Artigo de periodico

Rapid detection of bovine coronavirus by a semi-nested RT-PCR (2009)

• Authors:
  • Asano, Karen Miyuki - Universidade de São Paulo (USP)
  • Souza, Sibele Pinheiro de - Universidade de São Paulo (USP)
  • Silva, Sheila Oliveira de Souza
  • Richtzenhain, Leonardo José
  • Brandão, Paulo Eduardo
• USP affiliated authors: SILVA, SHEILA OLIVEIRA DE SOUZA - FMVZ ; RICHTZENHAIN, LEONARDO JOSÉ - FMVZ ; BRANDÃO, PAULO EDUARDO - FMVZ
• Unidade: FMVZ
• DOI: 10.1590/S0100-736X2009001100001
• Subjects: BIOLOGIA MOLECULAR; BOVINOS; CORONAVIRUS; REAÇÃO EM CADEIA POR POLIMERASE; VIROLOGIA VETERINÁRIA
• Language: Inglês
• Abstract: O Coronavírus bovino (BCoV) pertence ao grupo 2 do gênero Coronavirus (Nidovirales: Coronaviridae) e é agente causador de enterites tanto em bezerros como em bovinos adultos, bem como de doença respiratória em bezerros. O presente estudo teve por objetivo desenvolver uma semi-nested RT-PCR para a detecção do BCoV com base em seqüências representativas e recentes do gene do nucleocapsídeo, região conservada do genoma dos coronavírus. Três primers foram desenhados, a primeira amplificação com um fragmento esperado de 463pb e a segunda (semi-nested) com um fragmento esperado de 306pb. A sensibilidade analítica foi determinada pela diluição do BCoV cepa Kakegawa (título HA: 256) na base de 10 em água ultra-pura tratada com DEPC, em soro fetal bovino (SFB) e em uma suspensão fecal negativa para o BCoV, onde foram encontrados resultados positivos até a diluição de 10-2, 10-3 e 10-7, respectivamente. Este resultado sugere que a quantidade total de RNA na amostra influencia na precipitaçãodos pellets pelo método de extração utilizado. Quando se utiliza amostra fecal, a grande quantidade de RNA total funciona como carreadora do RNA do BCoV, demonstrando elevada sensibilidade analítica e ausência de possíveis substâncias inibidoras da PCR. O protocolo final da semi-nested RT-PCR foi aplicado a 25 amostras fecais de vacas adultas, previamente avaliadas por uma nested RT-PCR RdRp utilizada como teste de referência, resultando em 20 e 17 amostras positivas para oprimeiro e segundo teste, respectivamente. Os resultados dos dois sistema de diagnóstico apresentaram concordância substancial (kappa: 0,694). A elevada sensibilidade e especificidade do novo método proposto e o fato de que os primers foram desenhados baseados em sequências atuais do BCoV, oferecem bases para o diagnóstico mais acurado de infecções causadas pelo BCoV, assim como para novas perspectivas em protocolos de detecção de outros Coronavírus de ) importância tanto em saninade animal quanto em saúde pública
• Imprenta:
  • Publisher place: Rio de Janeiro
  • Date published: 2009
• Source:
  • Título: Pesquisa Veterinária Brasileira
  • ISSN: 0100-736X
  • Volume/Número/Paginação/Ano: v. 29, n, 11, p. 869-873, 2009

Informações sobre o DOI: 10.1590/S0100-736X2009001100001 (Fonte: oaDOI API)
• Este periódico é de acesso aberto
• Este artigo é de acesso aberto
• URL de acesso aberto
• Cor do Acesso Aberto: gold
• Licença: cc-by

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How to cite

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• ABNT

  ASANO, Karen Miyuki et al. Rapid detection of bovine coronavirus by a semi-nested RT-PCR. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 29, p. 869-873, 2009Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1590/S0100-736X2009001100001. Acesso em: 19 out. 2024.

• APA

  Asano, K. M., Souza, S. P. de, Silva, S. O. de S., Richtzenhain, L. J., & Brandão, P. E. (2009). Rapid detection of bovine coronavirus by a semi-nested RT-PCR. Pesquisa Veterinária Brasileira, 29, 869-873. doi:10.1590/S0100-736X2009001100001

• NLM

  Asano KM, Souza SP de, Silva SO de S, Richtzenhain LJ, Brandão PE. Rapid detection of bovine coronavirus by a semi-nested RT-PCR [Internet]. Pesquisa Veterinária Brasileira. 2009 ; 29 869-873.[citado 2024 out. 19 ] Available from: https://doi.org/10.1590/S0100-736X2009001100001

• Vancouver

  Asano KM, Souza SP de, Silva SO de S, Richtzenhain LJ, Brandão PE. Rapid detection of bovine coronavirus by a semi-nested RT-PCR [Internet]. Pesquisa Veterinária Brasileira. 2009 ; 29 869-873.[citado 2024 out. 19 ] Available from: https://doi.org/10.1590/S0100-736X2009001100001

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