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The transcriptome of oxygen-induced retinopathy and an angiogenesis-based prognostic gene signature for prediction of breast cancer relapse (2017)

  • Authors:
  • Autor USP: SOUSA, RODRIGO GUARISCHI MATTOS AMARAL DE - BIOINFORMÁTICA
  • Unidade: BIOINFORMÁTICA
  • Subjects: BIOINFORMÁTICA; RNA
  • Keywords: Angiogênese; Angiogenesis; Assinatura gênica; Biomarcador molecular; Breast cancer relapse; Gene signature; Molecular biomarker; Oxygen-Induced retinopathy; Recidiva de câncer de mama; Retinopatia Induzida por oxigênio; RNA-Seq; RNA-Seq; Transcriptomics; Transcritoma
  • Agências de fomento:
  • Language: Inglês
  • Abstract: Angiogênese é o processo de formação de novos vasos sanguíneos a partir dos vasos existentes. É um processo vital, mas muitas doenças também dependem deste mecanismo para obter nutrientes e progredir. Estas \"doenças dependentes de angiogênese\" incluem cânceres, retinopatias e degeneração macular. Alguns inibidores da angiogênese foram desenvolvidos na última década, com o objetivo de auxiliar no manejo dessas doenças e melhorar a qualidade de vida dos pacientes. A maioria destes compostos funciona inibindo a ligação de VEGFA/VEGFR2, que também é um elemento importante para a sobrevivência de células endoteliais quiescentes; e isso pode explicar parcialmente eventos adversos observados em alguns ensaios clínicos. Nossa hipótese é que a melhoria das terapias anti-angiogênicas depende de uma compreensão melhor e mais ampla desse processo, especialmente quando relacionada à progressão das doenças. Utilizando RNA-Seq e um modelo animal bem aceito de angiogênese, o modelo murino de Retinopatia Induzida por Oxigênio, exploramos o transcritoma e identificamos 153 genes diferencialmente expressos durante a angiogênese. Uma extensiva validação de vários genes realizada por qRT-PCR e hibridização in-situ confirmou a superexpressão de Esm1 em células endoteliais de tecidos com angiogênese ativa. A análise de enriquecimento desta lista de genes confirmou a ligação da angiogênese com genes frequentemente mutados em tumores, consistente com a conhecida ligação entre câncer e angiogênese,e forneceu sugestões de fármacos já aprovados que podem ser reutilizados para controlar a angiogênese em circunstâncias patológicas. Finalmente, com base neste panorama amplo da angiogênese, fomos capazes de criar um biomarcador molecular com poder prognóstico para a predição da recidiva de câncer de mama, com aplicações clínicas promissoras. Em resumo, este trabalho revelou com sucesso genes relacionados à angiogênese e forneceu novas alternativas terapêuticas, incluindo potenciais fármacos para reposicionamento. Esse conjunto de genes diferencialmente expressos é também um recurso valioso para investigações futuras
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 02.06.2017
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      SOUSA, Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de; GIORDANO, Ricardo José; SETUBAL, João Carlos. The transcriptome of oxygen-induced retinopathy and an angiogenesis-based prognostic gene signature for prediction of breast cancer relapse. 2017.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2017. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28092017-112917/ >.
    • APA

      Sousa, R. G. M. A. de, Giordano, R. J., & Setubal, J. C. (2017). The transcriptome of oxygen-induced retinopathy and an angiogenesis-based prognostic gene signature for prediction of breast cancer relapse. Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28092017-112917/
    • NLM

      Sousa RGMA de, Giordano RJ, Setubal JC. The transcriptome of oxygen-induced retinopathy and an angiogenesis-based prognostic gene signature for prediction of breast cancer relapse [Internet]. 2017 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28092017-112917/
    • Vancouver

      Sousa RGMA de, Giordano RJ, Setubal JC. The transcriptome of oxygen-induced retinopathy and an angiogenesis-based prognostic gene signature for prediction of breast cancer relapse [Internet]. 2017 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28092017-112917/

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