Uma plataforma computacional para análise de expressão diferencial múltipla (2009)
- Authors:
- Autor USP: SILVA, ISRAEL TOJAL DA - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RGE
- Subjects: EXPRESSÃO GÊNICA; BIOINFORMÁTICA
- Language: Português
- Abstract: A era pós-genômica trouxe novos desafios no que se refere à compreensão da organização e funcionamento do genoma humano. Muitos destes desafios estão centrados sobre o significado da regulação gênica diferencial em distintas condições biológicas, e podem ser enfrentados mediante a análise de Expressão Diferencial Múltipla (EDM) de genes relacionados a processos biológicos. Atualmente, a análise EDM está limitada aos métodos usuais de expressão diferencial inicialmente projetado para análise pareada. O aperfeiçoamento desta análise torna-se necessário para entender as desordens moleculares associadas com a fisiopatologia do fenótipo estudado. Esta tese tem como objetivos o desenvolvimento de uma plataforma computacional web (ProbFAST) para análise EDM em larga escala integrada às informações funcionais disponíveis. Apresenta-se, ainda, um estudo para avaliar a performance da abordagem implementada na ferramenta com outros procedimentos usuais ao analisar um conjunto de dados simulados. Quando aplicada a dados de expressão públicos e privados, demostramos a sua flexibilidade para extrair informações gênicas biologicamente relevantes. ProbFAST pode ser acessado pelo site http://gdm.fmrp.usp.br/probfast
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2009
- Data da defesa: 07.10.2009
-
ABNT
SILVA, Israel Tojal da. Uma plataforma computacional para análise de expressão diferencial múltipla. 2009. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2009. . Acesso em: 14 fev. 2026. -
APA
Silva, I. T. da. (2009). Uma plataforma computacional para análise de expressão diferencial múltipla (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Silva IT da. Uma plataforma computacional para análise de expressão diferencial múltipla. 2009 ;[citado 2026 fev. 14 ] -
Vancouver
Silva IT da. Uma plataforma computacional para análise de expressão diferencial múltipla. 2009 ;[citado 2026 fev. 14 ] - Tracking SARS-CoV-2 variants of concern in wastewater: an assessment of nine computational tools using simulated genomic data
- A mixture model for determining SARS-Cov-2 variant composition in pooled samples
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