ReP USP - Resultado da busca

Tese (Doutorado)
Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum (2025)
Muñoz-Pérez, Jorge Mario; Pachón, Diego Mauricio Riaño (Orientador)
Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, GENÔMICA, CANA-DE-AÇÚCAR, SORGO
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
MUÑOZ-PÉREZ, Jorge Mario. Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-25042025-121333/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Muñoz-Pérez, J. M. (2025). Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-25042025-121333/
NLM
Muñoz-Pérez JM. Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-25042025-121333/
Vancouver
Muñoz-Pérez JM. Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum [Internet]. 2025 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-25042025-121333/
Artigo de periodico
PGPg_finder: a comprehensive and user-friendly pipeline for identifying plant growth-promoting genes in genomic and metagenomic data (2024)
Pellegrinetti, Thierry Alexandre ; Monteiro, Gabriel Gustavo Tavares Nunes ; Lemos, Leandro Nascimento ; Santos, Renato Augusto Corrêa dos ; Barros, Artur Gomes ; Mendes, Lucas William
Source: Rhizosphere. Unidade: CENA
Subjects: PLANTAS, CRESCIMENTO VEGETAL, BIOMA, SOLOS, BIOINFORMÁTICA, GENES, GENÉTICA VEGETAL
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PELLEGRINETTI, Thierry Alexandre et al. PGPg_finder: a comprehensive and user-friendly pipeline for identifying plant growth-promoting genes in genomic and metagenomic data. Rhizosphere, v. 30, p. 1-9, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.rhisph.2024.100905. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Pellegrinetti, T. A., Monteiro, G. G. T. N., Lemos, L. N., Santos, R. A. C. dos, Barros, A. G., & Mendes, L. W. (2024). PGPg_finder: a comprehensive and user-friendly pipeline for identifying plant growth-promoting genes in genomic and metagenomic data. Rhizosphere, 30, 1-9. doi:10.1016/j.rhisph.2024.100905
NLM
Pellegrinetti TA, Monteiro GGTN, Lemos LN, Santos RAC dos, Barros AG, Mendes LW. PGPg_finder: a comprehensive and user-friendly pipeline for identifying plant growth-promoting genes in genomic and metagenomic data [Internet]. Rhizosphere. 2024 ; 30 1-9.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.rhisph.2024.100905
Vancouver
Pellegrinetti TA, Monteiro GGTN, Lemos LN, Santos RAC dos, Barros AG, Mendes LW. PGPg_finder: a comprehensive and user-friendly pipeline for identifying plant growth-promoting genes in genomic and metagenomic data [Internet]. Rhizosphere. 2024 ; 30 1-9.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.rhisph.2024.100905
Artigo de periodico
Unlocking biological activity and metabolomics insights: primary screening of cyanobacterial biomass from a tropical reservoir (2024)
Médice, Rhuana Valdetário ; Arruda, Renan Silva ; Yoon, Jaewon ; Borges, Ricardo Moreira ; Noyma, Natália Pessoa ; Lürling, Miquel ; Crnkovic, Camila Manoel ; Marinho, Marcelo Manzi ; Pinto, Ernani
Source: Environmental Toxicology and Chemistry. Unidades: FCF, CENA
Subjects: ALGAS, CYANOPHYTA, TOXICOLOGIA AMBIENTAL, ECOSSISTEMAS, METABÓLITOS, BIOINFORMÁTICA, CROMATOGRAFIA LÍQUIDA, ESPECTROMETRIA DE MASSAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
MÉDICE, Rhuana Valdetário et al. Unlocking biological activity and metabolomics insights: primary screening of cyanobacterial biomass from a tropical reservoir. Environmental Toxicology and Chemistry, v. 43, n. 10, p. 2222-2231, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1002/etc.5962. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Médice, R. V., Arruda, R. S., Yoon, J., Borges, R. M., Noyma, N. P., Lürling, M., et al. (2024). Unlocking biological activity and metabolomics insights: primary screening of cyanobacterial biomass from a tropical reservoir. Environmental Toxicology and Chemistry, 43( 10), 2222-2231. doi:10.1002/etc.5962
NLM
Médice RV, Arruda RS, Yoon J, Borges RM, Noyma NP, Lürling M, Crnkovic CM, Marinho MM, Pinto E. Unlocking biological activity and metabolomics insights: primary screening of cyanobacterial biomass from a tropical reservoir [Internet]. Environmental Toxicology and Chemistry. 2024 ; 43( 10): 2222-2231.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1002/etc.5962
Vancouver
Médice RV, Arruda RS, Yoon J, Borges RM, Noyma NP, Lürling M, Crnkovic CM, Marinho MM, Pinto E. Unlocking biological activity and metabolomics insights: primary screening of cyanobacterial biomass from a tropical reservoir [Internet]. Environmental Toxicology and Chemistry. 2024 ; 43( 10): 2222-2231.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1002/etc.5962
Artigo de periodico
Bioinformatic insights into sugar signaling pathways in sugarcane growth (2024)
Oliveira, Lauana Pereira de ; Pereira, João Pedro de Jesus ; Navarro, Bruno Viana ; Martins, Marina Camara Mattos ; Riaño-Pachón, Diego Mauricio ; Buckeridge, Marcos
Source: Scientific Reports. Unidades: CENA, IB
Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR, CARBOIDRATOS, BIOINFORMÁTICA, CINÉTICA, SACAROSE, AMINOÁCIDOS, BIOTECNOLOGIA DE PLANTAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
OLIVEIRA, Lauana Pereira de et al. Bioinformatic insights into sugar signaling pathways in sugarcane growth. Scientific Reports, v. 14, p. 1-14, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1038/s41598-024-75220-8. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Oliveira, L. P. de, Pereira, J. P. de J., Navarro, B. V., Martins, M. C. M., Riaño-Pachón, D. M., & Buckeridge, M. (2024). Bioinformatic insights into sugar signaling pathways in sugarcane growth. Scientific Reports, 14, 1-14. doi:10.1038/s41598-024-75220-8
NLM
Oliveira LP de, Pereira JP de J, Navarro BV, Martins MCM, Riaño-Pachón DM, Buckeridge M. Bioinformatic insights into sugar signaling pathways in sugarcane growth [Internet]. Scientific Reports. 2024 ; 14 1-14.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-024-75220-8
Vancouver
Oliveira LP de, Pereira JP de J, Navarro BV, Martins MCM, Riaño-Pachón DM, Buckeridge M. Bioinformatic insights into sugar signaling pathways in sugarcane growth [Internet]. Scientific Reports. 2024 ; 14 1-14.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-024-75220-8
Dissertação (Mestrado)
Caracterização molecular de genes endógenos no genoma da cana-de-açúcar por captura e sequenciamento de DNA de terceira geração (2023)
Poletto, Isabella de Oliveira Conte; Pachón, Diego Mauricio Riaño (Orientador)
Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, BIOLOGIA MOLECULAR VEGETAL, DADOS DE SEQUÊNCIA MOLECULAR, GENÔMICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
POLETTO, Isabella de Oliveira Conte. Caracterização molecular de genes endógenos no genoma da cana-de-açúcar por captura e sequenciamento de DNA de terceira geração. 2023. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27082024-150345/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Poletto, I. de O. C. (2023). Caracterização molecular de genes endógenos no genoma da cana-de-açúcar por captura e sequenciamento de DNA de terceira geração (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27082024-150345/
NLM
Poletto I de OC. Caracterização molecular de genes endógenos no genoma da cana-de-açúcar por captura e sequenciamento de DNA de terceira geração [Internet]. 2023 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27082024-150345/
Vancouver
Poletto I de OC. Caracterização molecular de genes endógenos no genoma da cana-de-açúcar por captura e sequenciamento de DNA de terceira geração [Internet]. 2023 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27082024-150345/
Tese (Doutorado)
Biossíntese de metabólitos fotoprotetores em cianobactérias isoladas do Pantanal brasileiro (2023)
Dextro, Rafael Barty; Fiore, Marli de Fatima (Orientador)
Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, BIOQUÍMICA MICROBIANA, CROMATOGRAFIA LÍQUIDA DE ALTA EFICIÊNCIA, CYANOPHYTA, ECOLOGIA MICROBIANA, ENZIMOLOGIA, GENÉTICA MICROBIANA, METABÓLITOS SECUNDÁRIOS, RADIAÇÃO ULTRAVIOLETA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
DEXTRO, Rafael Barty. Biossíntese de metabólitos fotoprotetores em cianobactérias isoladas do Pantanal brasileiro. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-28082023-090425/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Dextro, R. B. (2023). Biossíntese de metabólitos fotoprotetores em cianobactérias isoladas do Pantanal brasileiro (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-28082023-090425/
NLM
Dextro RB. Biossíntese de metabólitos fotoprotetores em cianobactérias isoladas do Pantanal brasileiro [Internet]. 2023 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-28082023-090425/
Vancouver
Dextro RB. Biossíntese de metabólitos fotoprotetores em cianobactérias isoladas do Pantanal brasileiro [Internet]. 2023 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-28082023-090425/
Artigo de periodico
Making sense of complexity: Advances in bioinformatics for plant biology (2023)
Emelianova, Katie ; Riaño-Pachón, Diego Mauricio ; Torres Jimenez, Maria Fernanda
Source: Applications in Plant Sciences. Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, BIOLOGIA VEGETAL, SEGURANÇA ALIMENTAR, BIOTECNOLOGIA DE PLANTAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
EMELIANOVA, Katie e RIAÑO-PACHÓN, Diego Mauricio e TORRES JIMENEZ, Maria Fernanda. Making sense of complexity: Advances in bioinformatics for plant biology. Applications in Plant Sciences, v. 11, 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1002/aps3.11538. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Emelianova, K., Riaño-Pachón, D. M., & Torres Jimenez, M. F. (2023). Making sense of complexity: Advances in bioinformatics for plant biology. Applications in Plant Sciences, 11. doi:10.1002/aps3.11538
NLM
Emelianova K, Riaño-Pachón DM, Torres Jimenez MF. Making sense of complexity: Advances in bioinformatics for plant biology [Internet]. Applications in Plant Sciences. 2023 ; 11[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1002/aps3.11538
Vancouver
Emelianova K, Riaño-Pachón DM, Torres Jimenez MF. Making sense of complexity: Advances in bioinformatics for plant biology [Internet]. Applications in Plant Sciences. 2023 ; 11[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1002/aps3.11538
Artigo de periodico
Bioinformatic analyses to uncover genes involved in trehalose metabolism in the polyploid sugarcane (2022)
Oliveira, Lauana P. de ; Navarro, Bruno Viana ; Pereira, João Pedro de Jesus ; Lopes, Adriana Rios ; Martins, Marina C. M ; Riaño-Pachón, Diego Mauricio ; Buckeridge, Marcos
Source: Scientific Reports. Unidades: CENA, IB
Subjects: BIOINFORMÁTICA, CANA-DE-AÇÚCAR, COMPUTAÇÃO EVOLUTIVA, ENZIMAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
OLIVEIRA, Lauana P. de et al. Bioinformatic analyses to uncover genes involved in trehalose metabolism in the polyploid sugarcane. Scientific Reports, v. 12, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1038/s41598-022-11508-x. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Oliveira, L. P. de, Navarro, B. V., Pereira, J. P. de J., Lopes, A. R., Martins, M. C. M., Riaño-Pachón, D. M., & Buckeridge, M. (2022). Bioinformatic analyses to uncover genes involved in trehalose metabolism in the polyploid sugarcane. Scientific Reports, 12. doi:10.1038/s41598-022-11508-x
NLM
Oliveira LP de, Navarro BV, Pereira JP de J, Lopes AR, Martins MCM, Riaño-Pachón DM, Buckeridge M. Bioinformatic analyses to uncover genes involved in trehalose metabolism in the polyploid sugarcane [Internet]. Scientific Reports. 2022 ; 12[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-022-11508-x
Vancouver
Oliveira LP de, Navarro BV, Pereira JP de J, Lopes AR, Martins MCM, Riaño-Pachón DM, Buckeridge M. Bioinformatic analyses to uncover genes involved in trehalose metabolism in the polyploid sugarcane [Internet]. Scientific Reports. 2022 ; 12[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-022-11508-x
Dissertação (Mestrado)
Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280 (2022)
Rossi, Verusca Semmler; Riaño-Pachón, Diego Mauricio (Orientador)
Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, BIOLOGIA MOLECULAR VEGETAL, EXPRESSÃO GÊNICA, FILOGENIA, GENES REGULADORES, GENÉTICA MOLECULAR VEGETAL, GENOMAS, REGULAÇÃO GÊNICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ROSSI, Verusca Semmler. Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-152934/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Rossi, V. S. (2022). Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280 (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-152934/
NLM
Rossi VS. Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280 [Internet]. 2022 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-152934/
Vancouver
Rossi VS. Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280 [Internet]. 2022 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-152934/
Tese (Doutorado)
Microbial communities and functional genes involved in nutrient cycling of Pantanal of Nhecolândia MS (2022)
Pellegrinetti, Thierry Alexandre; Fiore, Marli de Fatima (Orientador)
Unidade: CENA
Subjects: BACTÉRIAS, BIOINFORMÁTICA, CARBONO, CICLOS BIOGEOQUÍMICOS, DADOS DE SEQUÊNCIA MOLECULAR, ECOLOGIA MICROBIANA, LIMNOLOGIA, NITROGÊNIO
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PELLEGRINETTI, Thierry Alexandre. Microbial communities and functional genes involved in nutrient cycling of Pantanal of Nhecolândia MS. 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-155448/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Pellegrinetti, T. A. (2022). Microbial communities and functional genes involved in nutrient cycling of Pantanal of Nhecolândia MS (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-155448/
NLM
Pellegrinetti TA. Microbial communities and functional genes involved in nutrient cycling of Pantanal of Nhecolândia MS [Internet]. 2022 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-155448/
Vancouver
Pellegrinetti TA. Microbial communities and functional genes involved in nutrient cycling of Pantanal of Nhecolândia MS [Internet]. 2022 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-155448/
Artigo de periodico
CoCoView - A codon conservation viewer via sequence logos (2022)
Estevam, Beatriz Rodrigues ; Riaño-Pachón, Diego Mauricio
Source: MethodsX. Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, ANÁLISE SEQUENCIAL, NUCLEOTÍDEOS, AMINOÁCIDOS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ESTEVAM, Beatriz Rodrigues e RIAÑO-PACHÓN, Diego Mauricio. CoCoView - A codon conservation viewer via sequence logos. MethodsX, v. 9, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.mex.2022.101803. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Estevam, B. R., & Riaño-Pachón, D. M. (2022). CoCoView - A codon conservation viewer via sequence logos. MethodsX, 9. doi:10.1016/j.mex.2022.101803
NLM
Estevam BR, Riaño-Pachón DM. CoCoView - A codon conservation viewer via sequence logos [Internet]. MethodsX. 2022 ;9[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.mex.2022.101803
Vancouver
Estevam BR, Riaño-Pachón DM. CoCoView - A codon conservation viewer via sequence logos [Internet]. MethodsX. 2022 ;9[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.mex.2022.101803
Trabalho de evento-resumo periodico
ContFree-NGS: removing reads from contaminating organisms in next generation sequencing data (2021)
Peres, Felipe Vaz ; Riaño-Pachón, Diego Mauricio
Source: Advances in Bioinformatics and Computational Biology. Conference titles: Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB 2021). Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, SOFTWARES, CONTAMINAÇÃO, ZOOLOGIA (CLASSIFICAÇÃO)
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PERES, Felipe Vaz e RIAÑO-PACHÓN, Diego Mauricio. ContFree-NGS: removing reads from contaminating organisms in next generation sequencing data. Advances in Bioinformatics and Computational Biology. Heidelberg: Centro de Energia Nuclear na Agricultura, Universidade de São Paulo. . Acesso em: 15 nov. 2025. , 2021
APA
Peres, F. V., & Riaño-Pachón, D. M. (2021). ContFree-NGS: removing reads from contaminating organisms in next generation sequencing data. Advances in Bioinformatics and Computational Biology. Heidelberg: Centro de Energia Nuclear na Agricultura, Universidade de São Paulo.
NLM
Peres FV, Riaño-Pachón DM. ContFree-NGS: removing reads from contaminating organisms in next generation sequencing data. Advances in Bioinformatics and Computational Biology. 2021 ; 65-68.[citado 2025 nov. 15 ]
Vancouver
Peres FV, Riaño-Pachón DM. ContFree-NGS: removing reads from contaminating organisms in next generation sequencing data. Advances in Bioinformatics and Computational Biology. 2021 ; 65-68.[citado 2025 nov. 15 ]
Artigo de periodico
The experience of teaching introductory programming skills to bioscientists in Brazil (2021)
Zuvanov, Luíza ; Garcia, Ana Letycia Basso ; Correr, Fernando Henrique ; Bizarria Júnior, Rodolfo; Costa Filho, Ailton Pereira da ; Costa, Alisson Hayasi da 6; Thomaz, Andréa T. 7; Pinheiro, Ana Lúcia Mendes ; Riaño-Pachón, Diego Mauricio ; Winck, Flavia Vischi ; Esteves, Franciele Grego 4; Margarido, Gabriel Rodrigues Alves ; Casagrande, Giovanna Maria Stanfoca; Frajacomo, Henrique Cordeiro; Martins, Leonardo; Cavalheiro, Mariana Feitosa; Grachet, Nathalia Graf; Silva, Raniere Gaia Costa da; Cerri, Ricardo; Ramos, Rommel Thiago Juca; Medeiros, Simone Daniela Sartorio de; Tavares, Thayana Vieira; Santos, Renato Augusto Corrêa dos
Source: PLoS Computational Biology. Unidades: CENA, ESALQ, FCFRP, IFSC, FMRP
Subjects: BIOINFORMÁTICA, COVID-19, ENSINO POR COMPUTADOR, LINGUAGEM DE PROGRAMAÇÃO
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ZUVANOV, Luíza et al. The experience of teaching introductory programming skills to bioscientists in Brazil. PLoS Computational Biology, v. 17, n. 11, p. 1-16, 2021Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009534. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Zuvanov, L., Garcia, A. L. B., Correr, F. H., Bizarria Júnior, R., Costa Filho, A. P. da, Costa, A. H. da 6, et al. (2021). The experience of teaching introductory programming skills to bioscientists in Brazil. PLoS Computational Biology, 17( 11), 1-16. doi:10.1371/journal.pcbi.1009534
NLM
Zuvanov L, Garcia ALB, Correr FH, Bizarria Júnior R, Costa Filho AP da, Costa AH da 6, Thomaz AT 7, Pinheiro ALM, Riaño-Pachón DM, Winck FV, Esteves FG 4, Margarido GRA, Casagrande GMS, Frajacomo HC, Martins L, Cavalheiro MF, Grachet NG, Silva RGC da, Cerri R, Ramos RTJ, Medeiros SDS de, Tavares TV, Santos RAC dos. The experience of teaching introductory programming skills to bioscientists in Brazil [Internet]. PLoS Computational Biology. 2021 ; 17( 11): 1-16.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009534
Vancouver
Zuvanov L, Garcia ALB, Correr FH, Bizarria Júnior R, Costa Filho AP da, Costa AH da 6, Thomaz AT 7, Pinheiro ALM, Riaño-Pachón DM, Winck FV, Esteves FG 4, Margarido GRA, Casagrande GMS, Frajacomo HC, Martins L, Cavalheiro MF, Grachet NG, Silva RGC da, Cerri R, Ramos RTJ, Medeiros SDS de, Tavares TV, Santos RAC dos. The experience of teaching introductory programming skills to bioscientists in Brazil [Internet]. PLoS Computational Biology. 2021 ; 17( 11): 1-16.[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009534
Artigo de periodico
Trends in free-access genomic data accelerate advances in cyanobacteria taxonomy (2021)
Dextro, Rafael Barty ; Delbaje, Endrews ; Cotta, Simone Raposo ; Zehr, Jonathan P. ; Fiore, Marli de Fatima
Source: Journal of Phycology. Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, BASES DE DADOS, CYANOPHYTA, GENOMAS, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
DEXTRO, Rafael Barty et al. Trends in free-access genomic data accelerate advances in cyanobacteria taxonomy. Journal of Phycology, 2021Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1111/jpy.13200. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Dextro, R. B., Delbaje, E., Cotta, S. R., Zehr, J. P., & Fiore, M. de F. (2021). Trends in free-access genomic data accelerate advances in cyanobacteria taxonomy. Journal of Phycology. doi:10.1111/jpy.13200
NLM
Dextro RB, Delbaje E, Cotta SR, Zehr JP, Fiore M de F. Trends in free-access genomic data accelerate advances in cyanobacteria taxonomy [Internet]. Journal of Phycology. 2021 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1111/jpy.13200
Vancouver
Dextro RB, Delbaje E, Cotta SR, Zehr JP, Fiore M de F. Trends in free-access genomic data accelerate advances in cyanobacteria taxonomy [Internet]. Journal of Phycology. 2021 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.1111/jpy.13200
Artigo de periodico
Evaluating Eucalyptus leaf colonization by Brasilonema octagenarum (Cyanobacteria, Scytonemataceae) using in planta experiments and genomics (2020)
Alvarenga, Danillo Oliveira ; Franco, Maione W. ; Sivonen, Kaarina ; Fiore, Marli de Fatima ; Varani, Alessandro Melo
Source: PeerJ. Unidade: CENA
Subjects: CYANOPHYTA, EUCALIPTO, BIOINFORMÁTICA, GENÔMICA, MICROBIOLOGIA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ALVARENGA, Danillo Oliveira et al. Evaluating Eucalyptus leaf colonization by Brasilonema octagenarum (Cyanobacteria, Scytonemataceae) using in planta experiments and genomics. PeerJ, 2020Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.7717/peerj.9158. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Alvarenga, D. O., Franco, M. W., Sivonen, K., Fiore, M. de F., & Varani, A. M. (2020). Evaluating Eucalyptus leaf colonization by Brasilonema octagenarum (Cyanobacteria, Scytonemataceae) using in planta experiments and genomics. PeerJ. doi:10.7717/peerj.9158
NLM
Alvarenga DO, Franco MW, Sivonen K, Fiore M de F, Varani AM. Evaluating Eucalyptus leaf colonization by Brasilonema octagenarum (Cyanobacteria, Scytonemataceae) using in planta experiments and genomics [Internet]. PeerJ. 2020 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.7717/peerj.9158
Vancouver
Alvarenga DO, Franco MW, Sivonen K, Fiore M de F, Varani AM. Evaluating Eucalyptus leaf colonization by Brasilonema octagenarum (Cyanobacteria, Scytonemataceae) using in planta experiments and genomics [Internet]. PeerJ. 2020 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.7717/peerj.9158
Tese (Doutorado)
Integrative and in silico modeling of multi-omics data of Archaea and Bacteria phyla in Amazon soils (2019)
Lemos, Leandro Nascimento ; Tsai, Siu Mui (Orientador)
Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, ECOLOGIA MICROBIANA, MICROBIOLOGIA DO SOLO, SOLO TROPICAL
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
LEMOS, Leandro Nascimento. Integrative and in silico modeling of multi-omics data of Archaea and Bacteria phyla in Amazon soils. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-10022020-100957/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Lemos, L. N. (2019). Integrative and in silico modeling of multi-omics data of Archaea and Bacteria phyla in Amazon soils (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-10022020-100957/
NLM
Lemos LN. Integrative and in silico modeling of multi-omics data of Archaea and Bacteria phyla in Amazon soils [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-10022020-100957/
Vancouver
Lemos LN. Integrative and in silico modeling of multi-omics data of Archaea and Bacteria phyla in Amazon soils [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-10022020-100957/
Dissertação (Mestrado)
Caracterização funcional do gene codificador para transportador de amônio ScAMT3;3 de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) (2019)
Maniero, Rodolfo Augusto ; Figueira, Antonio Vargas de Oliveira (Orientador)
Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, CANA-DE-AÇÚCAR, ENGENHARIA GENÉTICA, GENÉTICA MOLECULAR VEGETAL, NITROGÊNIO, SACCHAROMYCES, TRANSLOCAÇÃO VEGETAL
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
MANIERO, Rodolfo Augusto. Caracterização funcional do gene codificador para transportador de amônio ScAMT3;3 de cana-de-açúcar (Saccharum spp.). 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2019. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-14072021-152236/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Maniero, R. A. (2019). Caracterização funcional do gene codificador para transportador de amônio ScAMT3;3 de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-14072021-152236/
NLM
Maniero RA. Caracterização funcional do gene codificador para transportador de amônio ScAMT3;3 de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-14072021-152236/
Vancouver
Maniero RA. Caracterização funcional do gene codificador para transportador de amônio ScAMT3;3 de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-14072021-152236/
Tese (Doutorado)
Microcosms and the role of active microbiota on methane cycle in soils under forest and pasture of Eastern Amazon (2019)
Nakamura, Fernanda Mancini ; Tsai, Siu Mui (Orientador)
Unidade: CENA
Subjects: BIOINFORMÁTICA, BIOLOGIA CELULAR, DNA, ECOLOGIA MICROBIANA, ISÓTOPOS ESTÁVEIS, METANO
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
NAKAMURA, Fernanda Mancini. Microcosms and the role of active microbiota on methane cycle in soils under forest and pasture of Eastern Amazon. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2019. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-14072021-141002/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Nakamura, F. M. (2019). Microcosms and the role of active microbiota on methane cycle in soils under forest and pasture of Eastern Amazon (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-14072021-141002/
NLM
Nakamura FM. Microcosms and the role of active microbiota on methane cycle in soils under forest and pasture of Eastern Amazon [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-14072021-141002/
Vancouver
Nakamura FM. Microcosms and the role of active microbiota on methane cycle in soils under forest and pasture of Eastern Amazon [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-14072021-141002/
Tese (Doutorado)
Molecular bioindicators prospection from maize rhizosphere microbiota to N2O gas mitigation under stover coverage (2018)
Yoshiura, Caio Augusto; Tsai, Siu Mui (Orientador)
Unidade: CENA
Subjects: BIOINDICADORES, BIOINFORMÁTICA, EFEITO ESTUFA, FERTILIZANTES NITROGENADOS, GENÔMICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
YOSHIURA, Caio Augusto. Molecular bioindicators prospection from maize rhizosphere microbiota to N2O gas mitigation under stover coverage. 2018. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-08102019-114320/. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Yoshiura, C. A. (2018). Molecular bioindicators prospection from maize rhizosphere microbiota to N2O gas mitigation under stover coverage (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-08102019-114320/
NLM
Yoshiura CA. Molecular bioindicators prospection from maize rhizosphere microbiota to N2O gas mitigation under stover coverage [Internet]. 2018 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-08102019-114320/
Vancouver
Yoshiura CA. Molecular bioindicators prospection from maize rhizosphere microbiota to N2O gas mitigation under stover coverage [Internet]. 2018 ;[citado 2025 nov. 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-08102019-114320/
Artigo de periodico
Genomic and genotypic characterization of Cylindrospermopsis raciborskii: toward an intraspecific phylogenetic evaluation by comparative genomics (2018)
Abreu, Vinicius Augusto Carvalho; Popin, Rafael Vicentini; Alvarenga, Danillo Oliveira de; Schaker, Patricia Dayane Carvalho; Hoff-Risseti, Caroline; Varani, Alessandro Melo; Fiore, Marli de Fatima
Source: Frontiers in Microbiology. Unidade: CENA
Subjects: CYANOPHYTA, GENOMAS, BIOINFORMÁTICA, PRODUTOS NATURAIS, FIXAÇÃO DE NITROGÊNIO
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ABREU, Vinicius Augusto Carvalho et al. Genomic and genotypic characterization of Cylindrospermopsis raciborskii: toward an intraspecific phylogenetic evaluation by comparative genomics. Frontiers in Microbiology, v. 9, 2018Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.00306. Acesso em: 15 nov. 2025.
APA
Abreu, V. A. C., Popin, R. V., Alvarenga, D. O. de, Schaker, P. D. C., Hoff-Risseti, C., Varani, A. M., & Fiore, M. de F. (2018). Genomic and genotypic characterization of Cylindrospermopsis raciborskii: toward an intraspecific phylogenetic evaluation by comparative genomics. Frontiers in Microbiology, 9. doi:10.3389/fmicb.2018.00306
NLM
Abreu VAC, Popin RV, Alvarenga DO de, Schaker PDC, Hoff-Risseti C, Varani AM, Fiore M de F. Genomic and genotypic characterization of Cylindrospermopsis raciborskii: toward an intraspecific phylogenetic evaluation by comparative genomics [Internet]. Frontiers in Microbiology. 2018 ; 9[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.00306
Vancouver
Abreu VAC, Popin RV, Alvarenga DO de, Schaker PDC, Hoff-Risseti C, Varani AM, Fiore M de F. Genomic and genotypic characterization of Cylindrospermopsis raciborskii: toward an intraspecific phylogenetic evaluation by comparative genomics [Internet]. Frontiers in Microbiology. 2018 ; 9[citado 2025 nov. 15 ] Available from: https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.00306

USP Schools

ReP

Filtros

USP Schools

Departament

Authors

USP affiliated authors

Date published

Subjects

Source title

Publisher

Countries/Territories

Funding Agencies

Indexado em

Non normalized affiliation

Countries of institutions of collaboration