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Desenvolvimento de um arcabouço probabilístico para implementação de campos aleatórios condicionais (2013)

  • Authors:
  • Autor USP: BONADIO, ÍGOR - IME
  • Unidade: IME
  • Sigla do Departamento: MAC
  • Subjects: BIOINFORMÁTICA; SIMULAÇÃO; INFERÊNCIA ESTATÍSTICA
  • Language: Português
  • Abstract: A segmentação de sequências é um problema desafiador que pode ser aplicado em diversas áreas de pesquisa. O uso de modelos geradores como Modelo Oculto de Markov (HMM, do inglês Hidden Markov Model) e Modelo Oculto de Markov Generalizado (GHMM, do inglês Generalized Hidden Markov Model) é uma das abordagens mais comuns, entretanto recentemente pesquisas apontam um novo modelo discriminativo promissor chamado Campo Aleatório Condicional. Nesse trabalho desenvolvemos um arcabouço probabilístico orientado a objetos para a implementação de Campos Aleatórios Condicionais de Cadeias Lineares, uma variante que é bastante utilizada na segmentação de sequências. Esse objetivo foi alcançado a partir da extensão do arcabouço probabilístico ToPS, originalmente projetado para HMMs, GHMMs e outros modelos geradores. Nossa implementação conta com algoritmos de inferência eficientes que paralelizam a computação e alcançam tempos de execução competitivos. Focando na facilidade de utilização, nosso arcabouço conta com um interpretador de modelos que permite a definição e treinamento de Campos Aleatórios Condicionais agilizando a prototipagem e investigação de problemas. Comparamos nossa abordagem com programas já existentes e observamos que nosso arcabouço permite ao usuário maior liberdade na definição de modelos além de obter melhor desempenho com relação ao tempo de execução.
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 19.03.2013
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      BONADIO, Ígor; DURHAM, Alan Mitchell. Desenvolvimento de um arcabouço probabilístico para implementação de campos aleatórios condicionais. 2013.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2013. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-15102018-193536/ >.
    • APA

      Bonadio, Í., & Durham, A. M. (2013). Desenvolvimento de um arcabouço probabilístico para implementação de campos aleatórios condicionais. Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-15102018-193536/
    • NLM

      Bonadio Í, Durham AM. Desenvolvimento de um arcabouço probabilístico para implementação de campos aleatórios condicionais [Internet]. 2013 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-15102018-193536/
    • Vancouver

      Bonadio Í, Durham AM. Desenvolvimento de um arcabouço probabilístico para implementação de campos aleatórios condicionais [Internet]. 2013 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-15102018-193536/


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