Transcriptômica da via de biossíntese dos monolignóis ao longo do desenvolvimento dos entrenós de cana-de-açúcar (<i>Saccharum spp.</i>) (2019)
- Authors:
- Autor USP: SILVA, IAQUINE SANTOS DA - EEL
- Unidade: EEL
- Sigla do Departamento: DEBIQ
- DOI: 10.11606/D.97.2019.tde-12072019-123830
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; LIGNINA
- Keywords: cana-de-açucar; lignin; lignina; monolignol; monolignol; Sugarcane
- Language: Português
- Abstract: As gramíneas são o mais importante grupo de plantas para em todo o mundo. Inúmeras são usadas para a alimentação dos animais, além de serem utilizadas para a produção de biocombustíveis, contribuindo para a redução do consumo de combustíveis fósseis e consequentemente da poluição ambiental. A biomassa vegetal é constituída basicamente por celulose, hemicelulose e lignina. Estudos na área de bioquímica e genética tem demonstrado a lignina como um dos principais compostos responsáveis pela recalcitrância da biomassa, sendo a resistência à digestão enzimática uma importante limitação do processo de produção de bioetanol. A lignina é um polímero vegetal resultantes da polimerização desidrogenativa de três monômeros de fenilpropanóides primários, os álcoois p-coumarilico (H), coniferilico (G) e sinapilico (S). A via metabólica dos fenilpropanóides envolve a participação de 11 enzimas, nas gramíneas, tais como PAL, C4H, 4CL, C3H, F5H, CCoAOMT, CSE, COMT, HCT, CCR e CAD. Até o momento, 28 genes de cana-de-açúcar foram identificados no SUCEST e explorados para identificar os possíveis bona fide. No entanto, com a disponibilização de bancos transcriptômicos (RNASeq) e ferramentas avançadas de bioinformática, o nosso grupo de pesquisa expandiu para 37 genes após o processo de identificação, anotação e classificação pelas análises filogenéticas. Diante disso, a presente proposta teve por objetivo realizar a análise de expressão destes transcritos anotados em uma variedade decana-de-açúcar com a composição química da parede celular caracterizada. Para identificar quais genes estão envolvidos nesta via, o presente trabalho propôs correlacionar o perfil de expressão com os quatro estágios de desenvolvimento do entrenó, separando córtex e medula, os quais estão associados aos estágios de lignificação em maior e menor grau, respectivamente. Dentre as análises realizadas, 34 transcritos tiveram os primers padronizados , 26 foram expressos no colmo nas condições testadas, sendo 7 genes adicionais aos previamente descritos na literatura. Baseado nas análises de expressão gênica, PAL1.1/1.2, COMT1, CAD2/5/8, 4CL2, F5H1, CCoAMOT1.2/2.1 e CCR1 foram apontados como possíveis candidatos principais na via de biossíntese da lignina
- Imprenta:
- Data da defesa: 01.04.2019
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
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ABNT
SILVA, Iaquine Santos da. Transcriptômica da via de biossíntese dos monolignóis ao longo do desenvolvimento dos entrenós de cana-de-açúcar (<i>Saccharum spp.</i>). 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Lorena, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/97/97132/tde-12072019-123830/. Acesso em: 29 jan. 2026. -
APA
Silva, I. S. da. (2019). Transcriptômica da via de biossíntese dos monolignóis ao longo do desenvolvimento dos entrenós de cana-de-açúcar (<i>Saccharum spp.</i>) (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Lorena. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/97/97132/tde-12072019-123830/ -
NLM
Silva IS da. Transcriptômica da via de biossíntese dos monolignóis ao longo do desenvolvimento dos entrenós de cana-de-açúcar (<i>Saccharum spp.</i>) [Internet]. 2019 ;[citado 2026 jan. 29 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/97/97132/tde-12072019-123830/ -
Vancouver
Silva IS da. Transcriptômica da via de biossíntese dos monolignóis ao longo do desenvolvimento dos entrenós de cana-de-açúcar (<i>Saccharum spp.</i>) [Internet]. 2019 ;[citado 2026 jan. 29 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/97/97132/tde-12072019-123830/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.97.2019.tde-12072019-123830 (Fonte: oaDOI API)
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