Determinação da estrutura e do estado oligomérico de proteínas chaperonas por espalhamento de raios-x a baixos ângulos (SAXS) (2020)
- Authors:
- Autor USP: RODRIGUES, LUIZ FERNANDO DE CAMARGO - IF
- Unidade: IF
- Sigla do Departamento: FGE
- DOI: 10.11606/D.43.2020.tde-24032020-120700
- Subjects: BIOFÍSICA; ESPALHAMENTO DE RAIOS X A BAIXOS ÂNGULOS; PROTEÍNAS; BIOQUÍMICA
- Keywords: CHAPERONAS MOLECULARES; ENOVELAMENTO DE PROTEÍNAS; HSP70; HSP90; BIOFISICA MOLECULAR; MOLECULAR CHAPERONES; PROTEIN FOLDING
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Espalhamento de raios-X a baixos ângulos (SAXS) é uma técnica estrutural em estudo de materiais a baixa resolução com um amplo leque de aplicações. Nas últimas décadas, houve progresso em métodos de análise de dados de SAXS que aumentaram a utilização dessa ferramenta, especialmente em biologia estrutural para o estudo de proteínas. As chaperonas moleculares constituem um conjunto diversificado de proteínas que tem como função biológica a prevenção e correção de problemas de enovelamento proteico e agregação, responsáveis por diversas patologias. Neste trabalho, foram aplicadas metodologias de análise de SAXS para o estudo de proteínas chaperonas das famílias 70-kDa e 90-kDa heat shock proteins (Hsp70 e Hsp90). Foram comparados membros de Hsp70 humana de diferentes compartimentos celulares e mostrou-se que não há variação apreciável observada por SAXS entre essas proteínas. Estas se encontram em conformação levemente elongada com baixa flexibilidade e em estado monomérico em solução. A Hsp70 de retículo endoplasmático (Binding immunoglobulin protein, Bip) foi utilizada para modelagens ab initio, de ensemble e de corpo rígido, com obtenção da orientação entre os domínios e do envelope da proteína a baixa resolução. Foi feito o estudo comparativo de uma Gro-P like Protein E de mitocôndria humana (GrpE-L1) em diferentes solventes: em tampão e em agentes oxidante e redutor. Obteve-se o envelope da proteína e mostrou-se que não há compactação sensível da proteína em agente redutor, indicando que pontes dissulfeto não são fatores únicos para a manutenção da forma altamente elongada observada para a GrpE-L1, encontrada como dímero em solução. Também foi estudada a Hsp90 de Aedes aegypti (AaHsp90) em presença de diferentes nucleotídeos de adenosina.Foi mostrado que a AaHsp90 se encontra como um dímero em solução com conformação bastante elongada e pouca flexibilidade, sem variação conformacional apreciável ao ligar-se a diferentes nucleotídeos. Foi obtida a estrutura da AaHsp90 em solução a partir de modelagens de corpo rígido e ab initio. A baixa plasticidade estrutural observada pode indicar que em Hsp90s de Aedes aegypti há maior dependência de co-chaperonas para que a função da proteína seja desempenhada neste organismo ou que interações com proteínas-cliente modulem sua ação, estando de acordo com estudos anteriores com membros de Hsp90 humana.
- Imprenta:
- Data da defesa: 03.03.2020
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão publicada (Published version)
- Acessar versão aberta:
-
ABNT
RODRIGUES, Luiz Fernando de Camargo. Determinação da estrutura e do estado oligomérico de proteínas chaperonas por espalhamento de raios-x a baixos ângulos (SAXS). 2020. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2020. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-24032020-120700/. Acesso em: 01 abr. 2026. -
APA
Rodrigues, L. F. de C. (2020). Determinação da estrutura e do estado oligomérico de proteínas chaperonas por espalhamento de raios-x a baixos ângulos (SAXS) (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-24032020-120700/ -
NLM
Rodrigues LF de C. Determinação da estrutura e do estado oligomérico de proteínas chaperonas por espalhamento de raios-x a baixos ângulos (SAXS) [Internet]. 2020 ;[citado 2026 abr. 01 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-24032020-120700/ -
Vancouver
Rodrigues LF de C. Determinação da estrutura e do estado oligomérico de proteínas chaperonas por espalhamento de raios-x a baixos ângulos (SAXS) [Internet]. 2020 ;[citado 2026 abr. 01 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-24032020-120700/ - Espalhamento de raios-X a baixos ângulos no contexto da biologia estrutural: aplicação ao estudo de protenas chaperonas
- Small Angle X-Ray Scattering (SAXS) As Tool For Obtaining Insights And Structural Models Of Molecular Chaperones: Recent Results And Perspectives
- Heat shock protein 90 kDa (Hsp90) from Aedes aegypti has an open conformation and is expressed under heat stress
- Insights into the structure and function of the C-terminus of SGTs (small glutamine-rich TPR-containing proteins): A study of the Aedes aegypti homolog
- Unveiling the three-step model for the interaction of imidazolium-based ionic liquids on albumin
- Teaching an old dog new tricks: new strategies for saxs data analysis of proteins in solution
- Structural, thermodynamic and functional studies of human 71 kDa heat shock cognate protein (HSPA8/hHsc70)
Informações sobre a disponibilidade de versões do artigo em acesso aberto coletadas automaticamente via oaDOI API (Unpaywall).
Por se tratar de integração com serviço externo, podem existir diferentes versões do trabalho (como preprints ou postprints), que podem diferir da versão publicada.
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
