Sistema Colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV (2008)
- Authors:
- Autor USP: ARAÚJO, LUCIANO VIEIRA DE - Interunidades em Bioinformática
- Unidade: Interunidades em Bioinformática
- DOI: 10.11606/T.95.2008.tde-20230725-114553
- Assunto: BIOINFORMÁTICA
- Language: Português
- Abstract: Este trabalho apresenta o DBCollHIV, um ambiente computacional para estudos sobre o HIV. Ele é composto por um banco de dados e um conjunto de ferramentas de bioinformática para análise dos dados armazenados. O DBCollHIV atende desafios biológicos relacionados às pesquisas sobre HIV/AIDS como a criação de software para gerenciamento e análise de dados genéticos, clínicos, epidemiológicos e laboratoriais sobre o HIV em larga escala e com foco na validação da qualidade dos dados. Para tanto, sua arquitetura modular permite adaptar as estruturas de coleta e análise de dados para atender as necessidades apresentadas pelo avanço do conhecimento científico. O conjunto de ferramentas de análise desenvolvidas e disponíveis no DBCollHIV é formado pelo software PCR-Contamination utilizado para a identificação de possíveis contaminações ocorridas durante a obtenção das seqüências genéticas por PCR; pelo software HIVSetSubtype usado para subtipagem automática das seqüências do HIV, sejam de subtipos puros ou recombinantes e pelo software HIVdag, um ambiente para criação e execução de algoritmos para identificação de resistência às drogas usadas no tratamento de pacientes. Com o HIVdag, as regras de resistência às drogas são mapeadas para expressões da álgebra de processo, o que permite uso do arcabouço algébrico para geração automática e precisa dos algoritmos propostos pelos pesquisadores. O DBCollHIV permite o trabalho cooperativo por meio do compartilhamento de dados gerenciado pelo proprietário do dado e pelo reaproveitamento e evolução de sua estrutura computacional.
- Imprenta:
- Data da defesa: 13.05.2008
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
-
ABNT
ARAÚJO, Luciano Vieira de. Sistema Colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV. 2008. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2008. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114553/. Acesso em: 27 dez. 2025. -
APA
Araújo, L. V. de. (2008). Sistema Colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114553/ -
NLM
Araújo LV de. Sistema Colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV [Internet]. 2008 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114553/ -
Vancouver
Araújo LV de. Sistema Colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV [Internet]. 2008 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114553/ - Sinergias humanas: interdisciplinaridade na saúde do idoso através da geriatria, gerontologia, filosofia da saúde e inteligência artificial generativa
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Informações sobre o DOI: 10.11606/T.95.2008.tde-20230725-114553 (Fonte: oaDOI API)
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