Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal (2016)
- Autores:
- Autor USP: LOURENÇO, MARCUS VENICIUS DE MELLO - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Assuntos: EXPRESSÃO GÊNICA; GENOMAS; ENXOFRE; ECOSSISTEMAS DE MANGUE; MICROBIOLOGIA DO SOLO
- Idioma: Português
- Resumo: Os manguezais compõem um bioma de interface entre o continente e o oceano em regiões intertropicais, ambiente este caracterizado por condições únicas ambientais e uma elevada biodiversidade. Este projeto tem como objetivo estudar, utilizando abordagens de metagenômica e metatranscriptomica, as comunidades microbianas encontradas nos manguezais localizados nos municípios de Bertioga/SP e Cananeia/SP, com enfoque nos genes relacionados ao processo de redução do sulfato. Para tanto, uma biblioteca metagenômica contendo 12.960 clones em vetor fosmídeo foi triada por meio de PCR específico para o gene dsrB, ao mesmo passo que esta foi completamente sequenciada em plataforma Illumina HiSeq2000. Foram obtidos três insertos metagenomicos (23D5, MGV 10001431 e MGV 10016026, com 31, 31 e 34 kb, respectivamente). Estes foram então anotados e analisados mais detalhadamente. A inserção 23D5 foi a única a apresentar genes essenciais para a redução dissimilatória do sulfato (apr, hdr, dsr, sat). A diversidade taxonômica dos grupos relacionados ao ciclo do enxofre demonstrou a predominância dos filos Bacteroidetes e Proteobacteria enquanto a análise filogenética para gene dsrB apresentou diferenças entre os três insertos, afiliando os mesmos a sequências similares a Firmicutes e Deltaproteobacteria e revelando serem diferentes das sequências presentes em base de dados. A análise de metatrascriptomica dos quatro manguezais apresentou um padrão de expressão diferencial para o cluster dsr deacordo com o estado de conservação dos manguezais estudados. Estes resultados compõem o primeiro acesso a fragmentos genômicos e a funcionalidade dos mesmos em microrganismos redutores de sulfato em solos de manguezais
- Imprenta:
- Local: Piracicaba
- Data de publicação: 2016
- Data da defesa: 19.12.2016
-
ABNT
LOURENÇO, Marcus Venicius de Mello. Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal. 2016. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2016. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-23012017-172654/. Acesso em: 23 abr. 2024. -
APA
Lourenço, M. V. de M. (2016). Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-23012017-172654/ -
NLM
Lourenço MV de M. Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal [Internet]. 2016 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-23012017-172654/ -
Vancouver
Lourenço MV de M. Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal [Internet]. 2016 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-23012017-172654/
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