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Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal (2016)

  • Authors:
  • USP affiliated author: LOURENÇO, MARCUS VENICIUS DE MELLO - ESALQ
  • School: ESALQ
  • Sigla do Departamento: LGN
  • Subjects: EXPRESSÃO GÊNICA; GENOMAS; ENXOFRE; ECOSSISTEMAS DE MANGUE; MICROBIOLOGIA DO SOLO
  • Language: Português
  • Abstract: Os manguezais compõem um bioma de interface entre o continente e o oceano em regiões intertropicais, ambiente este caracterizado por condições únicas ambientais e uma elevada biodiversidade. Este projeto tem como objetivo estudar, utilizando abordagens de metagenômica e metatranscriptomica, as comunidades microbianas encontradas nos manguezais localizados nos municípios de Bertioga/SP e Cananeia/SP, com enfoque nos genes relacionados ao processo de redução do sulfato. Para tanto, uma biblioteca metagenômica contendo 12.960 clones em vetor fosmídeo foi triada por meio de PCR específico para o gene dsrB, ao mesmo passo que esta foi completamente sequenciada em plataforma Illumina HiSeq2000. Foram obtidos três insertos metagenomicos (23D5, MGV 10001431 e MGV 10016026, com 31, 31 e 34 kb, respectivamente). Estes foram então anotados e analisados mais detalhadamente. A inserção 23D5 foi a única a apresentar genes essenciais para a redução dissimilatória do sulfato (apr, hdr, dsr, sat). A diversidade taxonômica dos grupos relacionados ao ciclo do enxofre demonstrou a predominância dos filos Bacteroidetes e Proteobacteria enquanto a análise filogenética para gene dsrB apresentou diferenças entre os três insertos, afiliando os mesmos a sequências similares a Firmicutes e Deltaproteobacteria e revelando serem diferentes das sequências presentes em base de dados. A análise de metatrascriptomica dos quatro manguezais apresentou um padrão de expressão diferencial para o cluster dsr deacordo com o estado de conservação dos manguezais estudados. Estes resultados compõem o primeiro acesso a fragmentos genômicos e a funcionalidade dos mesmos em microrganismos redutores de sulfato em solos de manguezais
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 19.12.2016
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    • ABNT

      LOURENÇO, Marcus Venicius de Mello; FIORE, Marli de Fatima. Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal. 2016.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2016. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-23012017-172654/ >.
    • APA

      Lourenço, M. V. de M., & Fiore, M. de F. (2016). Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-23012017-172654/
    • NLM

      Lourenço MV de M, Fiore M de F. Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal [Internet]. 2016 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-23012017-172654/
    • Vancouver

      Lourenço MV de M, Fiore M de F. Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal [Internet]. 2016 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-23012017-172654/

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