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The genomic and immune landscape of lethal metastatic breast cancer (2019)

  • Authors:
  • USP affiliated author: TIEZZI, DANIEL GUIMARÃES - FMRP
  • School: FMRP
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2019.04.098
  • Subjects: NEOPLASIAS MAMÁRIAS; GENÔMICA
  • Keywords: Immune landscapes; Metastatic phylogenies; Immunoediting; TCR repertoire; Breast cancer; Metastases; Stem mutations; Clade mutations; Private mutations; Genomic landscapes
  • Language: Inglês
  • Imprenta:
  • Source:
    • Título do periódico: Cell Reports
    • ISSN: 2211-1247
    • Volume/Número/Paginação/Ano: v. 27, n. 9, p. 2690-2708, e1-e10, 2019
  • Online source accessDOI
    Informações sobre o DOI: 10.1016/j.celrep.2019.04.098 (Fonte: oaDOI API)
    • Este periódico é de acesso aberto
    • Este artigo é de acesso aberto
    • URL de acesso aberto
    • Cor do Acesso Aberto: gold
    • Licença: cc-by

    How to cite
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    • ABNT

      MATOS-ARRUDA, Leticia de et al. The genomic and immune landscape of lethal metastatic breast cancer. Cell Reports, v. 27, n. 9, p. 2690-2708, 2019Tradução . . Disponível em: https://doi.org/. Acesso em: 24 set. 2022.
    • APA

      Matos-Arruda, L. de, Sammut, S. -J., Ross, E. M., Bashford-Rogers, R., Greenstein, E., Markus, H., et al. (2019). The genomic and immune landscape of lethal metastatic breast cancer. Cell Reports, 27( 9), 2690-2708. doi:10.1016/j.celrep.2019.04.098
    • NLM

      Matos-Arruda L de, Sammut S-J, Ross EM, Bashford-Rogers R, Greenstein E, Markus H, Morganella S, Teng Y, Maruvka Y, Tiezzi DG. The genomic and immune landscape of lethal metastatic breast cancer [Internet]. Cell Reports. 2019 ; 27( 9): 2690-2708.[citado 2022 set. 24 ] Available from: https://doi.org/
    • Vancouver

      Matos-Arruda L de, Sammut S-J, Ross EM, Bashford-Rogers R, Greenstein E, Markus H, Morganella S, Teng Y, Maruvka Y, Tiezzi DG. The genomic and immune landscape of lethal metastatic breast cancer [Internet]. Cell Reports. 2019 ; 27( 9): 2690-2708.[citado 2022 set. 24 ] Available from: https://doi.org/

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    DOI: 10.1371/journal.pmed.1002204
    Autor: Scheinin
    Título: DNA copy number analysis of fresh and formalin-fixed specimens by shallow whole-genome sequencing with identification and exclusion of problematic regions in the genome assembly
    Título do periódico: Genome Res.
    Volume: 24
    Primeira página: 2022
    Ano: 2014
    DOI: 10.1101/gr.175141.114
    Autor: Schreiber
    Título: Cancer immunoediting: integrating immunity’s roles in cancer suppression and promotion
    Título do periódico: Science
    Volume: 331
    Primeira página: 1565
    Ano: 2011
    DOI: 10.1126/science.1203486
    Autor: Schwarz
    Título: Phylogenetic quantification of intra-tumour heterogeneity
    Título do periódico: PLoS Comput. Biol.
    Volume: 10
    Primeira página: e1003535
    Ano: 2014
    DOI: 10.1371/journal.pcbi.1003535
    Autor: Shah
    Título: Mutational evolution in a lobular breast tumour profiled at single nucleotide resolution
    Título do periódico: Nature
    Volume: 461
    Primeira página: 809
    Ano: 2009
    DOI: 10.1038/nature08489
    Autor: Shah
    Título: The clonal and mutational evolution spectrum of primary triple-negative breast cancers
    Título do periódico: Nature
    Volume: 486
    Primeira página: 395
    Ano: 2012
    DOI: 10.1038/nature10933
    Autor: Shen
    Título: MPprimer: a program for reliable multiplex PCR primer design
    Título do periódico: BMC Bioinformatics
    Volume: 11
    Primeira página: 143
    Ano: 2010
    DOI: 10.1186/1471-2105-11-143
    Autor: Shukla
    Título: Comprehensive analysis of cancer-associated somatic mutations in class I HLA genes
    Título do periódico: Nat. Biotechnol.
    Volume: 33
    Primeira página: 1152
    Ano: 2015
    DOI: 10.1038/nbt.3344
    Autor: Soetaert
    Ano: 2009
    Autor: Stamatakis
    Título: RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 30
    Primeira página: 1312
    Ano: 2014
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btu033
    Autor: Tang
    Título: Comprehensive analysis of the clinical immuno-oncology landscape
    Título do periódico: Ann. Oncol.
    Volume: 29
    Primeira página: 84
    Ano: 2018
    DOI: 10.1093/annonc/mdx755
    Autor: Thorsson
    Título: The Immune Landscape of Cancer
    Título do periódico: Immunity
    Volume: 48
    Primeira página: 812
    Ano: 2018
    DOI: 10.1016/j.immuni.2018.03.023
    Autor: Toy
    Título: ESR1 ligand-binding domain mutations in hormone-resistant breast cancer
    Título do periódico: Nat. Genet.
    Volume: 45
    Primeira página: 1439
    Ano: 2013
    DOI: 10.1038/ng.2822
    Autor: Untergasser
    Título: Primer3--new capabilities and interfaces
    Título do periódico: Nucleic Acids Res.
    Volume: 40
    Primeira página: e115
    Ano: 2012
    DOI: 10.1093/nar/gks596
    Autor: Van Loo
    Título: Allele-specific copy number analysis of tumors
    Título do periódico: Proc. Natl. Acad. Sci. USA
    Volume: 107
    Primeira página: 16910
    Ano: 2010
    DOI: 10.1073/pnas.1009843107
    Autor: Vogelstein
    Título: Cancer genome landscapes
    Título do periódico: Science
    Volume: 339
    Primeira página: 1546
    Ano: 2013
    DOI: 10.1126/science.1235122
    Autor: Wang
    Título: ANNOVAR: functional annotation of genetic variants from high-throughput sequencing data
    Título do periódico: Nucleic Acids Res.
    Volume: 38
    Primeira página: e164
    Ano: 2010
    DOI: 10.1093/nar/gkq603
    Autor: Wang
    Título: The Different T-cell Receptor Repertoires in Breast Cancer Tumors, Draining Lymph Nodes, and Adjacent Tissues
    Título do periódico: Cancer Immunol. Res.
    Volume: 5
    Primeira página: 148
    Ano: 2017
    DOI: 10.1158/2326-6066.CIR-16-0107
    Autor: Watson
    Título: Viral population analysis and minority-variant detection using short read next-generation sequencing
    Título do periódico: Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci.
    Volume: 368
    Primeira página: 20120205
    Ano: 2013
    DOI: 10.1098/rstb.2012.0205
    Autor: Wolff
    Título: Recommendations for human epidermal growth factor receptor 2 testing in breast cancer: American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists clinical practice guideline update
    Título do periódico: J. Clin. Oncol.
    Volume: 31
    Primeira página: 3997
    Ano: 2013
    DOI: 10.1200/JCO.2013.50.9984
    Autor: Yates
    Título: Subclonal diversification of primary breast cancer revealed by multiregion sequencing
    Título do periódico: Nat. Med.
    Volume: 21
    Primeira página: 751
    Ano: 2015
    DOI: 10.1038/nm.3886
    Autor: Yates
    Título: Genomic Evolution of Breast Cancer Metastasis and Relapse
    Título do periódico: Cancer Cell
    Volume: 32
    Primeira página: 169
    Ano: 2017
    DOI: 10.1016/j.ccell.2017.07.005

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