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Artigo de periodico
RASGRP4 is a key factor in the KRAS activation mediated by SOS in tumor Y1 adrenocortical cell lines (2026)
Montoni, Fabio ; Wailemann, Rosangela Aparecida Moreira ; Torres, Thompson Eusébio Pavan ; Torres, Katia Andrea Menezes de ; Fonseca, Cecilia Sella; Reis, Marcelo da Silva; Armelin, Hugo Aguirre
Source: Scientific Reports. Unidades: IQ, Interunidades em Bioinformática
Subjects: ONCOGENES, NEOPLASIAS DO CÓRTEX SUPRARRENAL
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ABNT
MONTONI, Fabio et al. RASGRP4 is a key factor in the KRAS activation mediated by SOS in tumor Y1 adrenocortical cell lines. Scientific Reports, v. 12, p. 1-12 art. 12328, 2026Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1038/ s41598-026-42968-0. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Montoni, F., Wailemann, R. A. M., Torres, T. E. P., Torres, K. A. M. de, Fonseca, C. S., Reis, M. da S., & Armelin, H. A. (2026). RASGRP4 is a key factor in the KRAS activation mediated by SOS in tumor Y1 adrenocortical cell lines. Scientific Reports, 12, 1-12 art. 12328. doi:10.1038/ s41598-026-42968-0
NLM
Montoni F, Wailemann RAM, Torres TEP, Torres KAM de, Fonseca CS, Reis M da S, Armelin HA. RASGRP4 is a key factor in the KRAS activation mediated by SOS in tumor Y1 adrenocortical cell lines [Internet]. Scientific Reports. 2026 ; 12 1-12 art. 12328.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/ s41598-026-42968-0
Vancouver
Montoni F, Wailemann RAM, Torres TEP, Torres KAM de, Fonseca CS, Reis M da S, Armelin HA. RASGRP4 is a key factor in the KRAS activation mediated by SOS in tumor Y1 adrenocortical cell lines [Internet]. Scientific Reports. 2026 ; 12 1-12 art. 12328.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/ s41598-026-42968-0
Tese (Doutorado)
Exploring Hybrid Modeling of Cell Signaling Pathways: Combining Neural Networks and ODEs to Tackle the Lack of Isolation Problem (2025)
Sousa, Ronaldo Nogueira de ; Reis, Marcelo da Silva (Orientador) ; Hashimoto, Ronaldo Fumio (coorient)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Subjects: REAÇÕES QUÍMICAS, REDES NEURAIS, EQUAÇÕES DIFERENCIAIS, GEOMETRIA E MODELAGEM COMPUTACIONAL
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ABNT
SOUSA, Ronaldo Nogueira de. Exploring Hybrid Modeling of Cell Signaling Pathways: Combining Neural Networks and ODEs to Tackle the Lack of Isolation Problem. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10022026-122908/. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Sousa, R. N. de. (2025). Exploring Hybrid Modeling of Cell Signaling Pathways: Combining Neural Networks and ODEs to Tackle the Lack of Isolation Problem (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10022026-122908/
NLM
Sousa RN de. Exploring Hybrid Modeling of Cell Signaling Pathways: Combining Neural Networks and ODEs to Tackle the Lack of Isolation Problem [Internet]. 2025 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10022026-122908/
Vancouver
Sousa RN de. Exploring Hybrid Modeling of Cell Signaling Pathways: Combining Neural Networks and ODEs to Tackle the Lack of Isolation Problem [Internet]. 2025 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10022026-122908/
Dissertação (Mestrado)
Tuning Stochastic Dynamic Models of the Dynamics of DNA Replication in Trypanosomatids (2025)
Scholl, Bruno Boaventura; Reis, Marcelo da Silva (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Subjects: DNA, REPLICAÇÃO DO DNA, TRANSCRIÇÃO GÊNICA, TRIPANOSSOMOSE, GEOMETRIA E MODELAGEM COMPUTACIONAL
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ABNT
SCHOLL, Bruno Boaventura. Tuning Stochastic Dynamic Models of the Dynamics of DNA Replication in Trypanosomatids. 2025. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29062025-202725/. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Scholl, B. B. (2025). Tuning Stochastic Dynamic Models of the Dynamics of DNA Replication in Trypanosomatids (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29062025-202725/
NLM
Scholl BB. Tuning Stochastic Dynamic Models of the Dynamics of DNA Replication in Trypanosomatids [Internet]. 2025 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29062025-202725/
Vancouver
Scholl BB. Tuning Stochastic Dynamic Models of the Dynamics of DNA Replication in Trypanosomatids [Internet]. 2025 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29062025-202725/
Dissertação (Mestrado)
Desenvolvimento de um arcabouço para inferência e seleção de modelos dinâmicos de vias de sinalização celular (2023)
Lima Junior, Marcelo Batista de; Reis, Marcelo da Silva (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Subjects: INTERAÇÃO CELULAR, REAÇÕES ORGÂNICAS, REAÇÕES QUÍMICAS, SELEÇÃO DE MODELOS
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ABNT
LIMA JUNIOR, Marcelo Batista de. Desenvolvimento de um arcabouço para inferência e seleção de modelos dinâmicos de vias de sinalização celular. 2023. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19012024-074552/. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Lima Junior, M. B. de. (2023). Desenvolvimento de um arcabouço para inferência e seleção de modelos dinâmicos de vias de sinalização celular (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19012024-074552/
NLM
Lima Junior MB de. Desenvolvimento de um arcabouço para inferência e seleção de modelos dinâmicos de vias de sinalização celular [Internet]. 2023 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19012024-074552/
Vancouver
Lima Junior MB de. Desenvolvimento de um arcabouço para inferência e seleção de modelos dinâmicos de vias de sinalização celular [Internet]. 2023 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-19012024-074552/
Trabalho de evento-resumo
Even boosting stereotypes increase the gender gap in gamified tutoring systems: an analysis of self-efficacy, flow and learning (2023)
Takeshita, Maria; Challco, Geiser Chalco ; Reis, Marcelo da Silva ; Santos, Jário ; Isotani, Seiji ; Pinto, Ig Ibert Bittencourt Santana
Source: Anais estendidos. Conference titles: Congresso Brasileiro de Informática na Educação - CBIE. Unidade: ICMC
Subjects: JOGOS DE COMPUTADOR, GÊNEROS (GRUPOS SOCIAIS), MOTIVAÇÃO DO ALUNO
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ABNT
TAKESHITA, Maria et al. Even boosting stereotypes increase the gender gap in gamified tutoring systems: an analysis of self-efficacy, flow and learning. 2023, Anais.. Porto Alegre: SBC, 2023. Disponível em: https://doi.org/10.5753/cbie_estendido.2023.234557. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Takeshita, M., Challco, G. C., Reis, M. da S., Santos, J., Isotani, S., & Pinto, I. I. B. S. (2023). Even boosting stereotypes increase the gender gap in gamified tutoring systems: an analysis of self-efficacy, flow and learning. In Anais estendidos. Porto Alegre: SBC. doi:10.5753/cbie_estendido.2023.234557
NLM
Takeshita M, Challco GC, Reis M da S, Santos J, Isotani S, Pinto IIBS. Even boosting stereotypes increase the gender gap in gamified tutoring systems: an analysis of self-efficacy, flow and learning [Internet]. Anais estendidos. 2023 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.5753/cbie_estendido.2023.234557
Vancouver
Takeshita M, Challco GC, Reis M da S, Santos J, Isotani S, Pinto IIBS. Even boosting stereotypes increase the gender gap in gamified tutoring systems: an analysis of self-efficacy, flow and learning [Internet]. Anais estendidos. 2023 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.5753/cbie_estendido.2023.234557
Dissertação (Mestrado)
Identification of cell signaling pathways based on biochemical reaction kinetics repositories (2021)
Matos, Gustavo Estrela de; Reis, Marcelo da Silva (Orientador)
Unidade: IME
Subjects: SELEÇÃO DE MODELOS, EQUAÇÕES DIFERENCIAIS ORDINÁRIAS, BIOQUÍMICA CELULAR
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ABNT
MATOS, Gustavo Estrela de. Identification of cell signaling pathways based on biochemical reaction kinetics repositories. 2021. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2021. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-08032021-211926/. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Matos, G. E. de. (2021). Identification of cell signaling pathways based on biochemical reaction kinetics repositories (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-08032021-211926/
NLM
Matos GE de. Identification of cell signaling pathways based on biochemical reaction kinetics repositories [Internet]. 2021 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-08032021-211926/
Vancouver
Matos GE de. Identification of cell signaling pathways based on biochemical reaction kinetics repositories [Internet]. 2021 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-08032021-211926/
Artigo de periodico
An efficient, parallelized algorithm for optimal conditional entropy-based feature selection (2020)
Estrela, Gustavo ; Gubitoso, Marco Dimas ; Ferreira, Carlos Eduardo ; Barrera, Júnior; Reis, Marcelo da Silva
Source: Entropy. Unidade: IME
Assunto: TEORIA DA INFORMAÇÃO
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ABNT
ESTRELA, Gustavo et al. An efficient, parallelized algorithm for optimal conditional entropy-based feature selection. Entropy, v. 22, n. 4, p. 1-20, 2020Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3390/e22040492. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Estrela, G., Gubitoso, M. D., Ferreira, C. E., Barrera, J., & Reis, M. da S. (2020). An efficient, parallelized algorithm for optimal conditional entropy-based feature selection. Entropy, 22( 4), 1-20. doi:10.3390/e22040492
NLM
Estrela G, Gubitoso MD, Ferreira CE, Barrera J, Reis M da S. An efficient, parallelized algorithm for optimal conditional entropy-based feature selection [Internet]. Entropy. 2020 ; 22( 4): 1-20.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.3390/e22040492
Vancouver
Estrela G, Gubitoso MD, Ferreira CE, Barrera J, Reis M da S. An efficient, parallelized algorithm for optimal conditional entropy-based feature selection [Internet]. Entropy. 2020 ; 22( 4): 1-20.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.3390/e22040492
Artigo de periodico
Optimal Boolean lattice-based algorithms for the U-curve optimization problem (2019)
Reis, Marcelo da Silva ; Estrela, Gustavo; Ferreira, Carlos Eduardo ; Barrera, Junior
Source: Information Sciences. Unidade: IME
Subjects: OTIMIZAÇÃO COMBINATÓRIA, APRENDIZADO COMPUTACIONAL
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ABNT
REIS, Marcelo da Silva et al. Optimal Boolean lattice-based algorithms for the U-curve optimization problem. Information Sciences, v. 471, p. 97-114, 2019Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.ins.2018.08.060. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Reis, M. da S., Estrela, G., Ferreira, C. E., & Barrera, J. (2019). Optimal Boolean lattice-based algorithms for the U-curve optimization problem. Information Sciences, 471, 97-114. doi:10.1016/j.ins.2018.08.060
NLM
Reis M da S, Estrela G, Ferreira CE, Barrera J. Optimal Boolean lattice-based algorithms for the U-curve optimization problem [Internet]. Information Sciences. 2019 ; 471 97-114.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.ins.2018.08.060
Vancouver
Reis M da S, Estrela G, Ferreira CE, Barrera J. Optimal Boolean lattice-based algorithms for the U-curve optimization problem [Internet]. Information Sciences. 2019 ; 471 97-114.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.ins.2018.08.060
Artigo de periodico
A fast Branch-and-Bound algorithm for U-curve feature selection (2018)
Atashpaz-Gargari, Esmaeil; Reis, Marcelo da Silva ; Braga-Neto, Ulisses M.; Barrera, Júnior; Dougherty, Edward R
Source: Pattern Recognition. Unidade: IME
Assunto: CIÊNCIA DA COMPUTAÇÃO
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ABNT
ATASHPAZ-GARGARI, Esmaeil et al. A fast Branch-and-Bound algorithm for U-curve feature selection. Pattern Recognition, v. 73, p. 172-188, 2018Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.patcog.2017.08.013. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Atashpaz-Gargari, E., Reis, M. da S., Braga-Neto, U. M., Barrera, J., & Dougherty, E. R. (2018). A fast Branch-and-Bound algorithm for U-curve feature selection. Pattern Recognition, 73, 172-188. doi:10.1016/j.patcog.2017.08.013
NLM
Atashpaz-Gargari E, Reis M da S, Braga-Neto UM, Barrera J, Dougherty ER. A fast Branch-and-Bound algorithm for U-curve feature selection [Internet]. Pattern Recognition. 2018 ; 73 172-188.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.patcog.2017.08.013
Vancouver
Atashpaz-Gargari E, Reis M da S, Braga-Neto UM, Barrera J, Dougherty ER. A fast Branch-and-Bound algorithm for U-curve feature selection [Internet]. Pattern Recognition. 2018 ; 73 172-188.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.patcog.2017.08.013
Parte de monografia/livro
An interdisciplinary approach for designing kinetic models of the Ras/MAPK signaling pathway (2017)
Reis, Marcelo da Silva ; Noël, Vincent; Dias, Matheus H; Albuquerque, Layra Lucy; Guimarães, Amanda Sayuri; Wu, Lulu; Barrera, Junior; Armelin, Hugo Aguirre
Source: Kinase signaling networks. Unidades: IME, IQ
Subjects: EQUAÇÕES DIFERENCIAIS ORDINÁRIAS, EQUAÇÕES ALGÉBRICAS DIFERENCIAIS, OTIMIZAÇÃO NÃO LINEAR
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
REIS, Marcelo da Silva et al. An interdisciplinary approach for designing kinetic models of the Ras/MAPK signaling pathway. Kinase signaling networks. Tradução . New York: Humana Press, 2017. . Disponível em: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-7154-1_28. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Reis, M. da S., Noël, V., Dias, M. H., Albuquerque, L. L., Guimarães, A. S., Wu, L., et al. (2017). An interdisciplinary approach for designing kinetic models of the Ras/MAPK signaling pathway. In Kinase signaling networks. New York: Humana Press. doi:10.1007/978-1-4939-7154-1_28
NLM
Reis M da S, Noël V, Dias MH, Albuquerque LL, Guimarães AS, Wu L, Barrera J, Armelin HA. An interdisciplinary approach for designing kinetic models of the Ras/MAPK signaling pathway [Internet]. In: Kinase signaling networks. New York: Humana Press; 2017. [citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-7154-1_28
Vancouver
Reis M da S, Noël V, Dias MH, Albuquerque LL, Guimarães AS, Wu L, Barrera J, Armelin HA. An interdisciplinary approach for designing kinetic models of the Ras/MAPK signaling pathway [Internet]. In: Kinase signaling networks. New York: Humana Press; 2017. [citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-7154-1_28
Artigo de periodico
Quantitative proteomic analysis of replicative and nonreplicative forms reveals important insights into chromatin biology of Trypanosoma cruzi (2017)
Jesus, Teresa Cristina Leandro de; Calderano, Simone Guedes; Vitorino, Francisca Nathalia de Luna; Llanos, Ricardo Pariona; Lopes, Mariana de Camargo; Araújo, Christiane Bezerra de; Thiemann, Otávio Henrique ; Reis, Marcelo da Silva ; Elias, Maria Carolina; Cunha, Julia Pinheiro Chagas da
Source: Molecular and Cellular Proteomics. Unidade: IFSC
Subjects: TRYPANOSOMA CRUZI, MITOCÔNDRIAS, DOENÇA DE CHAGAS, BIOENERGÉTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
JESUS, Teresa Cristina Leandro de et al. Quantitative proteomic analysis of replicative and nonreplicative forms reveals important insights into chromatin biology of Trypanosoma cruzi. Molecular and Cellular Proteomics, v. 16, n. Ja 2017, p. 23-38, 2017Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1074/mcp.M116.061200. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Jesus, T. C. L. de, Calderano, S. G., Vitorino, F. N. de L., Llanos, R. P., Lopes, M. de C., Araújo, C. B. de, et al. (2017). Quantitative proteomic analysis of replicative and nonreplicative forms reveals important insights into chromatin biology of Trypanosoma cruzi. Molecular and Cellular Proteomics, 16( Ja 2017), 23-38. doi:10.1074/mcp.M116.061200
NLM
Jesus TCL de, Calderano SG, Vitorino FN de L, Llanos RP, Lopes M de C, Araújo CB de, Thiemann OH, Reis M da S, Elias MC, Cunha JPC da. Quantitative proteomic analysis of replicative and nonreplicative forms reveals important insights into chromatin biology of Trypanosoma cruzi [Internet]. Molecular and Cellular Proteomics. 2017 ; 16( Ja 2017): 23-38.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1074/mcp.M116.061200
Vancouver
Jesus TCL de, Calderano SG, Vitorino FN de L, Llanos RP, Lopes M de C, Araújo CB de, Thiemann OH, Reis M da S, Elias MC, Cunha JPC da. Quantitative proteomic analysis of replicative and nonreplicative forms reveals important insights into chromatin biology of Trypanosoma cruzi [Internet]. Molecular and Cellular Proteomics. 2017 ; 16( Ja 2017): 23-38.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1074/mcp.M116.061200
Artigo de periodico
featsel: a framework for benchmarking of feature selection algorithms and cost functions (2017)
Reis, Marcelo da Silva ; Estrela, Gustavo; Ferreira, Carlos Eduardo ; Barrera, Júnior
Source: SoftwareX. Unidade: IME
Assunto: ÁLGEBRAS DE BOOLE
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
REIS, Marcelo da Silva et al. featsel: a framework for benchmarking of feature selection algorithms and cost functions. SoftwareX, v. 6, p. 193-197, 2017Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.softx.2017.07.005. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Reis, M. da S., Estrela, G., Ferreira, C. E., & Barrera, J. (2017). featsel: a framework for benchmarking of feature selection algorithms and cost functions. SoftwareX, 6, 193-197. doi:10.1016/j.softx.2017.07.005
NLM
Reis M da S, Estrela G, Ferreira CE, Barrera J. featsel: a framework for benchmarking of feature selection algorithms and cost functions [Internet]. SoftwareX. 2017 ; 6 193-197.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.softx.2017.07.005
Vancouver
Reis M da S, Estrela G, Ferreira CE, Barrera J. featsel: a framework for benchmarking of feature selection algorithms and cost functions [Internet]. SoftwareX. 2017 ; 6 193-197.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.softx.2017.07.005
Trabalho de evento-resumo
SigNetSim: a web-based framework for designing kinetic models of molecular signaling networks (2016)
Noel, Vincent; Reis, Marcelo da Silva ; Dias, Matheus Henrique dos Santos; Wu, Lulu; Guimarães, Amanda Sayuri; Reverbel, Daniel F; Barrera, Júnior; Armelin, Hugo Aguirre
Source: Abstracts. Conference titles: Computational Modeling in BIology NEtwork - COMBINE. Unidades: IME, IQ
Subjects: COMPUTAÇÃO APLICADA, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
NOEL, Vincent et al. SigNetSim: a web-based framework for designing kinetic models of molecular signaling networks. 2016, Anais.. [S.l.]: COMBINE, 2016. Disponível em: http://co.mbine.org/events/COMBINE_2016/abstracts. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Noel, V., Reis, M. da S., Dias, M. H. dos S., Wu, L., Guimarães, A. S., Reverbel, D. F., et al. (2016). SigNetSim: a web-based framework for designing kinetic models of molecular signaling networks. In Abstracts. [S.l.]: COMBINE. Recuperado de http://co.mbine.org/events/COMBINE_2016/abstracts
NLM
Noel V, Reis M da S, Dias MH dos S, Wu L, Guimarães AS, Reverbel DF, Barrera J, Armelin HA. SigNetSim: a web-based framework for designing kinetic models of molecular signaling networks [Internet]. Abstracts. 2016 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: http://co.mbine.org/events/COMBINE_2016/abstracts
Vancouver
Noel V, Reis M da S, Dias MH dos S, Wu L, Guimarães AS, Reverbel DF, Barrera J, Armelin HA. SigNetSim: a web-based framework for designing kinetic models of molecular signaling networks [Internet]. Abstracts. 2016 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: http://co.mbine.org/events/COMBINE_2016/abstracts
Trabalho de evento-resumo
CeTICSdb: a platform for interdisciplinary research that allows quantitative and qualitative -omics analyses and mathematical modeling of signaling networks (2015)
Reis, Marcelo da Silva ; Nishiyama Junior, Milton Yutaka; Silva, Daniel F; Junqueira-de-Azevedo, Inácio de Loiola Meirelles; Cunha, Julia Pinheiro Chagas da; Barrera, Júnior; Iwai, Leo Kei; Serrano, Solange Maria de Toledo; Armelin, Hugo Aguirre
Source: Abstracts. Conference titles: Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology - RECOMB. Unidades: IME, IQ
Subjects: COMPUTAÇÃO APLICADA, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
REIS, Marcelo da Silva et al. CeTICSdb: a platform for interdisciplinary research that allows quantitative and qualitative -omics analyses and mathematical modeling of signaling networks. 2015, Anais.. München: Max-Planck-Gesellschaft, 2015. Disponível em: https://f1000research.com/posters/1095384. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Reis, M. da S., Nishiyama Junior, M. Y., Silva, D. F., Junqueira-de-Azevedo, I. de L. M., Cunha, J. P. C. da, Barrera, J., et al. (2015). CeTICSdb: a platform for interdisciplinary research that allows quantitative and qualitative -omics analyses and mathematical modeling of signaling networks. In Abstracts. München: Max-Planck-Gesellschaft. Recuperado de https://f1000research.com/posters/1095384
NLM
Reis M da S, Nishiyama Junior MY, Silva DF, Junqueira-de-Azevedo I de LM, Cunha JPC da, Barrera J, Iwai LK, Serrano SM de T, Armelin HA. CeTICSdb: a platform for interdisciplinary research that allows quantitative and qualitative -omics analyses and mathematical modeling of signaling networks [Internet]. Abstracts. 2015 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://f1000research.com/posters/1095384
Vancouver
Reis M da S, Nishiyama Junior MY, Silva DF, Junqueira-de-Azevedo I de LM, Cunha JPC da, Barrera J, Iwai LK, Serrano SM de T, Armelin HA. CeTICSdb: a platform for interdisciplinary research that allows quantitative and qualitative -omics analyses and mathematical modeling of signaling networks [Internet]. Abstracts. 2015 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://f1000research.com/posters/1095384
Artigo de periodico
A new approach for identification of cancer-related pathways using protein networks and genomic data (2015)
Fonseca, André; Gubitoso, Marco Dimas ; Reis, Marcelo da Silva ; Souza, Sandro J. de; Barrera, Júnior
Source: Cancer Informatics. Unidade: IME
Subjects: BIOINFORMÁTICA, BIOESTATÍSTICA, NEOPLASIAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
FONSECA, André et al. A new approach for identification of cancer-related pathways using protein networks and genomic data. Cancer Informatics, p. 139-149, 2015Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.4137/CIN.S30800. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Fonseca, A., Gubitoso, M. D., Reis, M. da S., Souza, S. J. de, & Barrera, J. (2015). A new approach for identification of cancer-related pathways using protein networks and genomic data. Cancer Informatics, 139-149. doi:10.4137/CIN.S30800
NLM
Fonseca A, Gubitoso MD, Reis M da S, Souza SJ de, Barrera J. A new approach for identification of cancer-related pathways using protein networks and genomic data [Internet]. Cancer Informatics. 2015 ; 139-149.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.4137/CIN.S30800
Vancouver
Fonseca A, Gubitoso MD, Reis M da S, Souza SJ de, Barrera J. A new approach for identification of cancer-related pathways using protein networks and genomic data [Internet]. Cancer Informatics. 2015 ; 139-149.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.4137/CIN.S30800
Artigo de periodico
Glyceraldehyde 3-Phosphate Dehydrogenase-Telomere association correlates with redox status in Trypanosoma cruzi (2015)
Pariona-Llanos, Ricardo; Pavani, Raphael Souza; Reis, Marcelo da Silva ; Noël, Vincent; Silber, Ariel Mariano ; Armelin, Hugo Aguirre ; Cano, Maria Isabel Nogueira; Elias, Maria Carolina
Source: PLOS ONE. Unidades: ICB, IQ
Subjects: PARASITOLOGIA, ENZIMAS (METABOLISMO), CATALISE, CATALISADORES, TRYPANOSOMA CRUZI, PROTEINAS RECOMBINANTES
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ABNT
PARIONA-LLANOS, Ricardo et al. Glyceraldehyde 3-Phosphate Dehydrogenase-Telomere association correlates with redox status in Trypanosoma cruzi. PLOS ONE, v. 10, n. 3, p. 1-17, 2015Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0120896. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Pariona-Llanos, R., Pavani, R. S., Reis, M. da S., Noël, V., Silber, A. M., Armelin, H. A., et al. (2015). Glyceraldehyde 3-Phosphate Dehydrogenase-Telomere association correlates with redox status in Trypanosoma cruzi. PLOS ONE, 10( 3), 1-17. doi:10.1371/journal.pone.0120896
NLM
Pariona-Llanos R, Pavani RS, Reis M da S, Noël V, Silber AM, Armelin HA, Cano MIN, Elias MC. Glyceraldehyde 3-Phosphate Dehydrogenase-Telomere association correlates with redox status in Trypanosoma cruzi [Internet]. PLOS ONE. 2015 ; 10( 3): 1-17.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0120896
Vancouver
Pariona-Llanos R, Pavani RS, Reis M da S, Noël V, Silber AM, Armelin HA, Cano MIN, Elias MC. Glyceraldehyde 3-Phosphate Dehydrogenase-Telomere association correlates with redox status in Trypanosoma cruzi [Internet]. PLOS ONE. 2015 ; 10( 3): 1-17.[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0120896
Trabalho de evento-resumo
Design and analysis of dynamical models of biochemical reaction networks (2015)
Noel, Vincent; Reis, Marcelo da Silva ; Dias, Matheus Henrique dos Santos; Albuquerque, Layra Lucy; Pariona-Llanos, Ricardo; Pavani, Raphael Souza; Silber, Ariel Mariano ; Cano, Maria Isabel Nogueira; Elias, Maria Carolina; Nakano, Fábio ; Barrera, Júnior; Armelin, Hugo Aguirre
Source: Abstracts Book. Conference titles: Congress of the International Union for Biochemistry and Molecular Biology - IUBMB. Unidades: ICB, IME, IQ
Subjects: BIOINFORMÁTICA, MODELOS MATEMÁTICOS
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ABNT
NOEL, Vincent et al. Design and analysis of dynamical models of biochemical reaction networks. 2015, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2015. Disponível em: http://www.sbbq.org.br/iubmb2015/cdrom/resumos/R08662-1.pdf. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Noel, V., Reis, M. da S., Dias, M. H. dos S., Albuquerque, L. L., Pariona-Llanos, R., Pavani, R. S., et al. (2015). Design and analysis of dynamical models of biochemical reaction networks. In Abstracts Book. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq). Recuperado de http://www.sbbq.org.br/iubmb2015/cdrom/resumos/R08662-1.pdf
NLM
Noel V, Reis M da S, Dias MH dos S, Albuquerque LL, Pariona-Llanos R, Pavani RS, Silber AM, Cano MIN, Elias MC, Nakano F, Barrera J, Armelin HA. Design and analysis of dynamical models of biochemical reaction networks [Internet]. Abstracts Book. 2015 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: http://www.sbbq.org.br/iubmb2015/cdrom/resumos/R08662-1.pdf
Vancouver
Noel V, Reis M da S, Dias MH dos S, Albuquerque LL, Pariona-Llanos R, Pavani RS, Silber AM, Cano MIN, Elias MC, Nakano F, Barrera J, Armelin HA. Design and analysis of dynamical models of biochemical reaction networks [Internet]. Abstracts Book. 2015 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: http://www.sbbq.org.br/iubmb2015/cdrom/resumos/R08662-1.pdf
Trabalho de evento-resumo
Mathematical modeling of RAs/MAPK signalling network kinetics provides insights into mechanisms of FGF2-induced cell cycle arrest in the K-K-ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells (2014)
Reis, Marcelo da Silva ; Dias, Matheus Henrique dos Santos; Nakano, Fábio ; Barrera, Júnior; Armelin, Hugo Aguirre
Source: Abstracts. Conference titles: Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology - RECOMB. Unidades: EACH, IME, IQ
Assunto: COMPUTAÇÃO APLICADA
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ABNT
REIS, Marcelo da Silva et al. Mathematical modeling of RAs/MAPK signalling network kinetics provides insights into mechanisms of FGF2-induced cell cycle arrest in the K-K-ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells. 2014, Anais.. München: Max-Planck-Gesellschaft, 2014. Disponível em: https://f1000research.com/posters/1095383. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Reis, M. da S., Dias, M. H. dos S., Nakano, F., Barrera, J., & Armelin, H. A. (2014). Mathematical modeling of RAs/MAPK signalling network kinetics provides insights into mechanisms of FGF2-induced cell cycle arrest in the K-K-ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells. In Abstracts. München: Max-Planck-Gesellschaft. Recuperado de https://f1000research.com/posters/1095383
NLM
Reis M da S, Dias MH dos S, Nakano F, Barrera J, Armelin HA. Mathematical modeling of RAs/MAPK signalling network kinetics provides insights into mechanisms of FGF2-induced cell cycle arrest in the K-K-ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells [Internet]. Abstracts. 2014 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://f1000research.com/posters/1095383
Vancouver
Reis M da S, Dias MH dos S, Nakano F, Barrera J, Armelin HA. Mathematical modeling of RAs/MAPK signalling network kinetics provides insights into mechanisms of FGF2-induced cell cycle arrest in the K-K-ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells [Internet]. Abstracts. 2014 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://f1000research.com/posters/1095383
Trabalho de evento-resumo
CeTICSdb: an integrated platform for analysis of heterogeneous, high-throughput-omics and mathematical modeling of biochemical reactions (2014)
Nishiyama Junior, Milton Yutaka; Reis, Marcelo da Silva ; Silva, Daniel F; Kitano, Eduardo Shigueo; Souza, Gláucia Mendes ; Junqueira-de-Azevedo, Inácio de Loiola Meirelles; Cunha, Julia Pinheiro Chagas da; Barrera, Júnior; Iwai, Leo Kei; Serrano, Solange Maria de Toledo; Armelin, Hugo Aguirre
Source: Abstracts. Conference titles: Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology - ISMB 2014 Satellite Meeting - HiTSeq SIG: High Throughput Sequencing Algorithms & Applications. Unidades: IQ, IME
Subjects: BIOINFORMÁTICA, COMPUTAÇÃO APLICADA, MODELOS MATEMÁTICOS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
NISHIYAMA JUNIOR, Milton Yutaka et al. CeTICSdb: an integrated platform for analysis of heterogeneous, high-throughput-omics and mathematical modeling of biochemical reactions. 2014, Anais.. Bethesda: Instituto de Química, Universidade de São Paulo, 2014. Disponível em: https://f1000research.com/posters/1096242. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Nishiyama Junior, M. Y., Reis, M. da S., Silva, D. F., Kitano, E. S., Souza, G. M., Junqueira-de-Azevedo, I. de L. M., et al. (2014). CeTICSdb: an integrated platform for analysis of heterogeneous, high-throughput-omics and mathematical modeling of biochemical reactions. In Abstracts. Bethesda: Instituto de Química, Universidade de São Paulo. Recuperado de https://f1000research.com/posters/1096242
NLM
Nishiyama Junior MY, Reis M da S, Silva DF, Kitano ES, Souza GM, Junqueira-de-Azevedo I de LM, Cunha JPC da, Barrera J, Iwai LK, Serrano SM de T, Armelin HA. CeTICSdb: an integrated platform for analysis of heterogeneous, high-throughput-omics and mathematical modeling of biochemical reactions [Internet]. Abstracts. 2014 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://f1000research.com/posters/1096242
Vancouver
Nishiyama Junior MY, Reis M da S, Silva DF, Kitano ES, Souza GM, Junqueira-de-Azevedo I de LM, Cunha JPC da, Barrera J, Iwai LK, Serrano SM de T, Armelin HA. CeTICSdb: an integrated platform for analysis of heterogeneous, high-throughput-omics and mathematical modeling of biochemical reactions [Internet]. Abstracts. 2014 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://f1000research.com/posters/1096242
Trabalho de evento-resumo
Modeling the kinetics of Ras/MAPK and PI3K/AKT signaling pathways in the K-Ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells: novel insights into the mechanisms of FGF2-driven cell cycle arrest (2014)
Reis, Marcelo da Silva ; Dias, Matheus H. S; Nakano, Fábio ; Nöel, Vincent; Barrera, Júnior; Armelin, Hugo Aguirre
Source: Program and Index. Conference titles: Annual Meeting of the Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society (SBBq). Unidades: EACH, IME, IQ
Assunto: COMPUTAÇÃO APLICADA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
REIS, Marcelo da Silva et al. Modeling the kinetics of Ras/MAPK and PI3K/AKT signaling pathways in the K-Ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells: novel insights into the mechanisms of FGF2-driven cell cycle arrest. 2014, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2014. Disponível em: https://f1000research.com/posters/1095752. Acesso em: 30 abr. 2026.
APA
Reis, M. da S., Dias, M. H. S., Nakano, F., Nöel, V., Barrera, J., & Armelin, H. A. (2014). Modeling the kinetics of Ras/MAPK and PI3K/AKT signaling pathways in the K-Ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells: novel insights into the mechanisms of FGF2-driven cell cycle arrest. In Program and Index. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq). Recuperado de https://f1000research.com/posters/1095752
NLM
Reis M da S, Dias MHS, Nakano F, Nöel V, Barrera J, Armelin HA. Modeling the kinetics of Ras/MAPK and PI3K/AKT signaling pathways in the K-Ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells: novel insights into the mechanisms of FGF2-driven cell cycle arrest [Internet]. Program and Index. 2014 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://f1000research.com/posters/1095752
Vancouver
Reis M da S, Dias MHS, Nakano F, Nöel V, Barrera J, Armelin HA. Modeling the kinetics of Ras/MAPK and PI3K/AKT signaling pathways in the K-Ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells: novel insights into the mechanisms of FGF2-driven cell cycle arrest [Internet]. Program and Index. 2014 ;[citado 2026 abr. 30 ] Available from: https://f1000research.com/posters/1095752

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