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Artigo de periodico
geneRFinder: gene finding in distinct metagenomic data complexities (2021)
Silva, Raíssa; Padovani, Kleber ; Goes, Fabiana Rodrigues de ; Alves, Ronnie
Source: BMC Bioinformatics. Unidade: ICMC
Subjects: APRENDIZADO COMPUTACIONAL, GENÔMICA, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
SILVA, Raíssa et al. geneRFinder: gene finding in distinct metagenomic data complexities. BMC Bioinformatics, v. 22, p. 1-17, 2021Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12859-021-03997-w. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Silva, R., Padovani, K., Goes, F. R. de, & Alves, R. (2021). geneRFinder: gene finding in distinct metagenomic data complexities. BMC Bioinformatics, 22, 1-17. doi:10.1186/s12859-021-03997-w
NLM
Silva R, Padovani K, Goes FR de, Alves R. geneRFinder: gene finding in distinct metagenomic data complexities [Internet]. BMC Bioinformatics. 2021 ; 22 1-17.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-021-03997-w
Vancouver
Silva R, Padovani K, Goes FR de, Alves R. geneRFinder: gene finding in distinct metagenomic data complexities [Internet]. BMC Bioinformatics. 2021 ; 22 1-17.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-021-03997-w
Artigo de periodico
CEMiTool: a bioconductor package for performing comprehensive modular co-expression analyses (2018)
Russo, Pedro de Sá Tavares; Ferreira, Gustavo Rodrigues; Cardozo, Lucas Esteves; Bürger, Matheus Carvalho; Arias-Carrasco, Raul; Maruyama, Sandra Regina; Hirata, Thiago Dominguez Crespo ; Lima, Diógenes Saulo de; Passos, Fernando Marcon; Fukutani, Kiyoshi Ferreira; Lever, Melissa; Silva, João Santana da; Maracajá-Coutinho, Vinicius; Nakaya, Helder Takashi Imoto
Source: BMC Bioinformatics. Unidades: FMRP, FCF
Subjects: LEISHMANIA, TRANSCRIÇÃO GÊNICA, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
RUSSO, Pedro de Sá Tavares et al. CEMiTool: a bioconductor package for performing comprehensive modular co-expression analyses. BMC Bioinformatics, v. 19, n. 1, p. 1-13 art. 56, 2018Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12859-018-2053-1. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Russo, P. de S. T., Ferreira, G. R., Cardozo, L. E., Bürger, M. C., Arias-Carrasco, R., Maruyama, S. R., et al. (2018). CEMiTool: a bioconductor package for performing comprehensive modular co-expression analyses. BMC Bioinformatics, 19( 1), 1-13 art. 56. doi:10.1186/s12859-018-2053-1
NLM
Russo P de ST, Ferreira GR, Cardozo LE, Bürger MC, Arias-Carrasco R, Maruyama SR, Hirata TDC, Lima DS de, Passos FM, Fukutani KF, Lever M, Silva JS da, Maracajá-Coutinho V, Nakaya HTI. CEMiTool: a bioconductor package for performing comprehensive modular co-expression analyses [Internet]. BMC Bioinformatics. 2018 ; 19( 1): 1-13 art. 56.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-018-2053-1
Vancouver
Russo P de ST, Ferreira GR, Cardozo LE, Bürger MC, Arias-Carrasco R, Maruyama SR, Hirata TDC, Lima DS de, Passos FM, Fukutani KF, Lever M, Silva JS da, Maracajá-Coutinho V, Nakaya HTI. CEMiTool: a bioconductor package for performing comprehensive modular co-expression analyses [Internet]. BMC Bioinformatics. 2018 ; 19( 1): 1-13 art. 56.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-018-2053-1
Artigo de periodico
StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction (2018)
Arias-Carrasco, Raul; Vásquez-Morán, Yessenia; Nakaya, Helder Takashi Imoto ; Maracajá-Coutinho, Vinicius
Source: BMC Bioinformatics. Unidade: FCF
Subjects: BIOINFORMÁTICA, RNA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
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ABNT
ARIAS-CARRASCO, Raul et al. StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction. BMC Bioinformatics, v. 19, n. 1, p. 1-7 art. 55, 2018Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12859-018-2052-2. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Arias-Carrasco, R., Vásquez-Morán, Y., Nakaya, H. T. I., & Maracajá-Coutinho, V. (2018). StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction. BMC Bioinformatics, 19( 1), 1-7 art. 55. doi:10.1186/s12859-018-2052-2
NLM
Arias-Carrasco R, Vásquez-Morán Y, Nakaya HTI, Maracajá-Coutinho V. StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction [Internet]. BMC Bioinformatics. 2018 ; 19( 1): 1-7 art. 55.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-018-2052-2
Vancouver
Arias-Carrasco R, Vásquez-Morán Y, Nakaya HTI, Maracajá-Coutinho V. StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction [Internet]. BMC Bioinformatics. 2018 ; 19( 1): 1-7 art. 55.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-018-2052-2
Artigo de periodico
A systematic comparative evaluation of biclustering techniques (2017)
Padilha, Victor A; Campello, Ricardo José Gabrielli Barreto
Source: BMC Bioinformatics. Unidade: ICMC
Subjects: INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL, RECONHECIMENTO DE PADRÕES, BIOINFORMÁTICA, EXPRESSÃO GÊNICA
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ABNT
PADILHA, Victor A e CAMPELLO, Ricardo José Gabrielli Barreto. A systematic comparative evaluation of biclustering techniques. BMC Bioinformatics, v. 18, p. 1-25, 2017Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12859-017-1487-1. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Padilha, V. A., & Campello, R. J. G. B. (2017). A systematic comparative evaluation of biclustering techniques. BMC Bioinformatics, 18, 1-25. doi:10.1186/s12859-017-1487-1
NLM
Padilha VA, Campello RJGB. A systematic comparative evaluation of biclustering techniques [Internet]. BMC Bioinformatics. 2017 ; 18 1-25.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-017-1487-1
Vancouver
Padilha VA, Campello RJGB. A systematic comparative evaluation of biclustering techniques [Internet]. BMC Bioinformatics. 2017 ; 18 1-25.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-017-1487-1
Artigo de periodico
Automatic learning of pre-miRNAs from different species (2016)
Lopes, Ivani de O. N; Schliep, Alexander; Carvalho, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de
Source: BMC Bioinformatics. Unidade: ICMC
Subjects: INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
LOPES, Ivani de O. N e SCHLIEP, Alexander e CARVALHO, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de. Automatic learning of pre-miRNAs from different species. BMC Bioinformatics, v. 17, p. 1-18, 2016Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12859-016-1036-3. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Lopes, I. de O. N., Schliep, A., & Carvalho, A. C. P. de L. F. de. (2016). Automatic learning of pre-miRNAs from different species. BMC Bioinformatics, 17, 1-18. doi:10.1186/s12859-016-1036-3
NLM
Lopes I de ON, Schliep A, Carvalho ACP de LF de. Automatic learning of pre-miRNAs from different species [Internet]. BMC Bioinformatics. 2016 ; 17 1-18.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-016-1036-3
Vancouver
Lopes I de ON, Schliep A, Carvalho ACP de LF de. Automatic learning of pre-miRNAs from different species [Internet]. BMC Bioinformatics. 2016 ; 17 1-18.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-016-1036-3
Trabalho de evento-anais periodico
NERI: network-medicine based integrative approach for disease gene prioritization by relative importance (2015)
Simões, Sérgio Nery; Martins Júnior, David Correa; Pereira, Carlos Alberto de Bragança ; Hashimoto, Ronaldo Fumio ; Brentani, Helena
Source: BMC Bioinformatics. Conference titles: Brazilian Symposium on Bioinformatics 2014. Unidades: IME, FM
Assunto: BIOINFORMÁTICA
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ABNT
SIMÕES, Sérgio Nery et al. NERI: network-medicine based integrative approach for disease gene prioritization by relative importance. BMC Bioinformatics. London: Instituto de Matemática e Estatística, Universidade de São Paulo. Disponível em: https://doi.org/10.1186/1471-2105-16-S19-S9. Acesso em: 10 nov. 2025. , 2015
APA
Simões, S. N., Martins Júnior, D. C., Pereira, C. A. de B., Hashimoto, R. F., & Brentani, H. (2015). NERI: network-medicine based integrative approach for disease gene prioritization by relative importance. BMC Bioinformatics. London: Instituto de Matemática e Estatística, Universidade de São Paulo. doi:10.1186/1471-2105-16-S19-S9
NLM
Simões SN, Martins Júnior DC, Pereira CA de B, Hashimoto RF, Brentani H. NERI: network-medicine based integrative approach for disease gene prioritization by relative importance [Internet]. BMC Bioinformatics. 2015 ; 16( article º S9): 14 .[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-16-S19-S9
Vancouver
Simões SN, Martins Júnior DC, Pereira CA de B, Hashimoto RF, Brentani H. NERI: network-medicine based integrative approach for disease gene prioritization by relative importance [Internet]. BMC Bioinformatics. 2015 ; 16( article º S9): 14 .[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-16-S19-S9
Artigo de periodico
Data-intensive analysis of HIV mutations (2015)
Ozahata, Mina Cintho; Sabino, Ester Cerdeira ; Diaz, Ricardo Sobhie; César Júnior, Roberto Marcondes ; Ferreira, João Eduardo
Source: BMC Bioinformatics. Unidades: IME, FM
Subjects: BIOINFORMÁTICA, COMPUTAÇÃO GRÁFICA, ALGORITMOS E ESTRUTURAS DE DADOS, HIV, MUTAÇÃO GENÉTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
OZAHATA, Mina Cintho et al. Data-intensive analysis of HIV mutations. BMC Bioinformatics, v. 16, n. 1, 2015Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12859-015-0452-0. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Ozahata, M. C., Sabino, E. C., Diaz, R. S., César Júnior, R. M., & Ferreira, J. E. (2015). Data-intensive analysis of HIV mutations. BMC Bioinformatics, 16( 1). doi:10.1186/s12859-015-0452-0
NLM
Ozahata MC, Sabino EC, Diaz RS, César Júnior RM, Ferreira JE. Data-intensive analysis of HIV mutations [Internet]. BMC Bioinformatics. 2015 ; 16( 1):[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-015-0452-0
Vancouver
Ozahata MC, Sabino EC, Diaz RS, César Júnior RM, Ferreira JE. Data-intensive analysis of HIV mutations [Internet]. BMC Bioinformatics. 2015 ; 16( 1):[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-015-0452-0
Artigo de periodico
The discriminant power of RNA features for pre-miRNA recognition (2014)
Lopes, Ivani O. N; Schliep, Alexander; Carvalho, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de
Source: BMC Bioinformatics. Unidade: ICMC
Subjects: INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
LOPES, Ivani O. N e SCHLIEP, Alexander e CARVALHO, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de. The discriminant power of RNA features for pre-miRNA recognition. BMC Bioinformatics, v. 15, p. 1-11, 2014Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/1471-2105-15-124. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Lopes, I. O. N., Schliep, A., & Carvalho, A. C. P. de L. F. de. (2014). The discriminant power of RNA features for pre-miRNA recognition. BMC Bioinformatics, 15, 1-11. doi:10.1186/1471-2105-15-124
NLM
Lopes ION, Schliep A, Carvalho ACP de LF de. The discriminant power of RNA features for pre-miRNA recognition [Internet]. BMC Bioinformatics. 2014 ; 15 1-11.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-15-124
Vancouver
Lopes ION, Schliep A, Carvalho ACP de LF de. The discriminant power of RNA features for pre-miRNA recognition [Internet]. BMC Bioinformatics. 2014 ; 15 1-11.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-15-124
Artigo de periodico
Integration and visualization of systems biology data in context of the genome (2010)
Bare, J. Christopher; Koide, Tie; Reiss, David J; Tenenbaum, Dan; Baliga, Nitin S.
Source: BMC Bioinformatics. Unidade: FMRP
Subjects: BIOINFORMÁTICA, GENOMAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
BARE, J. Christopher et al. Integration and visualization of systems biology data in context of the genome. BMC Bioinformatics, v. 11, 2010Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/1471-2105-11-382. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Bare, J. C., Koide, T., Reiss, D. J., Tenenbaum, D., & Baliga, N. S. (2010). Integration and visualization of systems biology data in context of the genome. BMC Bioinformatics, 11. doi:10.1186/1471-2105-11-382
NLM
Bare JC, Koide T, Reiss DJ, Tenenbaum D, Baliga NS. Integration and visualization of systems biology data in context of the genome [Internet]. BMC Bioinformatics. 2010 ; 11[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-11-382
Vancouver
Bare JC, Koide T, Reiss DJ, Tenenbaum D, Baliga NS. Integration and visualization of systems biology data in context of the genome [Internet]. BMC Bioinformatics. 2010 ; 11[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-11-382
Artigo de periodico
ProbFAST: probabilistic functional analysis system tool (2010)
Silva, Israel T.; Vêncio, Ricardo Zorzetto Nicoliello; Oliveira, Thiago Y. K.; Molfetta, Greice Andreotti de; Silva Júnior, Wilson Araújo da
Source: BMC Bioinformatics. Unidade: FMRP
Subjects: GENOMAS, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SILVA, Israel T. et al. ProbFAST: probabilistic functional analysis system tool. BMC Bioinformatics, v. 11, 2010Tradução . . Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Silva, I. T., Vêncio, R. Z. N., Oliveira, T. Y. K., Molfetta, G. A. de, & Silva Júnior, W. A. da. (2010). ProbFAST: probabilistic functional analysis system tool. BMC Bioinformatics, 11.
NLM
Silva IT, Vêncio RZN, Oliveira TYK, Molfetta GA de, Silva Júnior WA da. ProbFAST: probabilistic functional analysis system tool. BMC Bioinformatics. 2010 ; 11[citado 2025 nov. 10 ]
Vancouver
Silva IT, Vêncio RZN, Oliveira TYK, Molfetta GA de, Silva Júnior WA da. ProbFAST: probabilistic functional analysis system tool. BMC Bioinformatics. 2010 ; 11[citado 2025 nov. 10 ]
Artigo de periodico
Feature selection environment for genomic applications (2008)
Lopes, Fabricio Martins ; Martins Júnior, David Correa; César Júnior, Roberto Marcondes
Source: BMC Bioinformatics. Unidades: IME, Interunidades em Bioinformática
Subjects: BIOINFORMÁTICA, RECONHECIMENTO DE PADRÕES, ESTATÍSTICA COMPUTACIONAL
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
LOPES, Fabricio Martins e MARTINS JÚNIOR, David Correa e CÉSAR JÚNIOR, Roberto Marcondes. Feature selection environment for genomic applications. BMC Bioinformatics, v. 9, n. artigo 451, p. 1-8, 2008Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/1471-2105-9-451. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Lopes, F. M., Martins Júnior, D. C., & César Júnior, R. M. (2008). Feature selection environment for genomic applications. BMC Bioinformatics, 9( artigo 451), 1-8. doi:10.1186/1471-2105-9-451
NLM
Lopes FM, Martins Júnior DC, César Júnior RM. Feature selection environment for genomic applications [Internet]. BMC Bioinformatics. 2008 ; 9( artigo 451): 1-8.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-9-451
Vancouver
Lopes FM, Martins Júnior DC, César Júnior RM. Feature selection environment for genomic applications [Internet]. BMC Bioinformatics. 2008 ; 9( artigo 451): 1-8.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-9-451
Artigo de periodico
A feature selection approach for identification of signature genes from SAGE data (2007)
Barrera, Júnior; César Júnior, Roberto Marcondes ; Humes Júnior, Carlos; Martins, David C.; Patrão, Diogo Ferreira da Costa ; Silva, Paulo J. S. ; Brentani, Helena Paula
Source: BMC Bioinformatics. Unidade: IME
Assunto: BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
BARRERA, Júnior et al. A feature selection approach for identification of signature genes from SAGE data. BMC Bioinformatics, v. 8, n. Art. 169, 2007Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/1471-2105-8-169. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Barrera, J., César Júnior, R. M., Humes Júnior, C., Martins, D. C., Patrão, D. F. da C., Silva, P. J. S., & Brentani, H. P. (2007). A feature selection approach for identification of signature genes from SAGE data. BMC Bioinformatics, 8( Art. 169). doi:10.1186/1471-2105-8-169
NLM
Barrera J, César Júnior RM, Humes Júnior C, Martins DC, Patrão DF da C, Silva PJS, Brentani HP. A feature selection approach for identification of signature genes from SAGE data [Internet]. BMC Bioinformatics. 2007 ; 8( Art. 169):[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-8-169
Vancouver
Barrera J, César Júnior RM, Humes Júnior C, Martins DC, Patrão DF da C, Silva PJS, Brentani HP. A feature selection approach for identification of signature genes from SAGE data [Internet]. BMC Bioinformatics. 2007 ; 8( Art. 169):[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-8-169
Artigo de periodico
BayGO: Bayesian analysis of ontology term enrichment in microarray data (2006)
Vêncio, Ricardo Zorzetto Nicoliello; Koide, Tie; Gomes, Suely Lopes ; Pereira, Carlos Alberto de Bragança
Source: BMC Bioinformatics. Unidades: IQ, IME, Interunidades em Bioinformática
Assunto: BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
VÊNCIO, Ricardo Zorzetto Nicoliello et al. BayGO: Bayesian analysis of ontology term enrichment in microarray data. BMC Bioinformatics, v. 7, 2006Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-86. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Vêncio, R. Z. N., Koide, T., Gomes, S. L., & Pereira, C. A. de B. (2006). BayGO: Bayesian analysis of ontology term enrichment in microarray data. BMC Bioinformatics, 7. doi:10.1186/1471-2105-7-86
NLM
Vêncio RZN, Koide T, Gomes SL, Pereira CA de B. BayGO: Bayesian analysis of ontology term enrichment in microarray data [Internet]. BMC Bioinformatics. 2006 ; 7[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-86
Vancouver
Vêncio RZN, Koide T, Gomes SL, Pereira CA de B. BayGO: Bayesian analysis of ontology term enrichment in microarray data [Internet]. BMC Bioinformatics. 2006 ; 7[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-86
Artigo de periodico
Bayesian model accounting for within-class biological variability in serial analysis of gene expression (2004)
Vêncio, Ricardo Zorzetto Nicoliello ; Brentani, Helena Paula ; Patrão, Diogo Ferreira da Costa ; Pereira, Carlos Alberto de Bragança
Source: BMC Bioinformatics. Unidade: IME
Subjects: INFERÊNCIA BAYESIANA, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
VÊNCIO, Ricardo Zorzetto Nicoliello et al. Bayesian model accounting for within-class biological variability in serial analysis of gene expression. BMC Bioinformatics, v. 5, n. 1, p. 1-13, 2004Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/1471-2105-5-119. Acesso em: 10 nov. 2025.
APA
Vêncio, R. Z. N., Brentani, H. P., Patrão, D. F. da C., & Pereira, C. A. de B. (2004). Bayesian model accounting for within-class biological variability in serial analysis of gene expression. BMC Bioinformatics, 5( 1), 1-13. doi:10.1186/1471-2105-5-119
NLM
Vêncio RZN, Brentani HP, Patrão DF da C, Pereira CA de B. Bayesian model accounting for within-class biological variability in serial analysis of gene expression [Internet]. BMC Bioinformatics. 2004 ; 5( 1): 1-13.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-5-119
Vancouver
Vêncio RZN, Brentani HP, Patrão DF da C, Pereira CA de B. Bayesian model accounting for within-class biological variability in serial analysis of gene expression [Internet]. BMC Bioinformatics. 2004 ; 5( 1): 1-13.[citado 2025 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2105-5-119

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