
Paschoal AR, Maracajá-Coutinho VRH, Setubal JC, Simões ZLP, Verjovski-Almeida S, Durham AM. Non-coding transcription characterization and annotation [Internet]. RNA Biology. 2012 ; 9( 3): 274-282 : + Supplementary materials ( S1-S92).[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.4161/rna.19352
Dissertação (Mestrado)
Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes (2012)
Onuchic, Vitor Ferreira; Durham, Alan Mitchell (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Assunto: BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ONUCHIC, Vitor Ferreira. Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes. 2012. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2012. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114557/. Acesso em: 16 nov. 2025.
APA
Onuchic, V. F. (2012). Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114557/
NLM
Onuchic VF. Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes [Internet]. 2012 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114557/
Vancouver
Onuchic VF. Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes [Internet]. 2012 ;[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114557/
Trabalho de evento-anais periodico
Decreasing the number of false positives in sequence classification (2010)
Lima, Ariane Machado ; Kashiwabara, André Yoshiaki ; Durham, Alan Mitchell
Fonte: BMC Genomics. Nome do evento: International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Unidades: EACH, IME
Assunto: BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
LIMA, Ariane Machado e KASHIWABARA, André Yoshiaki e DURHAM, Alan Mitchell. Decreasing the number of false positives in sequence classification. BMC Genomics. London: Escola de Artes, Ciências e Humanidades, Universidade de São Paulo. Disponível em: https://doi.org/10.1186/1471-2164-11-S5-S10. Acesso em: 16 nov. 2025. , 2010
APA
Lima, A. M., Kashiwabara, A. Y., & Durham, A. M. (2010). Decreasing the number of false positives in sequence classification. BMC Genomics. London: Escola de Artes, Ciências e Humanidades, Universidade de São Paulo. doi:10.1186/1471-2164-11-S5-S10
NLM
Lima AM, Kashiwabara AY, Durham AM. Decreasing the number of false positives in sequence classification [Internet]. BMC Genomics. 2010 ; 11[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2164-11-S5-S10
Vancouver
Lima AM, Kashiwabara AY, Durham AM. Decreasing the number of false positives in sequence classification [Internet]. BMC Genomics. 2010 ; 11[citado 2025 nov. 16 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2164-11-S5-S10

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