Estudo evolutivo dos hantavírus e desenvolvimento de uma RT-PCR quantitativa em tempo real para detecção do vírus Araraquara (2013)
- Authors:
- Autor USP: SOUZA, WILLIAM MARCIEL DE - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RBI
- Subjects: INFECÇÕES POR HANTAVIRUS; EVOLUÇÃO COMPARADA
- Language: Português
- Abstract: O gênero Hantavírus são membros da família Bunyaviridae são vírus emergentes associados a roedores que podem infectar o homem causando graves doenças. Nas Américas, os Hantavírus causam uma síndrome pulmonar e cardiovascular (SPCVH) com alta letalidade. Cerca de 1600 casos de SPCVH já foram notificados no Brasil causando mais de 600 óbitos. Sete espécies de Hantavírus são conhecidas no Brasil incluindo o vírus Araraquara que circula nas regiões de cerrado do país associado ao roedor Necromys lasiurus. Esta Dissertação, possui 2 partes que versam sobre: o desenvolvimento de uma RT-PCR em tempo real para detecção e quantificação do Hantavírus Araraquara e um estudo filogenéticos sobre a evolução dos Hantavírus. Portanto, mostramos as etapas para o desenvolvimento de uma one-step RT-PCR em tempo real SYBR Green I para Hantavírus Araraquara que mostrou-se específica para o gênero e capaz de detectar até 10 cópias por mL de RNA viral na amostra. Como segunda parte deste trabalho, realizamos um estudo filogenético utilizando algoritmos bayesianos, com 190 sequências completas do gene da nucleoproteína, oriundas de 30 países durante um período de 25 anos (1985-2010) que encontravam-se disponíveis no GenBank (NCBI). Baseando-se em uma taxa média de 6.8 x ‘10 POT. -4’ (2.5 x ‘10 POT. -4’ - 1 x ‘10 POT. -3’) substituições nucleotídicas por sítio/ano, foi possível inferir que os Hantavírus teriam aproximadamente 1917 anos. O processo de dispersão dos Hantavírus pelo mundo teria ocorrido há aproximadamente 500 anos, e a introdução destes vírus nas Américas teria ocorrido há 549 anos (95% HPD 1555-341 anos), via América Central ou Mexico, originando os Hantavírus adaptados aos roedores da subfamília Neotominae, e pelo Brasil surgindo há 406 anos (95% HPD 1150-250 anos) os Hantavírus associados a roedores da subfamília Sigmodontinae, e posteriormente dispersaram paratodo o continente sulamericano. O trabalho contribui de forma relevante para o diagnóstico das infecções por Hantavírus com a one-step RT-PCR em tempo real SYBR Green I e também, contribui para o entendimento da filogenia e história destes vírus, oferecendo subsídios ao entendimento sobre como teria ocorrido o espalhamento dos Hantavírus pelo mundo.
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2013
- Data da defesa: 28.03.2013
-
ABNT
SOUZA, William Marciel de. Estudo evolutivo dos hantavírus e desenvolvimento de uma RT-PCR quantitativa em tempo real para detecção do vírus Araraquara. 2013. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2013. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-10042013-123852/. Acesso em: 19 set. 2024. -
APA
Souza, W. M. de. (2013). Estudo evolutivo dos hantavírus e desenvolvimento de uma RT-PCR quantitativa em tempo real para detecção do vírus Araraquara (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-10042013-123852/ -
NLM
Souza WM de. Estudo evolutivo dos hantavírus e desenvolvimento de uma RT-PCR quantitativa em tempo real para detecção do vírus Araraquara [Internet]. 2013 ;[citado 2024 set. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-10042013-123852/ -
Vancouver
Souza WM de. Estudo evolutivo dos hantavírus e desenvolvimento de uma RT-PCR quantitativa em tempo real para detecção do vírus Araraquara [Internet]. 2013 ;[citado 2024 set. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-10042013-123852/ - Caracterização genômica e evolutiva de vírus zoonóticos nas Américas (Tese)
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