Estudo da forma, função e expressão gênica em neurociência (2012)
- Authors:
- Autor USP: MIAZAKI, MAURO - IFSC
- Unidade: IFSC
- Sigla do Departamento: FCM
- Subjects: PROCESSAMENTO DE IMAGENS; EXPRESSÃO GÊNICA; NEUROCIÊNCIAS; BIOINFORMÁTICA; VISÃO COMPUTACIONAL
- Keywords: Bioinformatics; Computational modeling of neuronal systems; Gene expression; Image processing; Modelagem computacional de sistemas neuronais; Neuromorfometria; Neuromorphometry
- Language: Português
- Abstract: Durante o desenvolvimento de um neurônio, genes são ativados e desativados, a anatomia se forma e as funcionalidades emergem. Estes três componentes influenciam continuamente uns aos outros. O estudo da forma, função e expressão gênica nos neurônios e no cérebro permanece um tema desafiador e com potencial a ser explorado. Neste contexto, uma importante questão ainda a ser respondida é como quantificar o inter-relacionamento entre forma, função e genes. Para isso, foram realizadas atividades envolvendo caracterização e comparação da forma neuronal, o estudo de processos dinâmicos ocorrendo em redes de estruturas ramificadas, e a comparação entre expressões gênicas. Os dados da base pública NeuroMorpho, que possui quase 6.000 neurônios segmentados, foram caracterizados utilizando-se métodos estatísticos e foram analisados pelo conceito de morfoespaço proposto por McGhee. Outra base pública explorada foi o Mouse Allen Brain Atlas, com imagens de expressão gênica de cérebros de camundongo. Foi proposta a utilização de um método baseado em diagramas de Voronoi para a comparação da distribuição espacial de densidades de expressão gênica entre genes, com o propósito de encontrar correlações entre distribuições. Também foram gerados dados sobre raízes de feijão para o estudo da influência de sua estrutura ramificada na dinâmica de propagação de doenças, seguindo o modelo SIR (Suscetível-Infectado-Recuperado). Integrando os desenvolvimentos anteriores, foi proposto um arcabouço para mensurar a influência da expressão gênica ao longo da escala biológica. Este arcabouço permite mensurar a influência da expressão gênica (escala molecular) na morfologia dos neurônios (escala celular), avançando à escala topológica formada pelas conexões sinápticas, e alcançando o nível funcional das dinâmicas sobre essa rede. Nesse contexto, deve-seressaltar que a influência da expressão gênica é direta sobre a morfologia e indireta sobre a topologia e a dinâmica. As informações obtidas a partir do arcabouço são relevantes na investigação de como a expressão gênica influencia todo o processo, desde o neurônio individual até o funcionamento cerebral. O arcabouço proposto fornece uma metodologia sistemática, com um conjunto de ferramentas para essas análises.
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2012
- Data da defesa: 21.05.2012
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ABNT
MIAZAKI, Mauro. Estudo da forma, função e expressão gênica em neurociência. 2012. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2012. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-27062012-084104/. Acesso em: 02 ago. 2024. -
APA
Miazaki, M. (2012). Estudo da forma, função e expressão gênica em neurociência (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-27062012-084104/ -
NLM
Miazaki M. Estudo da forma, função e expressão gênica em neurociência [Internet]. 2012 ;[citado 2024 ago. 02 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-27062012-084104/ -
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Miazaki M. Estudo da forma, função e expressão gênica em neurociência [Internet]. 2012 ;[citado 2024 ago. 02 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-27062012-084104/
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