Sistema Colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV (2008)
- Authors:
- Autor USP: ARAÚJO, LUCIANO VIEIRA DE - BIOINFORMÁTICA
- Unidade: BIOINFORMÁTICA
- Assunto: BIOINFORMÁTICA
- Language: Português
- Abstract: Este trabalho apresenta o DBCollHIV, um ambiente computacional para estudos sobre o HIV. Ele é composto por um banco de dados e um conjunto de ferramentas de bioinformática para análise dos dados armazenados. O DBCollHIV atende desafios biológicos relacionados às pesquisas sobre HIV/AIDS como a criação de software para gerenciamento e análise de dados genéticos, clínicos, epidemiológicos e laboratoriais sobre o HIV em larga escala e com foco na validação da qualidade dos dados. Para tanto, sua arquitetura modular permite adaptar as estruturas de coleta e análise de dados para atender as necessidades apresentadas pelo avanço do conhecimento científico. O conjunto de ferramentas de análise desenvolvidas e disponíveis no DBCollHIV é formado pelo software PCR-Contamination utilizado para a identificação de possíveis contaminações ocorridas durante a obtenção das seqüências genéticas por PCR; pelo software HIVSetSubtype usado para subtipagem automática das seqüências do HIV, sejam de subtipos puros ou recombinantes e pelo software HIVdag, um ambiente para criação e execução de algoritmos para identificação de resistência às drogas usadas no tratamento de pacientes. Com o HIVdag, as regras de resistência às drogas são mapeadas para expressões da álgebra de processo, o que permite uso do arcabouço algébrico para geração automática e precisa dos algoritmos propostos pelos pesquisadores. O DBCollHIV permite o trabalho cooperativo por meio do compartilhamento de dados gerenciado pelo proprietário do dado e pelo reaproveitamento e evolução de sua estrutura computacional.
- Imprenta:
- Data da defesa: 13.05.2008
-
ABNT
ARAÚJO, Luciano Vieira de; FERREIRA, João Eduardo. Sistema Colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV. 2008.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2008. -
APA
Araújo, L. V. de, & Ferreira, J. E. (2008). Sistema Colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV. Universidade de São Paulo, São Paulo. -
NLM
Araújo LV de, Ferreira JE. Sistema Colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV. 2008 ; -
Vancouver
Araújo LV de, Ferreira JE. Sistema Colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV. 2008 ; - Virtual walking stick: mobile application to assist visually impaired people to walking safely
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