Tese

Identificação, anotação e análise filogenética das famílias gênicas envolvidas na via de biossíntese de hemicelulose em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) (2016)

• Authors:
  • Gustavo Mitsunori Aoyagi
  • Romanel, Elisson Antônio da Costa (Orientador)
• Autor USP: AOYAGI, GUSTAVO MITSUNORI - EEL
• Unidade: EEL
• Sigla do Departamento: LOT
• Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; ENZIMAS
• Language: Português
• Abstract: A parede celular de plantas é formada basicamente por celulose, hemicelulose e lignina. A formação dos polímeros de hemicelulose depende do suprimento de precursores chamados de açúcares-nucleotídeos. A biossíntese das diferentes estruturas de hemicelulose da parede celular envolve a participação de enzimas pertencentes às famílias das glicosiltransferases (GTs). Estudos feitos em Arabidopsis thaliana, Brachypodium distachyon, Oryza sativa (arroz) e Zea mays (milho) auxiliaram na descoberta de 11 enzimas da via de interconversão nucleotídeo-açúcar e de enzimas da família das glicosiltransferases (GTs), como as GT2, GT8, GT43, GT47, GT61 e GT75, envolvidas na biossíntese de hemicelulose. O presente trabalho visa a identificação de genes da via de biossíntese de hemicelulose da parede celular de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) e análise filogenética entre Arabidopsis thaliana (planta modelo de eudicotiledôneas), Oryza sativa, Brachypodium distachyon, Zea mays, Sorghum bicolor e Saccharum spp. Foram identificados os genes das famílias GT2, GT8, GT43, GT47, GT61, GT75, CSL, Epimerase e UDPG em cana-de-açúcar a partir da busca em sete bibliotecas de RNA-Seq utilizando as sequências de O. sativa, Z. mays e S. bicolor como referência. Os domínios específicos de cada família gênica foram confirmados através do programa PFAM e consequentemente anotados. A identificação e anotação das sequencias possibilitou a construção de bancos de sequências das famílias envolvidas na biossíntese de hemicelulose para as espécies A. thaliana, B. distachyon, O. sativa, Z. mays e S. bicolor. Foram identificadas para cada espécie, respectivamente, um total de 67, 49, 49, 60 e 56 genes bona fides. O presente trabalho, além da identificação de genes nas diferentes espécies, permitiu a identificação e seleção de 27 genes candidatos envolvidos na biossíntese de hemicelulose em cana-de-açúcar
• Imprenta:
  • Publisher place: Lorena
  • Date published: 2016
• Data da defesa: 29.02.2016

---

How to cite

A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

• ABNT

  GUSTAVO MITSUNORI AOYAGI,. Identificação, anotação e análise filogenética das famílias gênicas envolvidas na via de biossíntese de hemicelulose em cana-de-açúcar (Saccharum spp.). 2016. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Lorena, 2016. . Acesso em: 28 dez. 2025.

• APA

  Gustavo Mitsunori Aoyagi,. (2016). Identificação, anotação e análise filogenética das famílias gênicas envolvidas na via de biossíntese de hemicelulose em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Lorena.

• NLM

  Gustavo Mitsunori Aoyagi. Identificação, anotação e análise filogenética das famílias gênicas envolvidas na via de biossíntese de hemicelulose em cana-de-açúcar (Saccharum spp.). 2016 ;[citado 2025 dez. 28 ]

• Vancouver

  Gustavo Mitsunori Aoyagi. Identificação, anotação e análise filogenética das famílias gênicas envolvidas na via de biossíntese de hemicelulose em cana-de-açúcar (Saccharum spp.). 2016 ;[citado 2025 dez. 28 ]

Últimas obras dos mesmos autores vinculados com a USP cadastradas na BDPI:

• Genome-wide analysis of the MADS-box gene family in polyploid cotton (Gossypium hirsutum) and in its diploid parental species (Gossypium arboreum and Gossypium raimondii)