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  • Dissertação (Mestrado)

    Desenvolvimento de uma pipeline de bioinformática para a identificação de doenças infecciosas emergentes em pacientes com regime de transfusão crônica (2021)

    Valença, Ian Nunes; Slavov, Svetoslav Nanev (Orientador)

    Unidade: FMRP

    Subjects: DOENÇAS INFECCIOSAS, VÍRUS, BIOSSEGURANÇA, HEMOFILIA, BIOINFORMÁTICA, SEGURANÇA DO SANGUE

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
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    • ABNT

      VALENÇA, Ian Nunes. Desenvolvimento de uma pipeline de bioinformática para a identificação de doenças infecciosas emergentes em pacientes com regime de transfusão crônica. 2021. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2021. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17153/tde-09092021-084735/. Acesso em: 12 out. 2024.

    • APA

      Valença, I. N. (2021). Desenvolvimento de uma pipeline de bioinformática para a identificação de doenças infecciosas emergentes em pacientes com regime de transfusão crônica (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17153/tde-09092021-084735/

    • NLM

      Valença IN. Desenvolvimento de uma pipeline de bioinformática para a identificação de doenças infecciosas emergentes em pacientes com regime de transfusão crônica [Internet]. 2021 ;[citado 2024 out. 12 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17153/tde-09092021-084735/

    • Vancouver

      Valença IN. Desenvolvimento de uma pipeline de bioinformática para a identificação de doenças infecciosas emergentes em pacientes com regime de transfusão crônica [Internet]. 2021 ;[citado 2024 out. 12 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17153/tde-09092021-084735/

  • Dissertação (Mestrado)

    Aplicação de métodos de bioinformática para identificação de infecções virais com impacto em hemoterapia (2021)

    Bezerra, Rafael dos Santos; Slavov, Svetoslav Nanev (Orientador)

    Unidade: FMRP

    Subjects: BIOINFORMÁTICA, VÍRUS, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, GENÉTICA MICROBIANA, SANGUE, VIROSES

    Acesso à fonteHow to cite
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    • ABNT

      BEZERRA, Rafael dos Santos. Aplicação de métodos de bioinformática para identificação de infecções virais com impacto em hemoterapia. 2021. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2021. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17153/tde-04102021-161934/. Acesso em: 12 out. 2024.

    • APA

      Bezerra, R. dos S. (2021). Aplicação de métodos de bioinformática para identificação de infecções virais com impacto em hemoterapia (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17153/tde-04102021-161934/

    • NLM

      Bezerra R dos S. Aplicação de métodos de bioinformática para identificação de infecções virais com impacto em hemoterapia [Internet]. 2021 ;[citado 2024 out. 12 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17153/tde-04102021-161934/

    • Vancouver

      Bezerra R dos S. Aplicação de métodos de bioinformática para identificação de infecções virais com impacto em hemoterapia [Internet]. 2021 ;[citado 2024 out. 12 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17153/tde-04102021-161934/

  • Parte de monografia/livro

    Rational design of profile hidden Markov models for viral classification and discovery (2021)

    Oliveira, Liliane Santana; Gruber, Arthur

    Source: Bioinformatics [Internet]. Unidade: ICB

    Subjects: PARASITOLOGIA, VIROLOGIA MOLECULAR, MODELOS ANIMAIS DE DOENÇAS, VÍRUS, BIOINFORMÁTICA, DIVERSIDADE GENÉTICA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, MUTAÇÃO GENÉTICA

    Acesso à fonteDOIHow to cite
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    • ABNT

      OLIVEIRA, Liliane Santana e GRUBER, Arthur. Rational design of profile hidden Markov models for viral classification and discovery. Bioinformatics [Internet]. Tradução . Brisbane: Exon Publication, 2021. p. ca 9. Disponível em: https://doi.org/10.36255/exonpublications.bioinformatics.2021.ch9. Acesso em: 12 out. 2024.

    • APA

      Oliveira, L. S., & Gruber, A. (2021). Rational design of profile hidden Markov models for viral classification and discovery. In Bioinformatics [Internet] (p. ca 9). Brisbane: Exon Publication. doi:10.36255/exonpublications.bioinformatics.2021.ch9

    • NLM

      Oliveira LS, Gruber A. Rational design of profile hidden Markov models for viral classification and discovery [Internet]. In: Bioinformatics [Internet]. Brisbane: Exon Publication; 2021. p. ca 9.[citado 2024 out. 12 ] Available from: https://doi.org/10.36255/exonpublications.bioinformatics.2021.ch9

    • Vancouver

      Oliveira LS, Gruber A. Rational design of profile hidden Markov models for viral classification and discovery [Internet]. In: Bioinformatics [Internet]. Brisbane: Exon Publication; 2021. p. ca 9.[citado 2024 out. 12 ] Available from: https://doi.org/10.36255/exonpublications.bioinformatics.2021.ch9

  • Artigo de jornal-dep/entr

    Doutorando da USP desenvolve teste genético para vírus que causa febre hemorrágica [Depoimento a Fabiana Mariz] (2020)

    Amgarten, Deyvid ; Setubal, João Carlos ; Da Silva, Aline Maria ; Romano, Camila

    Source: Jornal da USP. Unidades: IQ, BIOINFORMÁTICA, BIOTECNOLOGIA

    Subjects: VÍRUS, BIOINFORMÁTICA

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    • ABNT

      AMGARTEN, Deyvid et al. Doutorando da USP desenvolve teste genético para vírus que causa febre hemorrágica [Depoimento a Fabiana Mariz]. Jornal da USP. São Paulo: Instituto de Química, Universidade de São Paulo. Disponível em: https://jornal.usp.br/ciencias/ciencias-da-saude/doutorando-da-usp-desenvolve-teste-genetico-para-virus-que-causa-febre-hemorragica. Acesso em: 12 out. 2024. , 2020

    • APA

      Amgarten, D., Setubal, J. C., Da Silva, A. M., & Romano, C. (2020). Doutorando da USP desenvolve teste genético para vírus que causa febre hemorrágica [Depoimento a Fabiana Mariz]. Jornal da USP. São Paulo: Instituto de Química, Universidade de São Paulo. Recuperado de https://jornal.usp.br/ciencias/ciencias-da-saude/doutorando-da-usp-desenvolve-teste-genetico-para-virus-que-causa-febre-hemorragica

    • NLM

      Amgarten D, Setubal JC, Da Silva AM, Romano C. Doutorando da USP desenvolve teste genético para vírus que causa febre hemorrágica [Depoimento a Fabiana Mariz] [Internet]. Jornal da USP. 2020 ;(30 ja 2020. on-line):[citado 2024 out. 12 ] Available from: https://jornal.usp.br/ciencias/ciencias-da-saude/doutorando-da-usp-desenvolve-teste-genetico-para-virus-que-causa-febre-hemorragica

    • Vancouver

      Amgarten D, Setubal JC, Da Silva AM, Romano C. Doutorando da USP desenvolve teste genético para vírus que causa febre hemorrágica [Depoimento a Fabiana Mariz] [Internet]. Jornal da USP. 2020 ;(30 ja 2020. on-line):[citado 2024 out. 12 ] Available from: https://jornal.usp.br/ciencias/ciencias-da-saude/doutorando-da-usp-desenvolve-teste-genetico-para-virus-que-causa-febre-hemorragica

  • Dissertação (Mestrado)

    Construção e aplicação de HMMs de perfil para a detecção e classificação de vírus (2019)

    Guimarães, Miriã Nunes; Gruber, Arthur (Orientador)

    Unidade: BIOINFORMÁTICA

    Subjects: BIOINFORMÁTICA, VÍRUS, MARCADOR MOLECULAR, MODELOS PARA PROCESSOS ESTOCÁSTICOS, GENOMAS

    Acesso à fonteHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      GUIMARÃES, Miriã Nunes. Construção e aplicação de HMMs de perfil para a detecção e classificação de vírus. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-24042019-115926/. Acesso em: 12 out. 2024.

    • APA

      Guimarães, M. N. (2019). Construção e aplicação de HMMs de perfil para a detecção e classificação de vírus (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-24042019-115926/

    • NLM

      Guimarães MN. Construção e aplicação de HMMs de perfil para a detecção e classificação de vírus [Internet]. 2019 ;[citado 2024 out. 12 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-24042019-115926/

    • Vancouver

      Guimarães MN. Construção e aplicação de HMMs de perfil para a detecção e classificação de vírus [Internet]. 2019 ;[citado 2024 out. 12 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-24042019-115926/

  • Artigo de periodico

    Bioinformatics meets virology: the european virus Bioinformatics Center’s Second Annual Meeting (2018)

    Ibrahim, Bashar; Arkhipova, Ksenia; Andeweg, Arno C.; Posada-Céspedes, Susana; Enault, François; Gruber, Arthur ; Koonin, Eugene V.; Kupczok, Anne; Lemey, Philippe; McHardy, Alice C.; McMahon, Dino P.; Pickett, Brett E.; Robertson, David L.; Scheuermann, Richard H.; Zhernakova, Alexandra; Zwart, Mark P.; Schönhuth, Alexander; Dutilh, Bas E.; Marz, Manja

    Source: Viruses. Unidade: ICB

    Subjects: PARASITOLOGIA, BIOINFORMÁTICA, VÍRUS

    Acesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      IBRAHIM, Bashar et al. Bioinformatics meets virology: the european virus Bioinformatics Center’s Second Annual Meeting. Viruses, v. 10, n. 5, p. 1-19, 2018Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3390/v10050256. Acesso em: 12 out. 2024.

    • APA

      Ibrahim, B., Arkhipova, K., Andeweg, A. C., Posada-Céspedes, S., Enault, F., Gruber, A., et al. (2018). Bioinformatics meets virology: the european virus Bioinformatics Center’s Second Annual Meeting. Viruses, 10( 5), 1-19. doi:10.3390/v10050256

    • NLM

      Ibrahim B, Arkhipova K, Andeweg AC, Posada-Céspedes S, Enault F, Gruber A, Koonin EV, Kupczok A, Lemey P, McHardy AC, McMahon DP, Pickett BE, Robertson DL, Scheuermann RH, Zhernakova A, Zwart MP, Schönhuth A, Dutilh BE, Marz M. Bioinformatics meets virology: the european virus Bioinformatics Center’s Second Annual Meeting [Internet]. Viruses. 2018 ; 10( 5): 1-19.[citado 2024 out. 12 ] Available from: https://doi.org/10.3390/v10050256

    • Vancouver

      Ibrahim B, Arkhipova K, Andeweg AC, Posada-Céspedes S, Enault F, Gruber A, Koonin EV, Kupczok A, Lemey P, McHardy AC, McMahon DP, Pickett BE, Robertson DL, Scheuermann RH, Zhernakova A, Zwart MP, Schönhuth A, Dutilh BE, Marz M. Bioinformatics meets virology: the european virus Bioinformatics Center’s Second Annual Meeting [Internet]. Viruses. 2018 ; 10( 5): 1-19.[citado 2024 out. 12 ] Available from: https://doi.org/10.3390/v10050256

  • Artigo de periodico-dep/entr

    Aliados improváveis. [Depoimento a Maria Guimarães] (2017)

    Da Silva, Aline Maria ; Setubal, João Carlos ; Schooley, Robert; Leão, Sylvia Cardoso; Balcão, Victor; Chammas, Roger; Fontes, Aparecida Maria; Zanelli, Cleslei; Pedrolli, Danielle; Danino, Tal; Harimoto, Tetsuhiro; Rocha, Rafael Silva; Heringer, Otto; Westmann, Cauã; Buckeridge, Marcos

    Source: Pesquisa FAPESP. Unidades: IQ, FM, FMRP, IB

    Subjects: VÍRUS, BACTÉRIAS PATOGÊNICAS, BIOLOGIA MOLECULAR, BACTERIÓFAGOS, GENÔMICA, BIOINFORMÁTICA, BIOTECNOLOGIA, PAREDE CELULAR VEGETAL, FÁRMACOS, PROJETOS DE PESQUISA

    Acesso à fonteHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      DA SILVA, Aline Maria et al. Aliados improváveis. [Depoimento a Maria Guimarães]. Pesquisa FAPESP. São Paulo: Instituto de Química, Universidade de São Paulo. Disponível em: http://revistapesquisa.fapesp.br/2017/07/17/aliados-improvaveis/. Acesso em: 12 out. 2024. , 2017

    • APA

      Da Silva, A. M., Setubal, J. C., Schooley, R., Leão, S. C., Balcão, V., Chammas, R., et al. (2017). Aliados improváveis. [Depoimento a Maria Guimarães]. Pesquisa FAPESP. São Paulo: Instituto de Química, Universidade de São Paulo. Recuperado de http://revistapesquisa.fapesp.br/2017/07/17/aliados-improvaveis/

    • NLM

      Da Silva AM, Setubal JC, Schooley R, Leão SC, Balcão V, Chammas R, Fontes AM, Zanelli C, Pedrolli D, Danino T, Harimoto T, Rocha RS, Heringer O, Westmann C, Buckeridge M. Aliados improváveis. [Depoimento a Maria Guimarães] [Internet]. Pesquisa FAPESP. 2017 ; 19-25.[citado 2024 out. 12 ] Available from: http://revistapesquisa.fapesp.br/2017/07/17/aliados-improvaveis/

    • Vancouver

      Da Silva AM, Setubal JC, Schooley R, Leão SC, Balcão V, Chammas R, Fontes AM, Zanelli C, Pedrolli D, Danino T, Harimoto T, Rocha RS, Heringer O, Westmann C, Buckeridge M. Aliados improváveis. [Depoimento a Maria Guimarães] [Internet]. Pesquisa FAPESP. 2017 ; 19-25.[citado 2024 out. 12 ] Available from: http://revistapesquisa.fapesp.br/2017/07/17/aliados-improvaveis/

  • Dissertação (Mestrado)

    GenSeed-HMM: desenvolvimento de uma plataforma para reconstrução de sequências e sua aplicação em dados de sequenciamento de nova geração (2012)

    Oliveira, André Luiz de; Gruber, Arthur (Orientador)

    Unidade: ICB

    Subjects: BIOINFORMÁTICA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, SEQUÊNCIA DO DNA, DESENVOLVIMENTO DE SOFTWARE, BIOLOGIA MOLECULAR, VÍRUS

    Acesso à fonteHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      OLIVEIRA, André Luiz de. GenSeed-HMM: desenvolvimento de uma plataforma para reconstrução de sequências e sua aplicação em dados de sequenciamento de nova geração. 2012. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2012. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-09112012-111833/. Acesso em: 12 out. 2024.

    • APA

      Oliveira, A. L. de. (2012). GenSeed-HMM: desenvolvimento de uma plataforma para reconstrução de sequências e sua aplicação em dados de sequenciamento de nova geração (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-09112012-111833/

    • NLM

      Oliveira AL de. GenSeed-HMM: desenvolvimento de uma plataforma para reconstrução de sequências e sua aplicação em dados de sequenciamento de nova geração [Internet]. 2012 ;[citado 2024 out. 12 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-09112012-111833/

    • Vancouver

      Oliveira AL de. GenSeed-HMM: desenvolvimento de uma plataforma para reconstrução de sequências e sua aplicação em dados de sequenciamento de nova geração [Internet]. 2012 ;[citado 2024 out. 12 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-09112012-111833/
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1 - 8 (8 records)

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