Análise teórica da topologia da densidade de carga eletrônica em sistemas periódicos tridimensionais (2019)
- Authors:
- Autor USP: WANDERLEY, ADILSON BARROS - IFSC
- Unidade: IFSC
- Sigla do Departamento: FCI
- Subjects: DENSIDADE; CARGA ELÉTRICA; TOPOLOGIA; ÁTOMOS; MOLÉCULA
- Keywords: Átomos em moléculas; Atoms in molecules; Cocristal fármaco-fármaco; Densidade de carga eletrônica; Density functional theory; Drug-drug cocrystals; Electron density; Teoria do funcional da densidade; Topology
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Cocristais fármaco-fármaco envolvem a junção de dois ou mais insumos farmacêuticos ativos (IFAs), preservando seu caráter neutro e sem a necessidade de quebra ou formação de ligação covalente, mantendo desta maneira sua eficácia. Propriedades dos IFAs em estado sólido, como as interações entre grupos farmacofóricos e receptores, são determinadas pela polaridade dos grupos funcionais e potencial eletrostático assim como pelas interações intermoleculares, que por sua vez dependem das características eletrônicas e moleculares do arranjo tridimensional. Propriedades eletrônicas moleculares e sua relação com a topologia da densidade de carga eletrônica é parte dos estudos teóricos apresentados neste trabalho. Estes estudos envolvem cálculos da distribuição da densidade de carga eletrônica e sua topologia por meio da Teoria Quântica de Átomos em Moléculas AIM (do inglês, atoms in molecules) de Bader. Neste contexto, o presente trabalho apresentou cálculos teóricos da densidade de carga em um sistema periódico tridimensional, utilizando como modelo de partida os dados cristalográficos do cocristal fármaco-fármaco constituído da 5-Fluorocitosina (antimetabólito) e da Isoniazida (tuberculostático), nomeado por 5FC-INH. A função de onda deste sistema foi calculada por meio da teoria do funcional da densidade DFT (do inglês, density functional theory), com alguns níveis de teoria em conjunto com funções de base, utilizando o pacote de programas CRYSTAL14. A distribuição da densidade decarga, resultante destes cálculos, foi analisada por meio da AIM utilizando alguns descritores topológicos, como densidade de carga, Laplaciano da densidade de carga e a elipticidade nos pontos críticos das ligações de enlace covalentes e as interações intermoleculares da unidade assimétrica. Uma análise preliminar dos valores da densidade de carga eletrônica, calculada nos pontos críticos de ligação da 5FC-INH, permitiu selecionar o nível de teoria e conjunto de funções base que melhor reproduziu os dados experimentais, como sendo o B3LYP/6-311++G**. Os valores dos descritores, obtidos dos cálculos com este nível de teoria, foram comparados com os provenientes dos experimentos de difração de raios X de alta resolução e resultaram em boa concordância na descrição da topologia da densidade de carga eletrônica. Os descritores apresentaram valores muito próximos dos reportados na literatura para os grupos funcionais da 5-FC e da INH. Imagens dos mapas das trajetórias do gradiente e do Laplaciano da densidade de carga, dos caminhos de ligação e dos contornos das bacias atômicas, permitiram visualizar as regiões de depleção e acúmulo da densidade de carga. Por meio destas representações foi possível descrever as ligações de hidrogênio responsáveis pela estabilização do cocristal, as ligações químicas covalentes, as deformações das bacias atômicas que caracterizam as polarizações e os mapas do Laplaciano que permitem observar os pares solitários de elétrons, como dos átomos deflúor, oxigênio e nitrogênio
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2019
- Data da defesa: 29.07.2019
-
ABNT
WANDERLEY, Adilson Barros. Análise teórica da topologia da densidade de carga eletrônica em sistemas periódicos tridimensionais. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-30092019-141547/. Acesso em: 07 maio 2024. -
APA
Wanderley, A. B. (2019). Análise teórica da topologia da densidade de carga eletrônica em sistemas periódicos tridimensionais (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-30092019-141547/ -
NLM
Wanderley AB. Análise teórica da topologia da densidade de carga eletrônica em sistemas periódicos tridimensionais [Internet]. 2019 ;[citado 2024 maio 07 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-30092019-141547/ -
Vancouver
Wanderley AB. Análise teórica da topologia da densidade de carga eletrônica em sistemas periódicos tridimensionais [Internet]. 2019 ;[citado 2024 maio 07 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-30092019-141547/ - Método de fitting de estruturas de bandas a partir de estratégias envolvendo propriedades de simetria
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