Panorama geral do mobiloma e satelitoma na família Trypanosomatidae (2025)
- Authors:
- Autor USP: VERGARA, PERCY OMAR TÚLLUME - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMP
- DOI: 10.11606/T.42.2025.tde-07112025-180305
- Subjects: PARASITOLOGIA; GENÔMICA; LEISHMANIA; GENOMAS; TRYPANOSOMATIDAE; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
- Keywords: DNA satélite; elemento de transposição; Genômica; Genomics; Leishmaniinae; Leishmaniinae; satellite DNA; transposable element; Trypanosomatidae; Trypanosomatidae
- Language: Português
- Abstract: A genômica, aliada às emergentes tecnologias de sequenciamento de terceira geração, tem impactado significativamente o estudo da biologia genômica da Família Trypanosomatidae. Embora um grande número de estudos esteja voltado para a análise da fração codificante do genoma, lacunas importantes ainda persistem nos estudos genômicos desses organismos. Atualmente, o conhecimento das regiões repetitivas é fundamental para compreender a dinâmica evolutiva dos genomas. Neste estudo, realizamos uma caracterização detalhada dos elementos de transposição correspondentes a regiões intercaladas, e das famílias satélites que são regiões em tandem, em um amplo grupo de espécies de tripanosomatídeos. Inicialmente, apresentamos o anúncio do genoma completo de duas espécies de Leishmania do subclado Viannia, endêmica do Brasil. Ambos os genomas foram montados em 35 cromossomos, com tamanhos de 33.36 Mb e 35.77 Mb para L. (V.) guyanensis e L. (V.) shawi, respectivamente. Por outro lado, pioneiros estudos caracterizaram ETs em tripanosomatídeos com foco em espécies modelo, como T. brucei, T. cruzi e L. major, revelando um número reduzido de famílias de ETs canônicas registradas em bases de dados como a Repabse. Neste estudo, identificamos famílias de ETs em espécies não modelos de tripanosomatídeos, expandindo o repertório conhecido por meio da criação de um banco de dados com 214 sequências modelos curadas.A abundância genômica desses elementos variou de 0.11% a 7.15%, e confirmamos a presença de quatro clados que colonizaram o genoma desses parasitas protozoa. Além dos ETs, as sequências de satélites representam regiões não codificantes essenciais que dirigem a evolução do genoma. Neste estudo, avaliamos a ferramenta TAREAN para a identificação de famílias de satélites em um grupo da subfamília Leishmaniinae, utilizando T. brucei e T. cruzi como grupos externos. Como resultado, nós expandimos o número de famílias satélites em tripanosomatídeos, curando 36 sequências consenso. Identificamos sequências satélites conservadas nos clado dos subgêneros Viannia e Leishmania, o que contribui para a compreensão da organização e evolução dessas regiões repetitivas. De forma geral, esta tese fornece insights significativos sobre a complexa arquitetura das regiões genômicas repetitivas em um amplo conjunto de espécies de tripanossomatídeos. Além disso, esses resultados oferecem dados biológicos valiosos que apoiarão as pesquisas em andamento na comunidade de tripanossomatídeos, especialmente no avanço do campo da biologia genômica.
- Imprenta:
- Data da defesa: 17.04.2025
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
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ABNT
VERGARA, Percy Omar Tullume. Panorama geral do mobiloma e satelitoma na família Trypanosomatidae. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-07112025-180305/. Acesso em: 20 jan. 2026. -
APA
Vergara, P. O. T. (2025). Panorama geral do mobiloma e satelitoma na família Trypanosomatidae (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-07112025-180305/ -
NLM
Vergara POT. Panorama geral do mobiloma e satelitoma na família Trypanosomatidae [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 20 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-07112025-180305/ -
Vancouver
Vergara POT. Panorama geral do mobiloma e satelitoma na família Trypanosomatidae [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 20 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42135/tde-07112025-180305/ - Análise filogenômica e comparativa de Endotrypanum schaudinni TCC224
- The genome of the endosymbiont-harboring trypanosomatid Kentomonas sorsogonicus
- Genomes of Endotrypanum monterogeii from Panama and Zelonia costaricensis from Brazil: expansion of multigene families in Leishmaniinae parasites that are close relatives of Leishmania spp.
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.42.2025.tde-07112025-180305 (Fonte: oaDOI API)
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