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Proposta de um campo de forças coarse-grained para a previsão da estrutura nativa de baixa resolução de proteínas (2017)

  • Authors:
  • USP affiliated author: ROMEIRO, RAFAEL RISNIK - EP
  • School: EP
  • Sigla do Departamento: PQI
  • Subjects: ESPALHAMENTO; RAIOS X; ESTRUTURA MOLECULAR (QUÍMICA TEÓRICA); CRISTALOGRAFIA; PROTEÍNAS
  • Language: Português
  • Abstract: A capacidade de prever a estrutura nativa de uma proteína é um problema ainda sem solução. A predição da estrutura final ou nativa de uma proteína -, ou seja, partir da estrutura primária (sequência de aminoácidos linear) de um polipeptídeo tentar prever qual será a estrutura terciária (arranjo de hélices alfa, folhas beta e grampos) - tem sido um desafio para diversos pesquisadores desde o século passado. Atualmente existem diversos modelos que se propõem a executar essa tarefa, mas poucos que de fato partem de princípios físicos básicos para realizá-la. A grande maioria baseia-se em estruturas já conhecidas de proteínas com sequenciamento ou função similares para prever a estrutura terciária. Neste trabalho, no entanto, propõe-se o desenvolvimento de um campo de forças coarse-grained para aplicação em simulações de dinâmica molecular a fim de prever a estrutura de proteínas sem que seja necessária a comparação com estruturas já conhecidas. O fator de forma é um importante indicativo da estrutura de uma molécula em solução. Apesar de se tratar de uma grandeza que fornece informações de baixa resolução, ou seja, não fornece pormenores a respeito da posição dos átomos na estrutura da molécula, é uma estimativa inicial do espaço ocupado pela molécula e também da maneira com a qual ela interage com outras moléculas em solução. Isso é decorrente das operações matemáticas necessárias para que o fator de forma seja acessado a partir de dados de experimentos de espalhamento de raios X. Os resultados mostram que o método consegue prever uma estrutura condizente com os dados de espalhamento de raios X das estruturas cristalográficas e com os dados experimentais utilizados.
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 23.02.2017
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    How to cite
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    • ABNT

      ROMEIRO, Rafael Risnik; PESSÔA FILHO, Pedro de Alcântara. Proposta de um campo de forças coarse-grained para a previsão da estrutura nativa de baixa resolução de proteínas. 2017.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2017. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-20062017-114133/pt-br.php >.
    • APA

      Romeiro, R. R., & Pessôa Filho, P. de A. (2017). Proposta de um campo de forças coarse-grained para a previsão da estrutura nativa de baixa resolução de proteínas. Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-20062017-114133/pt-br.php
    • NLM

      Romeiro RR, Pessôa Filho P de A. Proposta de um campo de forças coarse-grained para a previsão da estrutura nativa de baixa resolução de proteínas [Internet]. 2017 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-20062017-114133/pt-br.php
    • Vancouver

      Romeiro RR, Pessôa Filho P de A. Proposta de um campo de forças coarse-grained para a previsão da estrutura nativa de baixa resolução de proteínas [Internet]. 2017 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-20062017-114133/pt-br.php

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