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ABNT
SANCHEZ, Fabio Beltrame e GUIMA, Suzana Eiko Sato e SETUBAL, João Carlos. How to obtain and compare metagenome-assembled genomes. Comparative genomics: methods and protocols. Tradução . New York: Humana Press, 2024. . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5. Acesso em: 10 nov. 2024.
APA
Sanchez, F. B., Guima, S. E. S., & Setubal, J. C. (2024). How to obtain and compare metagenome-assembled genomes. In Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press. doi:10.1007/978-1-0716-3838-5
NLM
Sanchez FB, Guima SES, Setubal JC. How to obtain and compare metagenome-assembled genomes [Internet]. In: Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press; 2024. [citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
Vancouver
Sanchez FB, Guima SES, Setubal JC. How to obtain and compare metagenome-assembled genomes [Internet]. In: Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press; 2024. [citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
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ABNT
HUAMAN, Dennis Carhuaricra et al. Analysis of twelve genomes of the bacterium Kerstersia gyiorum from brown-throated sloths (Bradypus variegatus), the first from a non-human host. PerrJ, v. 12, p. 1-23 art. e17206, 2024Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.7717/peerj.17206. Acesso em: 10 nov. 2024.
APA
Huaman, D. C., Gonzalez, I. H. L., Ramos, P. L., Da Silva, A. M., & Setubal, J. C. (2024). Analysis of twelve genomes of the bacterium Kerstersia gyiorum from brown-throated sloths (Bradypus variegatus), the first from a non-human host. PerrJ, 12, 1-23 art. e17206. doi:10.7717/peerj.17206
NLM
Huaman DC, Gonzalez IHL, Ramos PL, Da Silva AM, Setubal JC. Analysis of twelve genomes of the bacterium Kerstersia gyiorum from brown-throated sloths (Bradypus variegatus), the first from a non-human host [Internet]. PerrJ. 2024 ; 12 1-23 art. e17206.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.7717/peerj.17206
Vancouver
Huaman DC, Gonzalez IHL, Ramos PL, Da Silva AM, Setubal JC. Analysis of twelve genomes of the bacterium Kerstersia gyiorum from brown-throated sloths (Bradypus variegatus), the first from a non-human host [Internet]. PerrJ. 2024 ; 12 1-23 art. e17206.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.7717/peerj.17206
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NASCIMENTO FILHO, Edson Galdino do et al. Global proteome of the saprophytic strain Leptospira biflexa and comparative analysis with pathogenic strain Leptospira interrogans uncover new pathogenesis mechanisms. Journal of Proteomics, v. 297, p. 1-10, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.jprot.2024.105125. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Nascimento Filho, E. G. do, Vieira, M. L., Dias, M., Mendes, M. A., Sanchez, F. B., Setubal, J. C., et al. (2024). Global proteome of the saprophytic strain Leptospira biflexa and comparative analysis with pathogenic strain Leptospira interrogans uncover new pathogenesis mechanisms. Journal of Proteomics, 297, 1-10. doi:10.1016/j.jprot.2024.105125
NLM
Nascimento Filho EG do, Vieira ML, Dias M, Mendes MA, Sanchez FB, Setubal JC, Heinemann MB, Souza GO de, Pimenta DC, Nascimento ALTO do. Global proteome of the saprophytic strain Leptospira biflexa and comparative analysis with pathogenic strain Leptospira interrogans uncover new pathogenesis mechanisms [Internet]. Journal of Proteomics. 2024 ; 297 1-10.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.jprot.2024.105125
Vancouver
Nascimento Filho EG do, Vieira ML, Dias M, Mendes MA, Sanchez FB, Setubal JC, Heinemann MB, Souza GO de, Pimenta DC, Nascimento ALTO do. Global proteome of the saprophytic strain Leptospira biflexa and comparative analysis with pathogenic strain Leptospira interrogans uncover new pathogenesis mechanisms [Internet]. Journal of Proteomics. 2024 ; 297 1-10.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.jprot.2024.105125
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FLORES, Vinicius S et al. Discovery and description of novel phage genomes from urban microbiomes sampled by the MetaSUB consortium. Scientific Reports, v. 14, p. 1-14 art. 7913, 2024Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-58226-0. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Flores, V. S., Amgarten, D. E., Iha, B. K. V., Ryon, K. A., Danko, D., Tierney, B. T., et al. (2024). Discovery and description of novel phage genomes from urban microbiomes sampled by the MetaSUB consortium. Scientific Reports, 14, 1-14 art. 7913. doi:10.1038/s41598-024-58226-0
NLM
Flores VS, Amgarten DE, Iha BKV, Ryon KA, Danko D, Tierney BT, Mason C, Da Silva AM, Setubal JC. Discovery and description of novel phage genomes from urban microbiomes sampled by the MetaSUB consortium [Internet]. Scientific Reports. 2024 ; 14 1-14 art. 7913.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-58226-0
Vancouver
Flores VS, Amgarten DE, Iha BKV, Ryon KA, Danko D, Tierney BT, Mason C, Da Silva AM, Setubal JC. Discovery and description of novel phage genomes from urban microbiomes sampled by the MetaSUB consortium [Internet]. Scientific Reports. 2024 ; 14 1-14 art. 7913.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-58226-0
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ROSSI, Fernando Pacheco Nobre et al. Comparative analyses of bacteriophage genomes. Comparative genomics: methods and protocols. Tradução . New York: Humana Press, 2024. . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Rossi, F. P. N., Flores, V. S., Campos, G. U., Amgarten, D. E., Setubal, J. C., & Da Silva, A. M. (2024). Comparative analyses of bacteriophage genomes. In Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press. doi:10.1007/978-1-0716-3838-5
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Vancouver
Rossi FPN, Flores VS, Campos GU, Amgarten DE, Setubal JC, Da Silva AM. Comparative analyses of bacteriophage genomes [Internet]. In: Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press; 2024. [citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
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PATANÉ, José Salvatore Leister e MARTINS JUNIOR, Joaquim e SETUBAL, João Carlos. A guide to phylogenomic inference. Comparative genomics: methods and protocols. Tradução . New York: Humana Press, 2024. . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Patané, J. S. L., Martins Junior, J., & Setubal, J. C. (2024). A guide to phylogenomic inference. In Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press. doi:10.1007/978-1-0716-3838-5
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Vancouver
Patané JSL, Martins Junior J, Setubal JC. A guide to phylogenomic inference [Internet]. In: Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press; 2024. [citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
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SETUBAL, João Carlos e STADLER, Peter F e STOYE, Jens. Comparative genomics: methods and protocols. . New York: Humana Press. Disponível em: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5. Acesso em: 10 nov. 2024. , 2024
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Setubal, J. C., Stadler, P. F., & Stoye, J. (2024). Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press. doi:10.1007/978-1-0716-3838-5
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Setubal JC, Stadler PF, Stoye J. Comparative genomics: methods and protocols [Internet]. 2024 ;[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
Vancouver
Setubal JC, Stadler PF, Stoye J. Comparative genomics: methods and protocols [Internet]. 2024 ;[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
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HUAMAN, Dennis Edgardo Carhuaricra e SETUBAL, João Carlos. Step-by-step bacterial genome comparison. Comparative genomics: methods and protocols. Tradução . New York: Humana Press, 2024. . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Huaman, D. E. C., & Setubal, J. C. (2024). Step-by-step bacterial genome comparison. In Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press. doi:10.1007/978-1-0716-3838-5
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Huaman DEC, Setubal JC. Step-by-step bacterial genome comparison [Internet]. In: Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press; 2024. [citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
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HUAMAN, Dennis Edgardo Carhuaricra e SETUBAL, João Carlos. Protein-coding gene families in prokaryote genome comparisons. Comparative genomics: methods and protocols. Tradução . New York: Humana Press, 2024. . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Huaman, D. E. C., & Setubal, J. C. (2024). Protein-coding gene families in prokaryote genome comparisons. In Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press. doi:10.1007/978-1-0716-3838-5
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Huaman DEC, Setubal JC. Protein-coding gene families in prokaryote genome comparisons [Internet]. In: Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press; 2024. [citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
Vancouver
Huaman DEC, Setubal JC. Protein-coding gene families in prokaryote genome comparisons [Internet]. In: Comparative genomics: methods and protocols. New York: Humana Press; 2024. [citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5
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LAUX, Marcele et al. The Raphidiopsis (= Cylindrospermopsis) raciborskii pangenome updated: Two new metagenome-assembled genomes from the South American clade. Harmful Algae, v. 129, p. 1-11 art. 102518, 2023Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1016/j.hal.2023.102518. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Laux, M., Piroupo, C. M., Setubal, J. C., & Giani, A. (2023). The Raphidiopsis (= Cylindrospermopsis) raciborskii pangenome updated: Two new metagenome-assembled genomes from the South American clade. Harmful Algae, 129, 1-11 art. 102518. doi:10.1016/j.hal.2023.102518
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Laux M, Piroupo CM, Setubal JC, Giani A. The Raphidiopsis (= Cylindrospermopsis) raciborskii pangenome updated: Two new metagenome-assembled genomes from the South American clade [Internet]. Harmful Algae. 2023 ; 129 1-11 art. 102518.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1016/j.hal.2023.102518
Vancouver
Laux M, Piroupo CM, Setubal JC, Giani A. The Raphidiopsis (= Cylindrospermopsis) raciborskii pangenome updated: Two new metagenome-assembled genomes from the South American clade [Internet]. Harmful Algae. 2023 ; 129 1-11 art. 102518.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1016/j.hal.2023.102518
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ATUM, Samir Vargas da Fonseca et al. Sequenciamento de DNA ambiental por reads longas e caracterização do microbioma de caverna em área conservada da Mata Atlântica. 2023, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2023. Disponível em: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/images/livro_completo2023. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Atum, S. V. da F., Soares, D. M. M., Bechara, E. J. H., Setubal, J. C., Stevani, C. V., & Freire, R. S. (2023). Sequenciamento de DNA ambiental por reads longas e caracterização do microbioma de caverna em área conservada da Mata Atlântica. In Livro de Resumos. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Recuperado de https://www2.sbbq.org.br/reuniao/images/livro_completo2023
NLM
Atum SV da F, Soares DMM, Bechara EJH, Setubal JC, Stevani CV, Freire RS. Sequenciamento de DNA ambiental por reads longas e caracterização do microbioma de caverna em área conservada da Mata Atlântica [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/images/livro_completo2023
Vancouver
Atum SV da F, Soares DMM, Bechara EJH, Setubal JC, Stevani CV, Freire RS. Sequenciamento de DNA ambiental por reads longas e caracterização do microbioma de caverna em área conservada da Mata Atlântica [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/images/livro_completo2023
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CARNERO, Luis Antonio Rodriguez et al. Anti-Trypanosoma cruzi antibody profiling in patients with Chagas disease treated with benznidazole assessed by genome phage display. Plos Neglected Tropical Diseases, v. 17, n. 1, p. 1-20 art. e0011019, 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011019. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Carnero, L. A. R., Kuramoto, A., Oliveira, L. C. de, Monteiro, J. S., Setubal, J. C., Cunha Neto, E., et al. (2023). Anti-Trypanosoma cruzi antibody profiling in patients with Chagas disease treated with benznidazole assessed by genome phage display. Plos Neglected Tropical Diseases, 17( 1), 1-20 art. e0011019. doi:10.1371/journal.pntd.0011019
NLM
Carnero LAR, Kuramoto A, Oliveira LC de, Monteiro JS, Setubal JC, Cunha Neto E, Sabino EC, Giordano RJ. Anti-Trypanosoma cruzi antibody profiling in patients with Chagas disease treated with benznidazole assessed by genome phage display [Internet]. Plos Neglected Tropical Diseases. 2023 ; 17( 1): 1-20 art. e0011019.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011019
Vancouver
Carnero LAR, Kuramoto A, Oliveira LC de, Monteiro JS, Setubal JC, Cunha Neto E, Sabino EC, Giordano RJ. Anti-Trypanosoma cruzi antibody profiling in patients with Chagas disease treated with benznidazole assessed by genome phage display [Internet]. Plos Neglected Tropical Diseases. 2023 ; 17( 1): 1-20 art. e0011019.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011019
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ABNT
SINGH, Nitin K et al. Characterization of metagenome-assembled genomes from the International Space Station. Microbiome, v. 11, p. 1-27 art. 125, 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s40168-023-01545-7. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Singh, N. K., Wood, J. M., Patane, J., Moura, L. M. S., Lombardino, J., Setubal, J. C., & Venkateswaran, K. (2023). Characterization of metagenome-assembled genomes from the International Space Station. Microbiome, 11, 1-27 art. 125. doi:10.1186/s40168-023-01545-7
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Singh NK, Wood JM, Patane J, Moura LMS, Lombardino J, Setubal JC, Venkateswaran K. Characterization of metagenome-assembled genomes from the International Space Station [Internet]. Microbiome. 2023 ; 11 1-27 art. 125.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s40168-023-01545-7
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Singh NK, Wood JM, Patane J, Moura LMS, Lombardino J, Setubal JC, Venkateswaran K. Characterization of metagenome-assembled genomes from the International Space Station [Internet]. Microbiome. 2023 ; 11 1-27 art. 125.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s40168-023-01545-7
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BOETTGER, Bruno C et al. Co-carriage of plasmid NDM and chromosomal KPC in Klebsiella pneumoniae ST255 human wound isolate in Brazil. Current Microbiology, v. 80, p. 1-4 art. 394, 2023Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1007/s00284-023-03509-4. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Boettger, B. C., Piroupo, C. M., Setubal, J. C., Girardello, R., & Pignatari, A. C. C. (2023). Co-carriage of plasmid NDM and chromosomal KPC in Klebsiella pneumoniae ST255 human wound isolate in Brazil. Current Microbiology, 80, 1-4 art. 394. doi:10.1007/s00284-023-03509-4
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Boettger BC, Piroupo CM, Setubal JC, Girardello R, Pignatari ACC. Co-carriage of plasmid NDM and chromosomal KPC in Klebsiella pneumoniae ST255 human wound isolate in Brazil [Internet]. Current Microbiology. 2023 ; 80 1-4 art. 394.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/s00284-023-03509-4
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Boettger BC, Piroupo CM, Setubal JC, Girardello R, Pignatari ACC. Co-carriage of plasmid NDM and chromosomal KPC in Klebsiella pneumoniae ST255 human wound isolate in Brazil [Internet]. Current Microbiology. 2023 ; 80 1-4 art. 394.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1007/s00284-023-03509-4
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INAGUE, Alex et al. Oxygen-induced pathological angiogenesis promotes intense lipid synthesis and remodeling in the retina. iScience, v. 26, p. 1-22 art. 106777, 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.106777. Acesso em: 10 nov. 2024.
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Inague, A., Alecrim, L. C., Monteiro, J. S., Yoshinaga, M. Y., Setubal, J. C., Miyamoto, S., & Giordano, R. J. (2023). Oxygen-induced pathological angiogenesis promotes intense lipid synthesis and remodeling in the retina. iScience, 26, 1-22 art. 106777. doi:10.1016/j.isci.2023.106777
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Inague A, Alecrim LC, Monteiro JS, Yoshinaga MY, Setubal JC, Miyamoto S, Giordano RJ. Oxygen-induced pathological angiogenesis promotes intense lipid synthesis and remodeling in the retina [Internet]. iScience. 2023 ; 26 1-22 art. 106777.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.106777
Vancouver
Inague A, Alecrim LC, Monteiro JS, Yoshinaga MY, Setubal JC, Miyamoto S, Giordano RJ. Oxygen-induced pathological angiogenesis promotes intense lipid synthesis and remodeling in the retina [Internet]. iScience. 2023 ; 26 1-22 art. 106777.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.106777
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PATANÉ, José S. L et al. New insights into plant natriuretic peptide evolution: from the lysogenic conversion in Xanthomonas to the lateral transfer to the whitefly Bemisia tabaci. Gene, v. 821, p. 1-10 art. 146326, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146326. Acesso em: 10 nov. 2024.
APA
Patané, J. S. L., Moreira, L. M., Teixeira, M. de M., Martins Junior, J., Varani, A. de M., & Setubal, J. C. (2022). New insights into plant natriuretic peptide evolution: from the lysogenic conversion in Xanthomonas to the lateral transfer to the whitefly Bemisia tabaci. Gene, 821, 1-10 art. 146326. doi:10.1016/j.gene.2022.146326
NLM
Patané JSL, Moreira LM, Teixeira M de M, Martins Junior J, Varani A de M, Setubal JC. New insights into plant natriuretic peptide evolution: from the lysogenic conversion in Xanthomonas to the lateral transfer to the whitefly Bemisia tabaci [Internet]. Gene. 2022 ; 821 1-10 art. 146326.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146326
Vancouver
Patané JSL, Moreira LM, Teixeira M de M, Martins Junior J, Varani A de M, Setubal JC. New insights into plant natriuretic peptide evolution: from the lysogenic conversion in Xanthomonas to the lateral transfer to the whitefly Bemisia tabaci [Internet]. Gene. 2022 ; 821 1-10 art. 146326.[citado 2024 nov. 10 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146326