Estudo da estrutura de solvatação de encefalinas e gramicidinas em solução aquosa via simulação molecular (2003)
- Authors:
- Autor USP: VIEIRA, DAVI SERRADELLA - FFCLRP
- Unidade: FFCLRP
- Sigla do Departamento: 593
- Subjects: BIOFÍSICA; QUÍMICA TEÓRICA; FÍSICO-QUÍMICA
- Language: Português
- Abstract: Alguns peptídeos biologicamente importantes são constituídos por poucos aminoácidos como, por exemplo, as encefalinas e as gramicidinas. As encefalinas são pentapeptídeos produzidos no sistema nervoso central que se ligam à receptores específicos no cérebro induzindo à analgesia. As gramicidinas A e S são antibióticos produzidos pela bactéria Bacillus brevis. As estruturas, propriedades dinâmicas e energéticas destes peptídeos foram estudadas via simulação de dinâmica molecular com o objetivo de explicar a estabilidade destes peptídeos e tentar relacionar estas informações com as suas atividades biológicas. Duas encefalinas endógenas (leu-encefalina e met-encefalina ) e uma análoga de maior potência, a dimetiltirosina-encefalina (dmt-encefalina) foram escolhidas para o estudo. As gramicidinas A e S foram estudadas nos meios aquoso e de tetracloreto de carbono. Os sistemas constituídos por uma molécula de cada peptídeo e por moléculas de água SPC /E, em pH fisiológico, ou por moléculas de CCl4 à 298K foram submetidos à simulação de dinâmica molecular no ensemble. NVT, Os peptídeos e as moléculas de solvente foram modelados pelo campo de força GROMOS96. As análises foram realizadas utilizando funções de distribuição radial, de distribuição de energia de pares de átomos, distâncias interatômicas; desvios quadráticos médios e ângulos diedrais. O estudo estrutural, dinâmico e energético das encefalinas endógenas e dmt-encefalina mostra uma grande similaridade entreelas. Há diferenças estruturais entre as encefalinas endógenas e a dmt-encefalina que são associadas à atividade destes peptídeos. A gramicidina A foi estudada nas formas dimérica e monomérica em diferentes meios com o intuito de investigar a influência do solvente na manutenção da estrutura secundária em hélice-ß. Foi mostrado a importante influência do solvente na estabilidade da estrutura ativa da gramicidina A. A rigidez apresentada pela .. gramicidina S devido à ciclização é suficiente para manter a estabilidade da sua estrutura secundária, em folhas- ß antiparalelas, independentemente da natureza do solvente. A estrutura secundária da gramicidina S parece ser um fator essencial para a sua atividade biológica
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2003
- Data da defesa: 26.09.2003
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ABNT
VIEIRA, Davi Serradella. Estudo da estrutura de solvatação de encefalinas e gramicidinas em solução aquosa via simulação molecular. 2003. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2003. . Acesso em: 21 maio 2025. -
APA
Vieira, D. S. (2003). Estudo da estrutura de solvatação de encefalinas e gramicidinas em solução aquosa via simulação molecular (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Vieira DS. Estudo da estrutura de solvatação de encefalinas e gramicidinas em solução aquosa via simulação molecular. 2003 ;[citado 2025 maio 21 ] -
Vancouver
Vieira DS. Estudo da estrutura de solvatação de encefalinas e gramicidinas em solução aquosa via simulação molecular. 2003 ;[citado 2025 maio 21 ]
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