ELMER v.2: an R/Bioconductor package to reconstruct gene regulatory networks from DNA methylation and transcriptome profiles (2019)
- Authors:
- USP affiliated authors: NOUSHMEHR, HOUTAN - FMRP ; SILVA, TIAGO CHEDRAOUI - FMRP
- Unidade: FMRP
- DOI: 10.1093/bioinformatics/bty902
- Subjects: DNA; METILAÇÃO; EXPRESSÃO GÊNICA
- Agências de fomento:
- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
Processo FAPESP: 2016/01389-7 - Financiado pelo National Institutes of Health
- Financiado pelo Cedars-Sinai’s Samuel Oschin Comprehensive Cancer Institute
- Financiado pelo NIH/NCI Informatics Technology for Cancer Research
- Financiado pelo Genomic Data Analysis Network
- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
- Language: Inglês
- Imprenta:
- Source:
- Título: Bioinformatics
- ISSN: 1367-4803
- Volume/Número/Paginação/Ano: v. 35, n. 11, p. 1974-1977, 2019
- Status:
- Artigo aberto em periódico híbrido (Hybrid Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão publicada (Published version)
- Acessar versão aberta:
-
ABNT
SILVA, Tiago Chedraoui et al. ELMER v.2: an R/Bioconductor package to reconstruct gene regulatory networks from DNA methylation and transcriptome profiles. Bioinformatics, v. 35, n. 11, p. 1974-1977, 2019Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty902. Acesso em: 09 maio 2026. -
APA
Silva, T. C., Coetzee, S. G., Gull, N., Yao, L., Hazelett, D. J., Noushmehr, H., et al. (2019). ELMER v.2: an R/Bioconductor package to reconstruct gene regulatory networks from DNA methylation and transcriptome profiles. Bioinformatics, 35( 11), 1974-1977. doi:10.1093/bioinformatics/bty902 -
NLM
Silva TC, Coetzee SG, Gull N, Yao L, Hazelett DJ, Noushmehr H, Lin D-C, Berman BP. ELMER v.2: an R/Bioconductor package to reconstruct gene regulatory networks from DNA methylation and transcriptome profiles [Internet]. Bioinformatics. 2019 ; 35( 11): 1974-1977.[citado 2026 maio 09 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty902 -
Vancouver
Silva TC, Coetzee SG, Gull N, Yao L, Hazelett DJ, Noushmehr H, Lin D-C, Berman BP. ELMER v.2: an R/Bioconductor package to reconstruct gene regulatory networks from DNA methylation and transcriptome profiles [Internet]. Bioinformatics. 2019 ; 35( 11): 1974-1977.[citado 2026 maio 09 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty902 - New functionalities in the TCGAbiolinks package for the study and integration of cancer data from GDC and GTEx
- Interpreting pathways to discover cancer driver genes with Moonlight
- Ferramenta de bioinformática para integrar e compreender as mudanças epigenômicas e genômicas aberrantes associadas com câncer: métodos, desenvolvimento e análise
- RNA-binding protein ZFP36L1 suppresses hypoxia and cell-cycle signaling
- TCGA workflow: analyze cancer genomics and epigenomics data using bioconductor packages [version 2; referees: 1 approved, 2 approved with reservations]
- The cancer genome atlas pan-cancer analysis project
- The somatic genomic landscape of glioblastoma
- Identification and characterization of functional risk variants for colorectal cancer mapping to chromosome 11q23.1
- Mais um passo da ciência. [Depoimento a Rosemeire Soares Talamone]
- Gene expression signature associated with aggressive glioblastoma growth is enriched in chromatin modification and stemness transcriptional regulation programs
Informações sobre a disponibilidade de versões do artigo em acesso aberto coletadas automaticamente via oaDOI API (Unpaywall).
Por se tratar de integração com serviço externo, podem existir diferentes versões do trabalho (como preprints ou postprints), que podem diferir da versão publicada.
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
