Análise in silico de "Random Sequence Tags" (RSTs) do fungo patogênico humano Paracoccidioides brasiliensis (2005)
- Authors:
- Autor USP: BERNARDES, LUCIANO ANGELO DE SOUZA - FCFRP
- Unidade: FCFRP
- Sigla do Departamento: 602
- Subjects: PARACOCCIDIOIDES BRASILIENSIS (PATOGENICIDADE); PARASITOLOGIA
- Language: Português
- Abstract: O fungo Paracoccidioides brasiliensis (Pb) apresenta duas formas morfologicamente distintas, micélio (saprófita) e levedura (patogênica). Supõe-se que ele se desenvolva no solo e/ou plantas e, apesar de ainda não existir um estudo conclusivo, acredita-se que animais participem de seu ciclo de desenvolvimento. Sendo o agente etiológico da Paracoccidioidomicose (PCM), endemia do Brasil e áreas adjacentes, causa uma doença que se manifesta sob duas formas: (i) juvenil: aguda e acomete crianças de ambos os sexos e adultos com menos de 30 anos (3 a 4% dos casos) e (ii) adulta: crônica e representa a maioria dos casos, atacando preferencialmente homens (80% dos casos) da zona rural, na sua fase mais produtiva (30 a 50 anos). Devido à relativa falta de ferramentas moleculares para a manipulação genética deste fungo, foram concentrados esforços em análises genômicas, para complementar os estudos e auxiliar a compreensão molecular da patobiologia deste organismo. Este trabalho teve como objetivo a análise computacional de Random Sequence Tags (RSTs) através do desenvolvimento de um sistema informatizado automático de recebimento via rede mundial de computadores, processamento (Phred e Cross_match) e disponibilização para visualização e análises dos dados ("pipeline"). Depois de todos os dados recebidos, estes foram agrupados em conjuntos para: (i) execução de comparações diversas com dados próprios (ESTs) e externos (NCBI), que permitiram classificá-Ias segundo suafunção biológica (sistema de anotação desenvolvido localmente); (ii) determinação de microssatélites; (iii) análise da estrutura "intrônica"; e (iv) polimorfismos de DNA
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2005
- Data da defesa: 28.04.2005
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ABNT
BERNARDES, Luciano Angelo de Souza. Análise in silico de "Random Sequence Tags" (RSTs) do fungo patogênico humano Paracoccidioides brasiliensis. 2005. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2005. . Acesso em: 18 fev. 2026. -
APA
Bernardes, L. A. de S. (2005). Análise in silico de "Random Sequence Tags" (RSTs) do fungo patogênico humano Paracoccidioides brasiliensis (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Bernardes LA de S. Análise in silico de "Random Sequence Tags" (RSTs) do fungo patogênico humano Paracoccidioides brasiliensis. 2005 ;[citado 2026 fev. 18 ] -
Vancouver
Bernardes LA de S. Análise in silico de "Random Sequence Tags" (RSTs) do fungo patogênico humano Paracoccidioides brasiliensis. 2005 ;[citado 2026 fev. 18 ]
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