Determinação das fases de ligação entre locos em um mapa de cana-de-açúcar, através do método da razão de verssimilhança (2003)
- Authors:
- Autor USP: GARCIA, ANTONIO AUGUSTO FRANCO - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; VEROSSIMILHANÇA; MAPEAMENTO GENÉTICO
- Language: Português
- Abstract: A cana-de-açúcar, por ser uma espécie poliplóide, apresenta grande complexidade genômica. Uma das dificuldades para a construção de mapas genéticos nesse caso, é o fato de as fases de ligação entre os marcadores serem inicialmente desconhecidas. Entretanto, existem diversas metodologias estatísticas que permitem a estimativa dessas fases de ligação (associação ou repulsão). Nesse contexto, o presente trabalho teve por objetivo a determinação das fases de ligação utilizando a estatística razão de verossimilhança. Os dados utilizados são referentes a uma progênie F1 proveniente do cruzamento entre duas variedades comerciais de cana-de-açúcar (SP 80-180 x SP 80-4966). Primeiramente, através do teste de dois pontos foram identificados os grupos de ligação. Em seguida, para as marcas localizadas no mesmo cromossomo, assumiu-se que a fase de ligação era associação, permitindo a distinção entre os indivíduos recombinantes e não recombinantes. Foi, então, calculada a estatística razão de verossimilhança (LRT) para cada par de marcas ligadas. Nos casos onde o valor de LRT não foi significativo, a fase de ligação não pôde ser determinada, o que é coerente, pois esse resultado indica que as marcas não estão ligadas. Já para os casos onde o valor de LRT foi significativo e o valor da estimativa de recombinação foi maior que 0,5, conclui-se que a fase de ligação era associação. Nos casos onde a estimativa de recombinação foi menor que 0,5, considerou-se que a fase de ligação erarepulsão
- Imprenta:
- Source:
- Título do periódico: Agropecuária; resumos
- Conference titles: Simposio Internacional de Iniciação Cientifica da Universidade de São Paulo
-
ABNT
PASTINA, M. M. et al. Determinação das fases de ligação entre locos em um mapa de cana-de-açúcar, através do método da razão de verssimilhança. 2003, Anais.. São Paulo: USP, 2003. . Acesso em: 29 mar. 2024. -
APA
Pastina, M. M., Gazaffi, R., Mollinari, M., Garcia, A. A. F., Margarido, G. R. A., Meza, A. N., & Souza, A. P. de. (2003). Determinação das fases de ligação entre locos em um mapa de cana-de-açúcar, através do método da razão de verssimilhança. In Agropecuária; resumos. São Paulo: USP. -
NLM
Pastina MM, Gazaffi R, Mollinari M, Garcia AAF, Margarido GRA, Meza AN, Souza AP de. Determinação das fases de ligação entre locos em um mapa de cana-de-açúcar, através do método da razão de verssimilhança. Agropecuária; resumos. 2003 ;[citado 2024 mar. 29 ] -
Vancouver
Pastina MM, Gazaffi R, Mollinari M, Garcia AAF, Margarido GRA, Meza AN, Souza AP de. Determinação das fases de ligação entre locos em um mapa de cana-de-açúcar, através do método da razão de verssimilhança. Agropecuária; resumos. 2003 ;[citado 2024 mar. 29 ] - Obtenção dos estimadores de máxima verossimilhança das distâncias entre locos com distorção nas segregações em cana-de-açúcar
- Multi-harvest-location QTL analysis for sugarcane using mixed models
- Modelos pra mapeamento genético em poliplóides
- Molecular mapping of complex traits
- Avaliação da vulnerabilidade genética das variedades de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) cultivadas no Estado de São Paulo de 1970 a 1997
- Uso do método de reamostragem bootstrap para validação da ordem de marcadores em mapas genéticos
- Estudo utilizando simulação do mapeamento de QLT's via análise de marcadores individuais, para caracteres quantitativos com diferentes herdabilidades
- Comparação de algoritmos genéticos usados para a ordenação de marcadores dentro de grupos de ligação de mapas genéticos
- Diversidade genética entre linhagens de milho tropical: comparação entre marcadores AFLP e microssatélites
- Diversidade genética entre linhagens de milho tropical: comparação entre marcadores AFLP e microssatélites
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas