Isolamento, caracterização, clonagem e expressão de genes de fatores de crescimento celular a partir de um banco de cDNA de fígado fetal humano (2009)
- Authors:
- Autor USP: AMARANTE, MARIA FERNANDA DE CASTRO - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RCM
- DOI: 10.11606/T.17.2009.tde-05112025-102142
- Subjects: EXPRESSÃO GÊNICA; FÍGADO; FATORES DE CRESCIMENTO; CÉLULAS-TRONCO
- Keywords: Banco de cDNA; Células-tronco hematopoéticas; Expressão de proteínas; Fatores de crescimento; Fígado fetal
- Language: Português
- Abstract: As células-tronco hematopoéticas (CTHs) habitam diferentes nichos durante o desenvolvimento do organismo. O fígado fetal é considerado o principal sítio da hematopoese entre a sexta e a 24ª semana de gestação, período caracterizado pela alta expansão das CTHs (Yu et al, 2009). A possibilidade de expandir as CTHs na presença de citocinas recombinantes surgiu com a necessidade de acelerar a enxertia pós-transplante em pacientes com câncer. Sabe-se que in vivo as CTHs podem se dividir sem perder as capacidades de renovação e diferenciação, mantendo seu potencial por toda a vida do indivíduo (Till et al, 1964). No entanto, ainda não se conhece todos os fatores necessários para que isso ocorra, nem se seria possível reproduzir os estímulos do microambiente do nicho in vitro. Este trabalho tem como objetivo identificar, clonar e expressar proteínas do fígado fetal importantes para o desenvolvimento das CTHs in vitro. O RNA mensageiro foi extraído de fígado fetal de 24 semanas de gestação. A partir deste material, foi construído um banco de cDNA e os genes foram avaliados com o auxílio da ferramenta Generic Est Annotation Pipeline (GEAP). A ontologia dos genes foi analisada utilizando as ferramentas disponíveis no site (http://babelomics.bioinfo.cipf.es/). Os genes da hemangiopoetina (HAPO) e da vitronectina (VN) foram amplificados a partir do RNA do fígado fetal e clonados no sistema TOPO®. Em seguida, foram ligados ao vetor de expressão pEGFP-N1 e expressos em sistema eucarioto (SK-HEP-1) utilizando a técnica de transfecção por lipofectamina. As análises para a detecção dos transcritos e da proteína recombinante foram realizadas por meio das técnicas de PCR convencional (primers específicos para os genes da VN e da HAPO), PCR quantitativo (qPCR) utilizando o reagente Power SYBR PCR Master Mix, espectrometria de massa (MALDI TOF/TOF) e microscopia confocal(anticorpos secundários marcados com Alexafluor® 488 para detecção da VN e com isotiocianato de fluoresceína-FITC para detecção da HAPO), 48 h após a transfecção e por citometria de fluxo após a seleção com geneticina (G418). Alguns genes isolados deste banco estão relacionados a processos importantes para a manutenção das CTHs in vitro, tais como proliferação, resposta a estímulos externos e endógenos, adesão e comunicação celular. Estes genes são componetes da matriz extracelular (MEC), como por exemplo, a vitronectina (VN), o nidogeno 1 (NID1) e a fibronectina 1 (FN1), componentes intracelulares como a fosfatase de especificidade dupla (DUSP6), a macroglobulina α-2 (A2M) e o hemogeno (EDAG) ou componentes da membrana celular como a estomatina (STOM) e o receptor de adiponectina 1 (ADlPOR 1). Além disso, os transcritos descritos acima estão relacionados com a atividade dos fatores de transcrição NF-kB, Myc e Smad-3, os quais têm participação no desenvolvimento das CTHs. A análise das sequências dos genes isolados neste estudo comprovou que o gene da VN (267 pb) tem 99% de identidade com o gene da vitronectina humana (NM_000638). A análise demonstrou também a presença da sequência referente ao peptídeo sinal e que o provável peso molecular da VN recombinante (VNrp) é de 10,5 KDa. O outro gene isolado (HAPO) possui os exons 1, 2 e parte do exon 3 da variante C do gene da proteoglicana 4 (PRG4) (NM_001127710). O gene da HAPO recombinante (HAPOrp) não apresenta o peptídeo sinal e tem um peso molecular de 35 KDa. Ambos os genes possuem as sequências que codificam os domínios somatomedina B e hemopexina. A presença dos transcritos da VN e da HAPO foi diretamente detectada por PCR e por qPCR, que detectou uma alta concentração dos transcritos em fusão com o gene da GFP proveniente do vetor plasmidial. A presença das proteínas VNrp e HAPOrp foi indiretamenteconfirmada pela técnica em citometria de fluxo. A GFP foi detectada em 42,76% e 21,09% das células SK-HEP-1 transfectadas com as construções [pEGFP-N1 + VN] e [pEGFP-N1 + HAPO], respectivamente. Além disso, a análise da banda de 35 KDa recortada do gel SDS-PAGE em espectrômetro de massa demonstrou a presença do íon equivalente a GFP a partir do sobrenadante do cultivo das células SK-HEP-1 transfectadas com a construção [pEGFP-N1 + VN]. As análises em microscópio confocal demonstraram a presença de fluorescência emitida pelas células transfectadas com as construções [pEGFP-N1 + VN] e [pEGFP-N1 + HAPO]. Entretanto, a fluorescência observada nas células marcadas com os anticorpos primário e secundário não confirma a presença das proteínas VNrp e HAPOrp, uma vez que a fluorescência emitida pela GFP e pelos fluoróforos Alexa-fluor® 488 e FITC estavam sobrepostas. Este estudo demonstrou que o fígado fetal humano é um ambiente rico em genes que atuam direta ou indiretamente no comportamento de células hematopoéticas maduras e primitivas. Este trabalho mostrou também que as células SK-HEP-1 produzem eficientemente o RNA mensageiro dos genes alvo em fusão com o gene da GFP e sugere, pela identificação da GFP, que as proteínas VNrp e HAPOrp foram expressas pelas células SK-HEP-1 transfectadas com as construções [pEGFP-N1 + VN] e [pEGFP-N1 + HAPO] por lipossomos
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- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2009
- Data da defesa: 08.10.2009
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ABNT
AMARANTE, Maria Fernanda de Castro. Isolamento, caracterização, clonagem e expressão de genes de fatores de crescimento celular a partir de um banco de cDNA de fígado fetal humano. 2009. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2009. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-05112025-102142/. Acesso em: 28 dez. 2025. -
APA
Amarante, M. F. de C. (2009). Isolamento, caracterização, clonagem e expressão de genes de fatores de crescimento celular a partir de um banco de cDNA de fígado fetal humano (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-05112025-102142/ -
NLM
Amarante MF de C. Isolamento, caracterização, clonagem e expressão de genes de fatores de crescimento celular a partir de um banco de cDNA de fígado fetal humano [Internet]. 2009 ;[citado 2025 dez. 28 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-05112025-102142/ -
Vancouver
Amarante MF de C. Isolamento, caracterização, clonagem e expressão de genes de fatores de crescimento celular a partir de um banco de cDNA de fígado fetal humano [Internet]. 2009 ;[citado 2025 dez. 28 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-05112025-102142/ - Estudo da prevalência e caracterização molecular do TT vírus (TTV) em doadores de sangue e pacientes politransfundidos e não-transfundidos
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Informações sobre o DOI: 10.11606/T.17.2009.tde-05112025-102142 (Fonte: oaDOI API)
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