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Dissertação (Mestrado)
Caracterização da rede regulatória e descoberta de genes prognósticos em gliomas (2025)
Barcelos, Pedro Marçal; Marques, Otavio Cabral (Orientador)
Unidade: FCF
Assuntos: GLIOMA, REGULAÇÃO GÊNICA, GENES, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
BARCELOS, Pedro Marçal. Caracterização da rede regulatória e descoberta de genes prognósticos em gliomas. 2025. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9142/tde-07042025-123308/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Barcelos, P. M. (2025). Caracterização da rede regulatória e descoberta de genes prognósticos em gliomas (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9142/tde-07042025-123308/
NLM
Barcelos PM. Caracterização da rede regulatória e descoberta de genes prognósticos em gliomas [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9142/tde-07042025-123308/
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Barcelos PM. Caracterização da rede regulatória e descoberta de genes prognósticos em gliomas [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9142/tde-07042025-123308/
Artigo de periodico
BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification (2024)
Santos, Anderson Paulo Avila ; Almeida, Breno Lívio Silva de ; Bonidia, Robson Parmezan ; Stadler, Peter F ; Štefanič, Polonca; Mandic-Mulec, Ines; Rocha, Ulisses Nunes da ; Sanches, Danilo Sipoli ; Carvalho, Andre Carlos Ponce de Leon Ferreira de
Fonte: RNA Biology. Unidades: ICMC, EESC E ICMC
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, APRENDIZAGEM PROFUNDA, REDES NEURAIS, RNA, REGULAÇÃO GÊNICA, GENÔMICA
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ABNT
SANTOS, Anderson Paulo Avila et al. BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification. RNA Biology, v. 21, n. 1, p. 1-12, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1080/15476286.2024.2329451. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Santos, A. P. A., Almeida, B. L. S. de, Bonidia, R. P., Stadler, P. F., Štefanič, P., Mandic-Mulec, I., et al. (2024). BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification. RNA Biology, 21( 1), 1-12. doi:10.1080/15476286.2024.2329451
NLM
Santos APA, Almeida BLS de, Bonidia RP, Stadler PF, Štefanič P, Mandic-Mulec I, Rocha UN da, Sanches DS, Carvalho ACP de LF de. BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification [Internet]. RNA Biology. 2024 ; 21( 1): 1-12.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1080/15476286.2024.2329451
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Santos APA, Almeida BLS de, Bonidia RP, Stadler PF, Štefanič P, Mandic-Mulec I, Rocha UN da, Sanches DS, Carvalho ACP de LF de. BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification [Internet]. RNA Biology. 2024 ; 21( 1): 1-12.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1080/15476286.2024.2329451
Dissertação (Mestrado)
Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280 (2022)
Rossi, Verusca Semmler; Riaño-Pachón, Diego Mauricio (Orientador)
Unidade: CENA
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, BIOLOGIA MOLECULAR VEGETAL, EXPRESSÃO GÊNICA, FILOGENIA, GENES REGULADORES, GENÉTICA MOLECULAR VEGETAL, GENOMAS, REGULAÇÃO GÊNICA
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ABNT
ROSSI, Verusca Semmler. Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-152934/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Rossi, V. S. (2022). Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280 (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-152934/
NLM
Rossi VS. Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280 [Internet]. 2022 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-152934/
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Rossi VS. Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280 [Internet]. 2022 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-152934/
Artigo de periodico
Low salt influences archaellum-based motility, glycerol metabolism, and gas vesicles biogenesis in Halobacterium salinarum (2022)
Onga, Evelyn Ayumi ; Vêncio, Ricardo Zorzetto Nicoliello; Koide, Tie
Fonte: Microorganisms. Unidades: FFCLRP, FMRP, EESC
Assuntos: PROTEÔMICA, REGULAÇÃO GÊNICA, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
ONGA, Evelyn Ayumi e VÊNCIO, Ricardo Zorzetto Nicoliello e KOIDE, Tie. Low salt influences archaellum-based motility, glycerol metabolism, and gas vesicles biogenesis in Halobacterium salinarum. Microorganisms, v. 10, n. 12, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3390/microorganisms10122442. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Onga, E. A., Vêncio, R. Z. N., & Koide, T. (2022). Low salt influences archaellum-based motility, glycerol metabolism, and gas vesicles biogenesis in Halobacterium salinarum. Microorganisms, 10( 12). doi:10.3390/microorganisms10122442
NLM
Onga EA, Vêncio RZN, Koide T. Low salt influences archaellum-based motility, glycerol metabolism, and gas vesicles biogenesis in Halobacterium salinarum [Internet]. Microorganisms. 2022 ; 10( 12):[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.3390/microorganisms10122442
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Onga EA, Vêncio RZN, Koide T. Low salt influences archaellum-based motility, glycerol metabolism, and gas vesicles biogenesis in Halobacterium salinarum [Internet]. Microorganisms. 2022 ; 10( 12):[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.3390/microorganisms10122442
Tese (Doutorado)
Deciphering the architecture/function relationship in complex bacterial promoters through Synthetic Biology approaches (2020)
Monteiro, Lummy Maria Oliveira ; Rocha, Rafael Silva (Orientador)
Unidade: FMRP
Assuntos: FATORES DE TRANSCRIÇÃO, APRENDIZADO COMPUTACIONAL, REGULAÇÃO GÊNICA, BIOINFORMÁTICA, BIOLOGIA SINTÉTICA, ESCHERICHIA COLI, GENOMAS, BACTÉRIAS
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ABNT
MONTEIRO, Lummy Maria Oliveira. Deciphering the architecture/function relationship in complex bacterial promoters through Synthetic Biology approaches. 2020. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2020. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-08022021-151242/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Monteiro, L. M. O. (2020). Deciphering the architecture/function relationship in complex bacterial promoters through Synthetic Biology approaches (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-08022021-151242/
NLM
Monteiro LMO. Deciphering the architecture/function relationship in complex bacterial promoters through Synthetic Biology approaches [Internet]. 2020 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-08022021-151242/
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Monteiro LMO. Deciphering the architecture/function relationship in complex bacterial promoters through Synthetic Biology approaches [Internet]. 2020 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-08022021-151242/
Artigo de periodico
Gene silencing of Diaphorina citri candidate effectors promotes changes in feeding behaviors (2020)
Pacheco, Inaiara de Souza; Galdeano, Diogo Manzano; Maluta, Nathalie Kristine Prado; Lopes, Joao Roberto Spotti ; Machado, Marcos Antonio
Fonte: Scientific Reports. Unidade: ESALQ
Assuntos: BACTÉRIAS FITOPATOGÊNICAS, BIOINFORMÁTICA, COMPORTAMENTO ALIMENTAR, EXPRESSÃO GÊNICA, GREENING (DOENÇA DE PLANTA), INSETOS VETORES, REGULAÇÃO GÊNICA, RNA
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ABNT
PACHECO, Inaiara de Souza et al. Gene silencing of Diaphorina citri candidate effectors promotes changes in feeding behaviors. Scientific Reports, v. 10, p. 1-14, 2020Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1038/s41598-020-62856-5. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Pacheco, I. de S., Galdeano, D. M., Maluta, N. K. P., Lopes, J. R. S., & Machado, M. A. (2020). Gene silencing of Diaphorina citri candidate effectors promotes changes in feeding behaviors. Scientific Reports, 10, 1-14. doi:10.1038/s41598-020-62856-5
NLM
Pacheco I de S, Galdeano DM, Maluta NKP, Lopes JRS, Machado MA. Gene silencing of Diaphorina citri candidate effectors promotes changes in feeding behaviors [Internet]. Scientific Reports. 2020 ;10 1-14.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-020-62856-5
Vancouver
Pacheco I de S, Galdeano DM, Maluta NKP, Lopes JRS, Machado MA. Gene silencing of Diaphorina citri candidate effectors promotes changes in feeding behaviors [Internet]. Scientific Reports. 2020 ;10 1-14.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-020-62856-5
Tese (Doutorado)
Comparação de redes de regulação gênica da placenta em resposta à exposição ao estresse entre sexos (2020)
Barbosa, Andre Rocha ; Brentani, Helena Paula (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, REGULAÇÃO GÊNICA, PLACENTA, ESTRESSE PSICOLÓGICO
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ABNT
BARBOSA, Andre Rocha. Comparação de redes de regulação gênica da placenta em resposta à exposição ao estresse entre sexos . 2020. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2020. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-09122020-200928/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Barbosa, A. R. (2020). Comparação de redes de regulação gênica da placenta em resposta à exposição ao estresse entre sexos (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-09122020-200928/
NLM
Barbosa AR. Comparação de redes de regulação gênica da placenta em resposta à exposição ao estresse entre sexos [Internet]. 2020 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-09122020-200928/
Vancouver
Barbosa AR. Comparação de redes de regulação gênica da placenta em resposta à exposição ao estresse entre sexos [Internet]. 2020 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-09122020-200928/
Trabalho de evento-resumo
Development of novel model for bacterial promoter prediction (2019)
Cassiano, Murilo Henrique Anzolini; Sanches-Medeiros, Ananda ; Silva-Rocha, Rafael
Fonte: Resumos. Nome do evento: Brazilian Congress of Genetics. Unidade: FMRP
Assuntos: REGULAÇÃO GÊNICA, BIOINFORMÁTICA, RNA POLIMERASES, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
CASSIANO, Murilo Henrique Anzolini e SANCHES-MEDEIROS, Ananda e SILVA-ROCHA, Rafael. Development of novel model for bacterial promoter prediction. 2019, Anais.. Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2019. Disponível em: https://www.sbg.org.br/sites/default/files/e_book_genetica2019_online_0.pdf. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Cassiano, M. H. A., Sanches-Medeiros, A., & Silva-Rocha, R. (2019). Development of novel model for bacterial promoter prediction. In Resumos. Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética. Recuperado de https://www.sbg.org.br/sites/default/files/e_book_genetica2019_online_0.pdf
NLM
Cassiano MHA, Sanches-Medeiros A, Silva-Rocha R. Development of novel model for bacterial promoter prediction [Internet]. Resumos. 2019 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.sbg.org.br/sites/default/files/e_book_genetica2019_online_0.pdf
Vancouver
Cassiano MHA, Sanches-Medeiros A, Silva-Rocha R. Development of novel model for bacterial promoter prediction [Internet]. Resumos. 2019 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.sbg.org.br/sites/default/files/e_book_genetica2019_online_0.pdf
Tese (Doutorado)
Estudo temporal integrado de redes de co-expressão gênica e microRNAs em um modelo experimental de convulsão febril induzida por hipertermia (2018)
Khaled, Nathália Amato; Moreira Filho, Carlos Alberto (Orientador)
Unidade: FM
Assuntos: HIPOCAMPO, EPILEPSIA, CONVULSÕES, FEBRE, MICRORNAS, BIOINFORMÁTICA, REGULAÇÃO GÊNICA
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ABNT
KHALED, Nathália Amato. Estudo temporal integrado de redes de co-expressão gênica e microRNAs em um modelo experimental de convulsão febril induzida por hipertermia. 2018. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-13022019-151025/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Khaled, N. A. (2018). Estudo temporal integrado de redes de co-expressão gênica e microRNAs em um modelo experimental de convulsão febril induzida por hipertermia (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-13022019-151025/
NLM
Khaled NA. Estudo temporal integrado de redes de co-expressão gênica e microRNAs em um modelo experimental de convulsão febril induzida por hipertermia [Internet]. 2018 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-13022019-151025/
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Khaled NA. Estudo temporal integrado de redes de co-expressão gênica e microRNAs em um modelo experimental de convulsão febril induzida por hipertermia [Internet]. 2018 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-13022019-151025/
Dissertação (Mestrado)
Halobacterium salinarum NRC-1: rede de regulação gênica e sua análise probabilística (2018)
Crocetti, Guilherme Martins; Vencio, Ricardo Zorzetto Nicoliello (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, REGULAÇÃO GÊNICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
CROCETTI, Guilherme Martins. Halobacterium salinarum NRC-1: rede de regulação gênica e sua análise probabilística. 2018. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-31052018-172109/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Crocetti, G. M. (2018). Halobacterium salinarum NRC-1: rede de regulação gênica e sua análise probabilística (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-31052018-172109/
NLM
Crocetti GM. Halobacterium salinarum NRC-1: rede de regulação gênica e sua análise probabilística [Internet]. 2018 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-31052018-172109/
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Crocetti GM. Halobacterium salinarum NRC-1: rede de regulação gênica e sua análise probabilística [Internet]. 2018 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-31052018-172109/
Tese (Doutorado)
Estudos sobre a organização genômica, evolução e expressão de microRNAs (2015)
França, Gustavo Starvaggi; Camargo, Anamaria Aranha (Orientador)
Unidade: IQ
Assuntos: EXPRESSÃO GÊNICA, REGULAÇÃO GÊNICA, BIOINFORMÁTICA, EVOLUÇÃO MOLECULAR, NEOPLASIAS COLORRETAIS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
FRANÇA, Gustavo Starvaggi. Estudos sobre a organização genômica, evolução e expressão de microRNAs. 2015. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2015. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-05042016-135626/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
França, G. S. (2015). Estudos sobre a organização genômica, evolução e expressão de microRNAs (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-05042016-135626/
NLM
França GS. Estudos sobre a organização genômica, evolução e expressão de microRNAs [Internet]. 2015 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-05042016-135626/
Vancouver
França GS. Estudos sobre a organização genômica, evolução e expressão de microRNAs [Internet]. 2015 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-05042016-135626/
Artigo de periodico
Entropic Biological Score: a cell cycle investigation for GRN inference (2014)
Lopes, Fabrício Martins; Ray, Shubhra Sankar; Hashimoto, Ronaldo Fumio ; César Júnior, Roberto Marcondes
Fonte: Gene. Unidade: IME
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, EXPRESSÃO GÊNICA, REGULAÇÃO GÊNICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
LOPES, Fabrício Martins et al. Entropic Biological Score: a cell cycle investigation for GRN inference. Gene, v. 541, n. 2, p. 129\2013137, 2014Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.gene.2014.03.010. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Lopes, F. M., Ray, S. S., Hashimoto, R. F., & César Júnior, R. M. (2014). Entropic Biological Score: a cell cycle investigation for GRN inference. Gene, 541( 2), 129\2013137. doi:10.1016/j.gene.2014.03.010
NLM
Lopes FM, Ray SS, Hashimoto RF, César Júnior RM. Entropic Biological Score: a cell cycle investigation for GRN inference [Internet]. Gene. 2014 ; 541( 2): 129\2013137.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.gene.2014.03.010
Vancouver
Lopes FM, Ray SS, Hashimoto RF, César Júnior RM. Entropic Biological Score: a cell cycle investigation for GRN inference [Internet]. Gene. 2014 ; 541( 2): 129\2013137.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.gene.2014.03.010
Tese (Doutorado)
Aplicação de métodos estatísticos e computacionais para o estudo da cis-regulação da expressão gênica (2010)
Almeida, Márcio Augusto Afonso de; Oliveira, Paulo Sérgio Lopes de (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, REGULAÇÃO GÊNICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ALMEIDA, Márcio Augusto Afonso de. Aplicação de métodos estatísticos e computacionais para o estudo da cis-regulação da expressão gênica. 2010. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2010. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14122010-095648/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Almeida, M. A. A. de. (2010). Aplicação de métodos estatísticos e computacionais para o estudo da cis-regulação da expressão gênica (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14122010-095648/
NLM
Almeida MAA de. Aplicação de métodos estatísticos e computacionais para o estudo da cis-regulação da expressão gênica [Internet]. 2010 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14122010-095648/
Vancouver
Almeida MAA de. Aplicação de métodos estatísticos e computacionais para o estudo da cis-regulação da expressão gênica [Internet]. 2010 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14122010-095648/

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