Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias (2007)
- Authors:
- Autor USP: FUJITA, ANDRÉ - BIOINFORMÁTICA
- Unidade: BIOINFORMÁTICA
- Subjects: ALGORITMOS E ESTRUTURAS DE DADOS; BIOINFORMÁTICA
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: A análise da expressão gênica através de dados gerados em experimentos de microarrays de DNA vêm possibilitando uma melhor compreensão da dinâmica e dos mecanismos envolvidos nos processos celulares ao nível molecular. O aprimoramento desta análise é crucial para o avanço do conhecimento sobre as bases moleculares das neoplasias e para a identificação de marcadores moleculares para uso em diagnóstico, desenho de novos medicamentos em terapias anti-tumorais. Este trabalho tem como objetivos o desenvolvimento de modelos de análise desses dados, propondo uma nova forma de normalização de dados provenientes de microarrays e dois modelos para a construção de redes regulatórias de expressão gênica, sendo uma baseada na conectividade dinâmica entre diversos genes ao longo do ciclo celular e a outra que resolve o problema da dimensionalidade, em que o número de experimentos de icroarrays é menor que o número de genes. Apresenta-se, ainda, um pacote de ferramentas com uma interface gráfica de fácil uso contendo diversas técnicas de análise de dados já conhecidas como também as abordagens propostas neste trabalho
- Imprenta:
- Data da defesa: 10.08.2007
-
ABNT
FUJITA, André. Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias. 2007. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2007. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14092007-173758/. Acesso em: 28 set. 2024. -
APA
Fujita, A. (2007). Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14092007-173758/ -
NLM
Fujita A. Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias [Internet]. 2007 ;[citado 2024 set. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14092007-173758/ -
Vancouver
Fujita A. Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias [Internet]. 2007 ;[citado 2024 set. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14092007-173758/ - Identifying regulational alterations in gene regulatory networks by state space representation of vector autoregressive models and variational annealing
- Potential confounders in the analysis of Brazilian adolescent’s health: a combination of machine learning and graph theory
- Systems biology model repository for macrophage pathway simulation
- Computational statistics in biological big data: methods and applications
- A tutorial to identify nonlinear associations in gene expression time series data
- Efficient eigenvalue counts for tree-like networks
- Granger causality among graphs and application to functional brain connectivity in autism spectrum disorder
- Dynamical properties for a tunable circular to polygonal billiard
- Conservative generalized bifurcation diagrams and phase space properties for oval-like billiards
- Elevated β-catenin pathway as a novel target for patients with resistance to EGF receptor targeting drugs
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
