Tese

Impactos da inclusão de corridas de homozigosidade em processos de acasalamento dirigido em uma população simulada de bovinos de corte (2024)

• Authors:
  • Selli, Alana
  • Brito, Luiz Fernando (coorient)
  • Buzanskas, Marcos Eli (coorient)
  • Ventura, Ricardo Vieira (Orientador)
• Autor USP: SELLI, ALANA - FMVZ
• Unidade: FMVZ
• Sigla do Departamento: VNP
• DOI: 10.11606/D.10.2024.tde-20062024-120257
• Subjects: ACASALAMENTO; BOVINOS DE CORTE
• Keywords: Data simulation; Genomic selection; Homozygosity
• Agências de fomento:
  • Financiamento CAPES
  • Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
    Processo FAPESP: 2021/11156-8
• Language: Português
• Abstract: Este trabalho teve como objetivo aplicar diferentes estratégias de seleção em relação aos perfis de corridas de homozigosidade em uma população (via dados simulados), além de investigar o impacto de tais estratégias sob o aumento ou redução do valor genético estimado (EBV) de uma característica e outros parâmetros relacionados à variabilidade genética da população. Para isso, uma população de bovinos de corte foi simulada com o pacote R AlphaSimR, contendo 5 cromossomos com diferentes tamanhos e números de loci de interesse econômico (QTL, do inglês Quantitative Trait Loci), correspondentes a uma característica com herdabilidade de 0,3. A partir da simulação inicial, foram testadas três estratégias de seleção e acasalamentos dirigidos. (1) EBV + Fped: valores genéticos estimados através do pedigree e fenótipo, e o coeficiente de endogamia baseado em Pedigree. (2) GEBV + Fg: valores genéticos estimados através de informações de marcadores genéticos do tipo SNP (Single Nucleotide Polymorphism), e coeficiente de endogamia genômico. (3) GEBV + Froh: valores genéticos estimados através de informações de marcadores genéticos do tipo SNP, e coeficiente de endogamia baseado em corridas de homozigosidade. A estratégia GEBV + Froh produziu consistentemente valores genéticos verdadeiros e fenótipos superiores. O Fg foi mais baixo quando utilizada a estratégia GEBV + Fg, no entanto a mesma estratégia promoveu a formação de corridas de homozigosidade maiores e mais frequentes no genoma.A estratégia mais eficiente para minimizar a porcentagem do genoma coberta por ROHs, no entanto, foi a EBV + Fped. As avaliações genéticas de cada animal da população, assim como os respectivos coeficientes de endogamia, foram desenvolvidos via mescla de ativações em tempo real de softwares já existentes (BLUF90, PLINK), por meio de uma interface desenvolvida em linguagem R. Algumas limitações foram pontuadas, tais quais o tamanho populacional utilizado e a adequação de certos parâmetros da simulação, e possíveis soluções foram propostas
• Imprenta:
  • Publisher place: Pirassununga
  • Date published: 2024
• Data da defesa: 19.03.2024

Informações sobre o DOI: 10.11606/D.10.2024.tde-20062024-120257 (Fonte: oaDOI API)
• Este periódico é de acesso aberto
• Este artigo é de acesso aberto
• URL de acesso aberto
• Cor do Acesso Aberto: gold
• Licença: cc-by-nc-sa

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How to cite

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• ABNT

  SELLI, Alana. Impactos da inclusão de corridas de homozigosidade em processos de acasalamento dirigido em uma população simulada de bovinos de corte. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10135/tde-20062024-120257/. Acesso em: 28 dez. 2025.

• APA

  Selli, A. (2024). Impactos da inclusão de corridas de homozigosidade em processos de acasalamento dirigido em uma população simulada de bovinos de corte (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Pirassununga. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10135/tde-20062024-120257/

• NLM

  Selli A. Impactos da inclusão de corridas de homozigosidade em processos de acasalamento dirigido em uma população simulada de bovinos de corte [Internet]. 2024 ;[citado 2025 dez. 28 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10135/tde-20062024-120257/

• Vancouver

  Selli A. Impactos da inclusão de corridas de homozigosidade em processos de acasalamento dirigido em uma população simulada de bovinos de corte [Internet]. 2024 ;[citado 2025 dez. 28 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10135/tde-20062024-120257/

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