Multi-omics approaches in long Covid investigation: immunoassay-based diagnosis, lipidomic and metabolomic analysis (2025)
- Authors:
- Autor USP: SILVA, MÔNICA DUARTE DA - FMVZ
- Unidade: FMVZ
- Sigla do Departamento: VCI
- DOI: 10.11606/T.10.2025.tde-12082025-170343
- Subjects: BIOMARCADORES; COVID-19; DIAGNÓSTICO
- Keywords: Biomarkers; Long COVID; Nucleocapsid; Paper spray; Persistent symptoms
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: A Long COVID é uma condição multifatorial e de longa duração que afeta uma proporção significativa de indivíduos após a infecção por SARS-CoV-2, apresentando sintomas persistentes como fadiga, disfunção cognitiva e alterações cardiovasculares. Estima-se que 30% a 60% dos infectados desenvolvam sintomas por mais de 12 semanas. Apesar dos avanços na compreensão da infecção aguda, os mecanismos fisiopatológicos da Long COVID ainda são pouco compreendidos, com hipóteses envolvendo persistência viral, disfunção imune e alterações metabólicas. Para investigar essas alterações, esta tese empregou tecnologias ômicas, com foco em abordagens metabolômicas e lipidômicas por espectrometria de massas. Desenvolvemos um imunoensaio em papel para detecção sensível da proteína N do SARS-CoV-2, utilizando uma estratégia inovadora de amplificação com dendrímeros e sonda iônica clivável, acoplada à espectrometria de massas. Este método atingiu um limite de detecção de 2,4 pM e demonstrou estabilidade após 30 dias à temperatura ambiente, sendo promissor para aplicações point-of-care (POC) e direto ao consumidor (DTC). Além disso, realizamos uma análise lipidômica direcionada por MRM em amostras plasmáticas de pacientes com Long COVID, revelando alterações significativas nos níveis de LPC, PC, CE e ácidos graxos, com destaque para disfunções mitocondriais e no metabolismo de glicerofosfolipídios e esfingolipídios. Algumas espécies lipídicas apresentaram alto poder discriminatório (AUC>0,89),indicando potencial como biomarcadores da condição. Por fim, exploramos a aplicação inédita da técnica de espectrometria de massas por spray de papel com orifício (pinhole paper spray) em substratos de papel hidrofóbico em relevo, permitindo a análise direta e rápida do plasma humano sem preparo prévio de amostra. A análise metabolômica não direcionada revelou perfis metabólicos distintos entre os grupos, com disfunções lipídicas, mitocondriais e inflamatórias evidentes. Esses resultados reforçam o papel das abordagens em papel acopladas à espectrometria de massas como ferramentas promissoras para a triagem clínica, descoberta de biomarcadores e compreensão dos mecanismos moleculares da Long COVID, com potencial de impacto em estratégias diagnósticas e terapêuticas personalizadas
- Imprenta:
- Data da defesa: 28.04.2025
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão publicada (Published version)
- Acessar versão aberta:
-
ABNT
SILVA, Mônica Duarte da. Multi-omics approaches in long Covid investigation: immunoassay-based diagnosis, lipidomic and metabolomic analysis. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10132/tde-12082025-170343/. Acesso em: 20 mar. 2026. -
APA
Silva, M. D. da. (2025). Multi-omics approaches in long Covid investigation: immunoassay-based diagnosis, lipidomic and metabolomic analysis (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10132/tde-12082025-170343/ -
NLM
Silva MD da. Multi-omics approaches in long Covid investigation: immunoassay-based diagnosis, lipidomic and metabolomic analysis [Internet]. 2025 ;[citado 2026 mar. 20 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10132/tde-12082025-170343/ -
Vancouver
Silva MD da. Multi-omics approaches in long Covid investigation: immunoassay-based diagnosis, lipidomic and metabolomic analysis [Internet]. 2025 ;[citado 2026 mar. 20 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10132/tde-12082025-170343/ - Elaboração de uma Ferramenta Interativa Destinada ao Estudo do Sistema Nervoso Central em Ovinos
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