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Dissertação (Mestrado)
Tuning Stochastic Dynamic Models of the Dynamics of DNA Replication in Trypanosomatids (2025)
Scholl, Bruno Boaventura; Reis, Marcelo da Silva (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Subjects: DNA, REPLICAÇÃO DO DNA, TRANSCRIÇÃO GÊNICA, TRIPANOSSOMOSE, GEOMETRIA E MODELAGEM COMPUTACIONAL
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ABNT
SCHOLL, Bruno Boaventura. Tuning Stochastic Dynamic Models of the Dynamics of DNA Replication in Trypanosomatids. 2025. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29062025-202725/. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Scholl, B. B. (2025). Tuning Stochastic Dynamic Models of the Dynamics of DNA Replication in Trypanosomatids (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29062025-202725/
NLM
Scholl BB. Tuning Stochastic Dynamic Models of the Dynamics of DNA Replication in Trypanosomatids [Internet]. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29062025-202725/
Vancouver
Scholl BB. Tuning Stochastic Dynamic Models of the Dynamics of DNA Replication in Trypanosomatids [Internet]. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-29062025-202725/
Artigo de periodico
Integrative immunology identified interferome signatures in uveitis and systemic diseaseassociated uveitis (2025)
Munhoz, Danielle Dias ; Fonseca, Dennyson Leandro Mathias da ; Filgueiras, Igor Salerno ; Dias, Haroldo Dutra ; Nakaya, Helder Takashi Imoto ; Jurisica, Igor ; Ochs, Hans D ; Schimke, Lena F ; Rizzo, Luiz Vicente; Marques, Otavio Cabral
Source: Frontiers in Immunology. Unidades: FCF, FM, Interunidades em Bioinformática, ICB
Subjects: UVEÍTE, GENES REGULADORES, INTERFERONS, CITOCINAS
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ABNT
MUNHOZ, Danielle Dias et al. Integrative immunology identified interferome signatures in uveitis and systemic diseaseassociated uveitis. Frontiers in Immunology, v. 16, p. 1-17 art. 1509805, 2025Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3389/fimmu.2025.1509805. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Munhoz, D. D., Fonseca, D. L. M. da, Filgueiras, I. S., Dias, H. D., Nakaya, H. T. I., Jurisica, I., et al. (2025). Integrative immunology identified interferome signatures in uveitis and systemic diseaseassociated uveitis. Frontiers in Immunology, 16, 1-17 art. 1509805. doi:10.3389/fimmu.2025.1509805
NLM
Munhoz DD, Fonseca DLM da, Filgueiras IS, Dias HD, Nakaya HTI, Jurisica I, Ochs HD, Schimke LF, Rizzo LV, Marques OC. Integrative immunology identified interferome signatures in uveitis and systemic diseaseassociated uveitis [Internet]. Frontiers in Immunology. 2025 ; 16 1-17 art. 1509805.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.3389/fimmu.2025.1509805
Vancouver
Munhoz DD, Fonseca DLM da, Filgueiras IS, Dias HD, Nakaya HTI, Jurisica I, Ochs HD, Schimke LF, Rizzo LV, Marques OC. Integrative immunology identified interferome signatures in uveitis and systemic diseaseassociated uveitis [Internet]. Frontiers in Immunology. 2025 ; 16 1-17 art. 1509805.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.3389/fimmu.2025.1509805
Trabalho de evento-resumo
Identification and mapping of Schistosoma mansoni v10 long non‐coding RNAs associated with oocyte differentiation using public bulk and single‐cell RNA‐seq data (2025)
Sousa, Caio Felipe Freire de; Lopes, Thalles Souza ; Tahira, Ana Carolina ; Verjovski-Almeida, Sergio
Source: Abstracts. Conference titles: Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology/SBBQ. Unidades: FM, IQ, Interunidades em Bioinformática
Subjects: PARASITOLOGIA, DOENÇAS NEGLIGENCIADAS
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ABNT
SOUSA, Caio Felipe Freire de et al. Identification and mapping of Schistosoma mansoni v10 long non‐coding RNAs associated with oocyte differentiation using public bulk and single‐cell RNA‐seq data. 2025, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Celular, 2025. Disponível em: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Sousa, C. F. F. de, Lopes, T. S., Tahira, A. C., & Verjovski-Almeida, S. (2025). Identification and mapping of Schistosoma mansoni v10 long non‐coding RNAs associated with oocyte differentiation using public bulk and single‐cell RNA‐seq data. In Abstracts. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Celular. Recuperado de https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf
NLM
Sousa CFF de, Lopes TS, Tahira AC, Verjovski-Almeida S. Identification and mapping of Schistosoma mansoni v10 long non‐coding RNAs associated with oocyte differentiation using public bulk and single‐cell RNA‐seq data [Internet]. Abstracts. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf
Vancouver
Sousa CFF de, Lopes TS, Tahira AC, Verjovski-Almeida S. Identification and mapping of Schistosoma mansoni v10 long non‐coding RNAs associated with oocyte differentiation using public bulk and single‐cell RNA‐seq data [Internet]. Abstracts. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf
Artigo de periodico
COVID-19 vaccination atlas using an integrative systems vaccinology approach (2025)
Prates-Syed, Wasim Aluisio ; Fonseca, Dennyson Leandro Mathias da ; Pour, Shahab Zaki ; Lira, Aline Aparecida de Lima ; Cortês, Nelson ; Silva, Jaqueline Dinis Queiroz; Carvalho, Evelyn; Filgueiras, Igor Salerno ; Vinces, Tania Geraldine Churasacari ; Schimke, Lena Friederike ; Chaves, Lorena C. S. ; Durães-Carvalho, Ricardo ; Dias, Haroldo Dutra ; Ochs, Hans Dieter ; Nakaya, Helder Takashi Imoto ; Krieger, Jose Eduardo ; Cabral-Marques, Otávio ; Cabral-Miranda, Gustavo ; Wunderlich, Gerhard ; Câmara, Niels Olsen Saraiva
Source: NPJ Vaccines. Unidades: FCF, ICB, FFCLRP, Interunidades em Biotecnologia, Interunidades em Bioinformática, FM
Subjects: IMUNOLOGIA, PARASITOLOGIA, COVID-19, VACINAÇÃO, VACINAS VIRAIS, CORONAVIRUS, INFECÇÕES POR VÍRUS DE RNA, INFECÇÕES POR CORONAVIRUS, ATLAS
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ABNT
PRATES-SYED, Wasim Aluisio et al. COVID-19 vaccination atlas using an integrative systems vaccinology approach. NPJ Vaccines, v. 10, n. 1, p. 12 , 2025Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.308/s41541-025-01148-3. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Prates-Syed, W. A., Fonseca, D. L. M. da, Pour, S. Z., Lira, A. A. de L., Cortês, N., Silva, J. D. Q., et al. (2025). COVID-19 vaccination atlas using an integrative systems vaccinology approach. NPJ Vaccines, 10( 1), 12 . doi:10.308/s41541-025-01148-3
NLM
Prates-Syed WA, Fonseca DLM da, Pour SZ, Lira AA de L, Cortês N, Silva JDQ, Carvalho E, Filgueiras IS, Vinces TGC, Schimke LF, Chaves LCS, Durães-Carvalho R, Dias HD, Ochs HD, Nakaya HTI, Krieger JE, Cabral-Marques O, Cabral-Miranda G, Wunderlich G, Câmara NOS. COVID-19 vaccination atlas using an integrative systems vaccinology approach [Internet]. NPJ Vaccines. 2025 ; 10( 1): 12 .[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.308/s41541-025-01148-3
Vancouver
Prates-Syed WA, Fonseca DLM da, Pour SZ, Lira AA de L, Cortês N, Silva JDQ, Carvalho E, Filgueiras IS, Vinces TGC, Schimke LF, Chaves LCS, Durães-Carvalho R, Dias HD, Ochs HD, Nakaya HTI, Krieger JE, Cabral-Marques O, Cabral-Miranda G, Wunderlich G, Câmara NOS. COVID-19 vaccination atlas using an integrative systems vaccinology approach [Internet]. NPJ Vaccines. 2025 ; 10( 1): 12 .[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.308/s41541-025-01148-3
Artigo de periodico
Identifying biomarkers and trajectories of executive functions and language development in the first 3 years of life: design, methods, and findings of the Germina cohort study (2025)
Fatori, Daniel ; Shephard, Elizabeth ; Benette, Danilo ; Naspolini, Nathalia Ferrazzo ; Guzman, Grover Enrique Castro ; Wang, Jaqueline Yu Ting ; Tótolo, Pedro ; Mafra, Anthonieta Looman ; Isaias, Caio; Santos, Davi Pereira dos ; Russo, Fabiele Baldino ; Kobayashi, Gerson Shigeru ; Argeu, Adriana; Teixeira, Monike ; Mattiello-Sverzut, Ana Claudia ; Fernandes, Maria Teresa Bechere ; Petian-Alonso, Danila Cristina ; Brentani, Helena Paula ; Scliar, Marilia ; Schüroff, Paulo Alfonso ; Zuccolo, Pedro Fonseca ; Lerner, Rogério ; Geraldini , Stephania A. R. Batista; Euclydes, Veronica Luiza Vale ; Matijasevich, Alicia ; Campos, Alline Cristina de ; Carvalho, Andre Carlos Ponce de Leon Ferreira de ; Fujita, André ; Taddei, Carla Romano ; Passos-Bueno, Maria Rita ; Beltrão-Braga, Patrícia Cristina Baleeiro ; Polanczyk, Guilherme Vanoni
Source: Development and Psychopathology. Unidades: IP, FMRP, FM, ICMC, IME, ICB, IB, Interunidades em Bioinformática, EACH
Subjects: BIOMARCADORES, DESENVOLVIMENTO DA FALA, DESENVOLVIMENTO INFANTIL, ELETROENCEFALOGRAFIA
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ABNT
FATORI, Daniel et al. Identifying biomarkers and trajectories of executive functions and language development in the first 3 years of life: design, methods, and findings of the Germina cohort study. Development and Psychopathology, 2025Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1017/S0954579425000069. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Fatori, D., Shephard, E., Benette, D., Naspolini, N. F., Guzman, G. E. C., Wang, J. Y. T., et al. (2025). Identifying biomarkers and trajectories of executive functions and language development in the first 3 years of life: design, methods, and findings of the Germina cohort study. Development and Psychopathology. doi:10.1017/S0954579425000069
NLM
Fatori D, Shephard E, Benette D, Naspolini NF, Guzman GEC, Wang JYT, Tótolo P, Mafra AL, Isaias C, Santos DP dos, Russo FB, Kobayashi GS, Argeu A, Teixeira M, Mattiello-Sverzut AC, Fernandes MTB, Petian-Alonso DC, Brentani HP, Scliar M, Schüroff PA, Zuccolo PF, Lerner R, Geraldini SARB, Euclydes VLV, Matijasevich A, Campos AC de, Carvalho ACP de LF de, Fujita A, Taddei CR, Passos-Bueno MR, Beltrão-Braga PCB, Polanczyk GV. Identifying biomarkers and trajectories of executive functions and language development in the first 3 years of life: design, methods, and findings of the Germina cohort study [Internet]. Development and Psychopathology. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1017/S0954579425000069
Vancouver
Fatori D, Shephard E, Benette D, Naspolini NF, Guzman GEC, Wang JYT, Tótolo P, Mafra AL, Isaias C, Santos DP dos, Russo FB, Kobayashi GS, Argeu A, Teixeira M, Mattiello-Sverzut AC, Fernandes MTB, Petian-Alonso DC, Brentani HP, Scliar M, Schüroff PA, Zuccolo PF, Lerner R, Geraldini SARB, Euclydes VLV, Matijasevich A, Campos AC de, Carvalho ACP de LF de, Fujita A, Taddei CR, Passos-Bueno MR, Beltrão-Braga PCB, Polanczyk GV. Identifying biomarkers and trajectories of executive functions and language development in the first 3 years of life: design, methods, and findings of the Germina cohort study [Internet]. Development and Psychopathology. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1017/S0954579425000069
Artigo de periodico
Dysregulated autoantibodies targeting AGTR1 are associated with the accumulation of COVID-19 symptoms (2025)
Fonseca, Dennyson Leandro Mathias da ; Jäpel, Maj; Gyamfi, Michael Adu ; Filgueiras, Igor Salerno ; Baiochi, Gabriela Crispim; Ostrinski, Yuri ; Halpert, Gilad; Lavi, Yael Bublil; Vojdani, Elroy; Sousa, Thayna Silva; Usuda, Julia Nakanishi ; Silva, Juan Carlo Santos e ; Freire, Paula Paccielli ; Nóbile, Adriel Leal; Adri, Anny Silva; Barcelos, Pedro Marçal; Corrêa, Yohan Lucas Gonçalves; Vale, Fernando Yuri Nery do; Lopes, Letícia Oliveira; Schmidt, Solveig Lea; Wang, Xiaoqing; Vahldieck, Carl; Fels, Benedikt; Schimke, Lena F; Miranda, Gustavo Cabral; Hirata, Mario Hiroyuki ; Nakaya, Helder Takashi Imoto
Source: Systems Biology and Applications. Unidades: Interunidades em Biotecnologia, FCF, Interunidades em Bioinformática, ICB
Subjects: COVID-19, PROTEÍNAS G, IMUNOLOGIA, ANTICORPOS
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ABNT
FONSECA, Dennyson Leandro Mathias da et al. Dysregulated autoantibodies targeting AGTR1 are associated with the accumulation of COVID-19 symptoms. Systems Biology and Applications, v. 11, n. 7, p. 1-13, 2025Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1038/s41540-025-00488-z. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Fonseca, D. L. M. da, Jäpel, M., Gyamfi, M. A., Filgueiras, I. S., Baiochi, G. C., Ostrinski, Y., et al. (2025). Dysregulated autoantibodies targeting AGTR1 are associated with the accumulation of COVID-19 symptoms. Systems Biology and Applications, 11( 7), 1-13. doi:10.1038/s41540-025-00488-z
NLM
Fonseca DLM da, Jäpel M, Gyamfi MA, Filgueiras IS, Baiochi GC, Ostrinski Y, Halpert G, Lavi YB, Vojdani E, Sousa TS, Usuda JN, Silva JCS e, Freire PP, Nóbile AL, Adri AS, Barcelos PM, Corrêa YLG, Vale FYN do, Lopes LO, Schmidt SL, Wang X, Vahldieck C, Fels B, Schimke LF, Miranda GC, Hirata MH, Nakaya HTI. Dysregulated autoantibodies targeting AGTR1 are associated with the accumulation of COVID-19 symptoms [Internet]. Systems Biology and Applications. 2025 ; 11( 7): 1-13.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41540-025-00488-z
Vancouver
Fonseca DLM da, Jäpel M, Gyamfi MA, Filgueiras IS, Baiochi GC, Ostrinski Y, Halpert G, Lavi YB, Vojdani E, Sousa TS, Usuda JN, Silva JCS e, Freire PP, Nóbile AL, Adri AS, Barcelos PM, Corrêa YLG, Vale FYN do, Lopes LO, Schmidt SL, Wang X, Vahldieck C, Fels B, Schimke LF, Miranda GC, Hirata MH, Nakaya HTI. Dysregulated autoantibodies targeting AGTR1 are associated with the accumulation of COVID-19 symptoms [Internet]. Systems Biology and Applications. 2025 ; 11( 7): 1-13.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41540-025-00488-z
Artigo de periodico
Insertion of a divergent GAF-like domain defines a novel samily of YcgR homologues that bind c-di-GMP in Leptospirales (2025)
Visnardi, Aline Biazola ; Ribeiro, Rodolfo Alvarenga ; Souza, Anacleto Silva de ; Vinces, Tania Geraldine Churasacari ; Llontop, Edgar E. ; Ferrari, Anielle Salviano de Almeida ; Henrique, Pedro Antônio França ; Valdivieso, Daniela; Sánchez-Limache, Daniel Enrique ; Silva, Gabriela Roberto; Soares, Eduardo Pereira ; Santos, Thomas Wittmann Cezar; Farah, Chuck Shaker ; Sassonia, Rogerio Corte ; Salinas, Roberto Kopke ; Guzzo, Cristiane Rodrigues ; Souza, Robson Francisco de
Source: ACS Omega. Unidades: IQ, ICB, Interunidades em Bioinformática
Subjects: MICROBIOLOIGIA, SPIROCHAETACEAE, SPIROCHAETALES, TRANSDUÇÃO DE SINAL CELULAR, INFECÇÕES BACTERIANAS GRAM-NEGATIVAS, PROTEÍNAS
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ABNT
VISNARDI, Aline Biazola et al. Insertion of a divergent GAF-like domain defines a novel samily of YcgR homologues that bind c-di-GMP in Leptospirales. ACS Omega, v. 10, n. 4, p. 3988-4006, 2025Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1021/acsomega.4c09917. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Visnardi, A. B., Ribeiro, R. A., Souza, A. S. de, Vinces, T. G. C., Llontop, E. E., Ferrari, A. S. de A., et al. (2025). Insertion of a divergent GAF-like domain defines a novel samily of YcgR homologues that bind c-di-GMP in Leptospirales. ACS Omega, 10( 4), 3988-4006. doi:10.1021/acsomega.4c09917
NLM
Visnardi AB, Ribeiro RA, Souza AS de, Vinces TGC, Llontop EE, Ferrari AS de A, Henrique PAF, Valdivieso D, Sánchez-Limache DE, Silva GR, Soares EP, Santos TWC, Farah CS, Sassonia RC, Salinas RK, Guzzo CR, Souza RF de. Insertion of a divergent GAF-like domain defines a novel samily of YcgR homologues that bind c-di-GMP in Leptospirales [Internet]. ACS Omega. 2025 ; 10( 4): 3988-4006.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acsomega.4c09917
Vancouver
Visnardi AB, Ribeiro RA, Souza AS de, Vinces TGC, Llontop EE, Ferrari AS de A, Henrique PAF, Valdivieso D, Sánchez-Limache DE, Silva GR, Soares EP, Santos TWC, Farah CS, Sassonia RC, Salinas RK, Guzzo CR, Souza RF de. Insertion of a divergent GAF-like domain defines a novel samily of YcgR homologues that bind c-di-GMP in Leptospirales [Internet]. ACS Omega. 2025 ; 10( 4): 3988-4006.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acsomega.4c09917
Artigo de periodico
The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis (2025)
Kato, Kathia Terumi ; Ferreira, Gabriela Carvalho Santos ; Fonseca, Dennyson Leandro Mathias da ; Trzan, Isis Ferraz Liborio ; Filgueiras, Igor Salerno ; Nóbile, Adriel Leal ; Adri, Anny Silva ; Fonseca, Monique Thaís Costa ; Souza, Rayssa N.; Matos, Caroline Martins; Sales, Manoela O. R.; Lino, Caroline Antunes ; Teramoto, Mariana Maymi ; Muxel, Sandra Marcia ; Cabral-Marques, Otavio ; Steiner, Alexandre Alarcon
Source: Brain, Behavior, and Immunity. Unidades: ICB, FM, Interunidades em Bioinformática, FCF
Subjects: IMUNOLOGIA, PERITONITE, PERITONITE ANIMAL, PERITÔNIO, PERITÔNEO DE ANIMAL, MODELOS ANIMAIS DE DOENÇAS, NEUTRÓFILOS, MACRÓFAGOS, IMUNIDADE, RNA, RATOS
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ABNT
KATO, Kathia Terumi et al. The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis. Brain, Behavior, and Immunity, v. 129, p. 30-41, 2025Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.bbi.2025.05.015. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Kato, K. T., Ferreira, G. C. S., Fonseca, D. L. M. da, Trzan, I. F. L., Filgueiras, I. S., Nóbile, A. L., et al. (2025). The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis. Brain, Behavior, and Immunity, 129, 30-41. doi:10.1016/j.bbi.2025.05.015
NLM
Kato KT, Ferreira GCS, Fonseca DLM da, Trzan IFL, Filgueiras IS, Nóbile AL, Adri AS, Fonseca MTC, Souza RN, Matos CM, Sales MOR, Lino CA, Teramoto MM, Muxel SM, Cabral-Marques O, Steiner AA. The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis [Internet]. Brain, Behavior, and Immunity. 2025 ; 129 30-41.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.bbi.2025.05.015
Vancouver
Kato KT, Ferreira GCS, Fonseca DLM da, Trzan IFL, Filgueiras IS, Nóbile AL, Adri AS, Fonseca MTC, Souza RN, Matos CM, Sales MOR, Lino CA, Teramoto MM, Muxel SM, Cabral-Marques O, Steiner AA. The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis [Internet]. Brain, Behavior, and Immunity. 2025 ; 129 30-41.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.bbi.2025.05.015
Trabalho de evento-resumo
ENSG00000265912 is a long noncoding RNA enriched in pancreatic cancer stem cells (2025)
Rezende, Nicolas Paulino ; Fonseca, Gabriel Lucas da; Bronze, Emily; Bizinelli, Daniela ; Sanches, Leonardo ; Reis, Eduardo Moraes ; Bassères, Daniela Sanchez
Source: Abstracts. Conference titles: Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology/SBBQ. Unidades: IQ, FCF, Interunidades em Bioinformática
Subjects: CÉLULAS-TRONCO, ADENOCARCINOMA
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ABNT
REZENDE, Nicolas Paulino et al. ENSG00000265912 is a long noncoding RNA enriched in pancreatic cancer stem cells. 2025, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Celular, 2025. Disponível em: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Rezende, N. P., Fonseca, G. L. da, Bronze, E., Bizinelli, D., Sanches, L., Reis, E. M., & Bassères, D. S. (2025). ENSG00000265912 is a long noncoding RNA enriched in pancreatic cancer stem cells. In Abstracts. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Celular. Recuperado de https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf
NLM
Rezende NP, Fonseca GL da, Bronze E, Bizinelli D, Sanches L, Reis EM, Bassères DS. ENSG00000265912 is a long noncoding RNA enriched in pancreatic cancer stem cells [Internet]. Abstracts. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf
Vancouver
Rezende NP, Fonseca GL da, Bronze E, Bizinelli D, Sanches L, Reis EM, Bassères DS. ENSG00000265912 is a long noncoding RNA enriched in pancreatic cancer stem cells [Internet]. Abstracts. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf
Trabalho de evento-resumo
Exploring PLCу𝛾 roles in mechanical hypersensitivity and edema during capsaicin‐triggered neurogenic inflammation (2025)
Nascimento, Alexandre Martins do ; Rodrigues, Ana Maria; Marques, Rauni Borges ; Santos, Raphael de Siqueira ; Dale, Camila Squarzoni ; Schechtman, Deborah
Source: Abstracts. Conference titles: Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology/SBBQ. Unidades: IB, ICB, IQ, Interunidades em Bioinformática
Subjects: HIPERSENSIBILIDADE, NEUROGENÉTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
NASCIMENTO, Alexandre Martins do et al. Exploring PLCу𝛾 roles in mechanical hypersensitivity and edema during capsaicin‐triggered neurogenic inflammation. 2025, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Celular, 2025. Disponível em: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Nascimento, A. M. do, Rodrigues, A. M., Marques, R. B., Santos, R. de S., Dale, C. S., & Schechtman, D. (2025). Exploring PLCу𝛾 roles in mechanical hypersensitivity and edema during capsaicin‐triggered neurogenic inflammation. In Abstracts. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Celular. Recuperado de https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf
NLM
Nascimento AM do, Rodrigues AM, Marques RB, Santos R de S, Dale CS, Schechtman D. Exploring PLCу𝛾 roles in mechanical hypersensitivity and edema during capsaicin‐triggered neurogenic inflammation [Internet]. Abstracts. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf
Vancouver
Nascimento AM do, Rodrigues AM, Marques RB, Santos R de S, Dale CS, Schechtman D. Exploring PLCу𝛾 roles in mechanical hypersensitivity and edema during capsaicin‐triggered neurogenic inflammation [Internet]. Abstracts. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2025/images/resumos.pdf
Artigo de periodico
Gene regulatory networks analysis for the discovery of prognostic genes in gliomas (2025)
Barcelos, Pedro Marçal; Filgueiras, Igor Salerno ; Nóbile, Adriel Leal; Usuda, Julia Nakanishi ; Adri, Anny Silva; Alburquerque, Débora Gomes de; Corrêa, Yohan Lucas Gonçalves; Vale, Fernando Yuri Nery do ; Bahia, Ian Antunes Ferreira; Nava, Roseane Galdioli; Boroni, Mariana ; Marques, Alexandre H. C; Dalmolin, Rodrigo; Schimke, Lena F. ; Miranda, Gustavo Cabral de ; Nakaya, Helder Takashi Imoto ; Dias, Haroldo Dutra ; Fonseca, Dennyson Leandro Mathias da ; Marques, Otavio Cabral
Source: Scientific Reports. Unidades: FCF, FM, ICB, Interunidades em Bioinformática
Subjects: GLIOMA, SOBREVIVÊNCIA CELULAR, BIOMARCADORES, NEOPLASIAS DO SISTEMA NERVOSO
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ABNT
BARCELOS, Pedro Marçal et al. Gene regulatory networks analysis for the discovery of prognostic genes in gliomas. Scientific Reports, v. 15, p. 1-15 art. 14034, 2025Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-025-98542-7. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Barcelos, P. M., Filgueiras, I. S., Nóbile, A. L., Usuda, J. N., Adri, A. S., Alburquerque, D. G. de, et al. (2025). Gene regulatory networks analysis for the discovery of prognostic genes in gliomas. Scientific Reports, 15, 1-15 art. 14034. doi:10.1038/s41598-025-98542-7
NLM
Barcelos PM, Filgueiras IS, Nóbile AL, Usuda JN, Adri AS, Alburquerque DG de, Corrêa YLG, Vale FYN do, Bahia IAF, Nava RG, Boroni M, Marques AHC, Dalmolin R, Schimke LF, Miranda GC de, Nakaya HTI, Dias HD, Fonseca DLM da, Marques OC. Gene regulatory networks analysis for the discovery of prognostic genes in gliomas [Internet]. Scientific Reports. 2025 ; 15 1-15 art. 14034.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-025-98542-7
Vancouver
Barcelos PM, Filgueiras IS, Nóbile AL, Usuda JN, Adri AS, Alburquerque DG de, Corrêa YLG, Vale FYN do, Bahia IAF, Nava RG, Boroni M, Marques AHC, Dalmolin R, Schimke LF, Miranda GC de, Nakaya HTI, Dias HD, Fonseca DLM da, Marques OC. Gene regulatory networks analysis for the discovery of prognostic genes in gliomas [Internet]. Scientific Reports. 2025 ; 15 1-15 art. 14034.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-025-98542-7
Artigo de periodico
Evolution and spread of Xanthomonas citri subsp. citri in the São Paulo, Brazil, citrus belt inferred from 758 novel genomes (2025)
Zamunér, Caio Felipe Cavicchia ; Huaman, Dennis Carhuaricra; Ragupathy, Roobinidevi; Redfern, James; Cueva, Carmen Lizeth Rodríguez ; Behlau, Franklin ; Enright, Mark C; Ferreira, Henrique; Setubal, João Carlos
Source: Microbial Genomics. Unidades: IQ, Interunidades em Bioinformática
Subjects: XANTHOMONAS, GENOMAS, CANCRO (DOENÇA DE PLANTA), CINTURÕES VERDES, ESTADO (UNIDADE DA FEDERAÇÃO)
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ABNT
ZAMUNÉR, Caio Felipe Cavicchia et al. Evolution and spread of Xanthomonas citri subsp. citri in the São Paulo, Brazil, citrus belt inferred from 758 novel genomes. Microbial Genomics, v. 11, p. 1-14 art. 001338, 2025Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1099/mgen.0.001338. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Zamunér, C. F. C., Huaman, D. C., Ragupathy, R., Redfern, J., Cueva, C. L. R., Behlau, F., et al. (2025). Evolution and spread of Xanthomonas citri subsp. citri in the São Paulo, Brazil, citrus belt inferred from 758 novel genomes. Microbial Genomics, 11, 1-14 art. 001338. doi:10.1099/mgen.0.001338
NLM
Zamunér CFC, Huaman DC, Ragupathy R, Redfern J, Cueva CLR, Behlau F, Enright MC, Ferreira H, Setubal JC. Evolution and spread of Xanthomonas citri subsp. citri in the São Paulo, Brazil, citrus belt inferred from 758 novel genomes [Internet]. Microbial Genomics. 2025 ; 11 1-14 art. 001338.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1099/mgen.0.001338
Vancouver
Zamunér CFC, Huaman DC, Ragupathy R, Redfern J, Cueva CLR, Behlau F, Enright MC, Ferreira H, Setubal JC. Evolution and spread of Xanthomonas citri subsp. citri in the São Paulo, Brazil, citrus belt inferred from 758 novel genomes [Internet]. Microbial Genomics. 2025 ; 11 1-14 art. 001338.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1099/mgen.0.001338
Artigo de periodico
Phylogenetics, biogeography, and life history evolution in the broadly distributed treefrog genus Dendropsophus (Anura: Hylidae: Hylinae) (2025)
Whitcher, Courtney; Nakamura, Daniel Yudi Miyahara ; Rada, Marco A ; Grant, Taran
Source: Molecular Phylogenetics and Evolution. Unidades: IB, Interunidades em Bioinformática
Subjects: FILOGENIA, ANURA, HYLIDAE, BIOGEOGRAFIA
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ABNT
WHITCHER, Courtney et al. Phylogenetics, biogeography, and life history evolution in the broadly distributed treefrog genus Dendropsophus (Anura: Hylidae: Hylinae). Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 204, 2025Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.ympev.2024.108275. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Whitcher, C., Nakamura, D. Y. M., Rada, M. A., & Grant, T. (2025). Phylogenetics, biogeography, and life history evolution in the broadly distributed treefrog genus Dendropsophus (Anura: Hylidae: Hylinae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 204. doi:10.1016/j.ympev.2024.108275
NLM
Whitcher C, Nakamura DYM, Rada MA, Grant T. Phylogenetics, biogeography, and life history evolution in the broadly distributed treefrog genus Dendropsophus (Anura: Hylidae: Hylinae) [Internet]. Molecular Phylogenetics and Evolution. 2025 ; 204[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.ympev.2024.108275
Vancouver
Whitcher C, Nakamura DYM, Rada MA, Grant T. Phylogenetics, biogeography, and life history evolution in the broadly distributed treefrog genus Dendropsophus (Anura: Hylidae: Hylinae) [Internet]. Molecular Phylogenetics and Evolution. 2025 ; 204[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.ympev.2024.108275
Tese (Doutorado)
Predição de fenótipos bacterianos a partir de genomas por meio de aprendizado de máquina (2025)
Iha, Bruno Koshin Vásquez ; Setubal, João Carlos
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Subjects: FENÓTIPOS, GENÔMICA, APRENDIZADO COMPUTACIONAL, GENÉTICA BACTERIANA
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ABNT
IHA, Bruno Koshin Vásquez e SETUBAL, João Carlos. Predição de fenótipos bacterianos a partir de genomas por meio de aprendizado de máquina. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-30042025-170213/. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Iha, B. K. V., & Setubal, J. C. (2025). Predição de fenótipos bacterianos a partir de genomas por meio de aprendizado de máquina (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-30042025-170213/
NLM
Iha BKV, Setubal JC. Predição de fenótipos bacterianos a partir de genomas por meio de aprendizado de máquina [Internet]. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-30042025-170213/
Vancouver
Iha BKV, Setubal JC. Predição de fenótipos bacterianos a partir de genomas por meio de aprendizado de máquina [Internet]. 2025 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-30042025-170213/
Dissertação (Mestrado)
3D nuclear architecture distinguishes thyroid neoplastic histotypes (2024)
Pozzo, Aline Rangel; Galante, Pedro Alexandre Favoretto (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Subjects: SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, MARCADOR MOLECULAR, NEOPLASIAS DA TIREOIDE
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ABNT
POZZO, Aline Rangel. 3D nuclear architecture distinguishes thyroid neoplastic histotypes. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28052024-203350/. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Pozzo, A. R. (2024). 3D nuclear architecture distinguishes thyroid neoplastic histotypes (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28052024-203350/
NLM
Pozzo AR. 3D nuclear architecture distinguishes thyroid neoplastic histotypes [Internet]. 2024 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28052024-203350/
Vancouver
Pozzo AR. 3D nuclear architecture distinguishes thyroid neoplastic histotypes [Internet]. 2024 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-28052024-203350/
Artigo de periodico
Phenotypical characterization of exteroceptive sensation and pain symptoms on diabetic patients (2024)
Oliveira, Inaeh de Paula ; Oliveira, Victoria Regina da Silva ; Matielo, Heloísa Alonso ; Eng, Beatriz Magalhães ; Andrade, Daniel Ciampi de ; Teixeira, Manoel Jacobsen ; Calsaverini, Milena Cristina Dias; Ribeiro, Fernando de Quadros ; Araújo, José Deney Alves de ; Nakaya, Helder Takashi Imoto ; Otoch, José Pinhata ; Dale, Camila Squarzoni
Source: Pain Practice. Unidades: FM, HU, FCF, ICB, Interunidades em Bioinformática
Subjects: DOR CRÔNICA, NEUROPATIAS DIABÉTICAS, FIBRAS NERVOSAS, DOENÇAS DO SISTEMA NERVOSO PERIFÉRICO, DOR, ESTUDOS LONGITUDINAIS
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ABNT
OLIVEIRA, Inaeh de Paula et al. Phenotypical characterization of exteroceptive sensation and pain symptoms on diabetic patients. Pain Practice, v. 24, n. 5, p. 724-738, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1111/papr.13353. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Oliveira, I. de P., Oliveira, V. R. da S., Matielo, H. A., Eng, B. M., Andrade, D. C. de, Teixeira, M. J., et al. (2024). Phenotypical characterization of exteroceptive sensation and pain symptoms on diabetic patients. Pain Practice, 24( 5), 724-738. doi:10.1111/papr.13353
NLM
Oliveira I de P, Oliveira VR da S, Matielo HA, Eng BM, Andrade DC de, Teixeira MJ, Calsaverini MCD, Ribeiro F de Q, Araújo JDA de, Nakaya HTI, Otoch JP, Dale CS. Phenotypical characterization of exteroceptive sensation and pain symptoms on diabetic patients [Internet]. Pain Practice. 2024 ; 24( 5): 724-738.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1111/papr.13353
Vancouver
Oliveira I de P, Oliveira VR da S, Matielo HA, Eng BM, Andrade DC de, Teixeira MJ, Calsaverini MCD, Ribeiro F de Q, Araújo JDA de, Nakaya HTI, Otoch JP, Dale CS. Phenotypical characterization of exteroceptive sensation and pain symptoms on diabetic patients [Internet]. Pain Practice. 2024 ; 24( 5): 724-738.[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://doi.org/10.1111/papr.13353
Artigo de periodico
Phages ZC01 and ZC03 require type-IV pilus for Pseudomonas aeruginosa infection and have a potential for therapeutic applications (2024)
Martins, Layla Farage ; Santos Junior, Ariosvaldo Pereira dos ; Nicastro, Gianlucca Gonçalves ; Scheunemann, Gaby Soares ; Angeli, Claudia Blanes ; Rossi, Fernando Pacheco Nobre ; Quaggio, Ronaldo Bento ; Palmisano, Giuseppe ; Sgro, Germán Gustavo ; Ishida, Kelly ; Baldini, Regina Lúcia ; Da Silva, Aline Maria
Source: Microbiology Spectrum. Unidades: IQ, ICB, FCFRP, Interunidades em Bioinformática
Subjects: PSEUDOMONAS, BACTERIÓFAGOS, GENÉTICA BACTERIANA, INFECÇÕES BACTERIANAS GRAM-NEGATIVAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
MARTINS, Layla Farage et al. Phages ZC01 and ZC03 require type-IV pilus for Pseudomonas aeruginosa infection and have a potential for therapeutic applications. Microbiology Spectrum, 2024Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1128/spectrum.01527-24. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Martins, L. F., Santos Junior, A. P. dos, Nicastro, G. G., Scheunemann, G. S., Angeli, C. B., Rossi, F. P. N., et al. (2024). Phages ZC01 and ZC03 require type-IV pilus for Pseudomonas aeruginosa infection and have a potential for therapeutic applications. Microbiology Spectrum. doi:10.1128/spectrum.01527-24
NLM
Martins LF, Santos Junior AP dos, Nicastro GG, Scheunemann GS, Angeli CB, Rossi FPN, Quaggio RB, Palmisano G, Sgro GG, Ishida K, Baldini RL, Da Silva AM. Phages ZC01 and ZC03 require type-IV pilus for Pseudomonas aeruginosa infection and have a potential for therapeutic applications [Internet]. Microbiology Spectrum. 2024 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1128/spectrum.01527-24
Vancouver
Martins LF, Santos Junior AP dos, Nicastro GG, Scheunemann GS, Angeli CB, Rossi FPN, Quaggio RB, Palmisano G, Sgro GG, Ishida K, Baldini RL, Da Silva AM. Phages ZC01 and ZC03 require type-IV pilus for Pseudomonas aeruginosa infection and have a potential for therapeutic applications [Internet]. Microbiology Spectrum. 2024 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1128/spectrum.01527-24
Dissertação (Mestrado)
Statistical Methods for Directed Graphs Based on the Graph Spectrum (2024)
Villela, Victor Chavauty; Fujita, André (Orientador)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Subjects: BIOINFORMÁTICA, REDES COMPLEXAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
VILLELA, Victor Chavauty. Statistical Methods for Directed Graphs Based on the Graph Spectrum. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. . Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Villela, V. C. (2024). Statistical Methods for Directed Graphs Based on the Graph Spectrum (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo.
NLM
Villela VC. Statistical Methods for Directed Graphs Based on the Graph Spectrum. 2024 ;[citado 2025 jul. 30 ]
Vancouver
Villela VC. Statistical Methods for Directed Graphs Based on the Graph Spectrum. 2024 ;[citado 2025 jul. 30 ]
Parte de monografia/livro
How to obtain and compare metagenome-assembled genomes (2024)
Sanchez, Fabio Beltrame; Guima, Suzana Eiko Sato ; Setubal, João Carlos
Source: Comparative genomics: methods and protocols. Unidades: IQ, Interunidades em Bioinformática
Assunto: GENOMAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SANCHEZ, Fabio Beltrame e GUIMA, Suzana Eiko Sato e SETUBAL, João Carlos. How to obtain and compare metagenome-assembled genomes. Comparative genomics: methods and protocols. Tradução . New York: Humana Press, 2024. . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Sanchez, F. B., Guima, S. E. S., & Setubal, J. C. (2024). How to obtain and compare metagenome-assembled genomes. In Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press. doi:10.1007/978-1-0716-3838-5
NLM
Sanchez FB, Guima SES, Setubal JC. How to obtain and compare metagenome-assembled genomes [Internet]. In: Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press; 2024. [citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
Vancouver
Sanchez FB, Guima SES, Setubal JC. How to obtain and compare metagenome-assembled genomes [Internet]. In: Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press; 2024. [citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
Tese (Doutorado)
Distribution, Dynamics, and Diversity of the Antiphage Immune Systems in Prokaryotic Genomes and Metagenomes (2024)
Campos, Guillermo Uceda ; Da Silva, Allyson dos Santos (Orientador) ; Setubal, João Carlos (coorient)
Unidade: Interunidades em Bioinformática
Subjects: BIOINFORMÁTICA, GENÔMICA, FILOGENIA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
CAMPOS, Guillermo Uceda. Distribution, Dynamics, and Diversity of the Antiphage Immune Systems in Prokaryotic Genomes and Metagenomes . 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10022025-103219/. Acesso em: 30 jul. 2025.
APA
Campos, G. U. (2024). Distribution, Dynamics, and Diversity of the Antiphage Immune Systems in Prokaryotic Genomes and Metagenomes (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10022025-103219/
NLM
Campos GU. Distribution, Dynamics, and Diversity of the Antiphage Immune Systems in Prokaryotic Genomes and Metagenomes [Internet]. 2024 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10022025-103219/
Vancouver
Campos GU. Distribution, Dynamics, and Diversity of the Antiphage Immune Systems in Prokaryotic Genomes and Metagenomes [Internet]. 2024 ;[citado 2025 jul. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-10022025-103219/

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