Estimation of genetic parameters, identification of genomic regions, and candidate genes for enhancing feeding behavior and feed efficiency in pigs (2025)
- Authors:
- Autor USP: GERVÁSIO, IZALLY CARVALHO - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LZT
- DOI: 10.11606/T.11.2025.tde-09052025-144254
- Subjects: COMPONENTES DE VARIÂNCIA; COMPORTAMENTO ALIMENTAR; GENÔMICA; MELHORAMENTO GENÉTICO ANIMAL; SELEÇÃO GENÉTICA; SUÍNOS
- Keywords: Eficiência alimentar
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: A eficiência alimentar e o comportamento alimentar são fatores essenciais para a sustentabilidade da produção suína, porém, o registro individual do consumo de ração é dispendioso, tornando a seleção genética uma estratégia relevante. Neste estudo, estimamos componentes de variância e parâmetros genéticos para oito características de eficiência alimentar e comportamento alimentar em suínos Landrace (LA) e Yorkshire (YO), utilizando três estratégias de coleta de dados: semanal (contínua), quinzenal e combinada. Foram analisadas 9.023 LA e 12.166 YO com o sistema FIRE, considerando consumo médio diário de ração (ADFI), conversão alimentar (FCR), consumo alimentar residual (RFI), tempo médio diário de ocupação do comedouro (AOTD), número médio de visitas ao comedouro (ANVD), consumo médio de ração por visita (AFIV), tempo médio de ocupação por visita (AOTV) e taxa média de consumo por visita (AFRV). As estimativas de herdabilidade variaram de 0,23 a 0,31 (ADFI), 0,29 a 0,39 (FCR) e 0,30 a 0,36 (RFI), enquanto as características de comportamento alimentar apresentaram herdabilidade moderada a alta (0,44 a 0,17 para AFIV; 0,34 a 0,19 para AFRV; 0,32 a 0,24 para ANVD; 0,24 a 0,16 para AOTD; 0,47 a 0,22 para AOTV). O cenário combinado resultou em estimativas mais precisas e maior consistência na seleção genética. Para aprofundar o entendimento dos fatores genéticos que influenciam o comportamento alimentar, foi conduzida uma análise de associação genômica ampla (ssGWAS),identificando loci de características quantitativas (QTL) associados ao comportamento alimentar, regiões regulatórias epigenômicas, genes candidatos e fatores de transcrição. As análises funcionais incluíram a anotação de SNPs utilizando o Variant Effect Predictor (VEP), a sobreposição com QTLs conhecidos, análise de enriquecimento funcional no DAVID, associação de fatores de transcrição com SNPs por meio do Enrichr, e a integração e visualização dos dados no IGV. Os resultados indicaram que fatores como STAT3, STAT5A, RARA, SMAD4, MYC, FOXP3, SP1, NOTCH1, RXRA, FOS, NRF1, BACH1, NR1I2, GLI1, THAP11, PDX1, NFIC, CCNT2, TP53 e ERG1 podem regular essas características, além da identificação de genes candidatos, como SLC22A2, CPAMD8 e NKX2-6. Esses achados contribuem para um melhor entendimento dos mecanismos regulatórios subjacentes à eficiência alimentar e ao comportamento alimentar em suínos, fornecendo subsídios para aprimorar estratégias de seleção genômica e promover maior sustentabilidade na produção suína
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2025
- Data da defesa: 07.02.2025
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
-
ABNT
GERVÁSIO, Izally Carvalho. Estimation of genetic parameters, identification of genomic regions, and candidate genes for enhancing feeding behavior and feed efficiency in pigs. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-09052025-144254/. Acesso em: 27 dez. 2025. -
APA
Gervásio, I. C. (2025). Estimation of genetic parameters, identification of genomic regions, and candidate genes for enhancing feeding behavior and feed efficiency in pigs (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-09052025-144254/ -
NLM
Gervásio IC. Estimation of genetic parameters, identification of genomic regions, and candidate genes for enhancing feeding behavior and feed efficiency in pigs [Internet]. 2025 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-09052025-144254/ -
Vancouver
Gervásio IC. Estimation of genetic parameters, identification of genomic regions, and candidate genes for enhancing feeding behavior and feed efficiency in pigs [Internet]. 2025 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-09052025-144254/ - Population structure and genetic diversity of Mangalarga Marchador horses
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Informações sobre o DOI: 10.11606/T.11.2025.tde-09052025-144254 (Fonte: oaDOI API)
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