Abordagem de biologia de sistemas para a determinação de mecanismos moleculares associados à eficiência alimentar de bovinos Nelore (2019)
- Authors:
- Autor USP: ALEXANDRE, PÂMELA ALMEIDA - FZEA
- Unidade: FZEA
- Sigla do Departamento: ZMV
- Subjects: CONSUMO ALIMENTAR PARA ANIMAL; BOVINOS DE CORTE; EXPRESSÃO GÊNICA
- Language: Português
- Abstract: A eficiência alimentar (EA) é um fenótipo complexo, controlado por diversos processos biológicos. Determinar e entender esses processos é fundamental para selecionar animais superiores ou mesmo orientar decisões de manejo com o objetivo de aumentar a produtividade e diminuir o impacto ambiental da pecuária. Neste trabalho, propusemos analisar a EA através de uma abordagem de biologia de sistemas, baseada em transcriptômica multitecidual, a fim de gerar um entendimento sistêmico dessa característica. Para isso, 18 animais extremos para consumo alimentar residual foram selecionados a partir de um grupo de 98 bovinos Nelore machos inteiros e tiveram seu transcriptoma de hipotálamo, pituitária, adrenal, músculo e fígado sequenciado (RNAseq). Os reads gerados foram alinhados com o genoma de referência bovino (UMD3.1), filtrados e a expressão de cada gene foi estimada. A partir desses dados três abordagens de análises de dados foram desenvolvidas. Na primeira, cinco critérios de inclusão foram definidos para selecionar genes e construir uma rede de co-expressão para os cinco tecidos, de forma que além de indicarmos diversos genes e processos associados à EA, também fomos capazes de determinar dois genes reguladores, o NR2F6 e o TGFB1. Na segunda abordagem focamos no eixo hipotálamo-pituitária-adrenal, também utilizando análises de co-expressão, mas dessa vez sem partir de prévia seleção de genes e concluímos que o sistema de recompensa do cérebro pode estar envolvido no estímulopara maior consumo de alimentos observado no grupo de baixa EA. Finalmente, com a terceira abordagem, identificamos RNAs longos não codificadores (lncRNAs) expressos nos cinco tecidos e encontramos 30 transcritos expressos diferencialmente entre a alta e baixa EA na pituitária, músculo e adrenal, sendo que alguns deles se mostraram relacionados a processos já previamente demostrados como sendo associados a essa característica. Concluímos que, apesar de não conseguirmos determinar nesse momento o papel da maior susceptibilidade ao estresse, reportado na literatura para animais de baixa EA, no estímulo para maior ingestão de alimentos desse grupo, o sistema de recompensa hipotalâmico parece estar envolvido nesse processo. A maior ingestão pode ser a causa da resposta inflamatória observada no fígado, sendo ela de origem bacteriana, indicada pela maior concentração de endotoxina sérica nos animais menos eficientes. O maior turnover de proteínas no músculo de animais de baixa EA já havia sido indicado como um dos fatores que levam ao maior gasto energético nesses indivíduos e foi confirmado nesse trabalho. Além de alguns fatores de transcrição serem indicados como reguladores centrais desse fenótipo, lncRNAs também parecem ter função regulatória importante na EA
- Imprenta:
- Publisher place: Pirassununga
- Date published: 2019
- Data da defesa: 25.01.2019
-
ABNT
ALEXANDRE, Pâmela Almeida. Abordagem de biologia de sistemas para a determinação de mecanismos moleculares associados à eficiência alimentar de bovinos Nelore. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-24042019-115123/. Acesso em: 31 dez. 2025. -
APA
Alexandre, P. A. (2019). Abordagem de biologia de sistemas para a determinação de mecanismos moleculares associados à eficiência alimentar de bovinos Nelore (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Pirassununga. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-24042019-115123/ -
NLM
Alexandre PA. Abordagem de biologia de sistemas para a determinação de mecanismos moleculares associados à eficiência alimentar de bovinos Nelore [Internet]. 2019 ;[citado 2025 dez. 31 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-24042019-115123/ -
Vancouver
Alexandre PA. Abordagem de biologia de sistemas para a determinação de mecanismos moleculares associados à eficiência alimentar de bovinos Nelore [Internet]. 2019 ;[citado 2025 dez. 31 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-24042019-115123/ - Caracterização do perfil de expressão gênica hepática global associada à eficiência alimentar em bovinos Nelore
- Exploring the regulatory potential of long non-coding RNA in feed efficiency of indicine cattle
- RNA-Seq transcriptome analysis shows anti-tumor actions of melatonin in a breast cancer xenograft model
- An epigenetic screening determines BET proteins as targets to suppress self-renewal and tumorigenicity in canine mammary cancer cells
- Identification of a metabolomic signature associated with feed efficiency in beef cattle
- Identification of two molecular subtypes in canine mast cell tumours through gene expression profiling
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