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Artigo de periodico
CodAn: predictive models for precise identification of coding regions in eukaryotic transcripts (2021)
Nachtigall, Pedro Gabriel ; Kashiwabara, André Yoshiaki ; Durham, Alan Mitchell
Source: Briefings in Bioinformatics. Unidade: IME
Subjects: BIOINFORMÁTICA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
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ABNT
NACHTIGALL, Pedro Gabriel e KASHIWABARA, André Yoshiaki e DURHAM, Alan Mitchell. CodAn: predictive models for precise identification of coding regions in eukaryotic transcripts. Briefings in Bioinformatics, v. 22, n. 3, p. 1-11, 2021Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1093/bib/bbaa045. Acesso em: 03 nov. 2024.
APA
Nachtigall, P. G., Kashiwabara, A. Y., & Durham, A. M. (2021). CodAn: predictive models for precise identification of coding regions in eukaryotic transcripts. Briefings in Bioinformatics, 22( 3), 1-11. doi:10.1093/bib/bbaa045
NLM
Nachtigall PG, Kashiwabara AY, Durham AM. CodAn: predictive models for precise identification of coding regions in eukaryotic transcripts [Internet]. Briefings in Bioinformatics. 2021 ; 22( 3): 1-11.[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bib/bbaa045
Vancouver
Nachtigall PG, Kashiwabara AY, Durham AM. CodAn: predictive models for precise identification of coding regions in eukaryotic transcripts [Internet]. Briefings in Bioinformatics. 2021 ; 22( 3): 1-11.[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bib/bbaa045
Artigo de periodico
A novel decomposing model with evolutionary algorithms for feature selection in long non-coding RNAs (2020)
Bonidia, Robson Parmezan ; Machida, Jaqueline Sayuri; Negri, Tatianne Costa ; Alves, Wonder Alexandre Luz ; Kashiwabara, André Yoshiaki ; Domingues, Douglas S ; Carvalho, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de ; Paschoal, Alexandre Rossi ; Sanches, Danilo Sipoli
Source: IEEE Access. Unidade: ICMC
Subjects: APRENDIZADO COMPUTACIONAL, BIOINFORMÁTICA, HEURÍSTICA, ALGORITMOS GENÉTICOS, RNA
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ABNT
BONIDIA, Robson Parmezan et al. A novel decomposing model with evolutionary algorithms for feature selection in long non-coding RNAs. IEEE Access, v. 8, p. 181683-181697, 2020Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1109/ACCESS.2020.3028039. Acesso em: 03 nov. 2024.
APA
Bonidia, R. P., Machida, J. S., Negri, T. C., Alves, W. A. L., Kashiwabara, A. Y., Domingues, D. S., et al. (2020). A novel decomposing model with evolutionary algorithms for feature selection in long non-coding RNAs. IEEE Access, 8, 181683-181697. doi:10.1109/ACCESS.2020.3028039
NLM
Bonidia RP, Machida JS, Negri TC, Alves WAL, Kashiwabara AY, Domingues DS, Carvalho ACP de LF de, Paschoal AR, Sanches DS. A novel decomposing model with evolutionary algorithms for feature selection in long non-coding RNAs [Internet]. IEEE Access. 2020 ; 8 181683-181697.[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.1109/ACCESS.2020.3028039
Vancouver
Bonidia RP, Machida JS, Negri TC, Alves WAL, Kashiwabara AY, Domingues DS, Carvalho ACP de LF de, Paschoal AR, Sanches DS. A novel decomposing model with evolutionary algorithms for feature selection in long non-coding RNAs [Internet]. IEEE Access. 2020 ; 8 181683-181697.[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.1109/ACCESS.2020.3028039
Artigo de periodico
DNA methylation landscape of hepatoblastomas reveals arrest at early stages of liver differentiation and cancer-related alterations (2017)
Maschietto, Mariana; Rodrigues, Tatiane Cristina; Kashiwabara, André Yoshiaki; Araújo, Érica Sara Souza de; Aguiar, Talita Ferreira Marques; Costa, Cecília Maria Lima da; Cunha, Isabela Werneck da; Vasques, Luciana dos Reis; Cypriano, Monica; Brentani, Helena; Toledo, Silvia Regina Caminada de; Pearson, Peter Lees; Carraro, Dirce Maria; Rosenberg, Carla ; Krepischi, Ana Cristina Victorino
Source: Oncotarget. Unidades: FM, IB
Subjects: NEOPLASIAS HEPÁTICAS, CITOGENÉTICA, METILAÇÃO DE DNA, DIFERENCIAÇÃO CELULAR, EXPRESSÃO GÊNICA, GENÉTICA MÉDICA
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ABNT
MASCHIETTO, Mariana et al. DNA methylation landscape of hepatoblastomas reveals arrest at early stages of liver differentiation and cancer-related alterations. Oncotarget, v. No 2017, n. 58, p. 97871-97889, 2017Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.18632/oncotarget.14208. Acesso em: 03 nov. 2024.
APA
Maschietto, M., Rodrigues, T. C., Kashiwabara, A. Y., Araújo, É. S. S. de, Aguiar, T. F. M., Costa, C. M. L. da, et al. (2017). DNA methylation landscape of hepatoblastomas reveals arrest at early stages of liver differentiation and cancer-related alterations. Oncotarget, No 2017( 58), 97871-97889. doi:10.18632/oncotarget.14208
NLM
Maschietto M, Rodrigues TC, Kashiwabara AY, Araújo ÉSS de, Aguiar TFM, Costa CML da, Cunha IW da, Vasques L dos R, Cypriano M, Brentani H, Toledo SRC de, Pearson PL, Carraro DM, Rosenberg C, Krepischi ACV. DNA methylation landscape of hepatoblastomas reveals arrest at early stages of liver differentiation and cancer-related alterations [Internet]. Oncotarget. 2017 ; No 2017( 58): 97871-97889.[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.18632/oncotarget.14208
Vancouver
Maschietto M, Rodrigues TC, Kashiwabara AY, Araújo ÉSS de, Aguiar TFM, Costa CML da, Cunha IW da, Vasques L dos R, Cypriano M, Brentani H, Toledo SRC de, Pearson PL, Carraro DM, Rosenberg C, Krepischi ACV. DNA methylation landscape of hepatoblastomas reveals arrest at early stages of liver differentiation and cancer-related alterations [Internet]. Oncotarget. 2017 ; No 2017( 58): 97871-97889.[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.18632/oncotarget.14208
Artigo de periodico
DNA methylation levels of melanoma risk genes are associated with clinical characteristics of melanoma patients (2015)
Araújo, Érica Sara Souza de; Pramio, Dimitrius T; Kashiwabara, André Yoshiaki; Pennacchi, Paula Comune; Maria-Engler, Silvya Stuchi ; Achatz, Maria Isabel Alves de Souza Waddington; Campos, Antônio Hugo José Fróes Marques; Duprat, João P; Rosenberg, Carla ; Carraro, Dirce Maria; Krepischi, Ana Cristina Victorino
Source: BioMed Research International. Unidades: FCF, IB
Subjects: MELANOMA, DNA
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ABNT
ARAÚJO, Érica Sara Souza de et al. DNA methylation levels of melanoma risk genes are associated with clinical characteristics of melanoma patients. BioMed Research International, p. 1-8 art. 376423, 2015Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1155/2015/376423. Acesso em: 03 nov. 2024.
APA
Araújo, É. S. S. de, Pramio, D. T., Kashiwabara, A. Y., Pennacchi, P. C., Maria-Engler, S. S., Achatz, M. I. A. de S. W., et al. (2015). DNA methylation levels of melanoma risk genes are associated with clinical characteristics of melanoma patients. BioMed Research International, 1-8 art. 376423. doi:10.1155/2015/376423
NLM
Araújo ÉSS de, Pramio DT, Kashiwabara AY, Pennacchi PC, Maria-Engler SS, Achatz MIA de SW, Campos AHJFM, Duprat JP, Rosenberg C, Carraro DM, Krepischi ACV. DNA methylation levels of melanoma risk genes are associated with clinical characteristics of melanoma patients [Internet]. BioMed Research International. 2015 ; 1-8 art. 376423.[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.1155/2015/376423
Vancouver
Araújo ÉSS de, Pramio DT, Kashiwabara AY, Pennacchi PC, Maria-Engler SS, Achatz MIA de SW, Campos AHJFM, Duprat JP, Rosenberg C, Carraro DM, Krepischi ACV. DNA methylation levels of melanoma risk genes are associated with clinical characteristics of melanoma patients [Internet]. BioMed Research International. 2015 ; 1-8 art. 376423.[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.1155/2015/376423
Tese (Doutorado)
MYOP/ToPS/SGEval: um ambiente computacional para estudo sistemático de predição de genes (2011)
Kashiwabara, André Yoshiaki ; Durham, Alan Mitchell (Orientador)
Unidade: IME
Assunto: COMPUTAÇÃO APLICADA
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ABNT
KASHIWABARA, André Yoshiaki. MYOP/ToPS/SGEval: um ambiente computacional para estudo sistemático de predição de genes. 2011. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2011. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-02042012-184145/. Acesso em: 03 nov. 2024.
APA
Kashiwabara, A. Y. (2011). MYOP/ToPS/SGEval: um ambiente computacional para estudo sistemático de predição de genes (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-02042012-184145/
NLM
Kashiwabara AY. MYOP/ToPS/SGEval: um ambiente computacional para estudo sistemático de predição de genes [Internet]. 2011 ;[citado 2024 nov. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-02042012-184145/
Vancouver
Kashiwabara AY. MYOP/ToPS/SGEval: um ambiente computacional para estudo sistemático de predição de genes [Internet]. 2011 ;[citado 2024 nov. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-02042012-184145/
Trabalho de evento-anais periodico
Decreasing the number of false positives in sequence classification (2010)
Lima, Ariane Machado ; Kashiwabara, André Yoshiaki ; Durham, Alan Mitchell
Source: BMC Genomics. Conference titles: International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Unidades: EACH, IME
Assunto: BIOINFORMÁTICA
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ABNT
LIMA, Ariane Machado e KASHIWABARA, André Yoshiaki e DURHAM, Alan Mitchell. Decreasing the number of false positives in sequence classification. BMC Genomics. London: Escola de Artes, Ciências e Humanidades, Universidade de São Paulo. Disponível em: https://doi.org/10.1186/1471-2164-11-S5-S10. Acesso em: 03 nov. 2024. , 2010
APA
Lima, A. M., Kashiwabara, A. Y., & Durham, A. M. (2010). Decreasing the number of false positives in sequence classification. BMC Genomics. London: Escola de Artes, Ciências e Humanidades, Universidade de São Paulo. doi:10.1186/1471-2164-11-S5-S10
NLM
Lima AM, Kashiwabara AY, Durham AM. Decreasing the number of false positives in sequence classification [Internet]. BMC Genomics. 2010 ; 11[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2164-11-S5-S10
Vancouver
Lima AM, Kashiwabara AY, Durham AM. Decreasing the number of false positives in sequence classification [Internet]. BMC Genomics. 2010 ; 11[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.1186/1471-2164-11-S5-S10
Dissertação (Mestrado)
MYOP: um arcabouço para predição de genes ab initio (2007)
Kashiwabara, André Yoshiaki; Durham, Alan Mitchell (Orientador)
Unidade: IME
Assunto: COMPUTAÇÃO APLICADA
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ABNT
KASHIWABARA, André Yoshiaki. MYOP: um arcabouço para predição de genes ab initio. 2007. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2007. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-25112009-151237/. Acesso em: 03 nov. 2024.
APA
Kashiwabara, A. Y. (2007). MYOP: um arcabouço para predição de genes ab initio (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-25112009-151237/
NLM
Kashiwabara AY. MYOP: um arcabouço para predição de genes ab initio [Internet]. 2007 ;[citado 2024 nov. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-25112009-151237/
Vancouver
Kashiwabara AY. MYOP: um arcabouço para predição de genes ab initio [Internet]. 2007 ;[citado 2024 nov. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-25112009-151237/
Artigo de periodico
EGene: a configurable pipeline generation system for automated sequence analysis (2005)
Durham, Alan Mitchell ; Kashiwabara, André Yoshiaki; Matsunaga, Fernando Tadashi Guerrera; Ahagon, P. H.; Rainone, Flávia; Varuzza, Leonardo; Gruber, Arthur
Source: Bioinformatics. Unidades: IME, FMVZ
Subjects: COMPUTAÇÃO APLICADA, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
DURHAM, Alan Mitchell et al. EGene: a configurable pipeline generation system for automated sequence analysis. Bioinformatics, v. 21, n. 12, p. 15 2812–2813, 2005Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti424. Acesso em: 03 nov. 2024.
APA
Durham, A. M., Kashiwabara, A. Y., Matsunaga, F. T. G., Ahagon, P. H., Rainone, F., Varuzza, L., & Gruber, A. (2005). EGene: a configurable pipeline generation system for automated sequence analysis. Bioinformatics, 21( 12), 15 2812–2813. doi:10.1093/bioinformatics/bti424
NLM
Durham AM, Kashiwabara AY, Matsunaga FTG, Ahagon PH, Rainone F, Varuzza L, Gruber A. EGene: a configurable pipeline generation system for automated sequence analysis [Internet]. Bioinformatics. 2005 ; 21( 12): 15 2812–2813.[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti424
Vancouver
Durham AM, Kashiwabara AY, Matsunaga FTG, Ahagon PH, Rainone F, Varuzza L, Gruber A. EGene: a configurable pipeline generation system for automated sequence analysis [Internet]. Bioinformatics. 2005 ; 21( 12): 15 2812–2813.[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti424
Trabalho de evento-resumo
The Eimeria ORESTES project: a preliminary analysis of 33,000 ESTs from Eimeria tenella, E. acervulina and E. maxima (2004)
Dias, Jeniffer Novaes G; Fernandez, Sandra; Mello, Joana Carvalho M; Nagao, Luciana Terumi; Sobreira, Tiago J. Paschoal; Kashiwabara, André Yoshiaki; Durham, Alan Mitchell ; Gruber, Arthur ; Madeira, Alda Maria Backx Noronha
Source: Resumos. Conference titles: Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology. Unidades: FMVZ, IME
Assunto: EIMERIA
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ABNT
DIAS, Jeniffer Novaes G et al. The Eimeria ORESTES project: a preliminary analysis of 33,000 ESTs from Eimeria tenella, E. acervulina and E. maxima. 2004, Anais.. São Paulo: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, 2004. . Acesso em: 03 nov. 2024.
APA
Dias, J. N. G., Fernandez, S., Mello, J. C. M., Nagao, L. T., Sobreira, T. J. P., Kashiwabara, A. Y., et al. (2004). The Eimeria ORESTES project: a preliminary analysis of 33,000 ESTs from Eimeria tenella, E. acervulina and E. maxima. In Resumos. São Paulo: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo.
NLM
Dias JNG, Fernandez S, Mello JCM, Nagao LT, Sobreira TJP, Kashiwabara AY, Durham AM, Gruber A, Madeira AMBN. The Eimeria ORESTES project: a preliminary analysis of 33,000 ESTs from Eimeria tenella, E. acervulina and E. maxima. Resumos. 2004 ;[citado 2024 nov. 03 ]
Vancouver
Dias JNG, Fernandez S, Mello JCM, Nagao LT, Sobreira TJP, Kashiwabara AY, Durham AM, Gruber A, Madeira AMBN. The Eimeria ORESTES project: a preliminary analysis of 33,000 ESTs from Eimeria tenella, E. acervulina and E. maxima. Resumos. 2004 ;[citado 2024 nov. 03 ]

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