Caracterização estrutural das septinas de levedura (<i>Saccharomyces cerevisiae</i>) Cdc3, Cdc10, Cdc11 e Cdc12 (2022)
- Authors:
- Autor USP: SILVA, RAFAEL MARQUES DA - IFSC
- Unidade: IFSC
- Sigla do Departamento: FCI
- DOI: 10.11606/D.76.2022.tde-17082022-083225
- Subjects: CRISTALOGRAFIA; LEVEDURAS; PROTEÍNAS
- Keywords: Crystallography; Septinas; Septins; Yeast
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Septinas são proteínas estruturais que normalmente apresentam atividade GTPasica, desempenhando um papel importante na estrutura da célula e servindo como um arcabouço no recrutamento de proteínas parceiras. Estas proteínas são encontradas nos mais diferentes tipos de forma de vida, como protozoários, fungos e animais. Para realizar suas funções, as diferentes septinas formam filamentos que são estabilizados por interações entre as subunidades através de dois tipos de interface, chamadas de G e NC. Em levedura quatro proteínas se arranjam de modo a formar um octâmero linear, cuja ordem das proteínas é Cdc11-Cdc12-Cdc3-Cdc10-Cdc10-Cdc3-Cdc12-Cdc11. Este octâmero por sua vez se polimeriza através das suas extremidades com outros octâmeros, dando origem a filamentos de maior complexidade. Compreender os mecanismos moleculares exatos que controlam a montagem correta dos filamentos individuais e posteriormente seu empacotamento em estruturas de ordem superior atualmente representa um dos maiores desafios na área de bioquímica de septinas. Das quatro proteínas mencionadas acima, apenas Cdc11 foi cristalizada e teve a estrutura reportada 1. Porém, os dados relacionados a esta septina são de muito baixa qualidade, onde se observam sérios problemas de ordem estereoquímica, cristalográfica e estatística. Por este motivo, este trabalho buscou redeterminar a estrutura da Cdc11 usando o protocolo da literatura para depois estender os estudos estruturais para outras septinas de levedura.Este trabalho também analisou propriedades biofísicas das quatro proteínas citadas, como estado monomérico em solução, estabilidade térmica, capacidade de ligar-se a nucleotídeo de guanina e também a hidrólise de GTP. Verificou-se que Cdc3 e Cdc11 quando sem a septina parceira são monômeros em solução e são purificados livres de nucleotídeos, diferentemente do que ocorre com Cdc12 que possui tanto GDP quanto GTP em seu interior devido à sua atividade catalítica. Também foi realizada a co-expressão de Cdc3/Cdc10 e Cdc11/Cdc12 que resultou em dímeros que permitiram a purificação de Cdc12 e Cdc10 por meio de SEC. Cristais proteicos foram obtidos para as septinas Cdc11 e complexos Cdc3/Cdc10 e Cdc11/Cdc12, que infelizmente difrataram em baixa resolução (4 5 Å) não permitindo a elucidação da estrutura cristalográfica. Em vista dos parâmetros ruins de validação da estrutura depositada de Cdc11, esta proteína foi modelada sozinha, com a sua parceira Cdc12 via interface G e também com outra cópia de Cdc11 via interface NC, cujos modelos são preferíveis à estrutura depositada
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2022
- Data da defesa: 26.04.2022
- Este artigo possui versão em acesso aberto
- URL de acesso aberto
- PDF de acesso aberto
- Versão do Documento: Versão publicada (Published version)
-
Status: Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access) -
ABNT
SILVA, Rafael Marques da. Caracterização estrutural das septinas de levedura (<i>Saccharomyces cerevisiae</i>) Cdc3, Cdc10, Cdc11 e Cdc12. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2022. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-17082022-083225/. Acesso em: 16 mar. 2026. -
APA
Silva, R. M. da. (2022). Caracterização estrutural das septinas de levedura (<i>Saccharomyces cerevisiae</i>) Cdc3, Cdc10, Cdc11 e Cdc12 (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-17082022-083225/ -
NLM
Silva RM da. Caracterização estrutural das septinas de levedura (<i>Saccharomyces cerevisiae</i>) Cdc3, Cdc10, Cdc11 e Cdc12 [Internet]. 2022 ;[citado 2026 mar. 16 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-17082022-083225/ -
Vancouver
Silva RM da. Caracterização estrutural das septinas de levedura (<i>Saccharomyces cerevisiae</i>) Cdc3, Cdc10, Cdc11 e Cdc12 [Internet]. 2022 ;[citado 2026 mar. 16 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-17082022-083225/ - Caracterização estrutural das septinas de levedura (<i>Saccharomyces cerevisiae</i>) Cdc3, Cdc10, Cdc11 e Cdc12
- Estudos estruturais, biofísicos e bioquímicos das septinas de levedura Cdc3, Cdc10, Cdc11 e Cdc12
- Expressão e purificação das septinas de levedura Cdc3, Cdc10, Cdc11 e Cdc12
- Modelagem por homologia de dois diferentes dímeros de septinas de levedura
- Structural biology of yeast septin complexes
- A key piece of the puzzle: the central tetramer of the Saccharomyces cerevisiae septin protofilament and its implications for self-assembly
- Unveiling the central tetramer of the Saccharomyces Cerevisiae septin protofilament
Informações sobre a disponibilidade de versões do artigo em acesso aberto coletadas automaticamente via oaDOI API (Unpaywall).
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
