Phylogenetic analysis of rabies virus isolated from herbivores in Minas Gerais and São Paulo border (2000-2009), Brazil (2014)
- Authors:
- Garcia, Andrea Isabel Estevez - Universidade de São Paulo (USP)
- Peixoto, Haila Chagas - Universidade de São Paulo (USP)
- Silva, Sheila Oliveira de Souza
- Polo, Gina - Universidade de São Paulo (USP)
- Alves, Ana J - Universidade de São Paulo (USP)
- Brandão, Paulo Eduardo
- Cunha, Elenice M - Instituto Biológico (IB)
- Richtzenhain, Leonardo José
- USP affiliated authors: SILVA, SHEILA OLIVEIRA DE SOUZA - FMVZ ; BRANDÃO, PAULO EDUARDO - FMVZ ; RICHTZENHAIN, LEONARDO JOSÉ - FMVZ
- School: FMVZ
- DOI: 10.1590/S0100-736X2014001200009
- Subjects: RAIVA; FILOGENIA; ZOONOSES POR VÍRUS
- Language: Inglês
- Abstract: A raiva transmitida por morcegos hematófagos da espécie Desmodus rotundus representa uma preocupação de saúde pública e causa de importantes prejuízos para a pecuária brasileira. A evidência atual sugere que a ocorrência de raiva está relacionada às características da paisagem, topografia, hidrografia, sistemas de produção animal e usos da terra. Contudo, existem poucos estudos que analisem as possíveis conexões entre fatores geográficos e a diversidade molecular do vírus da raiva, permitindo a compreensão da dinâmica espacial e temporal dos focos de raiva. Um desses trabalhos estabeleceu que a última epizootia de raiva dos herbívoros registrada no leste do estado de São Paulo (na fronteira com Minas Gerais), aconteceu em duas ondas epidêmicas, sendo a primeira em 1998 e, em 1999, a segunda. Considerando esta evidência, o intuito do presente estudo foi analisar casos de raiva em herbívoros na região sudeste de Minas Gerais (2000-2009) e sua possível relação com a epidemia previamente mencionada, incluindo as características geográficas da região. Foram obtidas sequencias parciais dos genes da glicoproteína (539 nt) e da nucleoproteína (414 nt) a partir de 31 isolados de vírus da raiva procedentes de herbívoros. Foi proposta uma árvore filogenética para cada região genômica usando o método de Neighbor joining, fixando o modelo evolutivo Kimura 2 - parâmetros com um nível de bootstrap de 1000 replicaçõesAs sublinhagens genéticas foram localizadas sobre mapas, considerando as áreas de risco para raiva dos herbívoros em São Paulo, assim como as características topográficas e bacias hidrográficas com o intuito de visualizar qualquer padrão aparente de distribuição segundo essas características. As duas árvores filogenéticas mostraram topologias concordantes, sugerindo uma possível origem comum para os surtos que aconteceram ao longo da fronteira SP/MG, ao redor das porções menos elevadas da Serra da Mantiqueira e acompanhando as bacias hidrográficas dos rios Piracicaba/Jaguarí, Paranaíba do Sul, Grande, Pardo e Mogi-Guaçu. Foi possível observar circulação de varias linhagens virais simultaneamente em alguns municípios, possivelmente por causa de sobreposição de surtos. As sequencias de proteína inferidas a partir dos dois genes mostraram mutações sinônimas, excetuando aquelas encontradas entre os resíduos 20 a 200, correspondentes ao domínio externo da glicoproteína. Esta informação salienta a importância da cooperação entre as autoridades sanitárias de ambos os estados para reforçar o programa de controle da doença nas áreas limítrofes
- Imprenta:
- Place of publication: Rio de Janeiro
- Date published: 2014
- Source:
- Título do periódico: Pesquisa Veterinária Brasileira
- ISSN: 0100-736X
- Volume/Número/Paginação/Ano: v. 34, n. 12, p. 1196-1202, 2014
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc
-
ABNT
GARCIA, Andrea Isabel Estevez; PEIXOTO, Haila Chagas; SILVA, Sheila Oliveira de Souza; et al. Phylogenetic analysis of rabies virus isolated from herbivores in Minas Gerais and São Paulo border (2000-2009), Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 34, n. 12, p. 1196-1202, 2014. Disponível em: < http://dx.doi.org/10.1590/S0100-736X2014001200009 > DOI: 10.1590/S0100-736X2014001200009. -
APA
Garcia, A. I. E., Peixoto, H. C., Silva, S. O. de S., Polo, G., Alves, A. J., Brandão, P. E., et al. (2014). Phylogenetic analysis of rabies virus isolated from herbivores in Minas Gerais and São Paulo border (2000-2009), Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira, 34( 12), 1196-1202. doi:10.1590/S0100-736X2014001200009 -
NLM
Garcia AIE, Peixoto HC, Silva SO de S, Polo G, Alves AJ, Brandão PE, Cunha EM, Richtzenhain LJ. Phylogenetic analysis of rabies virus isolated from herbivores in Minas Gerais and São Paulo border (2000-2009), Brazil [Internet]. Pesquisa Veterinária Brasileira. 2014 ; 34( 12): 1196-1202.Available from: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-736X2014001200009 -
Vancouver
Garcia AIE, Peixoto HC, Silva SO de S, Polo G, Alves AJ, Brandão PE, Cunha EM, Richtzenhain LJ. Phylogenetic analysis of rabies virus isolated from herbivores in Minas Gerais and São Paulo border (2000-2009), Brazil [Internet]. Pesquisa Veterinária Brasileira. 2014 ; 34( 12): 1196-1202.Available from: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-736X2014001200009 - Multiplex semi-nested RT-PCR with exogenous internal control for simultaneous detection of bovine coronavirus and group A rotavirus
- Rapid detection of bovine coronavirus by a semi-nested RT-PCR
- Canine coronavirus (CCoV), a neglected pathogen: molecular diversity of S, M, N and 3b genes
- Extinction and emergence of genomic haplotypes during the evolution of Avian coronavirus in chicken embryos
- Detection of infectious bronchitis virus and avian metapneumovirus by a duplex semi-nested reverse transcription-polymerase chain reaction assay
- A semi-nested RT-PCR assay targeted to hemagglutinin-esterase gene of Bovine Coronavirus
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Informações sobre o DOI: 10.1590/S0100-736X2014001200009 (Fonte: oaDOI API)
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