Estudo de associação genômica ampla para as diferenças genéticas entre as marchas batida e picada em equinos Mangalarga Marchador (2018)
- Authors:
- Autor USP: BUSSIMAN, FERNANDO DE OLIVEIRA - FZEA
- Unidade: FZEA
- Sigla do Departamento: VNP
- Subjects: MARCADOR MOLECULAR; MELHORAMENTO GENÉTICO ANIMAL; ALELOS; CAVALO MANGALARGA MARCHADOR
- Language: Português
- Abstract: O gene DMRT3 tem sido descrito como o principal gene a atuar na determinação da marcha em diversas raças equinas. O alelo A do SNP 23:g.22999655C>A do DMRT3 foi apontado como responsável por essa característica. Na raça brasileira Mangalarga Marchador, a qual apresenta dois padrões de marcha com características bem definidas, os genótipos AA e CA vem sendo associados à marcha picada e o genótipo CC à marcha batida. O objetivo geral do presente prospectar regiões genômicas associadas às marchas batida e picada em equinos Mangalarga Marchador. Foram utilizados 1.230 dados fenotípicos sobre o tipo de andamento (marcha batida N = 1.006; marcha picada N = 227) e, considerando a totalidade da genealogia conhecida para cada animal, 3172 animais no pedigree. Primeiramente foram testadas estratégias de modelagem para esta característica a fim de determinar os efeitos a serem considerados no modelo, bem como a melhor forma de inclusão (efeito fixo ou aleatório). Posteriormente, foi estudada a relação entre as frequências alélicas e genotípicas do gene DMRT3 com os padrões de parentesco e endogamia de acordo com cada tipo de marcha. Um estudo de associação genômica ampla em passo único (considerando informações de animais genotipados e não-genotipados simultaneamente) foi conduzido para verificar regiões genômicas, polimorfismos de nucleotídeo único e genes relacionados com a determinação do tipo de marcha em cavalos Mangalarga Marchador. Vinte e dois polimorfismos de nucleotídeoúnico localizados nos cromossomos 4(N = 5), 6 (2), 16 (1), 23 (11), 26 (1) e 29 (2), foram responsáveis por 42,43% da variância genética aditiva. Foram associados ao tipo de marcha 69 genes, mas cerca de 39 não estavam anotados em equinos. Foi conduzido um blast a fim de recuperar a função mais provável destes genes. Foram encontradas oito vias metabólicas associadas ao tipo de marcha. Os principais genes envolvidos estavam relacionados à percepção de estímulos externos, metabolismo energético-oxidativo, sistema imune e aprendizado e ritmo da locomoção. Não foi possível identificar a(s) variante(s) causal(ais) do tipo de marcha, contudo este estudo foi o primeiro e verificar que a possível determinação genética do tipo de marcha em cavalos Mangalarga Marchador passa por diferenças em níveis metabólicos que garantem a adaptação dos animais ao tipo de andamento
- Imprenta:
- Publisher place: Pirassununga
- Date published: 2018
- Data da defesa: 13.12.2018
-
ABNT
BUSSIMAN, Fernando de Oliveira. Estudo de associação genômica ampla para as diferenças genéticas entre as marchas batida e picada em equinos Mangalarga Marchador. 2018. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-14032019-110207/. Acesso em: 05 jun. 2025. -
APA
Bussiman, F. de O. (2018). Estudo de associação genômica ampla para as diferenças genéticas entre as marchas batida e picada em equinos Mangalarga Marchador (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Pirassununga. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-14032019-110207/ -
NLM
Bussiman F de O. Estudo de associação genômica ampla para as diferenças genéticas entre as marchas batida e picada em equinos Mangalarga Marchador [Internet]. 2018 ;[citado 2025 jun. 05 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-14032019-110207/ -
Vancouver
Bussiman F de O. Estudo de associação genômica ampla para as diferenças genéticas entre as marchas batida e picada em equinos Mangalarga Marchador [Internet]. 2018 ;[citado 2025 jun. 05 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-14032019-110207/ - Avaliação genética de cavalos Campolina: do pedigree à possibilidade de seleção genômica
- Genomic analysis of the population structure in horses of the Brazilian Mangalarga Marchador breed
- Genome-wide scans for signatures of selection in Mangalarga Marchador horses using high-throughput SNP genotyping
- Integrating audio signal processing and deep learning algorithms for gait pattern classification in Brazilian gaited horses
- Efeitos de meio e avaliação genética para variáveis cinemáticas de andamento em equinos marchadores
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