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Tese

Evaluation of polygenic risk scores for ER+/HER2- breast cancer in Brazilian women (2024)

  • Authors:
  • Autor USP: LEMOS, MARINA CANDIDO VISONTAI CORMEDI - FMRP
  • Unidade: FMRP
  • DOI: 10.11606/T.17.2024.tde-21012025-114323
  • Subjects: NEOPLASIAS MAMÁRIAS; PREDISPOSIÇÃO GENÉTICA PARA DOENÇA; MULHERES
  • Keywords: Breast cancer; Câncer de mama; Escore de risco poligênico; Genetic susceptibility to cancer; Polygenic risk score; Prevenção; Prevention; Susceptibilidade genética a câncer
  • Agências de fomento:
  • Language: Inglês
  • Abstract: Escores de risco poligênicos (ERP) são ferramentas para quantificar o risco germinativo de desenvolvimento de determinados fenótipos baseado na contribuição genética de alelos comuns. Baseiam-se em polimorfismos identificados por meio de estudos de associação genômica, que incluem majoritariamente indivíduos de ancestralidade europeia. Devido a diferenças de frequência alélica e de desequilíbrio de ligação, a habilidade de predição de risco de ERP em populações não europeias é menor, o que pode limitar sua aplicabilidade clínica. Para câncer de mama, estima-se que 45% da herdabilidade da doença seja explicada por alelos comuns, sendo essa fração maior (54%) para tumores que expressam receptores de estrogênio (RE+) e não expressam HER2 (HER2-). Diversos ERP para câncer de mama foram desenvolvidos e validados em população europeia; entretanto, os dados sobre a performance de ERP para câncer de mama em mulheres brasileiras são escassos. Este estudo objetiva avaliar ERP previamente desenvolvidos para predição de risco de câncer de mama RE+/HER2- em mulheres brasileiras. Foram incluídas 931 mulheres com idade ≤18 anos e diagnóstico de câncer de mama RE+/HER2-, provenientes de 5 hospitais de 3 regiões do Brasil. Dessas, 772 tiveram amostra disponível para genotipagem com o chip Illumina Global Screening Array v3.0. Como controles, foram utilizados os dados de 1048 mulheres com idade ≤18 anos sem câncer de mama previamente genotipadas. Após controle de qualidade, 1797 amostras (754 casos e 1043 controles) foram imputadas e 120 ERP para câncer de mama foram calculados. A associação dos escores com risco de câncer de mama RE+/HER2- foi estimada por regressão logística ajustada por idade e por estrutura populacional. A ancestralidade genética foi estimada pelo GRAF POP. Os riscos absolutos de câncer de mama foram estimados nas ferramentas GenoPred Tools e CanRisk. A análise estatística foi realizada em R ep-valor ≤ 0.001 foi considerado estatisticamente significativo. Dos 120 escores avaliados, 109 foram estatisticamente associados ao câncer de mama RE+/HER2-. O escore de melhor desempenho, que incluiu 1.120.410 SNPs (1.120.053 validados), a razão de chances (OR) por desvio padrão (DP) foi de 2,086 (intervalo de confiança [IC] de 95%: 1,811-2,409). A área sob a curva característica de operação do receptor (AUC) de 0,652 (IC 95% 0,627-0,678). Quando comparado com indivíduos com ancestralidade genética europeia (n=480), o desempenho do escore foi semelhante naqueles classificados como latino-americanos (n=985). No entanto, para outros escores, diferenças de performance foram observadas. O risco absoluto de câncer de mama ao longo da vida foi de 2% para mulheres que estão no 1% mais baixo do PRS e em 36,1% para aquelas que estão nos 99% superiores A incorporação do PRS no modelo CanRisk reclassificou 10,75% das mulheres jovens (com idade <41 anos) num estrato de risco absoluto mais elevado, sugerindo potenciais benefícios para medidas de rastreio precoce. Esses resultados indicam que ERP desenvolvidos em população de ascendência europeia se correlacionam com o câncer de mama ER+/HER2- na população brasileira, mas podem ter desempenhos diferentes de acordo com a ancestralidade genética. Estudos de GWAS específicos poderão melhor a estratificação de risco de escores poligênicos em populações miscigenadas
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 31.07.2024
    • Acesso à fonteAcesso à fonteDOI
    Informações sobre o DOI: 10.11606/T.17.2024.tde-21012025-114323 (Fonte: oaDOI API)
    • Este periódico é de acesso aberto
    • Este artigo é de acesso aberto
    • URL de acesso aberto
    • Cor do Acesso Aberto: gold
    • Licença: cc-by-nc-sa
    How to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      LEMOS, Marina Candido Visontai Cormedi. Evaluation of polygenic risk scores for ER+/HER2- breast cancer in Brazilian women. 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17154/tde-21012025-114323/. Acesso em: 29 dez. 2025.

    • APA

      Lemos, M. C. V. C. (2024). Evaluation of polygenic risk scores for ER+/HER2- breast cancer in Brazilian women (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17154/tde-21012025-114323/

    • NLM

      Lemos MCVC. Evaluation of polygenic risk scores for ER+/HER2- breast cancer in Brazilian women [Internet]. 2024 ;[citado 2025 dez. 29 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17154/tde-21012025-114323/

    • Vancouver

      Lemos MCVC. Evaluation of polygenic risk scores for ER+/HER2- breast cancer in Brazilian women [Internet]. 2024 ;[citado 2025 dez. 29 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17154/tde-21012025-114323/

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