Exportar registro bibliográfico


Metrics:

Systems analysis of subjects acutely infected with chikungunya virus (2019)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: ZANOTTO, PAOLO MARINHO DE ANDRADE - ICB ; ZAMBONI, DARIO SIMÕES - FMRP ; KALIL FILHO, JORGE ELIAS - FM ; NAKAYA, HELDER TAKASHI IMOTO - FCF ; CRUZ, NATÁLIA BAPTISTA - BIOINFORMÁTICA ; JORGE, LUÍZA ANTUNES DE CASTRO - FMRP ; CARVALHO, RENAN VILLANOVA HOMEM DE - FMRP ; CUNHA, MARIELTON DOS PASSOS - BIOINFORMÁTICA ; GONÇALVES, ANDRÉ NICOLAU AQUIME - FCF
  • Unidades: ICB; FMRP; FM; FCF; BIOINFORMÁTICA; FMRP; FMRP; BIOINFORMÁTICA; FCF
  • DOI: 10.1371/journal.ppat.1007880
  • Subjects: VÍRUS CHIKUNGUNYA; SURTOS DE DOENÇAS; MACRÓFAGOS; MICROBIOLOGIA
  • Agências de fomento:
  • Language: Inglês
  • Imprenta:
  • Source:
    • Título do periódico: Plos Pathogens
    • ISSN: 1553-7366
    • Volume/Número/Paginação/Ano: v. 15, n. 6, p. 1-10 art. e1007880, 2019
  • Informações sobre o DOI: 10.1371/journal.ppat.1007880 (Fonte: oaDOI API)
    • Este periódico é de acesso aberto
    • Este artigo é de acesso aberto
    • URL de acesso aberto
    • Cor do Acesso Aberto: gold
    • Licença: cc-by

    How to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      SCHANOSKI, Alessandra Soares; CRUZ, Natália Baptista; CASTRO-JORGE, Luiza Antunes de; et al. Systems analysis of subjects acutely infected with chikungunya virus. Plos Pathogens, San Francisco, v. 15, n. 6, p. 1-10 art. e1007880, 2019. Disponível em: < http://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1007880 > DOI: 10.1371/journal.ppat.1007880.
    • APA

      Schanoski, A. S., Cruz, N. B., Castro-Jorge, L. A. de, Carvalho, R. V. H. de, Santos, C. A. dos, Rós, N. da, et al. (2019). Systems analysis of subjects acutely infected with chikungunya virus. Plos Pathogens, 15( 6), 1-10 art. e1007880. doi:10.1371/journal.ppat.1007880
    • NLM

      Schanoski AS, Cruz NB, Castro-Jorge LA de, Carvalho RVH de, Santos CA dos, Rós N da, Oliveira Ú, Costa DD, Santos CLS dos, Cunha M dos P, Oliveira MLS, Alves JC, Océa RA de LC, Ribeiro DR, Gonçalves ANA, Gonzalez-Dias P, Suhrbier A, Zanotto PM de A, Azevedo IJ de, Zamboni DS, Almeida RP, Ho PL, Kalil Filho JE, Nishiyama Junior MY, Nakaya HTI. Systems analysis of subjects acutely infected with chikungunya virus [Internet]. Plos Pathogens. 2019 ; 15( 6): 1-10 art. e1007880.Available from: http://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1007880
    • Vancouver

      Schanoski AS, Cruz NB, Castro-Jorge LA de, Carvalho RVH de, Santos CA dos, Rós N da, Oliveira Ú, Costa DD, Santos CLS dos, Cunha M dos P, Oliveira MLS, Alves JC, Océa RA de LC, Ribeiro DR, Gonçalves ANA, Gonzalez-Dias P, Suhrbier A, Zanotto PM de A, Azevedo IJ de, Zamboni DS, Almeida RP, Ho PL, Kalil Filho JE, Nishiyama Junior MY, Nakaya HTI. Systems analysis of subjects acutely infected with chikungunya virus [Internet]. Plos Pathogens. 2019 ; 15( 6): 1-10 art. e1007880.Available from: http://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1007880

    Referências citadas na obra
    Autor: SC Weaver
    Título: Chikungunya virus and the global spread of a mosquito-borne disease
    Título do periódico: N Engl J Med
    Volume: 372
    Fascículo: 13
    Primeira página: 1231
    Ano: 2015
    DOI: 10.1056/NEJMra1406035
    Autor: O Schwartz
    Título: Biology and pathogenesis of chikungunya virus
    Título do periódico: Nat Rev Microbiol
    Volume: 8
    Fascículo: 7
    Primeira página: 491
    Ano: 2010
    DOI: 10.1038/nrmicro2368
    Autor: LC Ng
    Título: Tracing the path of Chikungunya virus—evolution and adaptation
    Título do periódico: Infect Genet Evol
    Volume: 10
    Fascículo: 7
    Primeira página: 876
    Ano: 2010
    DOI: 10.1016/j.meegid.2010.07.012
    Autor: Y Tan
    Título: Differing epidemiological dynamics of Chikungunya virus in the Americas during the 2014–2015 epidemic
    Título do periódico: PLoS Negl Trop Dis
    Volume: 12
    Fascículo: 7
    Primeira página: e0006670
    Ano: 2018
    DOI: 10.1371/journal.pntd.0006670
    Autor: LTM Figueiredo
    Título: Large outbreaks of Chikungunya virus in Brazil reveal uncommon clinical features and fatalities
    Título do periódico: Rev Soc Bras Med Trop
    Volume: 50
    Fascículo: 5
    Primeira página: 583
    Ano: 2017
    DOI: 10.1590/0037-8682-0397-2017
    SVS-MS. Monitoramento dos casos de dengue, febre de chikungunya e doença aguda pelo vírus Zika até a Semana Epidemiológica 19 de 2018. 2018.
    Autor: AY Chang
    Título: Frequency of Chronic Joint Pain Following Chikungunya Virus Infection: A Colombian Cohort Study
    Título do periódico: Arthritis Rheumatol
    Volume: 70
    Fascículo: 4
    Primeira página: 578
    Ano: 2018
    DOI: 10.1002/art.40384
    Autor: MC Jaffar-Bandjee
    Título: Emergence and clinical insights into the pathology of Chikungunya virus infection
    Título do periódico: Expert Rev Anti Infect Ther
    Volume: 8
    Fascículo: 9
    Primeira página: 987
    Ano: 2010
    DOI: 10.1586/eri.10.92
    Autor: MLA Bastos
    Título: Inability to work due to Chikungunya virus infection: impact on public service during the first epidemic in the State of Ceara, northeastern Brazil
    Título do periódico: Braz J Infect Dis
    Ano: 2018
    Autor: MS Hossain
    Título: Chikungunya outbreak (2017) in Bangladesh: Clinical profile, economic impact and quality of life during the acute phase of the disease
    Título do periódico: PLoS Negl Trop Dis
    Volume: 12
    Fascículo: 6
    Primeira página: e0006561
    Ano: 2018
    DOI: 10.1371/journal.pntd.0006561
    Autor: L Guaraldo
    Título: Treatment of chikungunya musculoskeletal disorders: a systematic review
    Título do periódico: Expert Rev Anti Infect Ther
    Volume: 16
    Fascículo: 4
    Primeira página: 333
    Ano: 2018
    DOI: 10.1080/14787210.2018.1450629
    Autor: LA Silva
    Título: Chikungunya virus: epidemiology, replication, disease mechanisms, and prospective intervention strategies
    Título do periódico: J Clin Invest
    Volume: 127
    Fascículo: 3
    Primeira página: 737
    Ano: 2017
    DOI: 10.1172/JCI84417
    Autor: PE Joubert
    Título: Inhibition of mTORC1 Enhances the Translation of Chikungunya Proteins via the Activation of the MnK/eIF4E Pathway
    Título do periódico: PLoS Pathog
    Volume: 11
    Fascículo: 8
    Primeira página: e1005091
    Ano: 2015
    DOI: 10.1371/journal.ppat.1005091
    Autor: HI Nakaya
    Título: Gene profiling of Chikungunya virus arthritis in a mouse model reveals significant overlap with rheumatoid arthritis
    Título do periódico: Arthritis Rheum
    Volume: 64
    Fascículo: 11
    Primeira página: 3553
    Ano: 2012
    DOI: 10.1002/art.34631
    Autor: JA Wilson
    Título: RNA-Seq analysis of chikungunya virus infection and identification of granzyme A as a major promoter of arthritic inflammation
    Título do periódico: PLoS Pathog
    Volume: 13
    Fascículo: 2
    Primeira página: e1006155
    Ano: 2017
    DOI: 10.1371/journal.ppat.1006155
    Autor: M Kwissa
    Título: Dengue virus infection induces expansion of a CD14(+)CD16(+) monocyte population that stimulates plasmablast differentiation
    Título do periódico: Cell Host Microbe
    Volume: 16
    Fascículo: 1
    Primeira página: 115
    Ano: 2014
    DOI: 10.1016/j.chom.2014.06.001
    Autor: HI Nakaya
    Título: Systems biology of immunity to MF59-adjuvanted versus nonadjuvanted trivalent seasonal influenza vaccines in early childhood
    Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A
    Volume: 113
    Fascículo: 7
    Primeira página: 1853
    Ano: 2016
    DOI: 10.1073/pnas.1519690113
    Autor: MDP Cunha
    Título: Outbreak of chikungunya virus in a vulnerable population of Sergipe, Brazil-A molecular and serological survey
    Título do periódico: J Clin Virol
    Volume: 97
    Primeira página: 44
    Ano: 2017
    DOI: 10.1016/j.jcv.2017.10.015
    Autor: P Hochedez
    Título: Chikungunya infection in travelers
    Título do periódico: Emerg Infect Dis
    Volume: 12
    Fascículo: 10
    Primeira página: 1565
    Ano: 2006
    DOI: 10.3201/eid1210.060495
    Autor: NA Prow
    Título: Lower temperatures reduce type I interferon activity and promote alphaviral arthritis
    Título do periódico: PLoS Pathog
    Volume: 13
    Fascículo: 12
    Primeira página: e1006788
    Ano: 2017
    DOI: 10.1371/journal.ppat.1006788
    Autor: PA Rudd
    Título: Interferon response factors 3 and 7 protect against Chikungunya virus hemorrhagic fever and shock
    Título do periódico: J Virol
    Volume: 86
    Fascículo: 18
    Primeira página: 9888
    Ano: 2012
    DOI: 10.1128/JVI.00956-12
    Autor: JAC Wilson
    Título: RNA-Seq analysis of chikungunya virus infection and identification of granzyme A as a major promoter of arthritic inflammation
    Título do periódico: Plos Pathogens
    Volume: 13
    Fascículo: 2
    Ano: 2017
    Autor: BM Gunn
    Título: Mannose Binding Lectin Is Required for Alphavirus-Induced Arthritis/Myositis
    Título do periódico: Plos Pathogens
    Volume: 8
    Fascículo: 3
    Ano: 2012
    Autor: C Sanfilippo
    Título: SERPING1 mRNA overexpression in monocytes from HIV+ patients
    Título do periódico: Inflamm Res
    Volume: 66
    Fascículo: 12
    Primeira página: 1107
    Ano: 2017
    DOI: 10.1007/s00011-017-1091-x
    Autor: D Walsh
    Título: Viral subversion of the host protein synthesis machinery
    Título do periódico: Nat Rev Microbiol
    Volume: 9
    Fascículo: 12
    Primeira página: 860
    Ano: 2011
    DOI: 10.1038/nrmicro2655
    Autor: L Carrasco
    Título: The Regulation of Translation in Alphavirus-Infected Cells
    Título do periódico: Viruses
    Volume: 10
    Fascículo: 2
    Ano: 2018
    Autor: RK Holmes
    Título: APOBEC-mediated viral restriction: not simply editing?
    Título do periódico: Trends Biochem Sci
    Volume: 32
    Fascículo: 3
    Primeira página: 118
    Ano: 2007
    DOI: 10.1016/j.tibs.2007.01.004
    Autor: C Patkar
    Título: Dengue virus type 2 modulates endothelial barrier function through CD73
    Título do periódico: Am J Trop Med Hyg
    Volume: 88
    Fascículo: 1
    Primeira página: 89
    Ano: 2013
    DOI: 10.4269/ajtmh.2012.12-0474
    Autor: A Rolle
    Título: Severe Sepsis and Septic Shock Associated with Chikungunya Virus Infection, Guadeloupe, 2014
    Título do periódico: Emerging Infectious Diseases
    Volume: 22
    Fascículo: 5
    Primeira página: 891
    Ano: 2016
    DOI: 10.3201/eid2205.151449
    Autor: W Chen
    Título: Specific inhibition of NLRP3 in chikungunya disease reveals a role for inflammasomes in alphavirus-induced inflammation
    Título do periódico: Nat Microbiol
    Volume: 2
    Fascículo: 10
    Primeira página: 1435
    Ano: 2017
    DOI: 10.1038/s41564-017-0015-4
    Autor: MR Spalinger
    Título: PTPN22 regulates NLRP3-mediated IL1B secretion in an autophagy-dependent manner
    Título do periódico: Autophagy
    Volume: 13
    Fascículo: 9
    Primeira página: 1590
    Ano: 2017
    DOI: 10.1080/15548627.2017.1341453
    Autor: KV Swanson
    Título: The NLRP3 inflammasome: molecular activation and regulation to therapeutics
    Título do periódico: Nat Rev Immunol
    Ano: 2019
    Autor: M Kirschfink
    Título: C1 inhibitor in anti-inflammatory therapy: from animal experiment to clinical application
    Título do periódico: Molecular Immunology
    Volume: 36
    Fascículo: 4–5
    Primeira página: 225
    Ano: 1999
    DOI: 10.1016/S0161-5890(99)00048-6
    Autor: E Karasu
    Título: Targeting Complement Pathways in Polytrauma- and Sepsis-Induced Multiple-Organ Dysfunction
    Título do periódico: Front Immunol
    Volume: 10
    Ano: 2019
    Autor: D Michlmayr
    Título: Comprehensive innate immune profiling of chikungunya virus infection in pediatric cases
    Título do periódico: Molecular Systems Biology
    Volume: 14
    Fascículo: 8
    Ano: 2018
    DOI: 10.15252/msb.20177862
    Autor: B Khadivjam
    Título: The ATP-Dependent RNA Helicase DDX3X Modulates Herpes Simplex Virus 1 Gene Expression
    Título do periódico: J Virol
    Volume: 91
    Fascículo: 8
    Ano: 2017
    DOI: 10.1128/JVI.02411-16
    Autor: PST Russo
    Título: CEMiTool: a Bioconductor package for performing comprehensive modular co-expression analyses
    Título do periódico: Bmc Bioinformatics
    Volume: 19
    Ano: 2018
    Autor: K Labadie
    Título: Chikungunya disease in nonhuman primates involves long-term viral persistence in macrophages
    Título do periódico: J Clin Invest
    Volume: 120
    Fascículo: 3
    Primeira página: 894
    Ano: 2010
    DOI: 10.1172/JCI40104
    Autor: YS Poo
    Título: CCR2 Deficiency Promotes Exacerbated Chronic Erosive Neutrophil-Dominated Chikungunya Virus Arthritis
    Título do periódico: Journal of Virology
    Volume: 88
    Fascículo: 12
    Primeira página: 6862
    Ano: 2014
    DOI: 10.1128/JVI.03364-13
    Autor: C Gabriel
    Título: Neutrophils: neglected players in viral diseases
    Título do periódico: DNA Cell Biol
    Volume: 32
    Fascículo: 12
    Primeira página: 665
    Ano: 2013
    DOI: 10.1089/dna.2013.2211
    Autor: V Naumenko
    Título: Neutrophils in viral infection
    Título do periódico: Cell Tissue Res
    Volume: 371
    Fascículo: 3
    Primeira página: 505
    Ano: 2018
    DOI: 10.1007/s00441-017-2763-0
    Autor: RYS David
    Título: Comparative analysis of viral RNA signatures on different RIG-I-like receptors
    Título do periódico: Elife
    Volume: 5
    Ano: 2016
    Autor: C Jakobs
    Título: AIM2 Drives Joint Inflammation in a Self-DNA Triggered Model of Chronic Polyarthritis
    Título do periódico: Plos One
    Volume: 10
    Fascículo: 6
    Primeira página: e0131702
    Ano: 2015
    DOI: 10.1371/journal.pone.0131702
    Autor: CA Dinarello
    Título: Interleukin-1 in the pathogenesis and treatment of inflammatory diseases
    Título do periódico: Blood
    Volume: 117
    Fascículo: 14
    Primeira página: 3720
    Ano: 2011
    DOI: 10.1182/blood-2010-07-273417
    Autor: SG Nanjappa
    Título: Immunotherapeutic effects of IL-7 during a chronic viral infection in mice
    Título do periódico: Blood
    Volume: 117
    Fascículo: 19
    Primeira página: 5123
    Ano: 2011
    DOI: 10.1182/blood-2010-12-323154
    Autor: C Gerlach
    Título: The Chemokine Receptor CX3CR1 Defines Three Antigen-Experienced CD8 T Cell Subsets with Distinct Roles in Immune Surveillance and Homeostasis
    Título do periódico: Immunity
    Volume: 45
    Fascículo: 6
    Primeira página: 1270
    Ano: 2016
    DOI: 10.1016/j.immuni.2016.10.018
    Autor: M Rayamajhi
    Título: Detection of pyroptosis by measuring released lactate dehydrogenase activity
    Título do periódico: Methods Mol Biol
    Volume: 1040
    Primeira página: 85
    Ano: 2013
    DOI: 10.1007/978-1-62703-523-1_7
    Autor: FJ Burt
    Título: Chikungunya virus: an update on the biology and pathogenesis of this emerging pathogen
    Título do periódico: Lancet Infect Dis
    Volume: 17
    Fascículo: 4
    Primeira página: e107
    Ano: 2017
    DOI: 10.1016/S1473-3099(16)30385-1
    Autor: D Simarmata
    Título: Early clearance of Chikungunya virus in children is associated with a strong innate immune response
    Título do periódico: Sci Rep
    Volume: 6
    Primeira página: 26097
    Ano: 2016
    DOI: 10.1038/srep26097
    Autor: D Michlmayr
    Título: Comprehensive innate immune profiling of chikungunya virus infection in pediatric cases
    Título do periódico: Mol Syst Biol
    Volume: 14
    Fascículo: 8
    Primeira página: e7862
    Ano: 2018
    DOI: 10.15252/msb.20177862
    Autor: A Chopra
    Título: Chikungunya virus aches and pains: an emerging challenge
    Título do periódico: Arthritis Rheum
    Volume: 58
    Fascículo: 9
    Primeira página: 2921
    Ano: 2008
    DOI: 10.1002/art.23753
    Autor: AY Chang
    Título: Chikungunya Arthritis Mechanisms in the Americas: A Cross-Sectional Analysis of Chikungunya Arthritis Patients Twenty-Two Months After Infection Demonstrating No Detectable Viral Persistence in Synovial Fluid
    Título do periódico: Arthritis Rheumatol
    Volume: 70
    Fascículo: 4
    Primeira página: 585
    Ano: 2018
    DOI: 10.1002/art.40383
    Autor: P Lewthwaite
    Título: Chikungunya virus and central nervous system infections in children, India
    Título do periódico: Emerg Infect Dis
    Volume: 15
    Fascículo: 2
    Primeira página: 329
    Ano: 2009
    DOI: 10.3201/eid1502.080902
    Autor: KA Tsetsarkin
    Título: Chikungunya virus: evolution and genetic determinants of emergence
    Título do periódico: Curr Opin Virol
    Volume: 1
    Fascículo: 4
    Primeira página: 310
    Ano: 2011
    DOI: 10.1016/j.coviro.2011.07.004
    Autor: SM Volk
    Título: Genome-scale phylogenetic analyses of chikungunya virus reveal independent emergences of recent epidemics and various evolutionary rates
    Título do periódico: J Virol
    Volume: 84
    Fascículo: 13
    Primeira página: 6497
    Ano: 2010
    DOI: 10.1128/JVI.01603-09
    Autor: C Chirathaworn
    Título: Cytokine levels in patients with chikungunya virus infection
    Título do periódico: Asian Pac J Trop Med
    Volume: 6
    Fascículo: 8
    Primeira página: 631
    Ano: 2013
    DOI: 10.1016/S1995-7645(13)60108-X
    Autor: JQ Lian
    Título: Expression profiles of circulating cytokines, chemokines and immune cells in patients with hepatitis B virus infection
    Título do periódico: Hepat Mon
    Volume: 14
    Fascículo: 6
    Primeira página: e18892
    Ano: 2014
    Autor: Z Her
    Título: Active infection of human blood monocytes by Chikungunya virus triggers an innate immune response
    Título do periódico: J Immunol
    Volume: 184
    Fascículo: 10
    Primeira página: 5903
    Ano: 2010
    DOI: 10.4049/jimmunol.0904181
    Autor: D Michlmayr
    Título: CD14(+)CD16(+) monocytes are the main target of Zika virus infection in peripheral blood mononuclear cells in a paediatric study in Nicaragua
    Título do periódico: Nat Microbiol
    Volume: 2
    Fascículo: 11
    Primeira página: 1462
    Ano: 2017
    DOI: 10.1038/s41564-017-0035-0
    Autor: J Gardner
    Título: Chikungunya Virus Arthritis in Adult Wild-Type Mice
    Título do periódico: Journal of Virology
    Volume: 84
    Fascículo: 16
    Primeira página: 8021
    Ano: 2010
    DOI: 10.1128/JVI.02603-09
    Autor: RS Lanciotti
    Título: Chikungunya virus in US travelers returning from India, 2006
    Título do periódico: Emerg Infect Dis
    Volume: 13
    Fascículo: 5
    Primeira página: 764
    Ano: 2007
    DOI: 10.3201/eid1305.070015
    Autor: AM Bolger
    Título: Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 30
    Fascículo: 15
    Primeira página: 2114
    Ano: 2014
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btu170
    Autor: B Langmead
    Título: Fast gapped-read alignment with Bowtie 2
    Título do periódico: Nat Methods
    Volume: 9
    Fascículo: 4
    Primeira página: 357
    Ano: 2012
    DOI: 10.1038/nmeth.1923
    Autor: D Kim
    Título: TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions
    Título do periódico: Genome Biol
    Volume: 14
    Fascículo: 4
    Primeira página: R36
    Ano: 2013
    DOI: 10.1186/gb-2013-14-4-r36
    Autor: Y Liao
    Título: featureCounts: an efficient general purpose program for assigning sequence reads to genomic features
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 30
    Fascículo: 7
    Primeira página: 923
    Ano: 2014
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btt656
    Jianying Li PRB, Tzu-Ming Chu, Russell D Wolfinger. Principal Variance Components Analysis: Estimating Batch Effects in Microarray Gene Expression Data2009 02 November 2009.
    Autor: S Li
    Título: Molecular signatures of antibody responses derived from a systems biology study of five human vaccines
    Título do periódico: Nat Immunol
    Volume: 15
    Fascículo: 2
    Primeira página: 195
    Ano: 2014
    DOI: 10.1038/ni.2789
    Autor: PST Russo
    Título: CEMiTool: a Bioconductor package for performing comprehensive modular co-expression analyses
    Título do periódico: Bmc Bioinformatics
    Volume: 19
    Fascículo: 1
    Primeira página: 56
    Ano: 2018
    DOI: 10.1186/s12859-018-2053-1
    Autor: FM Marim
    Título: A method for generation of bone marrow-derived macrophages from cryopreserved mouse bone marrow cells
    Título do periódico: Plos One
    Volume: 5
    Fascículo: 12
    Primeira página: e15263
    Ano: 2010
    DOI: 10.1371/journal.pone.0015263
    Autor: K Kuida
    Título: Altered cytokine export and apoptosis in mice deficient in interleukin-1 beta converting enzyme
    Título do periódico: Science
    Volume: 267
    Fascículo: 5206
    Primeira página: 2000
    Ano: 1995
    DOI: 10.1126/science.7535475

Digital Library of Intellectual Production of Universidade de São Paulo     2012 - 2019