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Artigo de periodico
BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification (2024)
Santos, Anderson Paulo Avila ; Almeida, Breno Lívio Silva de ; Bonidia, Robson Parmezan ; Stadler, Peter F ; Štefanič, Polonca; Mandic-Mulec, Ines; Rocha, Ulisses Nunes da ; Sanches, Danilo Sipoli ; Carvalho, Andre Carlos Ponce de Leon Ferreira de
Source: RNA Biology. Unidades: ICMC, EESC E ICMC
Subjects: BIOINFORMÁTICA, APRENDIZAGEM PROFUNDA, REDES NEURAIS, RNA, REGULAÇÃO GÊNICA, GENÔMICA
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ABNT
SANTOS, Anderson Paulo Avila et al. BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification. RNA Biology, v. 21, n. 1, p. 1-12, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1080/15476286.2024.2329451. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Santos, A. P. A., Almeida, B. L. S. de, Bonidia, R. P., Stadler, P. F., Štefanič, P., Mandic-Mulec, I., et al. (2024). BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification. RNA Biology, 21( 1), 1-12. doi:10.1080/15476286.2024.2329451
NLM
Santos APA, Almeida BLS de, Bonidia RP, Stadler PF, Štefanič P, Mandic-Mulec I, Rocha UN da, Sanches DS, Carvalho ACP de LF de. BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification [Internet]. RNA Biology. 2024 ; 21( 1): 1-12.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1080/15476286.2024.2329451
Vancouver
Santos APA, Almeida BLS de, Bonidia RP, Stadler PF, Štefanič P, Mandic-Mulec I, Rocha UN da, Sanches DS, Carvalho ACP de LF de. BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification [Internet]. RNA Biology. 2024 ; 21( 1): 1-12.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1080/15476286.2024.2329451
Artigo de periodico
Temporal progress of gene expression analysis with RNA-Seq data: a review on the relationship between computational methods (2023)
Costa-Silva, Juliana; Domingues, Douglas Silva ; Menotti, David; Hungria, Mariangela; Lopes, Fabrício Martins
Source: Computational and Structural Biotechnology Journal. Unidade: ESALQ
Subjects: BIOINFORMÁTICA, EXPRESSÃO GÊNICA, RNA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
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ABNT
COSTA-SILVA, Juliana et al. Temporal progress of gene expression analysis with RNA-Seq data: a review on the relationship between computational methods. Computational and Structural Biotechnology Journal, v. 21, p. 86-98, 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.11.051. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Costa-Silva, J., Domingues, D. S., Menotti, D., Hungria, M., & Lopes, F. M. (2023). Temporal progress of gene expression analysis with RNA-Seq data: a review on the relationship between computational methods. Computational and Structural Biotechnology Journal, 21, 86-98. doi:10.1016/j.csbj.2022.11.051
NLM
Costa-Silva J, Domingues DS, Menotti D, Hungria M, Lopes FM. Temporal progress of gene expression analysis with RNA-Seq data: a review on the relationship between computational methods [Internet]. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2023 ; 21 86-98.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.11.051
Vancouver
Costa-Silva J, Domingues DS, Menotti D, Hungria M, Lopes FM. Temporal progress of gene expression analysis with RNA-Seq data: a review on the relationship between computational methods [Internet]. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2023 ; 21 86-98.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.11.051
Tese (Doutorado)
Estudo dos PIWI-interacting RNAs (piRNAs): do desenvolvimento de uma base de dados à análise sistemática da expressão gênica em tecidos normais e tumorais (2023)
Piuco, Ricardo; Galante, Pedro Alexandre Favoretto (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, NEOPLASIAS, EXPRESSÃO GÊNICA, GENÔMICA, RNA
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ABNT
PIUCO, Ricardo. Estudo dos PIWI-interacting RNAs (piRNAs): do desenvolvimento de uma base de dados à análise sistemática da expressão gênica em tecidos normais e tumorais. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-31072023-072639/. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Piuco, R. (2023). Estudo dos PIWI-interacting RNAs (piRNAs): do desenvolvimento de uma base de dados à análise sistemática da expressão gênica em tecidos normais e tumorais (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-31072023-072639/
NLM
Piuco R. Estudo dos PIWI-interacting RNAs (piRNAs): do desenvolvimento de uma base de dados à análise sistemática da expressão gênica em tecidos normais e tumorais [Internet]. 2023 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-31072023-072639/
Vancouver
Piuco R. Estudo dos PIWI-interacting RNAs (piRNAs): do desenvolvimento de uma base de dados à análise sistemática da expressão gênica em tecidos normais e tumorais [Internet]. 2023 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-31072023-072639/
Tese (Doutorado)
Discovery of transcription start, transcription termination and transcript processing sites in Halobacterium salinarum NRC-1 using dRNA-seq (2023)
Ibrahim, Amr Galal Abd El-Raheem; Vêncio, Ricardo Zorzetto Nicoliello (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Subjects: EXPRESSÃO GÊNICA, RNA, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
IBRAHIM, Amr Galal Abd El-Raheem. Discovery of transcription start, transcription termination and transcript processing sites in Halobacterium salinarum NRC-1 using dRNA-seq. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17082023-215744/. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Ibrahim, A. G. A. E. -R. (2023). Discovery of transcription start, transcription termination and transcript processing sites in Halobacterium salinarum NRC-1 using dRNA-seq (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17082023-215744/
NLM
Ibrahim AGAE-R. Discovery of transcription start, transcription termination and transcript processing sites in Halobacterium salinarum NRC-1 using dRNA-seq [Internet]. 2023 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17082023-215744/
Vancouver
Ibrahim AGAE-R. Discovery of transcription start, transcription termination and transcript processing sites in Halobacterium salinarum NRC-1 using dRNA-seq [Internet]. 2023 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17082023-215744/
Trabalho de evento-resumo
Comparação prática e teórica entre técnicas de caracterização de estruturas secundárias de RNAs e o arcabouço GrammarLab (2022)
Moreira, Gabriel Brandão de Carvalho ; José Neto, João ; Lima, Ariane Machado
Source: 29º SIICUSP-EACH 2021: Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP: livro de resumos. Conference titles: Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP. Unidades: EP, EACH
Subjects: RNA, LINGUAGENS FORMAIS, RECONHECIMENTO DE PADRÕES, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
MOREIRA, Gabriel Brandão de Carvalho e JOSÉ NETO, João e LIMA, Ariane Machado. Comparação prática e teórica entre técnicas de caracterização de estruturas secundárias de RNAs e o arcabouço GrammarLab. 2022, Anais.. São Paulo: Escola de Artes, Ciências e Humanidades, 2022. p. 71-72. Disponível em: http://www5.each.usp.br/wp-content/uploads/2022/02/ANAIS-29%C2%BA-SIICUSP-EACH_USP.pdf. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Moreira, G. B. de C., José Neto, J., & Lima, A. M. (2022). Comparação prática e teórica entre técnicas de caracterização de estruturas secundárias de RNAs e o arcabouço GrammarLab. In 29º SIICUSP-EACH 2021: Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP: livro de resumos (p. 71-72). São Paulo: Escola de Artes, Ciências e Humanidades. Recuperado de http://www5.each.usp.br/wp-content/uploads/2022/02/ANAIS-29%C2%BA-SIICUSP-EACH_USP.pdf
NLM
Moreira GB de C, José Neto J, Lima AM. Comparação prática e teórica entre técnicas de caracterização de estruturas secundárias de RNAs e o arcabouço GrammarLab [Internet]. 29º SIICUSP-EACH 2021: Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP: livro de resumos. 2022 ; 71-72.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: http://www5.each.usp.br/wp-content/uploads/2022/02/ANAIS-29%C2%BA-SIICUSP-EACH_USP.pdf
Vancouver
Moreira GB de C, José Neto J, Lima AM. Comparação prática e teórica entre técnicas de caracterização de estruturas secundárias de RNAs e o arcabouço GrammarLab [Internet]. 29º SIICUSP-EACH 2021: Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP: livro de resumos. 2022 ; 71-72.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: http://www5.each.usp.br/wp-content/uploads/2022/02/ANAIS-29%C2%BA-SIICUSP-EACH_USP.pdf
Tese (Doutorado)
Sequenciamento de RNA de células únicas como ferramenta para a compreensão do microambiente intratumoral (2022)
Biagi Junior, Carlos Alberto Oliveira de ; Silva Junior, Wilson Araújo da (Orientador)
Unidade: FMRP
Subjects: BIOINFORMÁTICA, NEOPLASIAS PULMONARES, MELANOMA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
BIAGI JUNIOR, Carlos Alberto Oliveira de. Sequenciamento de RNA de células únicas como ferramenta para a compreensão do microambiente intratumoral. 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-13072022-151523/. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Biagi Junior, C. A. O. de. (2022). Sequenciamento de RNA de células únicas como ferramenta para a compreensão do microambiente intratumoral (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-13072022-151523/
NLM
Biagi Junior CAO de. Sequenciamento de RNA de células únicas como ferramenta para a compreensão do microambiente intratumoral [Internet]. 2022 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-13072022-151523/
Vancouver
Biagi Junior CAO de. Sequenciamento de RNA de células únicas como ferramenta para a compreensão do microambiente intratumoral [Internet]. 2022 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-13072022-151523/
Dissertação (Mestrado)
Perfil de expressão dos circRNAS no câncer colorretal (2022)
Freitas, Vanessa Galdeno; Asprino, Paula Fontes (coorient) ; Galante, Pedro Alexandre Favoretto (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, NEOPLASIAS COLORRETAIS, EXPRESSÃO GÊNICA, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
FREITAS, Vanessa Galdeno. Perfil de expressão dos circRNAS no câncer colorretal. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-12072022-110643/. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Freitas, V. G. (2022). Perfil de expressão dos circRNAS no câncer colorretal (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-12072022-110643/
NLM
Freitas VG. Perfil de expressão dos circRNAS no câncer colorretal [Internet]. 2022 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-12072022-110643/
Vancouver
Freitas VG. Perfil de expressão dos circRNAS no câncer colorretal [Internet]. 2022 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-12072022-110643/
Trabalho de evento-resumo
Characterization of immune system cell subpopulations from single cell RNA sequencing in head and neck squamous cell carcinoma (2021)
Biagi Junior, Carlos Alberto Oliveira de ; Teixeira, Samantha Kuwada; Pereira, Felipe Luiz; Silva Junior, Wilson Araújo da ; Severino, Patrícia
Source: Resumos. Conference titles: Congresso Brasileiro de Genética = Brazilian Congress of Genetics. Unidade: FMRP
Subjects: CARCINOMA DE CÉLULAS ESCAMOSAS, BIOINFORMÁTICA, CÉLULAS MIELOIDES, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
BIAGI JUNIOR, Carlos Alberto Oliveira de et al. Characterization of immune system cell subpopulations from single cell RNA sequencing in head and neck squamous cell carcinoma. 2021, Anais.. [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética - SBG, 2021. Disponível em: https://www.sbg.org.br/anais. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Biagi Junior, C. A. O. de, Teixeira, S. K., Pereira, F. L., Silva Junior, W. A. da, & Severino, P. (2021). Characterization of immune system cell subpopulations from single cell RNA sequencing in head and neck squamous cell carcinoma. In Resumos. [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética - SBG. Recuperado de https://www.sbg.org.br/anais
NLM
Biagi Junior CAO de, Teixeira SK, Pereira FL, Silva Junior WA da, Severino P. Characterization of immune system cell subpopulations from single cell RNA sequencing in head and neck squamous cell carcinoma [Internet]. Resumos. 2021 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.sbg.org.br/anais
Vancouver
Biagi Junior CAO de, Teixeira SK, Pereira FL, Silva Junior WA da, Severino P. Characterization of immune system cell subpopulations from single cell RNA sequencing in head and neck squamous cell carcinoma [Internet]. Resumos. 2021 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.sbg.org.br/anais
Artigo de periodico
Gene silencing of Diaphorina citri candidate effectors promotes changes in feeding behaviors (2020)
Pacheco, Inaiara de Souza; Galdeano, Diogo Manzano; Maluta, Nathalie Kristine Prado; Lopes, Joao Roberto Spotti ; Machado, Marcos Antonio
Source: Scientific Reports. Unidade: ESALQ
Subjects: BACTÉRIAS FITOPATOGÊNICAS, BIOINFORMÁTICA, COMPORTAMENTO ALIMENTAR, EXPRESSÃO GÊNICA, GREENING (DOENÇA DE PLANTA), INSETOS VETORES, REGULAÇÃO GÊNICA, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PACHECO, Inaiara de Souza et al. Gene silencing of Diaphorina citri candidate effectors promotes changes in feeding behaviors. Scientific Reports, v. 10, p. 1-14, 2020Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1038/s41598-020-62856-5. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Pacheco, I. de S., Galdeano, D. M., Maluta, N. K. P., Lopes, J. R. S., & Machado, M. A. (2020). Gene silencing of Diaphorina citri candidate effectors promotes changes in feeding behaviors. Scientific Reports, 10, 1-14. doi:10.1038/s41598-020-62856-5
NLM
Pacheco I de S, Galdeano DM, Maluta NKP, Lopes JRS, Machado MA. Gene silencing of Diaphorina citri candidate effectors promotes changes in feeding behaviors [Internet]. Scientific Reports. 2020 ;10 1-14.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-020-62856-5
Vancouver
Pacheco I de S, Galdeano DM, Maluta NKP, Lopes JRS, Machado MA. Gene silencing of Diaphorina citri candidate effectors promotes changes in feeding behaviors [Internet]. Scientific Reports. 2020 ;10 1-14.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-020-62856-5
Dissertação (Mestrado)
Detecção de populações em dados de sequenciamento de RNA de células individuais por meio de módulos de coexpressão (2020)
Alves, Tiago Lubiana ; Nakaya, Helder Takashi Imoto (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, RNA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ALVES, Tiago Lubiana. Detecção de populações em dados de sequenciamento de RNA de células individuais por meio de módulos de coexpressão. 2020. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2020. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17042020-100412/. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Alves, T. L. (2020). Detecção de populações em dados de sequenciamento de RNA de células individuais por meio de módulos de coexpressão (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17042020-100412/
NLM
Alves TL. Detecção de populações em dados de sequenciamento de RNA de células individuais por meio de módulos de coexpressão [Internet]. 2020 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17042020-100412/
Vancouver
Alves TL. Detecção de populações em dados de sequenciamento de RNA de células individuais por meio de módulos de coexpressão [Internet]. 2020 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17042020-100412/
Artigo de periodico
A novel decomposing model with evolutionary algorithms for feature selection in long non-coding RNAs (2020)
Bonidia, Robson Parmezan ; Machida, Jaqueline Sayuri; Negri, Tatianne Costa ; Alves, Wonder Alexandre Luz ; Kashiwabara, André Yoshiaki ; Domingues, Douglas S ; Carvalho, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de ; Paschoal, Alexandre Rossi ; Sanches, Danilo Sipoli
Source: IEEE Access. Unidade: ICMC
Subjects: APRENDIZADO COMPUTACIONAL, BIOINFORMÁTICA, HEURÍSTICA, ALGORITMOS GENÉTICOS, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
BONIDIA, Robson Parmezan et al. A novel decomposing model with evolutionary algorithms for feature selection in long non-coding RNAs. IEEE Access, v. 8, p. 181683-181697, 2020Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1109/ACCESS.2020.3028039. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Bonidia, R. P., Machida, J. S., Negri, T. C., Alves, W. A. L., Kashiwabara, A. Y., Domingues, D. S., et al. (2020). A novel decomposing model with evolutionary algorithms for feature selection in long non-coding RNAs. IEEE Access, 8, 181683-181697. doi:10.1109/ACCESS.2020.3028039
NLM
Bonidia RP, Machida JS, Negri TC, Alves WAL, Kashiwabara AY, Domingues DS, Carvalho ACP de LF de, Paschoal AR, Sanches DS. A novel decomposing model with evolutionary algorithms for feature selection in long non-coding RNAs [Internet]. IEEE Access. 2020 ; 8 181683-181697.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1109/ACCESS.2020.3028039
Vancouver
Bonidia RP, Machida JS, Negri TC, Alves WAL, Kashiwabara AY, Domingues DS, Carvalho ACP de LF de, Paschoal AR, Sanches DS. A novel decomposing model with evolutionary algorithms for feature selection in long non-coding RNAs [Internet]. IEEE Access. 2020 ; 8 181683-181697.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1109/ACCESS.2020.3028039
Trabalho de evento
Selecting the most relevant features for the identification of long non-coding RNAs in plants (2019)
Bonidia, Robson P ; Carvalho, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de ; Paschoal, Alexandre Rossi ; Sanches, Danilo Sipoli
Source: Proceedings. Conference titles: Brazilian Conference on Intelligent Systems - BRACIS. Unidade: ICMC
Subjects: BIOINFORMÁTICA, HEURÍSTICA, ALGORITMOS GENÉTICOS, APRENDIZADO COMPUTACIONAL, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
BONIDIA, Robson P et al. Selecting the most relevant features for the identification of long non-coding RNAs in plants. 2019, Anais.. Piscataway: IEEE, 2019. Disponível em: https://doi.org/10.1109/BRACIS.2019.00100. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Bonidia, R. P., Carvalho, A. C. P. de L. F. de, Paschoal, A. R., & Sanches, D. S. (2019). Selecting the most relevant features for the identification of long non-coding RNAs in plants. In Proceedings. Piscataway: IEEE. doi:10.1109/BRACIS.2019.00100
NLM
Bonidia RP, Carvalho ACP de LF de, Paschoal AR, Sanches DS. Selecting the most relevant features for the identification of long non-coding RNAs in plants [Internet]. Proceedings. 2019 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1109/BRACIS.2019.00100
Vancouver
Bonidia RP, Carvalho ACP de LF de, Paschoal AR, Sanches DS. Selecting the most relevant features for the identification of long non-coding RNAs in plants [Internet]. Proceedings. 2019 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1109/BRACIS.2019.00100
Parte de monografia/livro
Noncoding RNAs databases: current status and trends (2019)
Maracaja-Coutinho, Vinicius ; Paschoal, Alexandre Rossi ; Caris-Maldonado, José Carlos; Borges, Pedro Vinícius; Ferreira, Almir José; Durham, Alan Mitchell
Source: Computational biology of non-coding RNA : methods and protocols. Unidade: IME
Subjects: BIOINFORMÁTICA, BANCO DE DADOS, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
MARACAJA-COUTINHO, Vinicius et al. Noncoding RNAs databases: current status and trends. Computational biology of non-coding RNA : methods and protocols. Tradução . New York: Springer, 2019. . Disponível em: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-8982-9_10. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Maracaja-Coutinho, V., Paschoal, A. R., Caris-Maldonado, J. C., Borges, P. V., Ferreira, A. J., & Durham, A. M. (2019). Noncoding RNAs databases: current status and trends. In Computational biology of non-coding RNA : methods and protocols. New York: Springer. doi:10.1007/978-1-4939-8982-9_10
NLM
Maracaja-Coutinho V, Paschoal AR, Caris-Maldonado JC, Borges PV, Ferreira AJ, Durham AM. Noncoding RNAs databases: current status and trends [Internet]. In: Computational biology of non-coding RNA : methods and protocols. New York: Springer; 2019. [citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-8982-9_10
Vancouver
Maracaja-Coutinho V, Paschoal AR, Caris-Maldonado JC, Borges PV, Ferreira AJ, Durham AM. Noncoding RNAs databases: current status and trends [Internet]. In: Computational biology of non-coding RNA : methods and protocols. New York: Springer; 2019. [citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-8982-9_10
Artigo de periodico
Coarse-grained dynamic RNA titration simulations (2019)
Pasquali, Samuela ; Frezza, Elisa ; Silva, Fernando Luís Barroso da
Source: Interface Focus. Unidade: FCFRP
Subjects: RNA, BIOFÍSICA, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PASQUALI, Samuela e FREZZA, Elisa e SILVA, Fernando Luís Barroso da. Coarse-grained dynamic RNA titration simulations. Interface Focus, v. 9, n. 3, 2019Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1098/rsfs.2018.0066. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Pasquali, S., Frezza, E., & Silva, F. L. B. da. (2019). Coarse-grained dynamic RNA titration simulations. Interface Focus, 9( 3). doi:10.1098/rsfs.2018.0066
NLM
Pasquali S, Frezza E, Silva FLB da. Coarse-grained dynamic RNA titration simulations [Internet]. Interface Focus. 2019 ; 9( 3):[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1098/rsfs.2018.0066
Vancouver
Pasquali S, Frezza E, Silva FLB da. Coarse-grained dynamic RNA titration simulations [Internet]. Interface Focus. 2019 ; 9( 3):[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1098/rsfs.2018.0066
Artigo de periodico
Systematic analysis of splice-site-creating mutations in cancer (2018)
Jayasinghe, Reyka G.; Noushmehr, Houtan; Carlotti Júnior, Carlos Gilberto; Santos, José Sebastião dos; Kemp, Rafael; Sankarankutty, Ajith Kumar; Tirapelli, Daniela Pretti da Cunha
Source: Cell Reports. Unidade: FMRP
Subjects: RNA, MUTAÇÃO, GENOMAS, NEOPLASIAS, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
JAYASINGHE, Reyka G. et al. Systematic analysis of splice-site-creating mutations in cancer. Cell Reports, v. 23, n. 1, p. 270-281.e3, 2018Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.03.052. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Jayasinghe, R. G., Noushmehr, H., Carlotti Júnior, C. G., Santos, J. S. dos, Kemp, R., Sankarankutty, A. K., & Tirapelli, D. P. da C. (2018). Systematic analysis of splice-site-creating mutations in cancer. Cell Reports, 23( 1), 270-281.e3. doi:10.1016/j.celrep.2018.03.052
NLM
Jayasinghe RG, Noushmehr H, Carlotti Júnior CG, Santos JS dos, Kemp R, Sankarankutty AK, Tirapelli DP da C. Systematic analysis of splice-site-creating mutations in cancer [Internet]. Cell Reports. 2018 ; 23( 1): 270-281.e3.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.03.052
Vancouver
Jayasinghe RG, Noushmehr H, Carlotti Júnior CG, Santos JS dos, Kemp R, Sankarankutty AK, Tirapelli DP da C. Systematic analysis of splice-site-creating mutations in cancer [Internet]. Cell Reports. 2018 ; 23( 1): 270-281.e3.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.03.052
Dissertação (Mestrado)
Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classificadores de RNAs codificantes e não codificantes (2018)
Sá, Clebiano da Costa; Lauretto, Marcelo de Souza (Orientador) ; Lima, Ariane Machado (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SÁ, Clebiano da Costa. Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classificadores de RNAs codificantes e não codificantes. 2018. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19052018-122805/. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Sá, C. da C. (2018). Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classificadores de RNAs codificantes e não codificantes (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19052018-122805/
NLM
Sá C da C. Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classificadores de RNAs codificantes e não codificantes [Internet]. 2018 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19052018-122805/
Vancouver
Sá C da C. Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classificadores de RNAs codificantes e não codificantes [Internet]. 2018 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19052018-122805/
Artigo de periodico
StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction (2018)
Arias-Carrasco, Raul; Vásquez-Morán, Yessenia; Nakaya, Helder Takashi Imoto ; Maracajá-Coutinho, Vinicius
Source: BMC Bioinformatics. Unidade: FCF
Subjects: BIOINFORMÁTICA, RNA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ARIAS-CARRASCO, Raul et al. StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction. BMC Bioinformatics, v. 19, n. 1, p. 1-7 art. 55, 2018Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12859-018-2052-2. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Arias-Carrasco, R., Vásquez-Morán, Y., Nakaya, H. T. I., & Maracajá-Coutinho, V. (2018). StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction. BMC Bioinformatics, 19( 1), 1-7 art. 55. doi:10.1186/s12859-018-2052-2
NLM
Arias-Carrasco R, Vásquez-Morán Y, Nakaya HTI, Maracajá-Coutinho V. StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction [Internet]. BMC Bioinformatics. 2018 ; 19( 1): 1-7 art. 55.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-018-2052-2
Vancouver
Arias-Carrasco R, Vásquez-Morán Y, Nakaya HTI, Maracajá-Coutinho V. StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction [Internet]. BMC Bioinformatics. 2018 ; 19( 1): 1-7 art. 55.[citado 2024 ago. 17 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12859-018-2052-2
Tese (Doutorado)
Identificação e análise in silico de ncRNAs empregando dados de RNA-seq em Leishmania (2017)
Ruy, Patrícia de Cássia; Cruz, Angela Kaysel (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, LEISHMANIA, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
RUY, Patrícia de Cássia. Identificação e análise in silico de ncRNAs empregando dados de RNA-seq em Leishmania. 2017. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21112017-112651. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Ruy, P. de C. (2017). Identificação e análise in silico de ncRNAs empregando dados de RNA-seq em Leishmania (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21112017-112651
NLM
Ruy P de C. Identificação e análise in silico de ncRNAs empregando dados de RNA-seq em Leishmania [Internet]. 2017 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21112017-112651
Vancouver
Ruy P de C. Identificação e análise in silico de ncRNAs empregando dados de RNA-seq em Leishmania [Internet]. 2017 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21112017-112651
Tese (Doutorado)
LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local (2017)
Silva, Lucas Ferreira da; Verjovski-Almeida, Sergio (Orientador) ; Setubal, João Carlos (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, EPIGÊNESE GENÉTICA, NEOPLASIAS, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SILVA, Lucas Ferreira da. LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local. 2017. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19042019-201105/. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Silva, L. F. da. (2017). LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19042019-201105/
NLM
Silva LF da. LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local [Internet]. 2017 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19042019-201105/
Vancouver
Silva LF da. LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local [Internet]. 2017 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19042019-201105/
Tese (Doutorado)
The transcriptome of oxygen-induced retinopathy and an angiogenesis-based prognostic gene signature for prediction of breast cancer relapse (2017)
Sousa, Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de; Giordano, Ricardo José (Orientador) ; Setubal, João Carlos (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SOUSA, Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de. The transcriptome of oxygen-induced retinopathy and an angiogenesis-based prognostic gene signature for prediction of breast cancer relapse. 2017. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28092017-112917/. Acesso em: 17 ago. 2024.
APA
Sousa, R. G. M. A. de. (2017). The transcriptome of oxygen-induced retinopathy and an angiogenesis-based prognostic gene signature for prediction of breast cancer relapse (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28092017-112917/
NLM
Sousa RGMA de. The transcriptome of oxygen-induced retinopathy and an angiogenesis-based prognostic gene signature for prediction of breast cancer relapse [Internet]. 2017 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28092017-112917/
Vancouver
Sousa RGMA de. The transcriptome of oxygen-induced retinopathy and an angiogenesis-based prognostic gene signature for prediction of breast cancer relapse [Internet]. 2017 ;[citado 2024 ago. 17 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28092017-112917/

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