Enrichment of genotyping panels for the genomic selection of special traits in broiler chicken (2020)
- Authors:
- Autor USP: SALVIAN, MAYARA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LZT
- Subjects: FRANGOS DE CORTE; GENÔMICA; MARCADOR MOLECULAR; MELHORAMENTO GENÉTICO ANIMAL; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; SELEÇÃO GENÉTICA
- Language: Inglês
- Abstract: O melhoramento genético modificou consideravelmente a produção de frango no Brasil e no mundo. No entanto, o intensivo processo de seleção ao longo dos anos trouxe consequências negativas em aves, como por exemplo, o aumento na deposição de gordura abdominal nos animais, resultando em dificuldades de processamento e depreciação do produto final. Nos últimos anos, os avanços tecnológicos nas áreas de genética molecular e bioinformática fizeram com que a seleção genômica (SG) com o uso de marcadores moleculares (Single Nucleotide Polymorphisms - SNP), e mais recentemente o sequenciamento completo do genoma (Whole-Genomic Sequencing- WGS), se tornasse uma importante ferramenta para aumentar o ganho genético no melhoramento animal, especialmente para características complexas e de difícil mensuração. Os objetivos deste trabalho foram estimar os valores genéticos e comparar as predições genômicas utilizando provenientes de um painel de SNP de alta densidade (HD - 600K) e de dados do sequenciamento completo do genoma (WGS), por meio de diferentes densidades de marcadores. Foram utilizadas informações de órgãos (coração, fígado, moela e pulmões) e carcaça (peito, coxa, sobrecoxa) de 2.000 aves provenientes da população referência TT pertencente ao Programa de Melhoramento Genético de Aves da EMBRAPA Suínos e Aves. Posteriormente, as predições genômicas foram realizadas utilizando os modelos PBLUP (Pedigree-Based BLUP), ssGBLUP (single-step Genomic BLUP) e BayesC em váriasdensidades de SNP e variantes imputadas a partir da sequência do genoma completo. As predições genômicas foram melhores quando as informações genômicas foram adicionadas nas análises. No entanto, nossos resultados não mostraram nenhum benefício no uso de dados WGS em comparação aos dados do HD quando as abordagens ssGBLUP ou BayesC foram aplicadas. Além disso, o uso de um painel de baixa densidade (~74.000 SNPs) pode fornecer resultados significativos a um baixo custo
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2020
- Data da defesa: 02.06.2020
-
ABNT
SALVIAN, Mayara. Enrichment of genotyping panels for the genomic selection of special traits in broiler chicken. 2020. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2020. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-12082020-153615/. Acesso em: 27 dez. 2025. -
APA
Salvian, M. (2020). Enrichment of genotyping panels for the genomic selection of special traits in broiler chicken (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-12082020-153615/ -
NLM
Salvian M. Enrichment of genotyping panels for the genomic selection of special traits in broiler chicken [Internet]. 2020 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-12082020-153615/ -
Vancouver
Salvian M. Enrichment of genotyping panels for the genomic selection of special traits in broiler chicken [Internet]. 2020 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-12082020-153615/ - Estresse térmico sobre a predição de valores genéticos para características de produção e qualidade do leite de vacas Holandesas
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