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Filogenias moleculares e o enraizamento da "Árvore da Vida" (2009)

  • Authors:
  • Autor USP: CORRÊA, EMANUELLE CORBI - FFCLRP
  • Unidade: FFCLRP
  • Sigla do Departamento: 592
  • Subjects: ASPERGILLUS; FILOGENIA; ENZIMAS
  • Language: Português
  • Abstract: Os seres vivos têm sido divididos em três grandes domínios: Bacteria, Archaea e Eukarya. O relacionamento filogenético entre eles tem sido discutido por vários autores, que em sua maioria concordam com o arranjo ((Archaea + Eukarya) Bacteria). Alguns desses autores têm utilizado proteínas parálogas para enraizar as árvores geradas. A congruência entre as propostas indicaria robustez não fosse a falta de rigor metodológico no delineamento dos protocolos de análise e no tratamento desses dados. As nomeações atribuídas a grupos de seqüências compartilhando a mesma funcionalidade química muitas vezes é confusa dificultando as proposições de homologia, principalmente quando há interação de duas ou mais áreas do conhecimento. Ademais, quando proteínas são analisadas, é importante selecionarmos corretamente qual parte da seqüência deve ser considerada. É vasta a quantidade de trabalhos que omitem os protocolos metodológicos completos dificultando ou impossibilitando a replicação da análise. Nossas análises falharam em propor uma hipótese mais robusta para os três domínios, pois, glicosidases e xilanases demonstraram não compor grupos ortólogos de seqüências. As seqüências dos fatores de alongamento também resultaram na confirmação de que esse agrupamento químico pode não refletir um grupo evolutivo válido. Também é questionável a própria paralogia entre EF-Tu-l'alfa' e EF-G-2. Qualquer futura proposição de alterações na classificação dessas moléculas necessitará deestudos ainda mais abrangentes no que diz respeito aos grupos taxonômicos incluídos - dada a escassez de seqüências para alguns taxa. Devido à importância das xilanases em estudos de biotecnologia, realizamos um estudo filogenético de fungos do gênero Aspergillus para entendermos o comportamento de múltiplas xilanases em uma mesma espécie e propondo uma hipótese filogenética para o grupo, conseguíssemos separar xilanases ortólogas e focar futuros esforços por fungos do gênero Aspergillus que sejam bons produtores dessas enzimas. Finalmente, o programa POY cuja filosofia de análise agrada muitos filogeneticistas, pois é o que melhor reflete os princípios cladísticos parece ter problemas em seu algoritmo quando conjuntos grandes de seqüências protéicas são analisados
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 05.08.2009

  • How to cite
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    • ABNT

      CORRÊA, Emanuelle Corbi; AMORIM, Dalton de Souza. Filogenias moleculares e o enraizamento da "Árvore da Vida". 2009.Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2009.
    • APA

      Corrêa, E. C., & Amorim, D. de S. (2009). Filogenias moleculares e o enraizamento da "Árvore da Vida". Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto.
    • NLM

      Corrêa EC, Amorim D de S. Filogenias moleculares e o enraizamento da "Árvore da Vida". 2009 ;
    • Vancouver

      Corrêa EC, Amorim D de S. Filogenias moleculares e o enraizamento da "Árvore da Vida". 2009 ;

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