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MÁRQUEZ, Roberto et al. A draft genome assembly for the dart-poison frog Phyllobates terribilis. GigaByte, 2025Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.46471/gigabyte.157. Acesso em: 07 nov. 2025.
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SOUZA, Jozimara Teixeira de. Mapeamento de Regiões Genômicas de dependência na população Brasileira e Estudo de Associação. 2025. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-15092025-103252/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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IHA, Bruno Koshin Vásquez e SETUBAL, João Carlos. Predição de fenótipos bacterianos a partir de genomas por meio de aprendizado de máquina. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-30042025-170213/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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GRANT, Taran e NAKAMURA, Daniel. DNA histórico tem potencial para revolucionar o conhecimento evolutivo das espécies [Depoimento]. Jornal da USP. Ciências. São Paulo: Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo. Disponível em: https://jornal.usp.br/ciencias/dna-historico-tem-potencial-para-revolucionar-a-historia-evolutiva-das-especies/. Acesso em: 07 nov. 2025. , 2025
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Grant T, Nakamura D. DNA histórico tem potencial para revolucionar o conhecimento evolutivo das espécies [Depoimento] [Internet]. Jornal da USP. Ciências. 2025 ;[citado 2025 nov. 07 ] Available from: https://jornal.usp.br/ciencias/dna-historico-tem-potencial-para-revolucionar-a-historia-evolutiva-das-especies/
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CAMPOS, Guillermo Uceda. Distribution, Dynamics, and Diversity of the Antiphage Immune Systems in Prokaryotic Genomes and Metagenomes . 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10022025-103219/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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SOLANO, Arthur Henrique Barrios e SETUBAL, João Carlos. Levantamento da diversidade de espécies do gênero Xanthomonas com base em dados metagenômicos. 2024, Anais.. São Paulo: Pró-Reitoria de Pesquisa da USP, 2024. Disponível em: https://uspdigital.usp.br/siicusp/siicPublicacao.jsp?codmnu=7210. Acesso em: 07 nov. 2025.
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OLIVEIRA, Maria Vitoria Lima. Estudo funcional de eventos somáticos de retrocópias em modelos de linhagens tumorais. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-11022025-110519/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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PIUCO, Ricardo. Estudo dos PIWI-interacting RNAs (piRNAs): do desenvolvimento de uma base de dados à análise sistemática da expressão gênica em tecidos normais e tumorais. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-31072023-072639/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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SOARES, Ana Carolina dos Santos. Sponge microbiomes from Great Amazon Reef System. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-15062023-143118/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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HUAMAN, Dennis E. Carhuaricra. Análise genômica de isolados bacterianos de cobaias (Cavia porcellus) e preguiças-de-garganta-marrom (Bradypus variegatus). 2023. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-07022024-204134/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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Huaman DEC. Análise genômica de isolados bacterianos de cobaias (Cavia porcellus) e preguiças-de-garganta-marrom (Bradypus variegatus) [Internet]. 2023 ;[citado 2025 nov. 07 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-07022024-204134/
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Huaman DEC. Análise genômica de isolados bacterianos de cobaias (Cavia porcellus) e preguiças-de-garganta-marrom (Bradypus variegatus) [Internet]. 2023 ;[citado 2025 nov. 07 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-07022024-204134/
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SANCHEZ, Fabio Beltrame. MAGset: uma ferramenta para comparação de genomas recuperados de dados metagenômicos e sua aplicação para melhoria de suas montagens. 2021. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2021. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-16092021-090947/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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GUEDES, Aureliano Coelho Proença. Classificação e evolução de SBPs em contexto de transdução de sinal: interação entre SBPs e Cache. 2021. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2021. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-25072021-223213/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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Guedes ACP. Classificação e evolução de SBPs em contexto de transdução de sinal: interação entre SBPs e Cache [Internet]. 2021 ;[citado 2025 nov. 07 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-25072021-223213/
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SANTIAGO, Caio Rafael do Nascimento et al. Gene tags assessment by comparative genomics (GTACG): A user-friendly framework for bacterial comparative genomics. Frontiers in Genetics, v. 10, p. 01-19, 2019Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3389/fgene.2019.00725. Acesso em: 07 nov. 2025.
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CUNHA, Marielton dos Passos et al. Origin of the São Paulo Yellow Fever epidemic of 2017–2018 revealed through molecular epidemiological analysis of fatal cases. Scientific Reports, v. 9, p. 10 , 2019Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1038/s41598-019-56650-1. Acesso em: 07 nov. 2025.
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Cunha M dos P, Duarte Neto AN, Pour SZ, Baez ASO, Černý J, Pereira BB de S, Santos CTB, Ho Y-L, Perondi B, Sztajnbok J, Alves VAF, Dolhnikoff M, Holmes EC, Saldiva PHN, Zanotto PM de A. Origin of the São Paulo Yellow Fever epidemic of 2017–2018 revealed through molecular epidemiological analysis of fatal cases [Internet]. Scientific Reports. 2019 ; 9 10 .[citado 2025 nov. 07 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-019-56650-1
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BARBOZA, Suzane de Andrade. Genômica comparativa aplicada no estudo da invasividade de Streptococcus pyogenes. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17122019-223725/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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CAMPOS, Guillermo Uceda. Comparative genomics and phylogenomics of Xylella fastidiosa. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-23112020-184504/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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ROSSI, Fernando Pacheco Nobre. Análise comparativa do genoma de bacteriófagos isolados da compostagem e estudo dos determinantes de sua interação com Pseudomonas aeruginosa. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-16012021-172222/. Acesso em: 07 nov. 2025.
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SANTIAGO, Caio Rafael do Nascimento. GTACG: um arcabouço computacional focado em genômica comparativa de bactérias de um mesmo ramo evolutivo. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02032020-102628. Acesso em: 07 nov. 2025.
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Santiago, C. R. do N. (2019). GTACG: um arcabouço computacional focado em genômica comparativa de bactérias de um mesmo ramo evolutivo (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02032020-102628
NLM
Santiago CR do N. GTACG: um arcabouço computacional focado em genômica comparativa de bactérias de um mesmo ramo evolutivo [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 07 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02032020-102628
Vancouver
Santiago CR do N. GTACG: um arcabouço computacional focado em genômica comparativa de bactérias de um mesmo ramo evolutivo [Internet]. 2019 ;[citado 2025 nov. 07 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02032020-102628
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ABNT
MORAIS, Anderson Carvalho. Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus. 2018. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2018. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114614/. Acesso em: 07 nov. 2025.
APA
Morais, A. C. (2018). Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114614/
NLM
Morais AC. Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus [Internet]. 2018 ;[citado 2025 nov. 07 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114614/
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Morais AC. Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus [Internet]. 2018 ;[citado 2025 nov. 07 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114614/