Caracterização genômica e evolutiva de vírus zoonóticos nas Américas (Tese) (2017)
- Authors:
- Autor USP: SOUZA, WILLIAM MARCIEL DE - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RBI
- Subjects: IMUNOLOGIA; ZOONOSES POR VÍRUS; METAGEOGRAFIA
- Keywords: Arbovirus; Arbovírus; Bunyavirales; Evolução; Evolution; Genomic; Genômica; Metagenômica viral; Vesiculovirus; Vesiculovirus; Viral metagenomic; Zoonoses virais; Zoonotic viruses
- Language: Português
- Abstract: O sequenciamento de alto desempenho, pela redução dos custos nos últimos anos, vem sendo cada vez mais utilizado para prospectar e identificar vírus. Estes métodos são extremamente mais sensíveis que outros métodos moleculares, e capazes de sequenciar genomas vitais sem conhecimento prévio, clonagem ou isolamento. Neste estudo, utilizamos o sequenciamento de alto desempenho para conhecer, e caracterizar genomas completos de arbovírus isolados nas Américas, incluindo a prospecção de vírus em amostras de pequenas mamíferos do estado de São Paulo, Brasil. Assim, sequenciamos e caracterizamos 44 Bunyavirales, 35 no género Orthobunyavirus, família Peribunyaviridae, oito no gênero Phlebovirus, família Phenuiviridae, e um orthonairovírus, família Nairoviridae. Entre os Bunyavirales identificamos uma provável nova estratégia de codificação da proteína não estrutural do segmento pequeno, e ainda identificados sete vírus que são reassortants naturais. Caracterizamos o genoma completo do Vesiculovirus Piry, determinando sua relação filogenética com arbovírus pertencestes ao género Vesiculovirus, família Rhabdoviridae. Prospectamos novos vírus, os quais incluímos em três famílias, Parvoviridae, Anelloviridae e Hepeviridae. Na família Parvoviridae, identificamos 20 chapparvovírus endógenos e exógenos, oriundos de grande diversidade de hospedeiros vertebrados e invertebrados, e que representam uma nova subfamília, a Chapparvovirinae. Também, descrevemos onze novas espécies de Anelloviridae em roedores silvestres e marsupiais, fornecendo importantes informações sobre a diversidade, a taxonomia, e ainda ampliamos a gama de hospedeiros de anellovírus conhecidos. Por fim, identificamos e caracterizamos uma nova espécie de Orthohepeuirus de roedores Sigmodontinae, nomeada "Orthohepevirus E". Acreditamos que estamos a fornecerrelevantes informações sobre genômica, epidemiologia molecular, evolução e taxonomia de 45 arbovírus americanos, bem como sobre 13 novas espécies vitais encontradas em pequenas mamíferos. Tais informações deverão dar subsídios para múltiplos futuros estudos visando compreender a importância destes novos vírus e a desenvolver métodos diagnósticos
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2017
- Data da defesa: 10.11.2017
-
ABNT
SOUZA, William Marciel de. Caracterização genômica e evolutiva de vírus zoonóticos nas Américas (Tese). 2017. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-26042018-173824/. Acesso em: 03 nov. 2024. -
APA
Souza, W. M. de. (2017). Caracterização genômica e evolutiva de vírus zoonóticos nas Américas (Tese) (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-26042018-173824/ -
NLM
Souza WM de. Caracterização genômica e evolutiva de vírus zoonóticos nas Américas (Tese) [Internet]. 2017 ;[citado 2024 nov. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-26042018-173824/ -
Vancouver
Souza WM de. Caracterização genômica e evolutiva de vírus zoonóticos nas Américas (Tese) [Internet]. 2017 ;[citado 2024 nov. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-26042018-173824/ - An ancient lineage of highly divergent parvoviruses infects both vertebrate and invertebrate hosts
- Barrita virus, a novel virus of the Patois serogroup (Genus orthobunyavirus; family Peribunyaviridae)
- Estudo evolutivo dos hantavírus e desenvolvimento de uma RT-PCR quantitativa em tempo real para detecção do vírus Araraquara
- Characterization of three novel viruses from the families Nyamiviridae, Orthomyxoviridae, and Peribunyaviridae, isolated from dead birds collected during west nile virus surveillance in Harris County, Texas
- Murine and related chapparvoviruses are nephro-tropic and produce novel accessory proteins in infected kidneys
- Clusters of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 infection after vaccination with adenovirus-vectored and inactivated vaccines
- Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil
- 2020 taxonomic update for phylum Negarnaviricota (Riboviria: Orthornavirae), including the large orders Bunyavirales and Mononegavirales
- Fatal outcome of chikungunya virus infection in Brazil
- Epidemiological and clinical characteristics of the COVID-19 epidemic in Brazil
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
