Modelagem estatística e desenvolvimento de ferramentas computacionais aplicados à produção in vitro de embriões bovinos e hormesis em plantas (2023)
- Authors:
- Autor USP: AMORIM, DEOCLECIO JARDIM - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LCE
- DOI: 10.11606/T.11.2023.tde-10072023-095931
- Subjects: BOVINOS; EMBRIÃO DE ANIMAL; MODELAGEM DE DADOS; MODELOS LINEARES GENERALIZADOS; MODELOS NÃO LINEARES; PLANTAS CULTIVADAS; R (SOFTWARE ESTATÍSTICO)
- Keywords: Hormesis; Superdispersão
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Dados provenientes de estudos em ciências agrárias podem apresentar características diferentes, com destaque para estudos de produção in vitro apresentam distribuição normal e são medidos em contextos longitudinais ou hierárquicos. Exemplos comuns incluem dados na forma de contagens, proporções e binários. Por outro lado, na maioria dos estudos de hormesis, os dados são correlacionados, presentes em características morfológicas, fisiológicas e bioquímicas. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho é desenvolver modelos e ferramentas computacionais que auxiliem na análise desses tipos de dados, tornando-a mais acessível a pesquisadores de áreas aplicadas. Em relação aos dados da PIVE, inicialmente, abordaram-se os aspectos relacionados a superdispersão e correlação em dados longitudinais, testes de hipóteses sobre os componentes de variância e seleção de modelos com foco em dados na forma de contagens e na proposição de um tutorial utilizando o software R. Os modelos lineares generalizados mistos (MLGMs) e os modelos combinados (MC) ajustaram-se satisfatoriamente, captando a variabilidade extra e a correlação entre as medidas longitudinais. O MC tem como característica o uso de dois conjuntos de efeitos aleatórios para capturar a superdispersão e a correlação, sendo mais flexíveis que os tradicionais MLGMs. Apesar da flexibilidade de modelagem oferecida, os MCs ainda não possuem uma ferramenta computacional padronizada no software de código-aberto R. Em função disso, foidesenvolvido o pacote combTMB para o software R. As funcionalidades do pacote são ilustradas com duas aplicações em dados na forma de contagens e de proporções. Finalmente, foi proposta uma modelagem não linear multivariada para estudar hormesis em plantas, sendo que as informações concernentes às correlações das variáveis respostas são consideradas com uma matriz de variâncias e covariâncias obtida, a partir dos resíduos univariados. Uma vantagem dessa estratégia de modelagem é a obtenção de estimativas mais precisas dos parâmetros e uma maior compreensão das relações bifásicas de dose-resposta, pois considera na estrutura de modelagem as inter-relações existentes entre as diversas características mensuradas no sistema vegetal
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2023
- Data da defesa: 06.06.2023
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão publicada (Published version)
- Acessar versão aberta:
-
ABNT
AMORIM, Deoclecio Jardim. Modelagem estatística e desenvolvimento de ferramentas computacionais aplicados à produção in vitro de embriões bovinos e hormesis em plantas. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2023. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-10072023-095931/. Acesso em: 30 mar. 2026. -
APA
Amorim, D. J. (2023). Modelagem estatística e desenvolvimento de ferramentas computacionais aplicados à produção in vitro de embriões bovinos e hormesis em plantas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-10072023-095931/ -
NLM
Amorim DJ. Modelagem estatística e desenvolvimento de ferramentas computacionais aplicados à produção in vitro de embriões bovinos e hormesis em plantas [Internet]. 2023 ;[citado 2026 mar. 30 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-10072023-095931/ -
Vancouver
Amorim DJ. Modelagem estatística e desenvolvimento de ferramentas computacionais aplicados à produção in vitro de embriões bovinos e hormesis em plantas [Internet]. 2023 ;[citado 2026 mar. 30 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-10072023-095931/ - Glyphosate hormesis mitigates the effect of water deficit in safflower ( Carthamus tinctorius L.)
- The use of the generalized linear model to assess the speed and uniformity of germination of corn and soybean seeds
- Bacillus, Pseudomonas and Serratia control Meloidogyne incognita (Rhabditida: Meloidogynidae) and promote the growth of tomato plants
- Glyphosate hormesis attenuates water deficit stress in safflower (Carthamus tinctorius L.) by modulating physiological and biochemical mediators
- Correlation analysis between physical–chemical and biological conditions in the river and the incidence of diseases in the city of Piracicaba, Brazil
- Modeling hormesis using multivariate nonlinear regression in plant biology: a comprehensive approach to understanding dose-response relationships
- Potential of thaxtomin A for the control of the Asian soybean rust
- Biology and quality assessment of Telenomus remus (Hymenoptera: Scelionidae) and Trichogramma spp. (Hymenoptera: Trichogrammatidae) in eggs of Spodoptera spp. for augmentative biological control programs
- Predicting soil 𝛿13C patterns in Brazil using nested datasets, feature selection, and machine learning
- Biological basis for adoption of an isoline of Telenomus remus (Hymenoptera: Scelionidae) for an augmentative biological-control program for Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae)
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