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  • Artigo de periodico

    AI will create the next generation of user-friendly interfaces (2025)

    Nakaya, Helder Takashi Imoto

    Source: Nature Reviews Molecular Cell Biology. Unidade: FCF

    Subjects: INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL, BIOINFORMÁTICA

    Acesso à fonteDOIHow to cite
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    • ABNT

      NAKAYA, Helder Takashi Imoto. AI will create the next generation of user-friendly interfaces. Nature Reviews Molecular Cell Biology, v. 26, 2025Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1038/s41580-025-00900-w. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Nakaya, H. T. I. (2025). AI will create the next generation of user-friendly interfaces. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 26. doi:10.1038/s41580-025-00900-w

    • NLM

      Nakaya HTI. AI will create the next generation of user-friendly interfaces [Internet]. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2025 ; 26[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41580-025-00900-w

    • Vancouver

      Nakaya HTI. AI will create the next generation of user-friendly interfaces [Internet]. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2025 ; 26[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41580-025-00900-w

  • Dissertação (Mestrado)

    Segmentation of oral lesions through convolutional neural networks (2025)

    Souza, Eduardo Santos Carlos de ; Carvalho, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de (Orientador)

    Unidade: ICMC

    Subjects: INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL, REDES NEURAIS, NEOPLASIAS, LESÕES CANCERIZÁVEIS, APRENDIZADO COMPUTACIONAL, BIOINFORMÁTICA

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
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    • ABNT

      SOUZA, Eduardo Santos Carlos de. Segmentation of oral lesions through convolutional neural networks. 2025. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-29072025-102150/. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Souza, E. S. C. de. (2025). Segmentation of oral lesions through convolutional neural networks (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-29072025-102150/

    • NLM

      Souza ESC de. Segmentation of oral lesions through convolutional neural networks [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-29072025-102150/

    • Vancouver

      Souza ESC de. Segmentation of oral lesions through convolutional neural networks [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-29072025-102150/

  • Artigo de periodico

    Analysis of clonal evolution in cancer: a computational perspective (2025)

    Ribeiro, Paulo Henrique ; Simão, Adenilso da Silva

    Source: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. Unidade: ICMC

    Subjects: NEOPLASIAS, BIOINFORMÁTICA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO

    PrivadoAcesso à fonteDOIHow to cite
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    • ABNT

      RIBEIRO, Paulo Henrique e SIMÃO, Adenilso da Silva. Analysis of clonal evolution in cancer: a computational perspective. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, v. 23, n. 2, p. 2531001-1-2531001-32, 2025Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1142/S0219720025310018. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Ribeiro, P. H., & Simão, A. da S. (2025). Analysis of clonal evolution in cancer: a computational perspective. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 23( 2), 2531001-1-2531001-32. doi:10.1142/S0219720025310018

    • NLM

      Ribeiro PH, Simão A da S. Analysis of clonal evolution in cancer: a computational perspective [Internet]. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 2025 ; 23( 2): 2531001-1-2531001-32.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://doi.org/10.1142/S0219720025310018

    • Vancouver

      Ribeiro PH, Simão A da S. Analysis of clonal evolution in cancer: a computational perspective [Internet]. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 2025 ; 23( 2): 2531001-1-2531001-32.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://doi.org/10.1142/S0219720025310018

  • Dissertação (Mestrado)

    Busca por sítios de processamento específicos da ribonuclease NZ (VNG_RS05855) utilizando métodos de bioinformática (2025)

    Almeida, João Paulo Facio ; Koide, Tie (Orientador) ; Vêncio, Ricardo Zorzetto Nicoliello (coorient)

    Unidade: FMRP

    Subjects: BIOINFORMÁTICA, BIOQUÍMICA, MICROBIOLOGIA, RNA

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
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    • ABNT

      ALMEIDA, João Paulo Facio. Busca por sítios de processamento específicos da ribonuclease NZ (VNG_RS05855) utilizando métodos de bioinformática. 2025. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-24062025-095651/. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Almeida, J. P. F. (2025). Busca por sítios de processamento específicos da ribonuclease NZ (VNG_RS05855) utilizando métodos de bioinformática (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-24062025-095651/

    • NLM

      Almeida JPF. Busca por sítios de processamento específicos da ribonuclease NZ (VNG_RS05855) utilizando métodos de bioinformática [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-24062025-095651/

    • Vancouver

      Almeida JPF. Busca por sítios de processamento específicos da ribonuclease NZ (VNG_RS05855) utilizando métodos de bioinformática [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-24062025-095651/

  • Dissertação (Mestrado)

    Alinhamento de pares de sequências biológicas com privacidade preservada: uma abordagem homomórfica (2025)

    Ferreira, Bryan Kano; Terada, Routo (Orientador)

    Unidade: IME

    Subjects: BIOINFORMÁTICA, CRIPTOLOGIA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, PRIVACIDADE

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
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    • ABNT

      FERREIRA, Bryan Kano. Alinhamento de pares de sequências biológicas com privacidade preservada: uma abordagem homomórfica. 2025. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-26092025-041931/. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Ferreira, B. K. (2025). Alinhamento de pares de sequências biológicas com privacidade preservada: uma abordagem homomórfica (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-26092025-041931/

    • NLM

      Ferreira BK. Alinhamento de pares de sequências biológicas com privacidade preservada: uma abordagem homomórfica [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-26092025-041931/

    • Vancouver

      Ferreira BK. Alinhamento de pares de sequências biológicas com privacidade preservada: uma abordagem homomórfica [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-26092025-041931/

  • Tese (Doutorado)

    Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum (2025)

    Muñoz-Pérez, Jorge Mario; Pachón, Diego Mauricio Riaño (Orientador)

    Unidade: CENA

    Subjects: BIOINFORMÁTICA, GENÔMICA, CANA-DE-AÇÚCAR, SORGO

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
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    • ABNT

      MUÑOZ-PÉREZ, Jorge Mario. Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-25042025-121333/. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Muñoz-Pérez, J. M. (2025). Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-25042025-121333/

    • NLM

      Muñoz-Pérez JM. Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-25042025-121333/

    • Vancouver

      Muñoz-Pérez JM. Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-25042025-121333/

  • Artigo de jornal-dep/entr

    DNA histórico tem potencial para revolucionar o conhecimento evolutivo das espécies [Depoimento] (2025)

    Grant, Taran ; Nakamura, Daniel

    Source: Jornal da USP. Ciências. Unidades: IB, Interunidades em Bioinformática

    Subjects: BIOLOGIA MOLECULAR, GENÔMICA, BIOINFORMÁTICA

    Acesso à fonteHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      GRANT, Taran e NAKAMURA, Daniel. DNA histórico tem potencial para revolucionar o conhecimento evolutivo das espécies [Depoimento]. Jornal da USP. Ciências. São Paulo: Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo. Disponível em: https://jornal.usp.br/ciencias/dna-historico-tem-potencial-para-revolucionar-a-historia-evolutiva-das-especies/. Acesso em: 19 nov. 2025. , 2025

    • APA

      Grant, T., & Nakamura, D. (2025). DNA histórico tem potencial para revolucionar o conhecimento evolutivo das espécies [Depoimento]. Jornal da USP. Ciências. São Paulo: Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo. Recuperado de https://jornal.usp.br/ciencias/dna-historico-tem-potencial-para-revolucionar-a-historia-evolutiva-das-especies/

    • NLM

      Grant T, Nakamura D. DNA histórico tem potencial para revolucionar o conhecimento evolutivo das espécies [Depoimento] [Internet]. Jornal da USP. Ciências. 2025 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://jornal.usp.br/ciencias/dna-historico-tem-potencial-para-revolucionar-a-historia-evolutiva-das-especies/

    • Vancouver

      Grant T, Nakamura D. DNA histórico tem potencial para revolucionar o conhecimento evolutivo das espécies [Depoimento] [Internet]. Jornal da USP. Ciências. 2025 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://jornal.usp.br/ciencias/dna-historico-tem-potencial-para-revolucionar-a-historia-evolutiva-das-especies/

  • Trabalho de evento-resumo

    Identification of IP3 pathway components in Plasmodium falciparum and P. chabaudi using gene co-expression networks (2025)

    Cano, Lyang Higa; Garcia, Celia Regina da Silva; Hashimoto, Ronaldo Fumio

    Source: Abstracts/Posters. Conference titles: Brazilian Symposium on Bioinformatics - BSB. Unidades: FCF, IME, Interunidades em Bioinformática

    Subjects: PLASMODIUM, MELATONIN, CA 2+ , IP3 RECEPTOR, GENE CO-EXPRESSION NETWORKS., PLASMODIUM FALCIPARUM, MALÁRIA, MELATONINA, BIOINFORMÁTICA, EXPRESSÃO GÊNICA

    Versão PublicadaAcesso à fonteHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      CANO, Lyang Higa e GARCIA, Celia Regina da Silva e HASHIMOTO, Ronaldo Fumio. Identification of IP3 pathway components in Plasmodium falciparum and P. chabaudi using gene co-expression networks. 2025, Anais.. Porto Alegre: SBC, 2025. p. 1-3. Disponível em: http://bsb.sbc.org.br/2025/wp-content/uploads/sites/9/2025/09/Identification-of-IP3-Pathway-Components-in-Plasmodium-falciparum-and-P.-chabaudi-Using-Gene-Co-expression-Networks.pdf. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Cano, L. H., Garcia, C. R. da S., & Hashimoto, R. F. (2025). Identification of IP3 pathway components in Plasmodium falciparum and P. chabaudi using gene co-expression networks. In Abstracts/Posters (p. 1-3). Porto Alegre: SBC. Recuperado de http://bsb.sbc.org.br/2025/wp-content/uploads/sites/9/2025/09/Identification-of-IP3-Pathway-Components-in-Plasmodium-falciparum-and-P.-chabaudi-Using-Gene-Co-expression-Networks.pdf

    • NLM

      Cano LH, Garcia CR da S, Hashimoto RF. Identification of IP3 pathway components in Plasmodium falciparum and P. chabaudi using gene co-expression networks [Internet]. Abstracts/Posters. 2025 ; 1-3.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: http://bsb.sbc.org.br/2025/wp-content/uploads/sites/9/2025/09/Identification-of-IP3-Pathway-Components-in-Plasmodium-falciparum-and-P.-chabaudi-Using-Gene-Co-expression-Networks.pdf

    • Vancouver

      Cano LH, Garcia CR da S, Hashimoto RF. Identification of IP3 pathway components in Plasmodium falciparum and P. chabaudi using gene co-expression networks [Internet]. Abstracts/Posters. 2025 ; 1-3.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: http://bsb.sbc.org.br/2025/wp-content/uploads/sites/9/2025/09/Identification-of-IP3-Pathway-Components-in-Plasmodium-falciparum-and-P.-chabaudi-Using-Gene-Co-expression-Networks.pdf

  • Artigo de periodico

    Using reinforcement learning in genome assembly: in-depth analysis of a Q-learning assembler (2025)

    Padovani, Kleber ; Borges, Rafael Cabral ; Xavier, Roberto; Carvalho, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de ; Reali Costa, Anna Helena ; Chateau, Annie; Alves, Ronnie

    Source: Frontiers in Bioinformatics. Unidades: ICMC, EP

    Subjects: APRENDIZADO COMPUTACIONAL, BIOINFORMÁTICA, GENÔMICA

    Versão PublicadaAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      PADOVANI, Kleber et al. Using reinforcement learning in genome assembly: in-depth analysis of a Q-learning assembler. Frontiers in Bioinformatics, v. 5, p. 1-12, 2025Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3389/fbinf.2025.1633623. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Padovani, K., Borges, R. C., Xavier, R., Carvalho, A. C. P. de L. F. de, Reali Costa, A. H., Chateau, A., & Alves, R. (2025). Using reinforcement learning in genome assembly: in-depth analysis of a Q-learning assembler. Frontiers in Bioinformatics, 5, 1-12. doi:10.3389/fbinf.2025.1633623

    • NLM

      Padovani K, Borges RC, Xavier R, Carvalho ACP de LF de, Reali Costa AH, Chateau A, Alves R. Using reinforcement learning in genome assembly: in-depth analysis of a Q-learning assembler [Internet]. Frontiers in Bioinformatics. 2025 ; 5 1-12.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://doi.org/10.3389/fbinf.2025.1633623

    • Vancouver

      Padovani K, Borges RC, Xavier R, Carvalho ACP de LF de, Reali Costa AH, Chateau A, Alves R. Using reinforcement learning in genome assembly: in-depth analysis of a Q-learning assembler [Internet]. Frontiers in Bioinformatics. 2025 ; 5 1-12.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://doi.org/10.3389/fbinf.2025.1633623

  • Artigo de periodico

    Antiviral Action against SARS-CoV-2 of a synthetic peptide based on a novel defensin present in the transcriptome of the fire salamander (Salamandra salamandra) (2024)

    Barros, Ana Luisa Alves Nogueira ; Silva, Vladimir Costa ; Ribeiro Junior, Atvaldo F; Cardoso, Miguel G; Costa, Samuel R; Moraes, Carolina Borsoi ; Barbosa, Cecília G; Coleone, Alex P; Simões, Rafael Plana ; Cabral, Wanessa F; Falcão, Raul M; Vasconcelos, Andreanne Gomes ; Rocha, Jefferson Almeida ; Arcanjo, Daniel Dias Rufino ; Batagin Neto, Augusto ; Borges, Tatiana Karla dos Santos ; Gonçalves, João; Freitas-Junior, Lucio H. G; Eaton, Peter; Marani, Mariela ; Kato, Massuo Jorge ; Plácido, Alexandra ; Leite, José Roberto S. A

    Source: Pharmaceutics. Unidade: IQ

    Subjects: CAUDATA, ANTIVIRAIS, PEPTÍDEOS, BIOINFORMÁTICA

    Acesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      BARROS, Ana Luisa Alves Nogueira et al. Antiviral Action against SARS-CoV-2 of a synthetic peptide based on a novel defensin present in the transcriptome of the fire salamander (Salamandra salamandra). Pharmaceutics, v. 16, p. 1-19 art. 190, 2024Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.3390/pharmaceutics16020190. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Barros, A. L. A. N., Silva, V. C., Ribeiro Junior, A. F., Cardoso, M. G., Costa, S. R., Moraes, C. B., et al. (2024). Antiviral Action against SARS-CoV-2 of a synthetic peptide based on a novel defensin present in the transcriptome of the fire salamander (Salamandra salamandra). Pharmaceutics, 16, 1-19 art. 190. doi:10.3390/pharmaceutics16020190

    • NLM

      Barros ALAN, Silva VC, Ribeiro Junior AF, Cardoso MG, Costa SR, Moraes CB, Barbosa CG, Coleone AP, Simões RP, Cabral WF, Falcão RM, Vasconcelos AG, Rocha JA, Arcanjo DDR, Batagin Neto A, Borges TK dos S, Gonçalves J, Freitas-Junior LHG, Eaton P, Marani M, Kato MJ, Plácido A, Leite JRSA. Antiviral Action against SARS-CoV-2 of a synthetic peptide based on a novel defensin present in the transcriptome of the fire salamander (Salamandra salamandra) [Internet]. Pharmaceutics. 2024 ; 16 1-19 art. 190.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://dx.doi.org/10.3390/pharmaceutics16020190

    • Vancouver

      Barros ALAN, Silva VC, Ribeiro Junior AF, Cardoso MG, Costa SR, Moraes CB, Barbosa CG, Coleone AP, Simões RP, Cabral WF, Falcão RM, Vasconcelos AG, Rocha JA, Arcanjo DDR, Batagin Neto A, Borges TK dos S, Gonçalves J, Freitas-Junior LHG, Eaton P, Marani M, Kato MJ, Plácido A, Leite JRSA. Antiviral Action against SARS-CoV-2 of a synthetic peptide based on a novel defensin present in the transcriptome of the fire salamander (Salamandra salamandra) [Internet]. Pharmaceutics. 2024 ; 16 1-19 art. 190.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://dx.doi.org/10.3390/pharmaceutics16020190

  • Artigo de periodico

    Vesicle protrusion induced by antimicrobial peptides suggests common carpet mechanism for short antimicrobial peptides (2024)

    Park, Peter; Matsubara, Danilo Kiyoshi ; Barzotto, Domenico Riolfi ; Lima, Filipe S. ; Chaimovich Guralnik, Hernan ; Marrink, Siewert Jan ; Cuccovia, Iolanda Midea

    Source: Scientific Reports. Unidades: IQ, FCF

    Subjects: PEPTÍDEOS, BIOQUÍMICA, BIOINFORMÁTICA, QUÍMICA DE SUPERFÍCIE

    Acesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      PARK, Peter et al. Vesicle protrusion induced by antimicrobial peptides suggests common carpet mechanism for short antimicrobial peptides. Scientific Reports, v. 14, p. 1-13 art. 9701, 2024Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-60601-w. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Park, P., Matsubara, D. K., Barzotto, D. R., Lima, F. S., Chaimovich Guralnik, H., Marrink, S. J., & Cuccovia, I. M. (2024). Vesicle protrusion induced by antimicrobial peptides suggests common carpet mechanism for short antimicrobial peptides. Scientific Reports, 14, 1-13 art. 9701. doi:10.1038/s41598-024-60601-w

    • NLM

      Park P, Matsubara DK, Barzotto DR, Lima FS, Chaimovich Guralnik H, Marrink SJ, Cuccovia IM. Vesicle protrusion induced by antimicrobial peptides suggests common carpet mechanism for short antimicrobial peptides [Internet]. Scientific Reports. 2024 ; 14 1-13 art. 9701.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-60601-w

    • Vancouver

      Park P, Matsubara DK, Barzotto DR, Lima FS, Chaimovich Guralnik H, Marrink SJ, Cuccovia IM. Vesicle protrusion induced by antimicrobial peptides suggests common carpet mechanism for short antimicrobial peptides [Internet]. Scientific Reports. 2024 ; 14 1-13 art. 9701.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-60601-w

  • Tese (Doutorado)

    Exploration of non-coding RNA in complex microbial communities with machine learning (2024)

    Santos, Anderson Paulo Avila ; Carvalho, Andre Carlos Ponce de Leon Ferreira de (Orientador)

    Unidade: ICMC

    Subjects: APRENDIZADO COMPUTACIONAL, RNA, METADADOS, BIOGEOGRAFIA, BIOINFORMÁTICA

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      SANTOS, Anderson Paulo Avila. Exploration of non-coding RNA in complex microbial communities with machine learning. 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-19082024-091042/. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Santos, A. P. A. (2024). Exploration of non-coding RNA in complex microbial communities with machine learning (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-19082024-091042/

    • NLM

      Santos APA. Exploration of non-coding RNA in complex microbial communities with machine learning [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-19082024-091042/

    • Vancouver

      Santos APA. Exploration of non-coding RNA in complex microbial communities with machine learning [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-19082024-091042/

  • Dissertação (Mestrado)

    Identificação de vias de sinalização imunossupressoras associada à infecção por SARS-CoV-2 em células epiteliais nasofaríngeas de pacientes do sexo masculino e feminino (2024)

    Costa, André Luiz Caliari ; Squire, Jeremy Andrew (Orientador)

    Unidade: FMRP

    Subjects: NEOPLASIAS, BIOINFORMÁTICA, COVID-19, SISTEMAS IMUNOLÓGICOS ARTIFICIAIS

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      COSTA, André Luiz Caliari. Identificação de vias de sinalização imunossupressoras associada à infecção por SARS-CoV-2 em células epiteliais nasofaríngeas de pacientes do sexo masculino e feminino. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-11042024-103009/. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Costa, A. L. C. (2024). Identificação de vias de sinalização imunossupressoras associada à infecção por SARS-CoV-2 em células epiteliais nasofaríngeas de pacientes do sexo masculino e feminino (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-11042024-103009/

    • NLM

      Costa ALC. Identificação de vias de sinalização imunossupressoras associada à infecção por SARS-CoV-2 em células epiteliais nasofaríngeas de pacientes do sexo masculino e feminino [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-11042024-103009/

    • Vancouver

      Costa ALC. Identificação de vias de sinalização imunossupressoras associada à infecção por SARS-CoV-2 em células epiteliais nasofaríngeas de pacientes do sexo masculino e feminino [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-11042024-103009/

  • Dissertação (Mestrado)

    Statistical Methods for Directed Graphs Based on the Graph Spectrum (2024)

    Villela, Victor Chavauty; Fujita, André (Orientador)

    Unidade: Interunidades em Bioinformática

    Subjects: BIOINFORMÁTICA, REDES COMPLEXAS

    How to cite
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    • ABNT

      VILLELA, Victor Chavauty. Statistical Methods for Directed Graphs Based on the Graph Spectrum. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. . Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Villela, V. C. (2024). Statistical Methods for Directed Graphs Based on the Graph Spectrum (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo.

    • NLM

      Villela VC. Statistical Methods for Directed Graphs Based on the Graph Spectrum. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ]

    • Vancouver

      Villela VC. Statistical Methods for Directed Graphs Based on the Graph Spectrum. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ]

  • Tese (Doutorado)

    Advanced strategies in soybean breeding for enhanced oil, yield and balanced protein in the face of climate change (2024)

    Fagundes, Talieisse Gomes ; Pinheiro, Jose Baldin (Orientador)

    Unidade: ESALQ

    Subjects: APRENDIZADO COMPUTACIONAL, BIOINFORMÁTICA, GENÔMICA, MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL, MUDANÇA CLIMÁTICA, ÓLEO DE SOJA, PROTEÍNAS DE PLANTAS, SECA, SOJA

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      FAGUNDES, Talieisse Gomes. Advanced strategies in soybean breeding for enhanced oil, yield and balanced protein in the face of climate change. 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13032025-142733/. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Fagundes, T. G. (2024). Advanced strategies in soybean breeding for enhanced oil, yield and balanced protein in the face of climate change (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13032025-142733/

    • NLM

      Fagundes TG. Advanced strategies in soybean breeding for enhanced oil, yield and balanced protein in the face of climate change [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13032025-142733/

    • Vancouver

      Fagundes TG. Advanced strategies in soybean breeding for enhanced oil, yield and balanced protein in the face of climate change [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13032025-142733/

  • Artigo de periodico

    BioPrediction-RPI: democratizing the prediction of interaction between non-coding RNA and protein with end-to-end machine learning (2024)

    Florentino, Bruno Rafael ; Bonidia, Robson Parmezan ; Sanches, Natan Henrique ; Rocha, Ulisses Nunes da ; Carvalho, Andre Carlos Ponce de Leon Ferreira de

    Source: Computational and Structural Biotechnology Journal. Unidade: ICMC

    Subjects: APRENDIZADO COMPUTACIONAL, ALGORITMOS ÚTEIS E ESPECÍFICOS, BIOINFORMÁTICA, GENÔMICA

    Versão PublicadaAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      FLORENTINO, Bruno Rafael et al. BioPrediction-RPI: democratizing the prediction of interaction between non-coding RNA and protein with end-to-end machine learning. Computational and Structural Biotechnology Journal, v. 23, p. 2267-2276, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2024.05.031. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Florentino, B. R., Bonidia, R. P., Sanches, N. H., Rocha, U. N. da, & Carvalho, A. C. P. de L. F. de. (2024). BioPrediction-RPI: democratizing the prediction of interaction between non-coding RNA and protein with end-to-end machine learning. Computational and Structural Biotechnology Journal, 23, 2267-2276. doi:10.1016/j.csbj.2024.05.031

    • NLM

      Florentino BR, Bonidia RP, Sanches NH, Rocha UN da, Carvalho ACP de LF de. BioPrediction-RPI: democratizing the prediction of interaction between non-coding RNA and protein with end-to-end machine learning [Internet]. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2024 ; 23 2267-2276.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2024.05.031

    • Vancouver

      Florentino BR, Bonidia RP, Sanches NH, Rocha UN da, Carvalho ACP de LF de. BioPrediction-RPI: democratizing the prediction of interaction between non-coding RNA and protein with end-to-end machine learning [Internet]. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2024 ; 23 2267-2276.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2024.05.031

  • Tese (Doutorado)

    BioAutoML: Democratizing Machine Learning in Life Sciences (2024)

    Bonidia, Robson Parmezan ; Carvalho, Andre Carlos Ponce de Leon Ferreira de (Orientador)

    Unidade: ICMC

    Subjects: APRENDIZADO COMPUTACIONAL, BIOINFORMÁTICA, ANÁLISE DE DADOS, ASSISTÊNCIA À SAÚDE

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      BONIDIA, Robson Parmezan. BioAutoML: Democratizing Machine Learning in Life Sciences. 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-01042024-092414/. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Bonidia, R. P. (2024). BioAutoML: Democratizing Machine Learning in Life Sciences (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-01042024-092414/

    • NLM

      Bonidia RP. BioAutoML: Democratizing Machine Learning in Life Sciences [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-01042024-092414/

    • Vancouver

      Bonidia RP. BioAutoML: Democratizing Machine Learning in Life Sciences [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-01042024-092414/

  • Dissertação (Mestrado)

    Métodos eficientes para colapsagem e seleção de SNPs raros em dados familiares (2024)

    Noli, Ana Fernanda ; Zuanetti, Daiane Aparecida (Orientador)

    Unidade: Interinstitucional de Pós-Graduação em Estatística

    Subjects: VARIAÇÃO GENÉTICA, ESTATÍSTICA, BIOINFORMÁTICA

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      NOLI, Ana Fernanda. Métodos eficientes para colapsagem e seleção de SNPs raros em dados familiares. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/104/104131/tde-03092024-085008/. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Noli, A. F. (2024). Métodos eficientes para colapsagem e seleção de SNPs raros em dados familiares (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/104/104131/tde-03092024-085008/

    • NLM

      Noli AF. Métodos eficientes para colapsagem e seleção de SNPs raros em dados familiares [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/104/104131/tde-03092024-085008/

    • Vancouver

      Noli AF. Métodos eficientes para colapsagem e seleção de SNPs raros em dados familiares [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/104/104131/tde-03092024-085008/

  • Dissertação (Mestrado)

    Análise da ancestralidades genética da população de São Paulo (2024)

    Amemiya, Raphael Bruno; Matioli, Sergio Russo (Orientador)

    Unidade: Interunidades em Bioinformática

    Subjects: GENEALOGIA, BIOINFORMÁTICA, GENÉTICA

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      AMEMIYA, Raphael Bruno. Análise da ancestralidades genética da população de São Paulo. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17072024-053428/. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Amemiya, R. B. (2024). Análise da ancestralidades genética da população de São Paulo (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17072024-053428/

    • NLM

      Amemiya RB. Análise da ancestralidades genética da população de São Paulo [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17072024-053428/

    • Vancouver

      Amemiya RB. Análise da ancestralidades genética da população de São Paulo [Internet]. 2024 ;[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17072024-053428/

  • Artigo de periodico

    Towards more reproducibility in vegetation research (2024)

    Sperandii, Marta Gaia ; Bazzichetto, Manuele ; Mendieta‐Leiva, Glenda ; Schmidtlein, Sebastian ; Bott, Michael ; Lima, Renato Augusto Ferreira de ; Pillar, Valério D ; Price, Jodi N ; Wagner, Viktoria ; Chytrý, Milan

    Source: Journal of Vegetation Science. Unidade: ESALQ

    Subjects: ANÁLISE DE DADOS, BIOINFORMÁTICA, PESQUISA CIENTÍFICA, PRODUÇÃO CIENTÍFICA, REPRODUTIBILIDADE DE RESULTADOS, VEGETAÇÃO

    PrivadoAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      SPERANDII, Marta Gaia et al. Towards more reproducibility in vegetation research. Journal of Vegetation Science, v. 35, p. 1-6, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1111/jvs.13224. Acesso em: 19 nov. 2025.

    • APA

      Sperandii, M. G., Bazzichetto, M., Mendieta‐Leiva, G., Schmidtlein, S., Bott, M., Lima, R. A. F. de, et al. (2024). Towards more reproducibility in vegetation research. Journal of Vegetation Science, 35, 1-6. doi:10.1111/jvs.13224

    • NLM

      Sperandii MG, Bazzichetto M, Mendieta‐Leiva G, Schmidtlein S, Bott M, Lima RAF de, Pillar VD, Price JN, Wagner V, Chytrý M. Towards more reproducibility in vegetation research [Internet]. Journal of Vegetation Science. 2024 ; 35 1-6.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://doi.org/10.1111/jvs.13224

    • Vancouver

      Sperandii MG, Bazzichetto M, Mendieta‐Leiva G, Schmidtlein S, Bott M, Lima RAF de, Pillar VD, Price JN, Wagner V, Chytrý M. Towards more reproducibility in vegetation research [Internet]. Journal of Vegetation Science. 2024 ; 35 1-6.[citado 2025 nov. 19 ] Available from: https://doi.org/10.1111/jvs.13224

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