Estudos funcionais de CrNIP7 de <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>: uma proteína envolvida na biogênese de ribossomos (2016)
- Authors:
- Autor USP: GUTIERREZ, RAISSA FERREIRA - IFSC
- Unidade: IFSC
- Sigla do Departamento: FCI
- Subjects: PROTEÍNAS; RIBOSSOMOS; CHLAMYDIACEAE
- Keywords: <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>; Biogênese de ribossomo; CrNIP7; Ribosome biogenesis
- Language: Português
- Abstract: A biogênese do ribossomo é um processo complexo, altamente ordenado e regulado, no qual o transcrito primário é processado por endo e exonucleases para gerar os RNAs ribossomais maduros. Este processo foi melhor caracterizado em Saccharomyces cerevisiae, porém alguns fatores atuantes em humanos tiveram uma função divergente descrita. Um desses fatores é a proteína NIP7, altamente conservada em eucariotos, que atua na formação da subunidade ribossomal 60S, em levedura, e 40S, em humanos. Assim, esse trabalho propôs a caracterização funcional da proteína CrNIP7, homóloga a NIP7, presente em Chlamydomonas reinhardtii. C. reinhardtii é uma alga verde unicelular ancestral a plantas, utilizada como modelo eucarioto para estudos de fotossíntese e de flagelos. Nesse trabalho, um estudo de complementação funcional foi realizado utilizando duas linhagens de Saccharomyces cerevisiae diferentes e em ambas CrNIP7 complementou a função de Nip7p de leveduras, indicando uma participação na síntese da subunidade 60S do ribossomo. Uma busca por parceiros de interação de CrNIP7 foi também realizada, utilizando CrNIP7 como isca para rastrear uma biblioteca de cDNA de C. reinhardtii em sistema de duplo híbrido em leveduras, o que resultou em dois novos potenciais parceiros de interação. Esses parceiros foram identificados como proteínas preditas conceitualmente no genoma de C. reinhardtii, denominadas Predicted e G-patch. Adicionalmente, a interação entre CrNIP7 e CrSBDS, proteína homóloga aSdo1 (de levedura) e HsSBDS (de humanos), foi confirmada através de um experimento de duplo híbrido dirigido. A interação entre as proteínas CrNIP7 e CrSBDS foi validada por pull down e um teste preliminar sugeriu que CrNIP7 e Predicted também interagem in vitro. Análises de bioinformática indicam que Predicted, G-patch e CrSBDS tenham regiões intrinsicamente desordenadas, as quais podem se estruturar na interação com seus parceiros. Em conjunto, os resultados desse trabalho contribuem para entendimento do papel de CrNIP7 na biogênese de ribossomos em Chlamydomonas reinhardtii em comparação com outros modelos eucarióticos
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2016
- Data da defesa: 01.07.2016
-
ABNT
GUTIERREZ, Raissa Ferreira. Estudos funcionais de CrNIP7 de <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>: uma proteína envolvida na biogênese de ribossomos. 2016. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2016. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-21102016-140046/. Acesso em: 02 out. 2024. -
APA
Gutierrez, R. F. (2016). Estudos funcionais de CrNIP7 de <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>: uma proteína envolvida na biogênese de ribossomos (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-21102016-140046/ -
NLM
Gutierrez RF. Estudos funcionais de CrNIP7 de <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>: uma proteína envolvida na biogênese de ribossomos [Internet]. 2016 ;[citado 2024 out. 02 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-21102016-140046/ -
Vancouver
Gutierrez RF. Estudos funcionais de CrNIP7 de <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>: uma proteína envolvida na biogênese de ribossomos [Internet]. 2016 ;[citado 2024 out. 02 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-21102016-140046/ - Estudos funcionais de CrNIP7 de <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>: uma proteína envolvida na biogênese de ribossomos
- Estudos estruturais da proteína tiamina monofosfato sintase de Enterococcus faecalis (EfThiE)
- Estudos funcionais e estruturais de proteínas envolvidas na biossíntese de tiamina em Enterococcus faecalis
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- Assigning roles in chlamydomonas ribosome biogenesis: the conserved factor NIP7
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