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Nucleosome landscape reflects phenotypic differences in Trypanosoma cruzi life forms (2021)

  • Authors:
  • USP affiliated author: SILBER, ARIEL MARIANO - ICB
  • School: ICB
  • DOI: 10.1371/journal.ppat.1009272
  • Subjects: PARASITOLOGIA; TRYPANOSOMA CRUZI; FENÓTIPOS; PROTEÔMICA; HISTOMONÍASE ANIMAL; EPIGÊNESE GENÉTICA; GENOMAS; REPLICAÇÃO DO DNA; CROMATINA
  • Agências de fomento:
  • Language: Inglês
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    Informações sobre o DOI: 10.1371/journal.ppat.1009272 (Fonte: oaDOI API)
    • Este periódico é de acesso aberto
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    • Cor do Acesso Aberto: gold
    • Licença: cc-by

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    • ABNT

      LIMA, Alex Ranieri Jerônimo; CUNHA, Julia P. C. da; ARAUJO, Christiane B. de; et al. Nucleosome landscape reflects phenotypic differences in Trypanosoma cruzi life forms. PL o S Pathogens (Print), San Francisco, Public Library of Science, v. 17, n. 1, p. 26 , 2021. Disponível em: < https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1009272 > DOI: 10.1371/journal.ppat.1009272.
    • APA

      Lima, A. R. J., Cunha, J. P. C. da, Araujo, C. B. de, Bispo, S., Patané, J., Silber, A. M., & Elias, M. C. (2021). Nucleosome landscape reflects phenotypic differences in Trypanosoma cruzi life forms. PL o S Pathogens (Print), 17( 1), 26 . doi:10.1371/journal.ppat.1009272
    • NLM

      Lima ARJ, Cunha JPC da, Araujo CB de, Bispo S, Patané J, Silber AM, Elias MC. Nucleosome landscape reflects phenotypic differences in Trypanosoma cruzi life forms [Internet]. PL o S Pathogens (Print). 2021 ; 17( 1): 26 .Available from: https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1009272
    • Vancouver

      Lima ARJ, Cunha JPC da, Araujo CB de, Bispo S, Patané J, Silber AM, Elias MC. Nucleosome landscape reflects phenotypic differences in Trypanosoma cruzi life forms [Internet]. PL o S Pathogens (Print). 2021 ; 17( 1): 26 .Available from: https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1009272

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    Primeira página: 229
    Ano: 2012
    DOI: 10.1186/1471-2164-13-229
    Autor: B Suter
    Título: Poly(dA.dT) sequences exist as rigid DNA structures in nucleosome-free yeast promoters in vivo
    Título do periódico: Nucleic acids research
    Volume: 28
    Fascículo: 21
    Primeira página: 4083
    Ano: 2000
    DOI: 10.1093/nar/28.21.4083
    Autor: R Marques Porto
    Título: Histone H1 is phosphorylated in non-replicating and infective forms of Trypanosoma cruzi
    Título do periódico: Molecular and biochemical parasitology
    Volume: 119
    Fascículo: 2
    Primeira página: 265
    Ano: 2002
    DOI: 10.1016/S0166-6851(01)00430-3
    Autor: LM Gutiyama
    Título: Histone H1 of Trypanosoma cruzi is concentrated in the nucleolus region and disperses upon phosphorylation during progression to mitosis
    Título do periódico: Eukaryotic cell
    Volume: 7
    Fascículo: 4
    Primeira página: 560
    Ano: 2008
    DOI: 10.1128/EC.00460-07
    Autor: V Sabaj
    Título: Histone synthesis in Trypanosoma cruzi
    Título do periódico: Experimental cell research
    Volume: 236
    Fascículo: 2
    Primeira página: 446
    Ano: 1997
    DOI: 10.1006/excr.1997.3749
    Autor: VT Contreras
    Título: In vitro differentiation of Trypanosoma cruzi under chemically defined conditions
    Título do periódico: Molecular and biochemical parasitology
    Volume: 16
    Fascículo: 3
    Primeira página: 315
    Ano: 1985
    DOI: 10.1016/0166-6851(85)90073-8
    Autor: AM Bolger
    Título: Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 30
    Fascículo: 15
    Primeira página: 2114
    Ano: 2014
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btu170
    Autor: B Langmead
    Título: Fast gapped-read alignment with Bowtie 2
    Título do periódico: Nature methods
    Volume: 9
    Fascículo: 4
    Primeira página: 357
    Ano: 2012
    DOI: 10.1038/nmeth.1923
    Autor: H Li
    Título: The Sequence Alignment/Map format and SAMtools
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 25
    Fascículo: 16
    Primeira página: 2078
    Ano: 2009
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btp352
    Autor: F Ramírez
    Título: deepTools2: a next generation web server for deep-sequencing data analysis
    Título do periódico: Nucleic acids research
    Volume: 44
    Fascículo: W1
    Primeira página: W160
    Ano: 2016
    DOI: 10.1093/nar/gkw257
    Autor: AR Quinlan
    Título: BEDTools: a flexible suite of utilities for comparing genomic features
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 26
    Fascículo: 6
    Primeira página: 841
    Ano: 2010
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btq033
    Autor: H Thorvaldsdóttir
    Título: Integrative Genomics Viewer (IGV): high-performance genomics data visualization and exploration
    Título do periódico: Briefings in bioinformatics
    Volume: 14
    Fascículo: 2
    Primeira página: 178
    Ano: 2013
    DOI: 10.1093/bib/bbs017
    Autor: S Heinz
    Título: Simple combinations of lineage-determining transcription factors prime cis-regulatory elements required for macrophage and B cell identities
    Título do periódico: Molecular cell
    Volume: 38
    Fascículo: 4
    Primeira página: 576
    Ano: 2010
    DOI: 10.1016/j.molcel.2010.05.004
    Autor: F Supek
    Título: REVIGO summarizes and visualizes long lists of gene ontology terms
    Título do periódico: PloS one
    Volume: 6
    Fascículo: 7
    Primeira página: e21800
    Ano: 2011
    DOI: 10.1371/journal.pone.0021800

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